JPH0646180B2 - Method for estimating partial structure of compound - Google Patents
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Description
【発明の詳細な説明】 〔産業上の利用分野〕 本発明は、未知化合物の赤外スペクトルデータに人工知
能的手法を適用してその部分構造を推定する方法に関す
るものである。TECHNICAL FIELD The present invention relates to a method for estimating a partial structure of an unknown compound by applying an artificial intelligence method to infrared spectrum data of the unknown compound.
赤外スペクトルなどのスペクトルの情報から未知化合物
の構造決定を行う方法としては、帰納的方法と演繹的方
法の二通りの方法がある。帰納的方法は、多数の既知化
合物についてのスペクトルをデータベース化しておき、
それを検索して未知化合物のスペクトルと類似のものを
探し出そうというものである。この方法はいわゆるファ
イル検索またはライブラリーサーチとよばれ、例えば、
田辺、化学の領域増刊140号、p.107(1983)、特開昭63
-111429号公報等に記載されている。一方、演繹的方法
は、スペクトルを解析して未知化合物の部分構造に関す
る情報を引き出し、それらを組上げて未知化合物の全体
構造を推定しようというものである。この方法のうちパ
ターン認識の手法を用いたものについては本発明者らが
分析化学,35,518(1986)、同36,339(1987)において
提案している。There are two methods for determining the structure of an unknown compound from spectral information such as infrared spectrum, an inductive method and a deductive method. The inductive method is to create a database of spectra for many known compounds,
The search is to find a spectrum similar to the spectrum of an unknown compound. This method is called so-called file search or library search.
Tanabe, Special Issue on Chemistry, 140, p.107 (1983), JP-A-63
-111429, etc. On the other hand, the deductive method is to analyze the spectrum to obtain information on the partial structure of the unknown compound, and combine them to estimate the overall structure of the unknown compound. The present inventors have analyzed the chemical for those using the technique of pattern recognition of this method, 35, 518 (1986), it has been proposed in the 36, 339 (1987).
しかしながら、上記従来の方法には以下に述べるような
問題があった。However, the above conventional method has the following problems.
帰納的方法では、検索しようとする化合物についてのス
ペクトルデータがあらかじめデータベースのファイルに
入っていなければ、検索データが得られないという問題
がある。したがって、適用範囲に制限がある。The inductive method has a problem that the search data cannot be obtained unless the spectral data of the compound to be searched is stored in the database file in advance. Therefore, the application range is limited.
一方、演繹的方法の場合には上記のような適用範囲の制
限はないが、パターン認識の手法を用いたものでは、ス
ペクトルデータをパターン図形として処理しているた
め、部分構造推定に用いる多数のルール(規則)の管理
が難しいという問題がある。On the other hand, in the case of the deductive method, there is no limitation on the applicable range as described above, but in the method using the pattern recognition method, since the spectral data is processed as a pattern figure, many of the methods used for partial structure estimation are used. There is a problem that it is difficult to manage rules.
本発明は、以上の点に鑑み、演繹的方法において人工知
能的手法を採用することにより、適用範囲に制限がな
く、多数のルールの管理が非常に容易である、化合物の
部分構造推定方法を提供することを目的とする。In view of the above points, the present invention, by adopting an artificial intelligence method in the deductive method, there is no limit to the scope of application, it is very easy to manage a large number of rules, a partial structure estimation method of the compound, The purpose is to provide.
上記目的を達成するため、本発明の化合物の部分構造推
定方法は、多数の既知化合物の中から同じ部分構造をも
つ化合物の赤外スペクトルデータを抽出し、吸光度目盛
りでそれらの平均化を行い、スペクトルの特徴的なピー
クの波数及び強度のデータと部分構造との間の関係をル
ールとして抽出し、該ルールの抽出の際、前記ピークの
波数及び強度のデータの標準偏差を許容範囲として該ル
ールにもりこみ、抽出されたルールを知識ベースとして
記憶する手段a(第1図)と、未知化合物の赤外スペク
トルの特徴的なピークの波数及び強度のデータを入力す
る手段bと、該入力データに対し前記ルールを適用し、
各部分構造の存在の可能性を判定する手段cと、存在が
示唆された部分構造に対し前記入力データとルール記載
データを用いてその存在の確信度を算出する手段dと、
存在が示唆された部分構造とその存在の確信度を出力す
る手段eとを備えたことを特徴とするものである。In order to achieve the above object, the method for estimating the partial structure of a compound of the present invention is to extract infrared spectrum data of a compound having the same partial structure from a large number of known compounds and average them with an absorbance scale. The relationship between the characteristic wavenumber and intensity data of the spectrum and the partial structure is extracted as a rule, and when the rule is extracted, the standard deviation of the wavenumber and intensity data of the peak is set as an allowable range. Means for storing the extracted and extracted rules as a knowledge base (FIG. 1), means b for inputting the wave number and intensity data of the characteristic peak of the infrared spectrum of an unknown compound, and the input data For the above rules,
Means c for determining the possibility of the existence of each partial structure, and means d for calculating the certainty factor of the existence of the partial structure whose existence is suggested using the input data and the rule description data.
