JP6270742B2 - 架橋型核酸誘導体の製造方法 - Google Patents
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Description
(1)一般式(I)で表される化合物を塩基の存在下でアルドール反応に付する以下に示す工程:
(式中、R1及びR2は、同一または異なって、水素原子、核酸合成のアミノ基の保護基、アルキル基、アルケニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基、アシル基、シリル基、リン酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸基、−P(R7)R8[式中、R7およびR8は、同一または異なって、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1〜5のアルコキシ基、炭素数1〜5のアルキルチオ基、炭素数1〜6のシアノアルコキシ基、または、炭素数1〜5のアルキル基で置換されたアミノ基を示す];
R3は、水素原子、核酸合成の水酸基の保護基、アルキル基、アルケニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基、アシル基、シリル基、リン酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸基、−P(R9)R10[式中、R9およびR10は、同一または異なって、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1〜5のアルコキシ基、炭素数1〜5のアルキルチオ基、炭素数1〜6のシアノアルコキシ基、または、炭素数1〜5のアルキル基で置換されたアミノ基を示す];
R4は、水素原子、水酸基、または、炭素数1〜5のアルコキシ基;
R5及びR6は、同一または異なって、水素原子、炭素数1〜5のアルキル基、またはアリール基;
Bは、置換基を有していてもよい核酸塩基部分)
を含む、一般式(II)で表される化合物の製造方法、
(2)一般式(I)で表される化合物を塩基の存在下で式:R5C(=O)R6で表される化合物と反応させる以下に示す工程:
(3)前記塩基が、共役酸のpKaが6〜10のものである前記(1)または(2)記載の製造方法、
(4)前記塩基が、トリエチルアミン、またはN−メチルモルホリンである前記(3)記載の製造方法、
(5)前記(1)〜(4)のいずれかに記載の方法により一般式(II)で表される化合物を得た後、R4が、水素原子である場合、得られた一般式(II)で表される化合物を酸化反応に付する以下の工程:
(6)R1およびR2のいずれか一方が核酸合成のアミノ基の保護基であり、その他方が水素原子またはアルキル基である前記(1)〜(5)のいずれかに記載の製造方法、
(7)R3が核酸合成の水酸基の保護基である前記(1)〜(6)のいずれかに記載の製造方法、
(8)R4が水素原子である前記(1)〜(7)のいずれかに記載の製造方法、
(9)R5およびR6がいずれも水素原子である前記(1)〜(8)のいずれかに記載の製造方法、
(10)Bが置換基を有していてもよい、ピリミジン核酸塩基もしくはプリン核酸塩基である前記(1)〜(9)のいずれかに記載の製造方法、
(11)下記一般式(III)で表される化合物およびその塩
(12)一般式(III)で表される化合物を脱シリル化剤と反応させ、その反応液に縮合剤を反応させる以下に示す工程:
を含む、一般式(IV)で表される化合物の製造方法、
(13)前記(12)に記載の方法により一般式(IV)で表される化合物を得た後、得られた一般式(IV)で表される化合物に、核酸合成の水酸基の保護に使用する試薬を反応させる以下に示す工程:
を含む、一般式(V)で表される化合物の製造方法、
(14)下記一般式(V)で表される化合物およびその塩、
(15)下記一般式(VI)で表される化合物をトランスグリコシル化反応に付する以下に示す工程:
を含む、一般式(VII)で表される化合物の製造方法、
(16)下記一般式(VII)で表される化合物およびその塩、
(17)下記一般式(VIII)で表される化合物をアルキルアミンと反応させる以下に示す工程:
を含む、一般式(IX)で表される化合物の製造方法、
(18)下記一般式(X)で表される化合物をN−グリコシル化反応に付する以下に示す工程:
を含む、一般式(XI)で表される化合物の製造方法、および
(19)下記一般式(XII)で表される化合物を分子内環化反応に付する以下に示す工程:
に関する。
α群:水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、炭素数1〜5のアルコキシ基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1〜5のアルキルチオ基、アミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、炭素数1〜5のアルキル基で置換されたアミノ基、炭素数1〜5のアルキル基、および、ハロゲン原子。
1)4,4’−ジメトキシトリチル基の場合:ピリジン、DABCO(1,4−ジアザビシクロ[2.2.2]オクタン)、トリエチルアミン、ジイソプロピルエチルアミン等の塩基存在下、4,4’−ジメトキシトリチルクロリドあるいは4,4’−ジメトキシトリチルトリフルオロメタンスルホナート、
2)トリチル基の場合:ピリジン、DABCO(1,4−ジアザビシクロ[2.2.2]オクタン)、トリエチルアミン、ジイソプロピルエチルアミン等の塩基存在下、トリチルクロリドあるいはトリチルトリフルオロメタンスルホナート、
3)tert-ブチルジメチルシリル基の場合:イミダゾール、N−メチルイミダゾール、4,4−ジメチルアミノピリジン、トリエチルアミン等の塩基存在下、tert-ブチルジメチルシリルクロリドあるいはtert-ブチルジメチルシリルトリフルオロメタンスルホナート
4)tert-ブチルジフェニルシリル基の場合;イミダゾール、N−メチルイミダゾール、4,4−ジメチルアミノピリジン、トリエチルアミン等の塩基存在下、tert-ブチルジメチルシリルクロリドあるいはtert-ブチルジフェニルシリルトリフルオロメタンスルホナート
5)ベンゾイル基の場合;i) ピリジン、トリエチルアミン、炭酸カリウム等の塩基存在下、ベンゾイルクロリド、安息香酸無水物 ii)トリエチルアミン、N−メチルモルホリン等の塩基およびEDC(1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド)塩酸塩、DCC(N,N’−ジシクロヘキシルカルボジイミド)等の縮合剤存在下、安息香酸
