JPH0740270B2 - Recording / searching method for chemical reaction information - Google Patents
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Description
【発明の詳細な説明】 [発明の分野] 本発明は、化学反応情報の記録・検索方法に関するもの
であり、さらに詳しくは、化学反応に関与する物質につ
いての関連情報を記録し、検索処理する方法に関するも
のである。Description: FIELD OF THE INVENTION The present invention relates to a method for recording and retrieving chemical reaction information, and more specifically, recording and retrieving related information on a substance involved in a chemical reaction. It is about the method.
[発明の技術的背景] 近年において、コンピュータの発達に伴ない、化学物
質、特に有機化合物の構造情報の記録方法について各種
の方法が提案され、利用されつつある。今日までに研究
され、解明された有機化合物および有機化学反応は膨大
な量にのぼるが、これらの既知の情報を有効に利用して
公知の化学物質または化学反応を短時間のうちに検索し
たり、さらには所望の特性を有する新規物質の合成方法
を見出すことが望まれている。そのためには、化学物質
および化学反応の表現形態として、技術者にとってその
構造的特徴を把握することが容易な従来の化学構造式の
代りに、コンピュータが処理できる(すなわち、コンピ
ュータが論理判断しうる)表現形態を開発し、利用する
ことが要求されている。[Technical Background of the Invention] In recent years, with the development of computers, various methods have been proposed and are being used for recording structural information of chemical substances, particularly organic compounds. The amount of organic compounds and organic chemical reactions that have been studied and elucidated to date has reached enormous amounts. However, it is possible to effectively utilize this known information to search for known chemical substances or chemical reactions in a short time. Furthermore, it is desired to find a method for synthesizing a novel substance having desired properties. To that end, as a form of expression of chemical substances and chemical reactions, a computer can process (that is, a computer can make logical judgments) instead of a conventional chemical structural formula that makes it easy for an engineer to grasp the structural characteristics. ) It is required to develop and utilize forms of expression.
化学物質の記録方法としては、WLN(Wiswesser Linear
Notation)などの線型表記法および結合表による方法が
代表的なものであり、その詳細はたとえば、W.T.Wipke,
S.R.Heller,R.J.Feldmann,E.Hyde(Eds):“Computer
Representation and Manipulation of Chemical Inform
ation"(John Wiley and Sons,New York,1974)[ウィ
プケ、ヘラー、フェルドマン、ハイド(編):「化学情
報のコンピュータ表現および取扱い」(ジョン・ウィリ
ーアンドサンズ社)]に記載されている。結合表(conn
ection table)は、たとえば化学物質の構造式における
各原子の種類、それに結合する相手の原子および結合の
種類などを一覧表にまとめたものであり、上記の線型表
記法に比べて化学物質を原子単位で検索することができ
るとの利点がある。As a method of recording chemical substances, WLN (Wiswesser Linear)
Notation) and other linear notations are the typical ones, and details are given in, for example, WTWipke,
SRHeller, RJFeldmann, E.Hyde (Eds): “Computer
Representation and Manipulation of Chemical Inform
ation "(John Wiley and Sons, New York, 1974) [Wipke, Heller, Feldman, Hyde (eds.):" Computer representation and handling of chemical information "(John Willie and Sons)]. Join table (conn
ection table) is a list of, for example, the types of each atom in the structural formula of a chemical substance, the atoms of the partner that binds to it, the types of bonds, etc. There is an advantage that you can search in units.
また、化学物質の構造変化(化学反応)に関する情報を
記録する方法についても提案されているが、今までのと
ころ満足できる表現方法は知られていない。たとえば、
化学反応に関する情報を記録する方法として反応コード
による方法があり、具体的にはJ.Valls,O.Scheiner:“C
hemical Information Systems",E.Ash,E.Hyde(Eds),
(Ellis Horwood Limited,1975)p.241-258[バール、
シャイナー:「化学情報システム」、アッシュ、ハイド
編(エリス・ホアウッド社)]に記載された方法、M.A.
Lobeck,Angew.Chem.Intern.Ed.Engl.,9,578(1970)
[ロベック、アンゲバンテ・ヒェミー・インターナショ
ナル・エディション・イン・イングリッシュ]に記載さ
れた方法、およびH.J.Ziegler,J.Chem.Inf.Comput.Sc
i.,19,141(1979)[ジーグラー、ジャーナル・オブ・
ケミカル・インフォメーション・アンド・コンピューテ
ーショナル・サイエンス]に記載された方法などがあ
る。この方法では化学反応表現の観点が固定されている
ために、新しい化学反応が見い出された場合に記録でき
ないとの欠点がある。また、化学物質の構造情報とその
変化の情報とが別個の形態で記録されているので有効な
情報検索を行なうことができないとの欠点がある。Also, a method for recording information on the structural change (chemical reaction) of a chemical substance has been proposed, but a satisfactory expression method has not been known so far. For example,
As a method of recording information on chemical reactions, there is a method using a reaction code. Specifically, J.Valls, O.Scheiner: “C
hemical Information Systems ", E. Ash, E. Hyde (Eds),
(Ellis Horwood Limited, 1975) p.241-258 [bar,
Shiner: "Chemical Information System", Ash, Hyde, Ed. (Eris Hoawood Co.)], MA
Lobeck, Angew.Chem.Intern.Ed.Engl., 9 , 578 (1970)
[Lovec, Angevante Chemie International Edition in English] and HJZiegler, J.Chem.Inf.Comput.Sc
i., 19 , 141 (1979) [Ziegler, Journal of the
Chemical Information and Computational Science]. This method has a drawback in that when a new chemical reaction is found, it cannot be recorded because the viewpoint of expressing the chemical reaction is fixed. Further, since the structural information of the chemical substance and the information of its change are recorded in separate forms, there is a drawback that effective information retrieval cannot be performed.
別に、化学物質の合成経路を設計する立場から案出され
た記録方法も知られている。たとえば、E.J.Corey,R.D.
Cramer,W.J.Howe,J.Am.Chem.Soc.,94,440(1972)[コ
ーリ、クラマー、ホウエ、ジャーナル・オブ・アメリカ
ン・ケミカル・ソサエティ]、I.Ugi,J.Bauer,J.Braud
t,J.Friedrich,J.Gasteiger,L.Jochum,W.Schubert,Ange
w.Chem.Intern.Ed.Engl.,18,111(1979)[ウギ、バウ
アー、ブラウト、フリードリッヒ、ガスタイガー、ジョ
ッチャム、シューベルト、アンゲバンテ・ヒェミー・イ
ンターナショナル・エディション・イン・イングリッシ
ユ]に記載された方法がある。しかしながら、この方法
は個々の化学反応を記録するのには適していない。In addition, a recording method devised from the standpoint of designing a synthetic route for a chemical substance is also known. For example, EJCorey, RD
Cramer, WJHowe, J.Am.Chem.Soc., 94 , 440 (1972) [Cori, Cramer, Hohe, Journal of American Chemical Society], I.Ugi, J.Bauer, J.Braud
t, J.Friedrich, J.Gasteiger, L.Jochum, W.Schubert, Ange
w.Chem.Intern.Ed.Engl., 18 , 111 (1979) [Ugi, Bauer, Blaut, Friedrich, Gasteiger, Jocham, Schubert, Angevante Chemie International Edition in English] There is a way. However, this method is not suitable for recording individual chemical reactions.