It is characterized in that it is provided with a partial structure whose existence is suggested and a means e for outputting a certainty factor of the existence.
本発明では、多数の既知化合物の赤外スペクトルデータ
をもとに、赤外スペクトルのピークの波数及び強度と部
分構造との間の関係をルールとして抽出し、これらルー
ルを知識ベースとして記憶させておき、未知化合物の赤
外スペクトルの特徴的なピークの波数及び強度のデータ
に前記ルールを適用して部分構造を推定するという人工
知能的手法を用いているため、帰納的方法のように正解
がなければ解答が出ないといった事態はなく、確信度で
もつて各部分構造の存在の可能性が示されることによ
り、適用範囲の制限をとりはらうことが可能となる。さ
らに、人工知能的手法のため、推定に使用する多数のル
ールの管理が非常に容易に行えるようになる。したがっ
て、上記課題が解決される。In the present invention, based on the infrared spectrum data of a large number of known compounds, the relationship between the wave number and intensity of the peak of the infrared spectrum and the partial structure is extracted as a rule, and these rules are stored as a knowledge base. Every time, since the artificial intelligence method of estimating the partial structure by applying the above rule to the data of the wave number and intensity of the characteristic peak of the infrared spectrum of the unknown compound is used, the correct answer is the same as the inductive method. Unless there is no answer without it, the degree of certainty indicates the possibility of the existence of each substructure, which makes it possible to limit the scope of application. Moreover, the artificial intelligence approach makes it very easy to manage the large number of rules used for estimation. Therefore, the above problem is solved.
以下本発明を実施例により詳細に説明する。 Hereinafter, the present invention will be described in detail with reference to examples.
第1図は本実施例の方法の手順を示すフローチャート、
第2図は本実施例の実施に使用されるエキスパートシス
テムの構成を示すブロック図である 該エキスパートシステムは、いわゆるプロダクションル
ーム型の知識表現を用いるもので、基本的にユーザーイ
ンタフェース1、知識ベース管理システム2、知識獲得機
構3、推論・確信度計算部4及び知識ベース5を具備して
構成される。ユーザーインタフェース1はユーザーとエ
キスパートシステムのインタフェースであり、未知化合
物の赤外スペクトルデータ、各種コマンド等の入力及び
推論結果等の出力を行う。知識ベース管理システム2は
本エキスパートシステムの核をなす推論・確信度計算部
4及び知識ベース5の管理を行う。知識獲得機構3はエキ
スパートの持っている知識すなわちSDBS(スペクトルデ
ータベースシステム)に集積されている多数の既知化合
物の赤外スペクトルデータから赤外スペクトルと部分構
造との関係を表わすルールを抽出して知識ベース5に記
憶させる。推論・確信度計算部4はユーザーインタフェ
ースからの入力データに知識ベース5に格納されている
ルールを順次適用して、各部分構造の可能性を推定し、
存在の可能性が示唆された部分構造に対し存在の確信度
を計算する。知識ベース5は赤外スペクトルを部分構造
との関係をルールとして格納し、部分構造推定に供す
る。FIG. 1 is a flow chart showing the procedure of the method of the present embodiment,
FIG. 2 is a block diagram showing a configuration of an expert system used for implementing the present embodiment. The expert system uses a so-called production room type knowledge representation, and basically has a user interface 1 and a knowledge base management. A system 2, a knowledge acquisition mechanism 3, an inference / certainty factor calculation unit 4, and a knowledge base 5 are provided. A user interface 1 is an interface between a user and an expert system, which inputs infrared spectrum data of an unknown compound, various commands, and outputs inference results. The knowledge base management system 2 manages the inference / certainty factor calculation unit 4 and the knowledge base 5 which are the core of this expert system. Knowledge acquisition mechanism 3 is a knowledge possessed by an expert, that is, knowledge is obtained by extracting a rule indicating a relationship between an infrared spectrum and a partial structure from infrared spectrum data of many known compounds accumulated in SDBS (spectral database system). Store in base 5. The inference / confidence calculation unit 4 sequentially applies the rules stored in the knowledge base 5 to the input data from the user interface to estimate the possibility of each substructure,
The certainty factor of existence is calculated for the partial structure in which the possibility of existence is suggested. Knowledge base 5 stores the infrared spectrum as a rule in relation to the substructure, and uses it for substructure estimation.