6)レブノイル基の場合;4−ジメチルアミノピリジン、トリエチルアミン等の塩基およびEDC塩酸塩、DCC等の縮合剤存在下、レブリン酸
7)2−エトキシエチル基の場合:ピリジウムパラトルエンスルホン酸、トルエンスルホン酸等の酸触媒存在下、エトキシビニルエーテルが該当する。
本工程は、一般式(A−1)で表わされる化合物にR3−Hal(式中、Halはハロゲン)、(R3)2O等を反応させることにより、3’位水酸基がR3−で保護された一般式(A−2)で表わされる化合物を得る工程である。本工程は、Protective Groups in Organic Synthesis,Theodora W Green(John Wiley & Sons)等に記載の方法に従って行うことができる。例えば、一般式A−1で表わされる化合物を、DMF、アセトニトリル、ジクロロメタン等の溶媒中、1.0当量〜10.0当量、好ましくは3.0当量〜6.0当量のR3−Hal(式中、Halはハロゲン)、1.0当量〜10.0当量、好ましくは3.0当量〜6.0当量の有機塩基(例えば、N−メチルイミダゾール等)または無機塩基(例えば、水素化ナトリウム、炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、炭酸セシウム等)および1.0当量〜10.0当量、好ましくは2.0当量〜4.0当量のヨウ化ナトリウムなどの添加剤と、0℃〜120℃、好ましくは10℃〜30℃で1〜24時間反応させることにより一般式(A−2)で表わされる化合物を得ることができる。
本工程は、一般式(A−2)で表わされる化合物に塩酸などの強酸等を反応させることにより、4’位に結合する水酸基の保護基P1が脱保護された化合物A−3を得る工程である。本工程は、Protective Groups in Organic Synthesis,Theodora W Green(John Wiley & Sons)等に記載の方法に従って行うことができる。例えば、一般式A−2で表わされる化合物を、メタノール、エタノール、酢酸エチル、ジオキサン等の溶媒中、1.0当量〜10.0当量、好ましくは2.0当量〜4.0当量の強酸(塩酸、硫酸等の水溶液、パラトルエンスルホン酸等の有機酸等)と、0℃〜100℃、好ましくは20℃〜30℃で0.5〜24時間反応させることにより一般式(A−3)で表わされる化合物を得ることができる。
本工程は、一般式(A−3)で表わされる化合物に(R2)2O、R2−Hal(式中、Halはハロゲン)等を反応させることにより、アミノ基がR2−で保護された化合物A−4を得る工程である。本工程は、Protective Groups in Organic Synthesis,Theodora W Green(John Wiley & Sons)等に記載の方法に従って行うことができる。例えば、一般式A−3で表わされる化合物を、テトラヒドロフラン、ジクロロメタン、アセトニトリル、DMF等の溶媒中、または水−テトラヒドロフラン、水−トルエン等の混合溶媒中、1.0当量〜5.0当量、好ましくは2.0当量〜4.0当量の(R2)2Oおよび1.0当量〜5.0当量、好ましくは2.0当量〜4.0当量の有機塩基(例えば、ピリジン等)または無機塩基(例えば、水素化ナトリウム、水酸化ナトリウム、炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、炭酸セシウム、炭酸水素ナトリウム等)と、−20℃〜50℃、好ましくは0℃〜30℃で0.5〜24時間反応させることにより一般式(A−4)で表わされる化合物を得ることができる。
本工程は、一般式(A−4)で表わされる化合物の4’位に結合する水酸基を酸化して、カルボニル基を有する化合物(A−5)を得る工程である。本工程は、実験化学講座第5版17巻(山善)等に記載の方法に従って行うことができる。例えば、一般式A−4で表わされる化合物を、DMSO等の溶媒中、1.0当量〜5.0当量、好ましくは2.0当量〜4.0当量のEDCおよび1.0当量〜3.0当量、好ましくは1.0当量〜2.0当量の有機酸(例えば、パラトルエンスルホン酸ピリジニウム等)と、0℃〜50℃、好ましくは10℃〜30℃で0.5〜24時間反応させることにより一般式(A−5)で表わされる化合物を得ることができる。
上記の方法で得た一般式(A−5)で表わされる化合物については以下のアルドール反応を行う。
上記の方法で得た一般式(A−6)で表わされる化合物のR4が水素原子である場合には、以下の酸化反応を行う。
上記の方法で得た一般式(A−6)(ただし、R4が水酸基である場合に限る)もしくは(A−7)で表わされる化合物から一般式(A−12)で表されるアミダイト化合物は、下記の製法により得ることができる。
本工程は、一般式(A−7)で表わされる化合物のアミノ基に置換する保護基R2を脱保護して化合物A−8を得る工程である。本工程は、Protective Groups in Organic Synthesis,Theodora W Green(John Wiley & Sons)等に記載の方法に従って行うことができる。
本工程は、一般式(A−8)で表わされる化合物から、2’位と4’位がアミド結合で環化した一般式(A−9)で表わされる化合物を得る工程である。N,N’−ジメチルホルムアミド、アセトニトリル等の溶媒中、またはそれらの混合溶媒中、1.0当量〜5当量、好ましくは1.0当量〜1.5当量のDCC、EDC、CDI(カルボニルジイミダゾール)等の縮合剤を加え(あるいはそれらの縮合剤にHOBt、HOSu等を添加し)、−20℃〜120℃、好ましくは0℃〜80℃で0.5時間〜24時間反応させることにより一般式(A−9)で表わされる化合物を得ることができる。
本工程は、一般式(A−9)で表わされる化合物の5’位水酸基を保護基P2(例えば4,4’‐ジメトキシトリチル基)で保護された一般式(A−10)で表わされる化合物を得る工程である。本工程は、Protective Groups in Organic Synthesis,Theodora W Green(John Wiley & Sons)等に記載の方法に従って行うことができる。
本工程は、一般式(A−10)で表わされる化合物の3’位に結合する水酸基の保護基R3が脱保護された一般式(A−11)で表わされる化合物を得る工程である。本工程は、Protective Groups in Organic Synthesis,Theodora W Green(John Wiley & Sons)等に記載の方法に従って行うことができる。
