NOD2とは？わかりやすく解説

NOD2
PDBに登録されている構造
PDB	オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧
	5IRL, 5IRM, 5IRN
識別子
記号	NOD2, ACUG, BLAU, CARD15, CD, CLR16.3, IBD1, NLRC2, NOD2B, PSORAS1, nucleotide binding oligomerization domain containing 2, BLAUS, YAOS
外部ID	OMIM: 605956 MGI: 2429397 HomoloGene: 11156 GeneCards: NOD2
遺伝子の位置 (ヒト)
染色体	16番染色体 (ヒト)
終点	50,734,041 bp
遺伝子の位置 (マウス)
染色体	8番染色体 (マウス)
終点	89,415,102 bp
RNA発現パターン
	さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	• Hsp90タンパク質結合; • ヌクレオチド結合; • Hsp70タンパク質結合; • 血漿タンパク結合; • peptidoglycan binding; • 酵素結合; • actin binding; • CARD domain binding; • ATP binding; • プロテインキナーゼ結合; • muramyl dipeptide binding; • protein-containing complex binding;
細胞の構成要素	• 細胞質; • 細胞質基質; • 小胞; • 膜; • 細胞膜; • cell surface; • basolateral plasma membrane; • COP9シグナロソーム; • 細胞骨格; • ゴルジ体; • ミトコンドリア; • 高分子複合体;
生物学的プロセス	• positive regulation of prostaglandin-endoperoxide synthase activity; • regulation of apoptotic process; • 防衛反応; • detection of biotic stimulus; • cytokine production involved in immune response; • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • intracellular signal transduction; • detection of muramyl dipeptide; • positive regulation of interleukin-10 production; • positive regulation of epithelial cell proliferation; • 免疫系プロセス; • positive regulation of oxidoreductase activity; • response to muramyl dipeptide; • positive regulation of prostaglandin-E synthase activity; • positive regulation of JNK cascade; • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity; • positive regulation of gamma-delta T cell activation; • cellular response to muramyl dipeptide; • JNK cascade; • negative regulation of macrophage apoptotic process; • positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation; • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway; • maintenance of gastrointestinal epithelium; • defense response to bacterium; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of interleukin-8 production; • detection of bacterium; • positive regulation of interleukin-1 beta production; • regulation of inflammatory response; • positive regulation of interleukin-6 production; • protein complex oligomerization; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of B cell activation; • positive regulation of interleukin-17 production; • positive regulation of type 2 immune response; • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway; • positive regulation of stress-activated MAPK cascade; • positive regulation of Notch signaling pathway; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to organic cyclic compound; • positive regulation of cell population proliferation; • 自然免疫; • response to nutrient; • positive regulation of dendritic cell cytokine production; • positive regulation of protein K63-linked ubiquitination; • cellular response to peptidoglycan; • positive regulation of MAP kinase activity; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • cellular response to lipopolysaccharide;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	64127
	257632
	ENSG00000167207
	ENSMUSG00000055994
	Q9HC29,E9PK30
	Q80SY9
	NM_001293557; NM_022162; NM_001370466
	NM_145857
	NP_001280486; NP_071445; NP_001357395
	NP_665856
	ウィキデータ
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NOD2（nucleotide binding oligomerization domain containing 2）、もしくはCARD15（caspase recruitment domain-containing protein 15）、IBD1（inflammatory bowel disease protein 1）は、ヒトでは16番染色体（英語版）上に位置するNOD2遺伝子によってコードされているタンパク質である^[5]^[6]。NOD2は免疫系において重要な役割を果たしており、細菌の分子（ペプチドグリカン）を認識して免疫反応を刺激する^[7]。

NOD2は細胞内パターン認識受容体であり、構造面では植物の抵抗性タンパク質（英語版）と類似している。NOD2は、特定の細菌にみられるムラミルジペプチド（MDP）と呼ばれる構造を持つ分子を認識する^[8]。

構造と機能

NOD2タンパク質構造のモデル。N末端から2つのCARD（赤）、ヘリカルリンカー（青）、NODドメイン（緑）、LRRドメイン（シアン）と続く^[9]。

NOD2はNOD1（英語版）/Apaf-1ファミリーの一員である。主に末梢血白血球に発現しており、MDP構造を有する細菌分子の認識とNF-κBの活性化によって免疫応答に関与している^[10]。

NOD2タンパク質のC末端部分にはロイシンリッチリピート（LRR）が存在し、タンパク質間相互作用に関与していることが知られている。中間部はNODドメインによって特徴づけられ、タンパク質の自己重合に関与している。N末端部分には2つのCARD（英語版）が存在し、アポトーシスやNF-κB活性化経路に関与していることが知られている^[11]。

臨床的意義

NOD2遺伝子の変異は、クローン病、ブラウ症候群（英語版）、肺サルコイドーシス、移植片対宿主病など重篤な自己免疫疾患と関連している^[9]^[12]^[13]^[14]^[15]。

NOD2の機能喪失変異は、PD-1/PD-L1免疫チェックポイント遮断によるがん治療に対してのより良好な応答と関連している^[16]。

相互作用

NOD2はNLRC4と相互作用することが示されている^[17]^[18]。

一本鎖RNAやウイルスRNA処理に対する応答して、NOD2はMAVSに結合してインターフェロン応答を活性化することが示されている。このことはNOD2がウイルスに対するパターン認識受容体として作用していることを示している^[19]。

出典

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000167207 - Ensembl, May 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000055994 - Ensembl, May 2017
^ Human PubMed Reference:
^ Mouse PubMed Reference:
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