次に、本実施例の方法の具体的手順について第1図のフ
ローチャートに従い順次説明する。Next, the specific procedure of the method of this embodiment will be sequentially described with reference to the flowchart of FIG.
先ず、既知の化合物の赤外スペクトルデータをもとに知
識獲得機構3を通してルールを抽出し、知識ベース5に記
憶する(ステップ)。本実施例では、スペクトルデー
タベースシステム(SDBS)に集積されている約13,000種
の有機化合物の赤外スペクトルデータをもとにルールの
抽出を行った。すなわち同じ部分構造(たとえば飽和ア
ルデヒド)をもつ化合物の赤外スペクトルを抽出してき
て、吸光度目盛りでそれらの平均化を行い、特徴的なピ
ークの波数と強度(相対吸光度)を取り出してルールと
した。その際、統計的処理によりピークの波数と強度の
標準偏差を求め、それらを許容範囲としてルールにもり
こむようにした。なお、ピークの形状、幅などのデータ
も部分構造推定の際の有効なルールになりうる。しか
し、それらのデータをルールとして表現することはなか
なか容易でない上に、初心者のユーザーにとってそれら
のデータの入力はあまり容易でないと考えられるので、
ここではルールとしてはピークの波数と強度だけを用い
ることにした。また、エキスパートシステム構築用ツー
ルとしては、富士通(株)のEシェルを、またハードウェ
アとしてはFACOM-M380を用いた。種々の部分構造につい
て上記のようにして抽出したルールは、IF...THEN...の
形式のいわゆるプロダクションルールとしてEシェルに
格納した。First, rules are extracted through the knowledge acquisition mechanism 3 based on the infrared spectrum data of known compounds and stored in the knowledge base 5 (step). In this example, rules were extracted based on infrared spectrum data of about 13,000 kinds of organic compounds accumulated in a spectrum database system (SDBS). That is, the infrared spectrum of a compound having the same partial structure (for example, saturated aldehyde) was extracted, averaged on the absorbance scale, and the wave number and intensity (relative absorbance) of the characteristic peak were taken as a rule. At that time, the standard deviation of the wave number and intensity of the peak was obtained by statistical processing, and they were set as the allowable range and included in the rule. It should be noted that data such as peak shape and width can also be effective rules when estimating the partial structure. However, it is not easy to express such data as a rule, and it is considered that it is not so easy for a novice user to input such data.
Here, I decided to use only the wave number and intensity of the peak as a rule. As the expert system construction tool, E-shell of Fujitsu Limited was used, and as the hardware, FACOM-M380 was used. The rules extracted as described above for various substructures are stored in the E shell as so-called production rules in the form of IF ... THEN ....
次に、推定の対象となる未知化合物の赤外スペクトルデ
ータ中の主要なピークの波数及び強度を入力データとし
てユーザーインタフェース1より入力する(ステップ
)。ピーク強度のデータは透過率でも吸光度でもよい
が、透過率の場合は入力後に吸光度に変換しさらに相対
強度の数値に換算する。Next, the wave number and intensity of the main peak in the infrared spectrum data of the unknown compound to be estimated are input from the user interface 1 as input data (step). The peak intensity data may be transmittance or absorbance, but in the case of transmittance, it is converted to absorbance after input and converted into a numerical value of relative intensity.
データの入力が終わると、推論・確信度計算部4は知識
ベース5に格納されているルールを適用して各部分構造
の存在の可能性を判定する(ステップ)。この際、ル
ールに記載されているピークの波数と強度の許容範囲の
データが活用される。次に推論・確信度計算部4は存在
が示唆された部分構造に対し、各ピークの波数と強度の
入力データ及びルール記載データを用いて、その部分構
造の存在の確信度を計算し(ステップ)、その結果を
一日記憶する(ステップ)。上記推論及び確信度計算
を全ての構造について行う(ステップ→ステップ→
ステップ→ステップ→ステップ…)。When the input of data is completed, the inference / certainty factor calculation unit 4 applies the rules stored in the knowledge base 5 to determine the possibility of existence of each substructure (step). At this time, the data of the peak wave number and the allowable range of the intensity described in the rule are utilized. Next, the inference / certainty factor calculation unit 4 calculates the certainty factor of the existence of the partial structure using the input data of the wave number and intensity of each peak and the rule description data for the partial structure whose existence is suggested (step ), And memorize the result for one day (step). The above inference and confidence calculation are performed for all structures (step → step →
Step → step → step…).
全ての部分構造について推論及び確信度計算が終了する
と、存在が示唆された部分構造とその存在の確信度をユ
ーザーインタフェース1により出力し、ユーザーに表示
する。When the inference and the confidence factor calculation are completed for all the substructures, the substructures whose existence is suggested and the certainty factor of the existence are output by the user interface 1 and displayed to the user.