本工程は、一般式(A−11)で表わされる化合物に対して、アミダイト化試薬を反応させることにより、3’位水酸基がアミダイト化された一般式(A−12)で表わされる化合物を得る工程である。一般式(A−11)で表わされる化合物をアセトニトリル、ジクロロメタン、テトラヒドロフラン等の溶媒中、またはそれらの混合溶媒中、ジイソプロピルエチルアミン、トリエチルアミン等の塩基の存在下で、2−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルクロロホスホロアミダイトあるいはテトラゾール、ジシアノイミダゾール等の酸存在下で2−シアノエチル−N,N,N’,N’−テトライソプロピルホスフォロアミダイトを加え、0℃〜60℃で、1時間〜24時間反応させることにより、一般式(A−12)を得ることができる。
4種アミダイトの一般的製法(1)の別法として、一般式(A−9)から一般式(A−10−2)を経由して、一般式(A−11)を得ることが出来る
本工程は、一般式(A−9)で表わされる化合物の3’位に結合する水酸基の保護基R3が脱保護された一般式(A−10−2)で表わされる化合物を得る工程である。4種アミダイトの一般的製法(1)の第3工程(A−10からA−11の工程)と同様な方法で、一般式(A−10−2)で表わされる化合物を得ることができる。
なお、核酸塩基がアデニン(A)、グアニン(G)、シトシン(C)の場合でそのアミノ基が無保護の場合は、塩基存在下、TMSクロリド、 TBSクロリドなどのシリル化剤でシリル化し、ベンゾイルクロリド、フェノキシアセチルクロリド、各種酸無水物などのアシル化剤あるいは1,1−ジメトキシーN,N‘−ジメチルメタンアミン等のイミノ化剤を−20℃〜120℃、好ましくは0℃〜50℃で0.5時間〜24時間反応させた後、酸処理あるいは脱シリル化剤と反応させることにより、核酸塩基のアミノ基が保護された一般式(A−10−2)で表わされる化合物を得ることができる。
本工程は、一般式(A−10−2)で表わされる化合物の5’位水酸基を保護基R7(通常は4,4’‐ジメトキシトリチル基)で保護した一般式(A−11)で表わされる化合物を得る工程である。4種アミダイトの一般的製法(1)の第2工程(A−9からA−10の工程)と同様な方法で、一般式(A−11)で表わされる化合物を得ることができる。
4種アミダイトの一般的製法(1)の別法として、一般式(A−7)から一般式(A−11)は以下の工程によっても得ることができる。
本工程は、一般式(A−7)で表わされる化合物から、2’位と3’位の保護基を除去して一般式(A−13)で表わされる化合物を得る工程である。2’位の保護基がトリフルオロアセチル基の場合、テトラヒドロフラン、メタノール、アセトニトリル,ピリジン等の溶媒中、またはそれらの混合溶媒中、1.0当量〜5当量、好ましくは1.0当量〜3.0当量のTBAF(テトラブチルアンモニウムフロリド)、フッ化水素トリエチルアミン錯体、フッ化アンモニウム等の脱シリル化剤を加え、0℃〜100℃、好ましくは25℃〜80℃で0.5時間〜24時間反応させることにより一般式(A−13)で表わされる化合物を得ることができる。脱シリル化剤では通常除去されないトリフルオロアセチル基が除去される一方で、ベンゾイル基など核酸塩基の保護基が除去されないことが本反応の特徴であり、架橋型核酸誘導体の合成工程数、収率の向上を可能にする方法である。
また、別法としてR2がトリフルオロアセチル基を含むアシル系保護基あるいはカーバメート系保護基の場合、メタノール、エタノール、1,4−ジオキサン、テトラヒドロフラン等の溶媒中、またはそれらの混合溶媒中、0.1規定〜10規定のアルカリ溶液(水酸化ナトリウム水溶液、水酸化カリウム−メタノール溶液等)と、0℃〜100℃、好ましくは20℃〜30℃で0.1〜24時間反応することにより2’位の保護基を除去した後、TBAF等で脱シリル化することにより、一般式(A−13)で表わされる化合物を得ることができる。
R2が第3ブチルオキシカルボニル基(BOC基)の場合、メタノール、エタノール、1,4−ジオキサン、テトラヒドロフラン等の溶媒中、あるいは無溶媒で、トリフルオロ酢酸あるいは塩化水素等の酸と−20℃〜100℃、好ましくは20℃〜30℃で0.1〜24時間反応することにより2’位の保護基を除去した後、TBAF等で脱シリル化することにより、一般式(A−13)で表わされる化合物を得ることができる。
R2がベンジル系の保護基(CBz基、Bn基、MPM基等)の場合は、メタノール、テトラヒドロフラン、エタノール、ジオキサン、トルエン等の溶媒中、またはそれらの混合溶媒中、パラジウム−炭素粉末や水酸化パラジウム−炭素粉末を加え、水素気流下、0℃〜40℃で、1時間〜24時間反応させることにより、2’位の保護基を除去した後、TBAF等で脱シリル化することにより、一般式(A−13)で表わされる化合物を得ることができる。
本工程は、一般式(A−13)で表わされる化合物から、2’位と4’位がアミド結合で環化した一般式(A−14)で表わされる化合物を得る工程である。N,N’−ジメチルホルムアミド、テトラヒドロフラン、アセトニトリル等の溶媒中、またはそれらの混合溶媒中、1.0当量〜10当量、好ましくは1.0当量〜3当量のDCC、EDC、CDI(カルボニルジイミダゾール)等の縮合剤を加え(あるいはそれらの縮合剤にHOBt、HOSu等を添加し)、−20℃〜120℃、好ましくは25℃〜80℃で0.5時間〜24時間反応させることにより一般式(A−14)で表わされる化合物を得ることができる。
なお,核酸塩基がアデニン(A)、グアニン(G)、シトシン(C)で、そのアミノ基が無保護の場合は、塩基存在下、TMSクロリド、 TBSクロリドなどのシリル化剤でシリル化し、ベンゾイルクロリド、フェノキシアセチルクロリド、各種酸無水物などのアシル化剤あるいは1,1−ジメトキシーN,N‘−ジメチルメタンアミン等のイミノ化剤を−20℃〜120℃、好ましくは0℃〜50℃で0.5時間〜24時間反応させた後、酸処理あるいは脱シリル化剤と反応させることにより、核酸塩基のアミノ基が保護された一般式(A−14)で表わされる化合物を得ることができる。
本工程は、一般式(A−14)で表わされる化合物の5’位水酸基を保護基R7(例えば、4,4’‐ジメトキシトリチル基)で保護された一般式(A−11)で表わされる化合物を得る工程である。本工程は、Protective Groups in Organic Synthesis,Theodora W Green(John Wiley & Sons)等に記載の方法に従って行うことができる。