なお、本出願人は虚遷移構造および/または結合表を用
いて化学反応情報を記録保存する方法、また虚遷移構造
および/または結合表に図形処理もしくは演算処理を施
すことにより種々の部分構造を得る方法、さらにはこれ
らを用いて化学反応および反応に関与する物質構造など
を検索処理する方法について既に特許出願している(特
願昭60-177345号、同特願昭60-185386号、同60-197463
号、同60-213184号、同60-221087号等)。Note that the present applicant has a method of recording and storing chemical reaction information by using an imaginary transition structure and / or a binding table, and various partial structures by performing graphic processing or arithmetic processing on the imaginary transition structure and / or the binding table. Patent applications have already been filed for the method for obtaining the compound, and the method for searching for the chemical reaction and the structure of substances involved in the reaction by using these methods (Japanese Patent Application Nos. 60-177345, 60-185386, 60-185386, 60-197463
No. 60-213184, No. 60-221087, etc.).
[発明の要旨] 本発明は、化学反応情報と化学反応に関与する物質につ
いての関連情報とを対応づけて、記録・検索するための
処理方法を提供することをその目的とするものである。SUMMARY OF THE INVENTION It is an object of the present invention to provide a processing method for recording / searching in association with chemical reaction information and related information about a substance involved in the chemical reaction.
特に本発明は、化学反応情報に基づいて化学反応に関与
する物質についての関連情報をコンピュータ処理による
検索および表示記録可能とするための処理方法を提供す
ることをその目的とするものである。In particular, it is an object of the present invention to provide a processing method for making it possible to search and display and record by computer processing related information on a substance involved in a chemical reaction based on the chemical reaction information.
すなわち、本発明は、少なくとも一つの出発物質から少
なくとも一つの生成物質を生ずる化学反応の出発物質の
構造と生成物質の構造とをトポロジカルに重ねあわせ、
(1)出発物質および生成物質に共通して存在するノー
ド間の結合、(2)出発物質のみに存在するノード間の
結合および(3)生成物質のみに存在するノード間の結
合をそれぞれ区別して表わす結合表を作成し、該化学反
応に関与する物質の物質名、分子式、重量、容量、モル
数、純度、物性値、スペクトル情報、立体化学および収
率からなる群より選ばれる関連情報に対応づけられてい
る少なくとも一つの識別符号をこの結合表に付す工程;
得られた結合表を、コンピュータに付設された記録媒体
に記録保存する工程;そして上記の記録保存された結合
表中のノード間の結合と識別符号とを利用してコンピュ
ータでの処理を行なうことにより、化学反応の情報と共
に上記関連情報を検索する工程;を含む化学反応情報の
記録・検索方法にある。That is, the present invention topologically superimposes the structure of the starting material and the structure of the product of a chemical reaction that produces at least one product from at least one starting material,
Differentiating between (1) the bond between the nodes that commonly exist in the starting material and the product, (2) the bond between the nodes that exist only in the starting material, and (3) the bond between the nodes that exist only in the product. Create a bond table to represent the relevant information selected from the group consisting of substance name, molecular formula, weight, volume, number of moles, purity, physical properties, spectral information, stereochemistry and yield of substances involved in the chemical reaction. Attaching at least one identification code attached to this binding table;
A step of recording and storing the obtained connection table in a recording medium attached to a computer; and performing a computer process by using the connection between the nodes and the identification code in the above-mentioned recorded and stored connection table. The method for recording / searching chemical reaction information includes the step of searching the related information together with the information on the chemical reaction.
また、本発明は、触媒の関与下にて少なくとも一つの出
発物質から少なくとも一つの生成物質を生ずる化学反応
の出発物質の構造と生成物質の構造とをトポロジカルに
重ねあわせ、(1)出発物質および生成物質に共通して
存在するノード間の結合、(2)出発物質のみに存在す
るノード間の結合および(3)生成物質のみに存在する
ノード間の結合をそれぞれ区別して表わし、さらに触媒
を独立のノードとして表わす結合表を作成し、該化学反
応に関与する物質の物質名、分子式、重量、容量、モル
数、純度、物性値、スペクトル情報、立体化学および収
率からなる群より選ばれる関連情報に対応づけられてい
る少なくとも一つの識別符号をこの結合表に付す工程;
得られた結合表を、コンピュータに付設された記録媒体
に記録保存する工程;そして上記の記録保存された結合
表中のノード間の結合、触媒のノードそして識別符号を
利用してコンピュータでの処理を行なうことにより、化
学反応の情報と共に上記関連情報を検索する工程;を含
む化学反応情報の記録・検索方法にもある。In addition, the present invention topologically superimposes the structure of the starting material and the structure of the product in a chemical reaction in which at least one starting material is produced from at least one starting material under the participation of a catalyst, and (1) the starting material and Separately represents the bonds between the nodes that are commonly present in the generated substances, (2) the bonds between the nodes that are present only in the starting substances, and (3) the bonds between the nodes that are present only in the produced substances, and further make the catalyst independent. A bond table represented as a node of is created, and a relation selected from the group consisting of substance name, molecular formula, weight, volume, number of moles, purity, physical property information, spectral information, stereochemistry and yield of substances involved in the chemical reaction. Attaching at least one identification code associated with the information to this binding table;
A step of recording and storing the obtained binding table in a recording medium attached to a computer; and a computer processing using the binding between the nodes, the node of the catalyst and the identification code in the above recorded and stored binding table. And a method of recording / retrieving chemical reaction information, which includes the step of retrieving the relevant information together with the information of the chemical reaction by carrying out.
本発明の方法によれば、出発物質、生成物質さらには触
媒などの化学反応に関与する物質についての関連情報
(本発明においては、物質名、分子式、重量、容量、モ
ル数、純度、物性値、スペクトル情報、立体化学および
収率から選ばれる一以上の情報をいう)を、固有の識別
符号として虚遷移構造から導かれた結合表に付すことに
より、この識別符号を介して化学反応情報と関連情報と
を随時対応づけ、記録し、検索することができる。According to the method of the present invention, the related information on the starting material, the produced material, and the material related to the chemical reaction such as the catalyst (in the present invention, the substance name, molecular formula, weight, volume, number of moles, purity, physical property value) , Spectral information, stereochemistry, and one or more information selected from yields) is attached to the binding table derived from the imaginary transition structure as a unique identification code, and chemical reaction information is obtained through this identification code. Corresponding information can be associated, recorded, and searched at any time.
上記の虚遷移構造(imaginary transition structure
s、以下においてITSと略称する)とは、化学反応に関与
する物質の構造変化を、(1)出発物質のみに存在する
結合、(2)生成物質のみに存在する結合および(3)
両者に共通に存在する結合からなる三種類に区別して表
わした二次元もしくは三次元の構造図(図形)をいう。
この構造図は、化合物についての従来の構造式および三
次元的構造図に準じて技術者が視覚的になじみやすく、
また容易に理解できる形態で化学反応を表わすことがで
きるものである。The above imaginary transition structure
s, hereinafter abbreviated as ITS) means the structural change of a substance involved in a chemical reaction, (1) a bond existing only in a starting material, (2) a bond existing only in a product, and (3)
A two-dimensional or three-dimensional structural diagram (figure) that is represented by distinguishing into three types of bonds that are common to both.