次に、上記の方法を用いて数種の部分構造について実測
スペクトルを用いて行ったテストについて述べる。Next, a description will be given of a test performed by using the measured spectrum for several kinds of partial structures using the above method.
飽和アルデヒド、飽和エステル、飽和カルボン酸、飽和
エーテル、ニトロ基、シアノ基等の部分構造について上
記の方法により、SDBSよりルールの獲得、実測スペクト
ルを用いた実行テストを行ない、出力された確信度の検
証を行った。For partial structures such as saturated aldehydes, saturated esters, saturated carboxylic acids, saturated ethers, nitro groups, cyano groups, etc., the rules were obtained from SDBS, the execution test using the measured spectrum was performed, and the confidence level output was It was verified.
この結果、テストに用いた部分構造についてはいずれも
高い確信度で存在の可能性が示唆されることがわかっ
た。As a result, it was found that the substructures used in the tests could all exist with high confidence.
以上詳細に説明したように、本発明によれば、既知化合
物の赤外スペクトルの特徴的なピークに関するデータと
部分構造との間の関係をルールとして抽出して知識ベー
スとして記載させておき、該ルールを適用して各部分構
造の存在の可能性を判定するとともに存在が示唆された
部分構造に対する存在の確信度を求めることにより部分
構造の推定を行うようにしたので、帰納的方法における
ような適用範囲の制限がなく、しかも多数のルールが非
常に容易に管理できる利点がある。As described above in detail, according to the present invention, the relation between the data regarding the characteristic peak of the infrared spectrum of the known compound and the partial structure is extracted as a rule and is described as a knowledge base. Since the rules are applied to determine the possibility of the existence of each substructure and the degree of certainty of the existence of the substructure in which the existence is suggested is obtained, the substructure is estimated. It has the advantage that there are no restrictions on the scope of application and that a large number of rules can be managed very easily.
第1図は本発明の実施例の方法の具体的手順を示すフロ
ーチャート、第2図は上記実施例の実施に使用されるエ
キスパートシステムの構成を示すブロック図である。 1……ユーザーインタフェース 2……知識ベース管理システム 3……知識獲得機構 4……推論・確信度計算部 5……知識ベースFIG. 1 is a flow chart showing a specific procedure of a method of an embodiment of the present invention, and FIG. 2 is a block diagram showing a configuration of an expert system used for implementing the above embodiment. 1 …… User interface 2 …… Knowledge base management system 3 …… Knowledge acquisition mechanism 4 …… Inference / certainty factor calculation unit 5 …… Knowledge base
Claims (1)
もつ化合物の赤外スペクトルデータを抽出し、吸光度目
盛りでそれらの平均化を行い、スペクトルの特徴的なピ
ークの波数及び強度のデータと部分構造との間の関係を
ルールとして抽出し、該ルールの抽出の際、前記ピーク
の波数及び強度のデータの標準偏差を許容範囲として該
ルールにもりこみ、抽出されたルールを知識ベースとし
て記憶する手段と、 未知化合物の赤外スペクトルの特徴的なピークの波数及
び強度のデータを入力する手段と、 該入力データに対し前記ルールを適用し、各部分構造の
存在の可能性を判定する手段と、 存在が示唆された部分構造に対し前記入力データとルー
ル記載データを用いてその存在の確信度を算出する手段
と、 存在が示唆された部分構造とその存在の確信度を出力す
る手段とを備えたことを特徴とする化合物の部分構造推
定方法。1. Infrared spectrum data of a compound having the same partial structure is extracted from a large number of known compounds, and they are averaged on an absorbance scale to obtain data of wave numbers and intensities of characteristic peaks of the spectrum. The relationship with the substructure is extracted as a rule, and when the rule is extracted, the standard deviation of the wave number and intensity data of the peak is included in the rule as an allowable range, and the extracted rule is stored as a knowledge base. Means, means for inputting wave number and intensity data of a characteristic peak of the infrared spectrum of an unknown compound, and means for applying the above rule to the input data and determining the possibility of existence of each partial structure. , Means for calculating the certainty factor of existence of the partial structure of which existence is suggested using the input data and rule description data, and the partial structure of which existence is suggested and its A method for estimating a partial structure of a compound, comprising: a means for outputting a certainty factor of existence.
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1988
- 1988-09-01 JP JP21909788A patent/JPH0646180B2/en not_active Expired - Lifetime
Non-Patent Citations (1)
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|---|
| 第22回応用スペクトロメトリー東京討論会講演要旨集「赤外スペクトルデータの位相相関検索法(昭62−3)日本分折化学会他P.47−50 |
Also Published As
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| JPH0267944A (en) | 1990-03-07 |
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Legal Events
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| EXPY | Cancellation because of completion of term |