一般式(A−14)で表わされる化合物をピリジン、DABCO(1,4−ジアザビシクロ[2.2.2]オクタン)、トリエチルアミン、ジイソプロピルエチルアミン等の塩基存在下、ジクロロメタン、トルエン、テトラヒドロフラン等の溶媒中、あるいはピリジン溶媒中、1.0当量〜5当量、好ましくは1.0当量〜3当量の4,4’−ジメトキシトリチルクロリドを加え、0℃〜80℃、好ましくは20℃〜30℃で、0.5時間〜24時間反応させることによりR7が4,4’−ジメトキシトリチル基である一般式(A―11)で表わされる化合物を得ることができる。
なお、第1工程〜第3工程は反応溶媒を適切に選択することにより、1ポットで実施することも可能である。
一般式(A−7)において、Bがチミン(T)あるいはその誘導体である場合には、トランスグリコシル化反応によって、アデニン(A)、グアニン(G)、シトシン(C)あるいはこれらの誘導体に変換することができる。具体的には、1,2−ジクロロエタン、トルエン、アセトニトリル、CPME(シクロペンチルメチルエーテル)等の溶媒中、またはそれらの混合溶媒中、BSA(N,O−ビス(トリメチルシリル)アセトアミド)、アデニン、グアニン、あるいはこれらの誘導体、TMSOTf、BF3OEt2等のルイス酸を加え、0℃〜120℃、好ましくは50℃〜80℃で0.1〜24時間反応することにより、Bがアデニン(A)、グアニン(G)、シトシン(C)あるいはこれらの誘導体の一般式(A−7)で表わされる化合物を得ることができる。
一般式(A−11c)で表される化合物は、一般式(A−10)より、下記の方法により得ることができる。
本工程は、上記の一般式(A−10)で表わされる化合物において、核酸塩基部(B)がチミン又はチミン誘導体(A−10t)であるチミジン型化合物から、核酸塩基部(B)がシトシン又はシトシン誘導体(A−10c)であるシチジン型化合物を得る工程である。アセトニトリル、ジクロロメタン、ピリジン等の溶媒中、またはそれらの混合溶媒中、トリエチルアミン、イミダゾール、N,N−ジメチルアミノピリジン等の塩基、および2,4,6−トリイソプロピルベンゼンスルホニルクロリド等のスルホニルクロリドと、−20℃〜80℃、好ましくは0℃〜30℃で0.1〜24時間反応させた後、アンモニア水を加えて、0℃〜80℃、好ましくは0℃〜30℃で0.5〜8時間反応させることにより、一般式(A−10c)で表わされる化合物を得ることができる。
本工程は、一般式(A−10c)で表わされる化合物から、さらに、シトシン又はシトシン誘導体のアミノ基を修飾して、一般式(A−11c)で表わされる化合物を得る工程である。N,N’−ジメチルホルムアミド、ピリジン、アセトニトリル、ジクロロメタン等の溶媒中、またはそれらの混合溶媒中、トリエチルアミン、イミダゾール、N,N−ジメチルアミノピリジン等の塩基、およびベンゾイルクロリド、アセチルクロリド等のアシルクロリドあるいは安息香酸無水物、無水酢酸等の酸無水物と、−20℃〜80℃、好ましくは0℃〜30℃で0.1〜48時間反応させることにより、一般式(A−11c)で表わされる化合物を得ることができる。
[実施例1]
窒素雰囲気下、化合物1(合成法はOrganic Letters,7,1569−1572(2005)に記載の方法に準じる、4.40g、8.05mmol)のテトラヒドロフラン(26mL)懸濁液に、飽和重曹水(13mL)、Cbzクロリド(1.26mL、8.86mmol)を氷冷下で加え、室温で1時間撹拌した。反応液に水(13mL)を加え、ジクロロメタン(75mL)で抽出した。有機層を飽和食塩水(25mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣に酢酸エチル−イソプロピルエーテル(2:1、66mL)を加えた。析出した固体をろ取した後、酢酸エチル−イソプロピルエーテル(1:1)で洗浄し、化合物2(4.87g、収率93%)を得た。得られた化合物2の物性データは、以下のとおりであった。
1H-NMR(CDCl3)δ:8.04(1H, s), 7.54(1H, s), 7.44-7.27(20H, m), 6.59(1H, d, J=7.3 Hz), 5.20(1H, brs), 4.63(1H, brs), 4.17(1H, s), 3.49(1H, dd, J=10.7, 2.4 Hz), 3.39(1H, brs), 3.15(3H, s), 1.36(3H, s).
化合物2(4.35g、6.72mmol)、イミダゾール(81.8mg、1.20mmol)のDMF(9mL)溶液に、TBSクロリド(140mg、0.929mmol)を氷冷下で加え、室温で19時間攪拌した。反応液を酢酸エチル(45mL)で希釈した後、水(15mL)および2mol/L塩酸(5mL)を氷冷下で加えた。有機層を水(20mL)および飽和食塩水(20mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、化合物3の粗生成物を得た。
工程2で得た化合物3の粗生成物のクロロホルム(40mL)溶液に、4mol/L塩化水素・酢酸エチル溶液(2.00mL、8.00mmol)を氷冷下で加え、室温に昇温しながら4.5時間攪拌した。さらに4mol/L塩化水素・酢酸エチル溶液(1.34mL、5.36mmol)を氷冷下で加え、30分間攪拌した。反応液に水(40mL)を氷冷下で加え、有機層を水(40mL)および飽和食塩水(20mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘキサン−酢酸エチル)により精製して化合物4(2.20g、収率63%)と化合物3(1.68g、収率33%)を得た。得られた化合物4の物性データは、以下のとおりであった。
1H-NMR(CDCl3)δ:8.24(1H, s), 7.46(0.8H, s), 7.33-7.24(5.2H, m), 6.42(0.8H, d, J=9.3 Hz), 6.23(0.2H, d, J=8.3 Hz), 5.19-5.05(2H, m), 4.73(0.2H, t, J=7.9 Hz), 4.66(0.8H, t, J=7.3 Hz), 4.49(0.8H, d, J=6.3 Hz), 4.42(0.2H, d, J=5.3 Hz), 4.02(0.8H, s), 3.99(0.2H, s), 3.88(1H, d, J=12.0 Hz), 3.78-3.71(1H, m), 3.07(0.7H, s), 3.06(2.3H, s), 2.38(1H, brs), 1.89(2.3H, s), 1.84(0.7H, s), 0.85(9H, s), 0.01(3H, s), -0.03(3H, s).