This structure diagram is easy for engineers to familiarize themselves with in accordance with the conventional structural formula and three-dimensional structure diagram of a compound,
In addition, the chemical reaction can be expressed in a form that can be easily understood.
また、結合表(connection table)は、化学反応におけ
るノードの種類、該ノードに結合する相手ノードおよび
上記三種類に区別して表わしたこれらノード間の結合な
どの組合せからなる簡単かつ明瞭な一覧表であり、そし
てこの結合表は化学反応情報をたいして大きな容量を必
要とせずに記録媒体に蓄積保存することができるもので
ある。特に、登録形態として結合表を用いることにより
コンピュータによる情報の処理が容易となり、化学反応
の登録を簡便に行なうことができるためこれらの情報の
蓄積、管理が容易となる。Further, the connection table is a simple and clear list consisting of combinations of the types of nodes in a chemical reaction, the partner nodes that bind to the nodes, and the connections between these nodes, which are distinguished by being classified into the above three types. Yes, and this binding table allows chemical reaction information to be stored and stored in a recording medium without requiring a large capacity. In particular, the use of a binding table as a registration form facilitates the processing of information by a computer and facilitates the registration of chemical reactions, which facilitates the storage and management of such information.
上記虚遷移構造および結合表において、化学反応は基本
的に原子、原子団などからなるノード(節、node)とノ
ードとの間の結合についての簡易な表現で表わされ、か
つ反応系におけるノード間の結合は上記三種類に区別し
て表わされている。従って、コンピュータに登録された
虚遷移構造および結合表は、化学反応のみならず反応に
関与する化学物質(反応の出発物質および生成物質等)
についての情報も包含している。In the above imaginary transition structure and bond table, a chemical reaction is basically expressed by a simple expression of a bond between a node (a node) composed of atoms, atomic groups, etc. and a node in a reaction system. The bond between them is represented by being distinguished into the above three types. Therefore, the imaginary transition structure and the binding table registered in the computer are not only chemical reactions, but also chemical substances involved in the reaction (starting substances and producing substances of the reaction, etc.)
It also includes information about.
また、本発明においては、上記結合表(そして虚遷移構
造)にさらに識別符号を付して、この識別符号に出発物
質の使用量、生成物質の収率、触媒の量あるいはこれら
物質の各種の物性(融点、沸点等)、立体化学などを対
応づけておくことにより、反応に関与する物質について
の関連情報(これを『単位情報項目』と呼ぶ)を該化学
反応と対応させて容易に引き出すことができる。すなわ
ち、上記の形態で記録保存された化学反応情報を検索し
て一つの化学反応を引き出した場合に、さらに識別符号
に基づいて関連情報を簡単に導き出すことができる。こ
の関連情報の入手は、化学反応の包括的な理解、実施お
よび生成物質等の理解、応用性を知る上で大きな助けと
なるものであり、反応情報の利用性および汎用性を高め
ることができる。Further, in the present invention, an identification code is further attached to the binding table (and the imaginary transition structure), and the identification code indicates the amount of the starting material used, the yield of the product, the amount of the catalyst or various kinds of these materials. By associating physical properties (melting point, boiling point, etc.), stereochemistry, etc., it is possible to easily extract relevant information (referred to as "unit information items") about the substances involved in the reaction in association with the chemical reaction. be able to. That is, when the chemical reaction information recorded and stored in the above-described form is searched to derive one chemical reaction, the related information can be easily derived based on the identification code. Obtaining this related information is a great help for comprehensive understanding of chemical reactions, understanding of implementation and products, etc., and applicability, and it is possible to enhance the usability and versatility of reaction information. .
特に、識別符号をノードおよび/または結合に付すこと
により、各関連情報を出発物質、生成物質さらには触媒
それぞれと明確に対応づけることができる。In particular, by attaching the identification code to the node and / or the bond, it is possible to clearly associate each related information with each of the starting material, the produced material, and the catalyst.
識別符号が付された結合表(そして虚遷移構造)は、コ
ンピュータに記録保存したり、更には白紙に記録した
り、CRTなどの画面に表示することができる。また、こ
れらの関連情報は虚遷移構造等とともにあるいは単独
で、白紙に記録したり、CRTなどの画面に表示したり、
更には適当な記録媒体に記録保存することができる。The binding table (and the imaginary transition structure) with the identification code can be recorded and stored in a computer, further recorded on a blank sheet, or displayed on a screen such as a CRT. In addition, these related information can be recorded on a blank sheet of paper or displayed on a screen such as a CRT together with the imaginary transition structure or alone.
Further, it can be recorded and stored in an appropriate recording medium.
さらに、化学反応情報を処理する際に、触媒に関する情
報を如何に処理するかということは大きな問題である
が、本発明者は触媒について種々検討した結果、情報処
理上少なくとも二種類の触媒が存在することを見い出し
た。本発明によれば、触媒の種類によらず反応過程にお
ける触媒の役割を的確に記述することができる。すなわ
ち、反応に携わる触媒を独立のノードとして表わすこと
により、結合表(そして虚遷移構造)は触媒についての
情報をも包含する。また、この場合には反応過程におけ
る触媒の作用を虚遷移構造上で明示することができる。Further, when processing the chemical reaction information, how to process the information about the catalyst is a big problem, but as a result of various studies on the catalyst, the present inventor found that at least two kinds of catalysts exist in information processing. I found out what to do. According to the present invention, the role of the catalyst in the reaction process can be accurately described regardless of the type of the catalyst. That is, by representing the catalysts involved in the reaction as independent nodes, the binding table (and the imaginary transition structure) also contains information about the catalyst. Further, in this case, the action of the catalyst in the reaction process can be clearly shown on the imaginary transition structure.
そして、登録された反応情報に基づいて化学反応に関す
る情報検索を短時間のうちに効率良く行なうことができ
るため、技術者の個々の研究において情報の収集、調査
等に要する時間を短縮化し、かつ得られる情報の密度を
高めて、研究を効率的に進めることができる。Further, since information on chemical reactions can be efficiently searched based on the registered reaction information in a short time, the time required for collecting and investigating information in individual research of engineers is shortened, and The density of information available can be increased to facilitate research.
これらの利点に加えて、本発明の方法においては、化学
反応情報とこれに対応づけられている関連情報とを組み
合わせて利用することにより、更には反応に関与する物
質情報をも合わせて利用することにより、薬品製造等に
たずさわる技術者にとって要望が大である化学物質の構
造解析、分子設計(molecular modeling)、有機合成経
路設計(heuristic analysis of organic synthesis)
を行なうことが可能である。さらに、化学物質の部分構
造検索、構造−活性相関、未知化合物の構造自動決定、
および複雑な化合物をある条件下で反応させた場合の反
応機構および反応生成物の予測(mechanistic evaluati
on of organic reaction)などを短時間のうちに十分実
用可能な範囲内で行なうことが可能である。In addition to these advantages, in the method of the present invention, by combining the chemical reaction information and the related information associated therewith, the information on the substances involved in the reaction is also used together. Therefore, structural analysis of chemical substances, molecular modeling, and heuristic analysis of organic synthesis, which are highly demanded by engineers involved in drug manufacturing, etc.