1H-NMR(CDCl3)δ:8.13(0.4H, s), 8.08(0.6H, s), 7.69(0.4H, s), 7.56(0.6H, s), 7.49-7.20 (20H, m), 6.60-6.55(1H, m), 5.47(0.4H, d, J=11.8 Hz), 5.19(1.2H, s), 4.97(0.6H, dd, J=9.0, 6.4 Hz), 4.87(0.4H, d, J=12.2 Hz), 4.81(0.4H, dd, J=8.7, 5.8 Hz), 4.67(0.6H, d, J=5.9 Hz), 4.47(0.4H, d, J=5.3 Hz), 4.05(0.6H, s), 3.98(0.4H, s), 3.40-3.24(2H, m), 3.16(1.2H, s), 3.12(1.8H, s), 1.41(1.2H, s), 1.34(1.8H, s), 0.82(5.4H, s), 0.77(3.6H, s), -0.03(1.8H, s), -0.09(1.8H, s), -0.21(1.2H, s), -0.26(1.2H, s).
化合物4(1.07g、2.06mmol)のDMSO(10mL)溶液に、EDC塩酸塩(1.18mg、6.16mmol)およびパラトルエンスルホン酸ピリジニウム(518mg、2.06mmol)を室温で加え、3時間攪拌した。反応液を酢酸エチル(30mL)で希釈した後、水(10mL×4回)および飽和食塩水(10mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、化合物5の粗生成物を得た。
工程4で得た化合物5の粗生成物のエタノール(4mL)溶液に、トリエチルアミン(2.00mL、14.4mmol)および37%ホルマリン水溶液(2.00mL、26.9mmol)を室温で加え、80℃で4時間攪拌した。反応液に1mol/L塩酸(20mL)を氷冷下で加え、酢酸エチル(30mLおよび20mL)で抽出した。有機層を水(20mL)および飽和食塩水(20mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、化合物6の粗生成物を得た。
工程5で得た化合物6の粗生成物、りん酸二水素ナトリウム二水和物(551mg、3.53mmol)および2−メチル−2−ブテン(1.87mL、17.7mmol)のtert−ブタノール(10mL)、水(3mL)溶液に、亜塩素酸ナトリウム(800mg、8.85mmol)の水(5mL)溶液を氷冷下で滴下した後、反応液を室温に昇温しながら2.5時間攪拌した。反応液に0.2mol/L水酸化ナトリウム水溶液(20mL)を加え、トルエン(20mL)で洗浄した。有機層を水(5mL)で抽出し、水層を合わせて2mol/L塩酸(4mL)を加えた後、酢酸エチル(20mL×2回)で抽出した。酢酸エチル抽出液を飽和食塩水(20mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、化合物7(816mg、ジアステレオマー比率93%、3工程通算収率70%)を得た。得られた化合物7の物性データは、以下のとおりであった。
1H-NMR(DMSO-d6)δ:11.51(1H, d, J=4.6 Hz), 7.66(0.8H, d, J=4.5 Hz), 7.36-7.21(5.2H, m), 6.59(0.8H, d, J=8.8 Hz), 6.48(0.2H, d, J=9.5 Hz), 5.54-5.49(0.8H, m), 5.22(0.2H, d, J=13.1 Hz), 5.11-4.94(2H, m), 4.66-4.55(1H, m), 4.49(1H, dd, J=6.4, 6.4 Hz), 4.23(0.8H, s), 3.87(0.8H, dd, J=11.7, 3.6 Hz), 3.78(0.2H, d, J=11.2 Hz), 3.72-3.54(1H, m), 2.96(2H, s), 2.91(1H, s), 1.79(2H, s), 1.76(1H, s), 0.89-0.82(9H, m), 0.10-0.00(3H, m), -0.10--0.18(3H, m).
化合物7(816mg、1.45mmol)、10%パラジウム炭素(78.0mg)のメタノール(16mL)懸濁液を常圧の水素雰囲気下で5時間攪拌した。反応液をろ過した後、ろ液の溶媒を減圧留去し、化合物8の粗生成物を得た。得られた化合物8の物性データは、以下のとおりであった。
1H-NMR(DMSO-d6)δ:11.41(1H, s), 7.83(1H, s), 6.07(1H, d, J=5.5 Hz), 5.34(1H, brs), 4.60(1H, d, J=6.0 Hz), 3.85-3.72(3H, m), 2.47(3H, s), 1.83(4H, s), 0.91(9H, s), 0.16(3H, s), 0.15(3H, s).
[実施例2]
窒素雰囲気下、化合物1(合成法はOrganic Letters,7,1569−1572(2005)に記載の方法に準じる、1300g、2.53mol)のDMF(3.9L)懸濁液に、TBSクロリド(1717g、11.39mol)のDMF(2.6L)溶液を5〜15℃で滴下した。続いて、10〜20℃でヨウ化ナトリウム(1138g、7.59mol)を加え、同温下でN−メチルイミダゾール(999mL、12.7mol)を滴下した。20〜30℃で6時間撹拌した後、終夜で静置した。反応液を酢酸エチル(3.9L)と氷水(10.4L)の混合物に注加し、更に酢酸エチル(2.6L)、水(2.6L)を加えた。有機層を1mol/L塩酸(6.5L)、10%炭酸ナトリウム水溶液(6.5L)、10%食塩水(6.5L)で順次洗浄した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣(2.68kg)にメタノール(2.6L)を加えた。再び溶媒を減圧留去し、化合物9の粗生成物(2.62kg)を得た。
工程1で得た化合物9の粗生成物(2.62kg)のメタノール(6.5L)溶液に、35%塩酸(633mL、7.59mol)を20〜30℃で滴下し、4時間撹拌した。反応液をジイソプロピルエーテル(6.5L)と氷水(3.9L)の混合物に注加し、更にジイソプロピルエーテル(6.5L)、水(2.6L)を加えた。水層をジイソプロピルエーテル(3.25L)で洗浄した後、炭酸ナトリウム(1073g、10.1mol)の水(6.5L)溶液を加え、酢酸エチル(19.5Lおよび6.5L)で抽出し、有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣にテトラヒドロフラン(2.6L)を加えた。再び溶媒を減圧留去し、化合物10の粗生成物(1.08kg)を得た。得られた化合物10の物性データは、以下のとおりであった。
1H-NMR(DMSO-d6)δ:0.13 (s, 6H), 0.91 (s, 9H), 1.40-1.55 (br, 1H), 1.79 (s, 3H), 2.28 (s, 3H), 3.15-3.20 (d, J = 4.1Hz, 1H), 3.52-3.65 (m, 2H), 3.85 (s, 1H), 4.30-4.35 (d, J = 4.1Hz, 1H), 5.18-5.24 (br, 1H), 5.64-5.70 (d, J = 7.3Hz), 7.73 (s, 1H), 11.34 (s, 1H).
窒素雰囲気下、工程2で得た化合物10の粗生成物(17.7g)およびピリジン(10.1mL、125mmol)のテトラヒドロフラン(80mL)溶液に、0〜10℃でトリフルオロ酢酸無水物(17.8mL、125mmol)を滴下し、1時間撹拌した。反応液を氷冷下、20%炭酸ナトリウム水溶液(112mL)へ注加し、テトラヒドロフラン(24mL)および水(48mL)を加えた。氷冷下で20分間、室温で1時間撹拌した後、酢酸エチル(112mL)、n−ヘキサン(80mL)、10%食塩水(32mL)および水(176mL)を加えた。有機層を2mol/L塩酸(80mL)、0.4mol/L塩酸(80mL)、5%炭酸水素ナトリウム水溶液(80mL)、10%食塩水(80mL)で順次洗浄した。各水層はそれぞれ酢酸エチル(80mL)で抽出した。有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣に酢酸エチル(24mL)を加え、60℃に加熱して溶解させた後、n−ヘキサン(72mL)を加えた。生じたスラリーを室温まで冷却した後、ろ過して得られた固体を酢酸エチル/n−ヘキサン(3.2mL/60.8mL)で洗浄した後、通風乾燥を1日行い、化合物11(15.8g、工程1からの通算収率79.1%)を得た。得られた化合物11の物性データは、以下のとおりであった。
1H-NMR(DMSO-d6)δ:-0.01 (2.1H, s), 0.02 (0.9H, s), 0.08 (2.1H, s), 0.09 (s, 0.9H, s), 0.86 (6.3H, s), 0.87 (2.7H, s), 1.78 (0.9H, d, J = 0.8Hz), 1.79 (2.1H, d, J = 0.8Hz), 3.12 (0.9H, s), 3.20 (2.1H, s), 3.61-3.57 (1.0H, m), 3.72-3.67 (1.0H, m), 3.99 (0.7H, q, J = 3.3Hz), 4.02 (0.3H, m), 4.45 (0.3H, m), 4.45 (0.3H, m), 4.52 (0.7H, dd, J = 6.8, 3.3Hz), 4.77 (0.7H, dd, J = 7.6, 6.8Hz), 5.30 (0.7H, t, J = 4.7Hz), 5.38 (0.3H, t, J = 4.7Hz), 6.37 (0.3H, m), 6.39 (0.7H, d, J = 7.6Hz), 7.73 (1.0H, s), 11.44 (0.7H, brs), 11.5 (0.3H, brs).
窒素雰囲気下、化合物11(450g、935mmol)のDMSO(1.35L)溶液に、EDC(538g、2800mmol)、DMSO(675mL)、パラトルエンスルホン酸ピリジニウム(235g、935mmol)およびDMSO(225mL)を順次加え、20〜30℃で2.5時間撹拌した。続いて10〜20℃で酢酸エチル(4.5L)、水(2.25L)および酢酸エチル(2.25L)を順次加えた。有機層を水(2.25L)で2回洗浄した後、溶媒を減圧留去し、得られた残渣にアセトニトリル(900mL)を加えた。再び溶媒を減圧留去し、化合物12の粗生成物(540g)を得た。
まず工程5で行うアルドール反応の条件検討を行った。具体的には、用いる塩基の種類・量、試薬の種類・量、溶媒の種類・量、反応温度、反応時間について組み合わせ検討を行い、目的物、副生物の生成率、原料の残存率をHPLCにて分析した。その結果を以下の表に示す。
工程5で得られた化合物13を含有する酢酸エチル溶液にリン酸二水素ナトリウム2水和物(292g、1870mmol)の水(1.35L)水溶液、スクアレン(898mL、1870mmol)、アセトニトリル(1.35L)を順次加えた。20〜30℃で亜塩素酸ナトリウム(423g、4670mmol)の水(2.25L)溶液を滴下し、3時間撹拌した。続いて10〜15℃で0.5mol/L水酸化ナトリウム水溶液(3.6L)、チオ硫酸ナトリウム5水和物(1160g、4670mmol)を順次加え、5〜15℃で20分間撹拌した。反応液に酢酸エチル(900mL)および水(900mL)を加え、有機層を水(900mL)で洗浄した。水層を合わせて酢酸エチル(900mL)で洗浄した後、水層に酢酸エチル(5.4L)および2mol/L塩酸水溶液(2.25L)を加えた。有機層を10%食塩水(2.25L)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。混合物をろ過、乾燥剤を酢酸エチル(1.35L)で洗浄して得られたろ液に酢酸カリウム(82.5g、841mmol)およびエタノール(338mL)を加えた。混合物を20〜30℃で1時間撹拌した。生じたスラリーをろ過して得られた固体を酢酸エチル/エタノール(3860mL/193mL)で洗浄した後、通風乾燥を1日行い、化合物14(283g、工程4からの通算収率53.8%)を得た。得られた化合物14の物性データは、以下のとおりであった。
1H-NMR(DMSO-d6)δ :-0.11 (1.8H, s), -0.09 (1.2H, s), 0.09 (1.8H, s), 0.10 (1.2H, s), 0.82 (3.6H, s), 0.83 (5.4H, s), 1.77 (1.2H, s), 1.78 (1.8H, s), 3.18 (1.2H, s), 3.33 (1.8H, s), 3.54 (1.0H, d, J = 10.8Hz), 3.68 (0.6H, d, J = 10.8Hz), 3.69 (0.4H, d, J = 10.8Hz), 4.18 (0.4H, dd, J = 8.6, 7.8Hz), 4.49 (0.4H, d, J = 8.6Hz), 4.51 (0.6H, d, J = 8.6Hz), 4.73 (0.6H, dd, J = 8.6, 7.8Hz), 6.1 (1H, br), 6.90 (0.4H, d, J = 7.8Hz), 6.92 (0.6H, d, J = 7.8Hz), 7.61 (0.6H, s), 7.65 (0.4H, s).