It is possible to Furthermore, partial structure search of chemical substances, structure-activity relationship, automatic structure determination of unknown compounds,
Of reaction mechanism and reaction product when complex and complex compounds are reacted under certain conditions (mechanistic evaluati
on of organic reaction) can be carried out within a sufficiently practical range within a short time.
[発明の構成] 本発明の化学反応情報の記録・検索処理方法において
は、ノード間の結合を出発物質のみに存在する結合、生
成物質のみに存在する結合および両者に共通に存在する
結合からなる三種類に区別して表わした虚遷移構造およ
び/または結合表として記述されている化学反応情報に
さらに固有の識別符号を付す操作、および反応に関与す
る物質についての関連情報に同一の識別符号を付して対
応づける操作が行なわれ、これにより、反応情報と関連
情報とが識別符号を介して対応づけられる。[Structure of the Invention] In the chemical reaction information recording / retrieval processing method of the present invention, a bond between nodes is composed of a bond existing only in the starting material, a bond existing only in the produced material, and a bond common to both. An operation to attach a unique identification code to the chemical reaction information described as an imaginary transition structure and / or a binding table that is distinguished in three types, and the same identification code to the related information about the substances involved in the reaction Then, the corresponding information is associated with each other, and the reaction information and the related information are associated with each other via the identification code.
以下に、本発明の方法を酢酸エチルを塩酸によって加水
分解する反応を例に挙げて説明する。The method of the present invention will be described below by taking the reaction of hydrolyzing ethyl acetate with hydrochloric acid as an example.
この化学反応は、 CH3COOCH2CH3+H2O+HCl →CH3COOH+CH3CH2OH+HCl (反応式1) で表わされる。反応の虚遷移構造(ITS)はたとえば以
下のように表わすことができる。This chemical reaction is represented by CH 3 COOCH 2 CH 3 + H 2 O + HCl → CH 3 COOH + CH 3 CH 2 OH + HCl (reaction formula 1). The imaginary transition structure (ITS) of the reaction can be expressed as follows, for example.
ここで、 出発物質および生成物質に共通して存在する結合を表わ
し、 出発物質にのみ存在する結合を表わし、そして iii)記号…は、生成物質にのみ存在する結合を表わし
ている。 here, Represents the bonds that are commonly present in the starting material and the product, Represents a bond that is only present in the starting material, and the iii) symbol ... Represents a bond that is only present in the product material.
すなわち、虚遷移構造(ITS)とは、出発物質の構造と
生成物質の構造とをトポロジカルに重ね合わせて、各ノ
ード間の結合を上記i)〜iii)の三種類で区別した二
次元もしくは三次元の構造をいう。なお、『トポロジカ
ルに重ね合わせる』とは具体的に、出発物質の構造に現
れるノードと生成物質の構造に現れるノードとを一致さ
せてこれらの構造を一つに組み合わせることをいう。That is, the imaginary transition structure (ITS) is a two-dimensional or three-dimensional structure in which the structure of the starting material and the structure of the generated material are topologically overlapped and the bonds between the respective nodes are distinguished by the above three types i) to iii). The original structure. Note that "topologically superimposing" specifically means that the nodes appearing in the structure of the starting material and the nodes appearing in the structure of the produced material are matched and these structures are combined into one.
上記の虚遷移構造(ITS)において、化学反応に関与す
る物質のノードは、原系(出発物質群)および生成系
(生成物質群)に含まれる原子を単位として表わされて
いてもよいし、あるいはメチル基[上記ノード(1)、
(5)]、メチレン基[上記ノード(4)]のような官
能基などの原子団単位で表わされてもよい。また、化学
反応を表現するに際して、原系および生成系に現れるノ
ードが一部省略して表わされていてもよい。In the above imaginary transition structure (ITS), the nodes of the substances involved in the chemical reaction may be represented by the atoms contained in the original system (starting substance group) and the producing system (producing substance group) as a unit. , Or a methyl group [above node (1),
(5)], a functional group such as a methylene group [node (4) above] or the like. When expressing a chemical reaction, some of the nodes appearing in the original system and the producing system may be omitted.
また、三種類の結合の区別は上記i)〜iii)のような
記号による表示に限定されるものではなく、たとえば数
字(1、2、3)等の簡単な文字による表示、あるいは
色彩(黒色、赤色、緑色)による色分け表示など利用者
が五感により判断でき、かつコンピュータ処理が可能で
ある限り、いかなる手段が用いられていてもよい。Also, the distinction between the three types of bonds is not limited to the display by the symbols such as i) to iii) above, and may be displayed by simple characters such as numbers (1, 2, 3) or the color (black). , Red, green) and the like, any means may be used as long as the user can judge by the five senses and computer processing is possible.
以下本明細書において、 i)出発物質および生成物質に共通の結合 を『無色の結合』または恒結合(par-bond)と呼び、 ii)出発物質にのみ存在する結合 を『出結合』(out-bond)と呼び、 iii)生成物質にのみ存在する結合(記号…)を『入結
合』(in-bond)と呼び、 そして、出結合と入結合とを総称して『有色の結合』と
呼び、また虚遷移構造に現れるこれら三種の結合を総称
して『虚結合』と呼ぶことにする。In the following, i) a common bond to the starting material and the product Is called a "colorless bond" or a constant bond (par-bond), and ii) a bond that exists only in the starting material. Is called "out-bond", iii) The bond (symbol ...) that exists only in the product is called "in-bond", and the out-bond and the in-bond are collectively called. Are called "colored bonds", and these three types of bonds appearing in the imaginary transition structure are collectively called "imaginary bonds".
具体的に、虚遷移構造に現れる結合の種類を第1表にま
とめて示す。なお、第1表において横の数値は結合の出
入の指標を意味する。Specifically, Table 1 shows the types of bonds appearing in the imaginary transition structure. In addition, in Table 1, the numerical value on the side means an index of bond entry and exit.
第1表において、たとえば記号『…』で表わされた結合
は単入結合(single in-bond)であって、一対の数字
(0+1)で表わすことができる。ここで、0は反応前
の原系において結合が存在しないことを意味し、+1は
反応後の生成系において単結合が生じていることを意味
する。同様にして、 で表わされた結合は単出結合(single out-bond)であ
って(1−1)で表わし、反応前の原系において単結合
が存在するが反応後の生成系において単結合が消滅して
いることを意味する。また、(2−1)で表わされる結
合は単出の二重結合(double bond singly cleaved)で
あり、 で表記される。 In Table 1, for example, the bond represented by the symbol "..." Is a single in-bond and can be represented by a pair of numbers (0 + 1). Here, 0 means that there is no bond in the original system before the reaction, and +1 means that a single bond has occurred in the produced system after the reaction. Similarly, The bond represented by is a single out-bond and is represented by (1-1). There is a single bond in the original system before the reaction, but the single bond disappears in the production system after the reaction. It means that The bond represented by (2-1) is a double bond singly cleaved, It is written in.
このように結合の種類はまた、一対の数字:(a,b)
[ただし、aは出発物質における結合多重度を表わす整
数であり、bは化学反応における結合多重度の変化を表
わす整数である] で表わすことができ、これを『複素結合数』(complex
bond number)または『虚多重度』(imaginary multipl
icity)と呼ぶことにする。なお、(a,b)の表記のうち
コンマ(,)は省略してもよい。この表記によれば、結
合多重度が二以上であっても簡潔に表わすことができ
る。また、記憶容量をそれほど必要としなく、かつ直接
にコンピュータ処理が可能である点で化学反応の記録保
存に特に好ましいものであり、以下に述べる結合表の作
成に際して好適に用いられる表現方法である。Thus the type of bond is also a pair of numbers: (a, b)
[Where a is an integer that represents the bond multiplicity in the starting material, and b is an integer that represents the change in the bond multiplicity in the chemical reaction], and this can be represented by the “complex bond number” (complex bond number).
bond number) or “imaginary multipl”
icity). The comma (,) in the notation (a, b) may be omitted. According to this notation, even if the coupling multiplicity is two or more, it can be simply expressed. In addition, it is a particularly preferable method for recording and storing chemical reactions because it does not require much storage capacity and can be directly processed by a computer, and is an expression method that is preferably used when creating a binding table described below.
虚遷移構造には反応に関与する物質についての関連情報
(単位情報項目)に対応づけられている識別符号が付さ
れる。An identification code associated with relevant information (unit information item) about the substance involved in the reaction is attached to the imaginary transition structure.
ここで、反応に関与する物質とは具体的に、出発物質
(反応式1においては酢酸エチル)、生成物質(酢酸)
および触媒(塩酸)を意味する。また、単位情報項目と
は、これらの物質の分子式、名称、重量、容量、モル
数、純度、物性(融点、沸点、比重等)、スペクトル情
報(可視、UV、IR、NMR、マススペクトル等)、立体化
学(R、S、シス、トランス等)、さらに生成物質の場
合には収率などを意味する。なお、触媒をITS中に記述
しない場合には単位情報項目に触媒を含ませることがで
きる。Here, the substances involved in the reaction include, specifically, a starting material (ethyl acetate in Reaction Scheme 1), a product (acetic acid)
And catalyst (hydrochloric acid). The unit information items are molecular formulas, names, weights, volumes, number of moles, purity, physical properties (melting point, boiling point, specific gravity, etc.), spectral information (visible, UV, IR, NMR, mass spectra, etc.) of these substances. , Stereochemistry (R, S, cis, trans, etc.) and, in the case of a product, yield and the like. If the catalyst is not described in the ITS, the unit information item can include the catalyst.
これらの単位情報項目のうちの少なくとも一つと対応づ
けられた識別符号が少なくとも一つ虚遷移構造に付され
る。At least one identification code associated with at least one of these unit information items is attached to the imaginary transition structure.
識別符号としては、ITS1に示したように、[−1]、
[+1]、[#1]などの記号が用いられる。ここで、
『−』は出発物質を、『+』は生成物質を、『#』は触
媒を意味し、二種以上の出発物質(または生成物質また
は触媒)について単位情報項目を対応づける場合には通
し番号が付される。As the identification code, as shown in ITS1, [-1],
Symbols such as [+1] and [# 1] are used. here,
"-" Means starting material, "+" means produced material, "#" means catalyst, and serial numbers are used when unit information items are associated with two or more starting materials (or produced materials or catalysts). Attached.
ただし、識別符号は上記の記号に限定されるものではな
く、虚遷移構造に表わされているノード、結合と混同が
生じずかつコンピュータが可読な限り任意の数値、アル
ファベット、その他の記号およびこれらの組合せを用い
ることができる。However, the identification code is not limited to the above-mentioned symbols, and any numerical value, alphabet, other symbols and these, as long as they are not confused with the node, the bond and the computer represented in the imaginary transition structure and are readable by the computer, Can be used.
識別符号は、ITS1に示したように、該物質中で反応の核
となるノード(酢酸エチルおよび酢酸におけるノード
(2)C、塩酸におけるノード(11)Cl)に附随させる
ことができる。あるいは反応の核となる結合に附随させ
てもよい。上記ITS1においてはたとえば、酢酸エチルで
あればノード(2)(3)間の 酢酸であればノード(2)(7)間の結合(…)、塩酸
であればノード(10)(11)間の にそれぞれ対応する識別符号を付すことができる。As shown in ITS1, the identification code can be attached to the node (node (2) C in ethyl acetate and acetic acid, node (11) Cl in hydrochloric acid) that becomes the nucleus of the reaction in the substance. Alternatively, it may be attached to a bond serving as a nucleus of the reaction. In the above-mentioned ITS1, for example, in the case of ethyl acetate, between nodes (2) and (3) For acetic acid, the bond (...) between nodes (2) and (7), and for hydrochloric acid, between nodes (10) and (11) It is possible to attach an identification code corresponding to each.
虚遷移構造中のノードまたは結合に識別符号を付すこと
により、単位情報項目との対応づけをより一層明確にす
ることができる。By assigning an identification code to a node or a bond in the imaginary transition structure, the correspondence with the unit information item can be further clarified.
あるいは識別符号は、以下に示すように、原系および生
成系を抽出する操作[それぞれ、『原系への投影』(pr
ojection to the starting stage、PSと略称する)、
『生成系への投影』(projection to the product stag
e、PPと略称する)]を行なうことにより得られる出発
物質および生成物質に付してもよい。この場合に、理解
しやすいようにPS操作により得られる物質には『−』お
よび『#』の識別符号を付し、PP操作により得られる物
質には『+』および『#』の識別符号を付すのが好まし
い。Alternatively, as the identification code, as shown below, the operation of extracting the original system and the generation system [respectively, "projection on original system" (pr
ojection to the starting stage, abbreviated as PS),
"Projection to the product stag"
e, abbreviated as PP)]]. In this case, for easy understanding, the substances obtained by the PS operation are marked with “−” and “#”, and the substances obtained by the PP operation are marked with “+” and “#”. It is preferable to attach it.
また、識別符号は、PS操作およびPP操作自体と対応づけ
られていてもよい。 Further, the identification code may be associated with the PS operation and the PP operation itself.
なお、PS操作は虚遷移構造(ITS1)から入結合(記号
…)を無視して出結合 を恒結合とみなす操作であり、PP操作はITS1から出結合
を無視して入結合を恒結合とみなす操作である。PS操作
およびPP操作の詳細については前記特願昭60-185386号
明細書に記載されている。In addition, the PS operation ignores the input coupling (symbols ...) from the imaginary transition structure (ITS1) Is an operation that regards a constant bond as a constant bond, and the PP operation is an operation that ignores an output bond from ITS1 and regards an incoming bond as a constant bond. Details of the PS operation and PP operation are described in the above-mentioned Japanese Patent Application No. 60-185386.
化学反応はまた、各ノード、該ノードに結合する結合相
手のノードおよび該ノード間の結合に関する情報を含む
結合表(connection table)として表わすことができ
る。A chemical reaction can also be represented as a connection table that contains information about each node, the node of the binding partner that binds to the node, and the binding between the nodes.
上記エステルの加水分解反応についての結合表を第2表
に示す。なお、結合表は各ノードの二次元座標(xy座
標)に関する情報をも包含している。The binding table for the hydrolysis reaction of the above ester is shown in Table 2. The connection table also includes information on the two-dimensional coordinates (xy coordinates) of each node.