[実施例3]
窒素雰囲気下、化合物14(455mg、0.807mmol)のピリジン(4mL)懸濁液に、1mol/L TBAF−テトラヒドロフラン溶液(0.888mL、0.888mmol)を滴下し、60〜70℃で9時間撹拌した後、終夜室温で静置した。翌日さらに60〜70℃で9時間撹拌した後、終夜室温で静置した。EDC塩酸塩(310mg、1.62mmol)を加え、60〜70℃で9時間撹拌した後、EDC塩酸塩(310mg、1.62mmol)を追加し、終夜室温で静置した。DMTr(4,4’−ジメトキシトリチル)クロリド(547mg、1.61mmol)を加えて室温で5時間撹拌した後、さらにDMTrクロリド(547mg、1.61mmol)を加え、2時間撹拌した。反応液に5%炭酸水素ナトリウム水溶液(10mL)を加え、酢酸エチル(10mL)で抽出した後、水(5mL)で3回洗浄した。それぞれの水洗浄液は酢酸エチル(5mL)で抽出した。有機層を合わせて溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(クロロホルム−メタノール)により精製し、化合物15(334mg、収率69.1%)を得た。
1H-NMR(CDCl3)δ:1.70 (s, 3H), 1.97 (d, J = 5.1Hz, 1H), 3.02 (s, 3H), 3.61 (d, J = 12.3Hz, 1H), 3.79 (s, 6H), 3.95 (d, J = 12.3Hz, 1H), 4.11 (s, 1H), 4.37 (d, J = 4.9Hz, 1H), 5.41 (s, 1H), 6.85 (dd, J = 8.5, 2.5Hz, 4H), 7.23-7.36 (m, 7H), 7.45 (d, J = 7.7Hz, 2H), 7.76 (s, 1H), 8.55 (s, 1H).
WO2011/052436A1に記載の方法に準じた方法に従って、化合物16を合成した。
メタノール溶液(1ml)に0℃で水素化ホウ素ナトリウム(47mg、6eq.)を加えた後、化合物14(100mg)を加え、室温で3.5時間撹拌した。原料が消失しなかったので、さらに水素化ホウ素ナトリウム(32mg)を加え、室温で1時間撹拌した後、塩酸―メタノール溶液にて、pH=3に調整し、さらに1時間撹拌した。反応液はそのまま濃縮し、化合物30の粗生成物(218mg)を得た。得られた化合物30の粗生成物は精製を行わず、収率は定量的とし次工程に進めた。
前工程で得られた化合物30の粗生成物(196mg)をN,N’−ジメチルホルムアミド(1.4ml)に懸濁した後、EDC塩酸塩(76mg)を加え、室温で4時間撹拌した。反応液をろ過することにより無機物をろ別した後(N,N’−ジメチルホルムアミド(1.5ml)にて洗浄)、水(3.3ml)を加えて、スラリー状の固形物を析出させた。固形物をろ取、水洗、乾燥することにより化合物31(36.5mg、化合物14からの収率=63%)を無色固体として得た。
化合物31をピリジン中、4,4’−ジメトキシトリチルクロリドで処理することにより、化合物32を得た。
工程4 化合物32から化合物15への変換
化合物32をテトラブチルアンモニウムフロリド−テトラヒドロフラン溶液で処理することにより、化合物15を得た。
[実施例4]
工程1で行うトランスグリコシル化反応の条件検討を行った。具体的には、試薬量、溶媒の種類について組み合わせ検討を行い、目的物、副生物の生成率、原料の残存率をHPLCにて分析した。その結果を以下の表に示す。
1H-NMR(DMSO-d6)δ:-0.06 (s, 3H), 0.13 (s, 2.1H), 0.14 (s, 0.9H), 0.89 (s, 9H), 3.22 (s, 0.9H), 3.31 (s, 2.1H), 3.82 (d, J = 12.0Hz, 1H), 3.89-3.95 (m, 1H), 4.70 (d, J = 7.3Hz, 0.3H), 4.75 (d, J = 7.3Hz, 0.7H), 5.04 (t, J = 7.5Hz, 0.3H), 5.41 (brs, 0.7H), 5.49 (t, J = 8.0Hz, 0.7H), 5.55 (brs, 0.3H), 7.02 (d, J = 8.5Hz, 0.3H), 7.04 (d, J = 8.5Hz, 0.7H), 7.56 (t, J = 7.4Hz, 2H), 7.66 (t, J = 7.4Hz, 1H), 8.04 (d, J = 7.8Hz, 2H), 8.78 (s, 1H), 8.80 (s, 1H), 11.31 (s, 1H), 13.34 (brs, 1H).