第2表に示すように、結合表は加水分解反応に関与する
原系(酢酸エチル、水、塩酸)および生成系(酢酸、エ
タノール、塩酸)について、全てのノード、その二次元
座標(ノード(1)を原点にとってある)、各ノードに
結合する全てのノードおよびこれらノード間の結合の種
類がノード番号順に記載された一覧表である。 As shown in Table 2, the binding table shows all nodes and their two-dimensional coordinates (node (node (ethyl acetate, water, hydrochloric acid)) and production system (acetic acid, ethanol, hydrochloric acid) involved in the hydrolysis reaction. 1) is the origin), all nodes connected to each node, and types of connections between these nodes are listed in the order of node numbers.
また、本発明において結合表には、反応に関与する物質
についての単位情報項目と対応づけられている識別符号
が付される。第2表では、ノードに出発物質、生成物質
および触媒それぞれについての識別符号(−1、+1、
#1)が付されている。結合表に付す場合にも、前記と
同様に識別符号はこれらの記号に限定されるものではな
く、またノード以外の結合などに付すこともできる。Further, in the present invention, the binding table is provided with an identification code associated with the unit information item for the substance involved in the reaction. In Table 2, the identification code (-1, +1,
# 1) is attached. Also in the case of attaching to the connection table, the identification code is not limited to these symbols as in the above, and it can be attached to a connection other than the node.
上記のように反応の虚遷移構造に基づいて結合表を作成
することが可能であり、逆に結合表が各ノードの位置情
報を含んでいる場合には結合表から虚遷移構造を作成す
ることができる。換言すれば、虚遷移構造と結合表と
は、化学反応情報の登録および表示形態として表裏一体
の関係をなすものと言える。結合表には、上記のように
各ノードの位置座標等に関する入力情報が併記されてい
てもよい。As described above, it is possible to create a connection table based on the imaginary transition structure of the reaction, and conversely, if the connection table contains the position information of each node, create an imaginary transition structure from the connection table. You can In other words, it can be said that the imaginary transition structure and the binding table form a one-sided relationship as a registration and display form of chemical reaction information. In the connection table, as described above, the input information regarding the position coordinates and the like of each node may be written together.
次に、触媒の取扱いについて説明する。Next, the handling of the catalyst will be described.
触媒は、その作用上記大きく二種類に分類することがで
きる。第一は、上記酢酸エチルの加水分解反応(反応式
1)における塩酸のように、反応の前後(ITS1にPSおよ
びPP操作を施すことにより得られる)におけるHClは分
子種としては同一であるが、ノードに番号を付して区別
した場合にはそれぞれ別個のノードを含んでいる(ITS1
参照)場合である。化学的には同一であるために触媒と
みなされる。このように、分子種としては同一であるが
ノードの異なるものが原系および生成系の両方に現れる
場合に、この物質を第一種触媒と称する。The catalysts can be roughly classified into two types, which are the above-mentioned actions. First, HCl is the same as the molecular species before and after the reaction (obtained by subjecting ITS1 to PS and PP operations) like hydrochloric acid in the above-mentioned ethyl acetate hydrolysis reaction (Scheme 1). , If the nodes are numbered and distinguished, each node contains a separate node (ITS1
See). Since they are chemically the same, they are regarded as catalysts. In this way, when substances having the same molecular species but different nodes appear in both the original system and the production system, this substance is referred to as a first-class catalyst.
第二は、反応の前後において分子種およびノードとも同
一であり、ITSにおいては恒結合のみからなる独立の部
分構造して現れる。独立部分構造とは、ITSの他の部分
と全く結合関係を持たない一群のノードよりなる部分構
造をいう。このような恒結合で結ばれた独立部分構造
は、ITSにPSおよびPP操作を施した場合に原系および生
成系にもそのままの形で出現するため、触媒とみなすこ
とができる。これを、第二種触媒と称する。単一のノー
ドよりなる独立部分構造も第二種触媒に含まれる。Second, the molecular species and nodes are the same before and after the reaction, and they appear as independent substructures consisting of only constant bonds in ITS. An independent substructure is a substructure that consists of a group of nodes that have no connection with other parts of the ITS. Such an independent partial structure connected by a constant bond can be regarded as a catalyst because it appears as it is in the original system and the product system when the ITS is subjected to PS and PP operations. This is called a second type catalyst. An independent partial structure consisting of a single node is also included in the second type catalyst.
第二種触媒について、具体的にシクロヘキセンをパラジ
ウム触媒を用いて水素添加してシクロヘキサンを得る反
応を例に挙げて説明する。The second type catalyst will be specifically described by taking as an example the reaction of hydrogenating cyclohexene with a palladium catalyst to obtain cyclohexane.
この化学反応は、次のような反応式で表わされる。This chemical reaction is represented by the following reaction formula.
反応の虚遷移構造はたとえば以下のように表わすことが
できる。 The imaginary transition structure of the reaction can be represented as follows, for example.
ITS2に対応する結合表を第3表に示す。なお、第3表に
おいて表示座標は省略されている。 Table 3 shows the binding table corresponding to ITS2. The display coordinates are omitted in Table 3.
触媒Pdは、上記ITS2において独立部分構造[単一のノー
ド(9)]として現れる。ITS2にPSおよびPP操作を施す
と、以下に示す原系および生成系が得られる。 The catalyst Pd appears as an independent substructure [single node (9)] in ITS2. When PS and PP operations are performed on ITS2, the following original system and production system are obtained.
このように有色の結合(入結合および出結合)を含まな
い独立部分構造は触媒とみなす。独立部分構造であるか
否かは、たとえば結合表で結合関係をたどっていくこと
により判断、検出することができる。 Such independent substructures that do not contain colored bonds (in and out bonds) are considered catalysts. Whether or not the structure is an independent partial structure can be determined and detected, for example, by tracing the binding relationship in a binding table.
また、ITS2に付した識別符号[−1]と対応させて、原
系のシクロヘキセンに関する単位情報項目を格納するこ
とができ、[+1]と対応させて生成系のシクロヘキサ
ンに関する単位情報項目を格納することができる。同様
に、[#1]と対応させて触媒Pdの単位情報項目を格納
することができる。そして、ITS2で表わされた反応情報
の利用に際してはこれらの識別符号を介して単位情報項
目を得ることができる。Further, the unit information item relating to the cyclohexene of the original system can be stored in association with the identification code [-1] attached to ITS2, and the unit information item relating to cyclohexane of the producing system can be stored in association with [+1]. be able to. Similarly, the unit information item of the catalyst Pd can be stored in association with [# 1]. When using the reaction information represented by ITS2, the unit information item can be obtained through these identification codes.
上記反応における触媒の作用は、次のような二段階の素
反応に分解することにより容易に理解することができ
る。ここで、ノードの過不足を防ぐために反応式2に現
われる全てのノードを最初から取り上げることにする。The action of the catalyst in the above reaction can be easily understood by decomposing it into the following two-step elementary reaction. Here, in order to prevent excess and deficiency of nodes, all nodes appearing in the reaction formula 2 will be taken up from the beginning.
各素反応についてITS2-1およびITS2-2が得られる。ま
た、これらのITSに対応する結合表をまとめて第4表に
示す。 ITS2-1 and ITS2-2 are obtained for each elementary reaction. In addition, Table 4 summarizes the binding tables corresponding to these ITSs.
上記虚遷移構造および結合表から、触媒Pdは、ITS2-1お
よび2-2においては反応に関与しているが、全過程のITS
2においては独立ノードであることが明らかである。 From the above imaginary transition structure and binding table, the catalyst Pd is involved in the reaction in ITS2-1 and 2-2, but
In 2 it is clear that it is an independent node.
なお、ITS2は、図形上でITS2-1と2-2を重ね合わせるこ
とにより得ることができる。あるいは、結合表に(a,
b)で表わされたノード間の結合に次のような演算処理
を行なうことにより、結合関係としても得ることができ
る。Note that ITS2 can be obtained by superimposing ITS2-1 and 2-2 on the figure. Or in the binding table (a,
A connection relation can be obtained by performing the following arithmetic processing on the connection between the nodes shown in b).
各段階の反応における各ノード間の結合が、一対の数字
(aij k,bij k)[ただし、kは1≦k≦nの範囲の正整
数であり、nは全反応の総段階数を表わす2以上の正整
数であり、iおよびjはそれぞれノード番号を表わし、
aij kはk段階の反応の出発物質におけるノードiとj間
の結合の多重度を表わす整数であり、bij kはk段階の反
応におけるノードiとj間の結合の多重度の変化を表わ
す整数である]で表わされているとき、 aij 1m=aij 1 bij 1m=bij 1+bij 1+1+…+bij m-1+bij m [ただし、lおよびmはそれぞれ1≦l≦m≦nなる条
件を満足する正整数であり、iおよびjはそれぞれノー
ド番号を表わし、aij lmは1段階からm段階までの反応
の出発物質におけるノードiとj間の結合の多重度を表
わす整数であり、bij lmは1段階からm段階までの反応
におけるノードiとj間の結合の多重度の変化を表わす
整数である] なる演算を行なう。The connection between each node in the reaction of each step is a pair of numbers (a ij k , b ij k ) [k is a positive integer in the range of 1 ≦ k ≦ n, and n is the total number of steps of all reactions. Is a positive integer of 2 or more, i and j each represent a node number,
a ij k is an integer representing the bond multiplicity between the nodes i and j in the starting material of the k-step reaction, and b ij k is the change in the bond multiplicity between the nodes i and j in the k-step reaction. Is expressed as an integer] a ij 1m = a ij 1 b ij 1m = b ij 1 + b ij 1 + 1 + ... + b ij m-1 + b ij m [where l and m are respectively It is a positive integer satisfying the condition of 1 ≦ l ≦ m ≦ n, i and j each represent a node number, and a ij lm is a bond between the nodes i and j in the starting material of the reaction from the 1st stage to the mth stage. B ij lm is an integer representing the change in the multiplicity of the coupling between nodes i and j in the reaction from the 1st stage to the mth stage].
上記多段階反応のITSおよび結合表の詳細は、本出願人
による特願昭60-203690号明細書に記載されている。Details of the ITS and the binding table for the multistep reaction are described in Japanese Patent Application No. 60-203690 by the present applicant.
識別符号の付された結合表のコンピュータへの登録は、
コンピュータ内の主記憶装置に記録保存することにより
行なってもよいし、あるいは適当な記録媒体(磁気ディ
スク、光ディスク、磁気テープなど)を介して記録保存
してもよい。識別符号で対応づけられた単位情報項目も
同様にして別個に記録保存することができる。To register a binding table with an identification code on a computer,
It may be performed by recording and saving it in the main storage device in the computer, or may be recorded and saved via an appropriate recording medium (magnetic disk, optical disk, magnetic tape, etc.). Similarly, the unit information items associated with the identification code can be separately recorded and stored.
また、登録された結合表は識別符号を介して単位情報項
目と対応づけた後、単位情報項目と一緒に適当な記録装
置によりプレインペーパーなど各種の記録材料上に記録
したり、あるいはコンピュータや電子機器に接続したカ
ラーブラウン管などに表示(グラフィックディスプレ
イ)することができる。The registered binding table is associated with unit information items through identification codes, and then recorded together with the unit information items on various recording materials such as plain paper by a suitable recording device, or a computer or electronic device. It can be displayed on a color CRT connected to the device (graphic display).
以下に、本発明を実施例を用いて更に説明する。The present invention will be further described below with reference to examples.
[実施例1]ナフタレンの臭素化反応 ナフタレンを臭素化して1−ブロモナフタレンを得る反
応において、出発物質としてナフタレン512gおよび臭素
707gを用いて1−ブロモナフタレン600〜620g(収率72
〜75%、基準:ナフタレン)が得られる。[Example 1] Bromination reaction of naphthalene In the reaction of brominating naphthalene to obtain 1-bromonaphthalene, 512 g of naphthalene and bromine were used as starting materials.
Using 707 g, 600-620 g of 1-bromonaphthalene (yield 72
~ 75%, standard: naphthalene) is obtained.
この反応の虚遷移構造を以下のように表わした。The imaginary transition structure of this reaction is represented as follows.
ITS3に示すように、3つの識別符号[−1]、[−2]
および[+1]をノードに付した。一方出発物質につい
ての単位情報項目として、ナフタレンの重量512gに識別
符号[−1]を、臭素の重量707gに識別符号[−2]
を、生成物質についての二つの単位情報項目として1−
ブロモナフタレンの重量および収率に識別符号[+1]
を付した。これにより、識別符号[−1]、[−2]お
よび[+1]を介してITSの情報と各単位情報項目とが
対応づけられた。 As shown in ITS3, three identification codes [-1], [-2]
And [+1] to the node. On the other hand, as a unit information item for the starting material, the identification code [-1] is assigned to the weight 512 g of naphthalene and the identification code [-2] is assigned to the weight 707 g of bromine.
As the two unit information items for the product
Identification code [+1] for the weight and yield of bromonaphthalene
Attached. As a result, the ITS information and each unit information item are associated with each other through the identification codes [-1], [-2], and [+1].
また、ITS1にPS操作を施すことにより、原系を得た。Moreover, the original strain was obtained by performing PS operation on ITS1.
識別符号[−1]を介して、出発物質であるナフタレン
の構造式と上記単位情報項目とが対応づけられた。ま
た、識別符号[−2]を介して、出発物質である臭素の
構造式と上記単位情報項目とが対応づけられた。 The structural formula of naphthalene as a starting material was associated with the above unit information item through the identification code [-1]. In addition, the structural formula of bromine, which is a starting material, and the unit information item are associated with each other through the identification code [-2].
ITS1にPP操作を施すことにより、生成系を得た。なお、
理解しやすくするためにプラスの識別符号のみを残し
た。The PP system was applied to ITS1 to obtain the generation system. In addition,
Only the positive identification code is left for clarity.
識別符号[+1]を介して、生成物質の構造式と上記単
位情報項目とが対応づけられた。 The structural formula of the product and the unit information item were associated with each other via the identification code [+1].
[実施例2] 実施例1のITS3を結合表により表わした。得られた結果
を第5表に示す。識別符号と単位情報項目との対応は実
施例1と同じである。なお、第5表において表示座標は
省略されている。[Example 2] ITS3 of Example 1 was represented by a binding table. The results obtained are shown in Table 5. The correspondence between the identification code and the unit information item is the same as that in the first embodiment. The display coordinates are omitted in Table 5.
[実施例3]ベンゼンのフリーデルクラフツ反応 この化学反応は、次のように表わされる。 Example 3 Friedel-Crafts Reaction of Benzene This chemical reaction is represented as follows.
この反応の虚遷移構造を以下のように表わした。 The imaginary transition structure of this reaction is represented as follows.
また、ITS4に対応する結合表を作成した。なお、第6表
において表示座標は省略されている。 In addition, we created a connection table for ITS4. The display coordinates are omitted in Table 6.
ITS4および結合表から、Al Cl3は独立部分構造でありか
つ有色の結合を含まないので触媒として検出された。ま
た、ITS4および結合表に付された識別符号[−1]、
[−2]、[+1]および[#1]はそれぞれ相応する
単位情報項目と対応づけられた。 From ITS4 and binding table, Al Cl 3 was detected as a catalyst does not include a bond is and colored independent partial structures. Also, the identification code [-1] attached to the ITS4 and the connection table,
[-2], [+1] and [# 1] are respectively associated with corresponding unit information items.
Claims (6)
一つの生成物質を生ずる化学反応の出発物質の構造と生
成物質の構造とをトポロジカルに重ねあわせ、(1)出
発物質および生成物質に共通して存在するノード間の結
合、(2)出発物質のみに存在するノード間の結合およ
び(3)生成物質のみに存在するノード間の結合をそれ
ぞれ区別して表わす結合表を作成し、該化学反応に関与
する物質の物質名、分子式、重量、容量、モル数、純
度、物性値、スペクトル情報、立体化学および収率から
なる群より選ばれる関連情報に対応づけられている少な
くとも一つの識別符号をこの結合表に付す工程; 得られた結合表を、コンピュータに付設された記録媒体
に記録保存する工程; そして 上記の記録保存された結合表中のノード間の結合と識別
符号とを利用してコンピュータでの処理を行なうことに
より、化学反応の情報と共に上記関連情報を検索する工
程; を含む化学反応情報の記録・検索方法。1. A structure in which a starting material and a structure of a starting material in a chemical reaction for producing at least one starting material from at least one starting material are topologically overlapped with each other, and (1) common to both the starting material and the starting material. Which is involved in the chemical reaction by creating a bond table that distinguishes the bond between the nodes, (2) the bond between the nodes existing only in the starting material, and (3) the bond between the nodes existing only in the generated material. At least one identification code associated with relevant information selected from the group consisting of substance name, molecular formula, weight, volume, number of moles, purity, physical property value, spectral information, stereochemistry and yield A step of recording and storing the obtained connection table in a recording medium attached to a computer; and a connection between the nodes in the above-mentioned recorded and stored connection table. By performing the process in the computer by using a different code, the step of searching for the related information together with the information of the chemical reaction; recording and search for basic reactions information including.
字(a,b)[ただし、aは出発物質における結合多重度
を表わす整数であり、bは化学反応における結合多重度
の変化を表わす整数である]によって区別して表わす特
許請求の範囲第1項記載の化学反応情報の記録・検索方
法。2. The bond between nodes in the bond table is a pair of numbers (a, b) [where a is an integer representing the bond multiplicity in the starting material and b is the change in bond multiplicity in a chemical reaction. The method for recording and retrieving chemical reaction information according to claim 1, wherein the chemical reaction information is recorded and retrieved.
び生成物質からなる群より選ばれる少なくとも1つの物
質についての関連情報に対応するものである特許請求の
範囲第1項記載の化学反応情報の記録・検索方法。3. The chemical reaction information according to claim 1, wherein the identification code corresponds to relevant information about at least one substance selected from the group consisting of a starting substance and a producing substance of a chemical reaction. How to record and search.
質から少なくとも一つの生成物質を生ずる化学反応の出
発物質の構造と生成物質の構造とをトポロジカルに重ね
あわせ、(1)出発物質および生成物質に共通して存在
するノード間の結合、(2)出発物質のみに存在するノ
ード間の結合および(3)生成物質のみに存在するノー
ド間の結合をそれぞれ区別して表わし、さらに触媒を独
立のノードとして表わす結合表を作成し、該化学反応に
関与する物質の物質名、分子式、重量、容量、モル数、
純度、物性値、スペクトル情報、立体化学および収率か
らなる群より選ばれる関連情報に対応づけられている少
なくとも一つ識別符号をこの結合表に付す工程; 得られた結合表を、コンピュータに付設された記録媒体
に記録保存する工程; そして 上記の記録保存された結合表中のノード間の結合、触媒
のノードそして識別符号を利用してコンピュータでの処
理を行なうことにより、化学反応の情報と共に上記関連
情報を検索する工程; を含む化学反応情報の記録・検索方法。4. A structure of a starting material and a structure of a product of a chemical reaction for producing at least one product from at least one starting material under the participation of a catalyst are topologically superposed, and (1) the starting material and the product are formed. The bonds between the nodes that are commonly present in the substances, (2) the bonds between the nodes that are present only in the starting substance, and (3) the bonds between the nodes that are present only in the produced substance are shown separately, and the catalyst is independent. A bond table represented as a node is created, and the substance name, molecular formula, weight, capacity, number of moles of substances involved in the chemical reaction,
Attaching at least one identification code associated with relevant information selected from the group consisting of purity, physical property value, spectral information, stereochemistry and yield to this binding table; attaching the obtained binding table to a computer A step of recording and storing in a recorded recording medium; and by performing a computer process using the connection between the nodes in the above-mentioned recorded and stored connection table, the node of the catalyst and the identification code, the information of the chemical reaction is obtained. A method for recording / retrieving chemical reaction information, including the step of retrieving the related information.
字(a,b)[ただし、aは出発物質における結合多重度
を表わす整数であり、bは化学反応における結合多重度
の変化を表わす整数である]によって区別して表わす特
許請求の範囲第4項記載の化学反応情報の記録・検索方
法。5. A pair of numbers (a, b) [where a is an integer representing the bond multiplicity in the starting material and b is the change in the bond multiplicity in a chemical reaction] The method for recording and retrieving chemical reaction information according to claim 4, wherein the chemical reaction information is recorded and retrieved.
成物質および触媒からなる群より選ばれる少なくとも1
つの物質についての関連情報に対応するものである特許
請求の範囲第4項記載の化学反応情報の記録・検索方
法。6. The identification code is at least one selected from the group consisting of a starting material of a chemical reaction, a product and a catalyst.
The method for recording and retrieving chemical reaction information according to claim 4, which corresponds to related information on two substances.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP62030854A JPH0740270B2 (en) | 1987-02-12 | 1987-02-12 | Recording / searching method for chemical reaction information |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP62030854A JPH0740270B2 (en) | 1987-02-12 | 1987-02-12 | Recording / searching method for chemical reaction information |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPS63197223A JPS63197223A (en) | 1988-08-16 |
| JPH0740270B2 true JPH0740270B2 (en) | 1995-05-01 |
Family
ID=12315298
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP62030854A Expired - Fee Related JPH0740270B2 (en) | 1987-02-12 | 1987-02-12 | Recording / searching method for chemical reaction information |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPH0740270B2 (en) |
-
1987
- 1987-02-12 JP JP62030854A patent/JPH0740270B2/en not_active Expired - Fee Related
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| JournalofChemicalInformationandComputerSciencesvol.26,no.4,1986,P.205−242 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JPS63197223A (en) | 1988-08-16 |
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