窒素雰囲気下、化合物17(4.75g、7.44mmol)のテトラヒドロフラン(25mL)溶液に、1mol/L TBAF−テトラヒドロフラン溶液(14.9mL、14.9mmol)を滴下し、60〜65℃で3.5時間撹拌した。EDC塩酸塩(1.71g、8.92mmol)を加え、60〜65℃で1時間撹拌した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣にアセトニトリル(50mL)を加え、再び溶媒を減圧留去することを3回繰り返し、化合物18の粗生成物(9.12g)を得た。
1H-NMR(CDCl3)δ:3.14 (s, 3H), 4.09 (dd, J = 13.8, 6.8Hz, 1H), 4.18 (dd, J = 14.0, 3.3Hz, 1H), 4.37 (s, 1H), 4.64 (s, 1H), 5.26 (m, 1H), 5.89 (s, 1H), 6.46(brs, 1H), 7.52 (t, J = 7.5Hz, 2H), 7.60 (t, J = 7.3Hz, 1H), 8.01 (d, J = 7.7Hz, 2H), 8.56(s, 1H), 8.78 (s, 1H), 9.31 (s, 1H).
窒素雰囲気下、工程2で得た化合物18の粗生成物(9.12g)のジクロロメタン(25mL)溶液に、DABCO(2.09g、18.6mmol)およびDMTrクロリド(5.04g、14.9mmol)を加え、室温で2時間撹拌した。DMTrクロリド(1.26g、3.72mmol)を追加し、さらに2時間撹拌した。反応液に5%炭酸水素ナトリウム水溶液(50mL)およびジクロロメタン(50mL)を加え、有機層を水(50ml)で洗浄し、水洗浄液はジクロロメタン(50mL)で抽出した。有機層を合わせてメタノール(50mL)を加え、重量が60gになるまで溶媒を留去した後、再びメタノール(50mL)を加え、重量が67gになるまで溶媒を留去した。再びメタノール(25mL)を加え、室温で30分間撹拌して得られたスラリーをろ過した。ろ取した固体をメタノール(35mL)で洗浄した後、風乾することにより化合物19(4.31g、工程2からの通算収率81.3%)を得た。
1H-NMR(DMSO-d6)δ:2.98 (s, 3H), 3.26 (d, J = 11.0Hz, 1H), 3.42 (d, J = 11.7Hz, 1H), 3.73 (s, 6H), 4.67 (s, 1H), 4.79 (brs, 1H), 6.14 (s, 1H), 6.19 (brs, 1H), 6.88 (d, J = 8.3Hz, 4H), 7.21-7.32 (m, 7H), 7.39 (d, J = 7.8Hz, 2H), 7.57 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 7.67 (t, J = 7.4Hz, 1H), 8.06 (d, J = 7.4Hz, 2H), 8.53 (s, 1H), 8.84 (s, 1H), 11.33 (brs, 1H). 1H-NMR(CDCl3)δ:8.98(1H, s), 8.81 (1H, s), 8.39 (1H, s), 8.03 (1H, d, J=8.0 Hz), 7.63 (1H, t, J=8.0 Hz), 7.55 (2H, t, J=8.0 Hz), 7.46 (2H, d, J=8.0 Hz), 7.38-7.24 (7H, m), 6.86 (4H, d, J=8.0 Hz), 5.89 (1H, s), 4.51 (1H, s), 4.47 (1H, m), 3.91 (1H, d, J=12.0 Hz), 3.79 (6H, s), 3.73 (1H, d, J=12.0 Hz), 3.15 (3H, s), 2.07 (1H, br s, 4.0 Hz).LC-MS: UPLC 4min base 2.28 min M+H = 713
窒素雰囲気下、化合物19(107g、150mmol)およびDIEA(79mL、450mmol、3.0eq.)のピリジン(428mL、4V)懸濁液に氷冷下、2−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルクロロホスホロアミジト(53.6mL、240mmol、1.6eq.)を滴下し、室温で2時間撹拌した。反応液に氷冷下、5%炭酸水素ナトリウム水溶液(1.1L)を加え、酢酸エチル(1.1L)で抽出した。有機層を3%塩化ナトリウム水溶液(1.1L)で2回洗浄し、洗浄液はそれぞれ酢酸エチル(1.1L)で再抽出し、有機層を合わせて硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル)により精製し、化合物20 (120g、ピリジン2.0wt%、酢酸エチル5.0wt%含有、収率81.5%)を得た。
1H-NMR(DMSO-d6)δ:0.87 (d, J = 6.8Hz, 2H), 0.92 (d, J = 6.5Hz, 4H), 1.06 (d, J = 6.8Hz, 2H), 1.08 (d, J = 6.8Hz, 4H), 2.55 (dd, J = 11.7, 5.4Hz, 1.3H), 2.70 (m, 0.7H), 2.99 (s, 2H), 3.01 (s, 1H), 3.18 (d, J = 11.5Hz, 0.7H), 3.22 (d, J = 11.5Hz, 0.3H), 3.43-3.57 (m, 4.3H), 3.65-3.70 (m, 0.7H), 3.72 (s, 2H), 3.73 (s, 4H), 4.98 (s, 1H), 5.04 (d, J = 4.8Hz, 0.3H), 5.12 (d, J = 7.8Hz, 0.7H), 6.28 (s, 0.7H), 6.29 (s, 0.3H), 6.85-6.89 (m, 4H), 7.21-7.31 (m, 7H), 7.36-7.39 (m, 2H), 7.57 (t, J = 7.5Hz, 2H), 7.66 (t, J = 7.3Hz, 1H), 8.06 (d, J = 7.5Hz, 2H), 8.50 (s, 0.3H), 8.52 (s, 0.7H), 8.83 (s, 1H), 11.31 (brs, 1H).
31P-NMR(DMSO-d6)δ:150.13 (s, 0.3H), 150.42 (s, 0.7H).
窒素雰囲気下、化合物14(5.0g、8.07mmol)およびアデニン(1.091g、8.07mmol)のシクロペンチルメチルエーテル(50mL)懸濁液に、N,O−ビス(トリメチルシリル)アセトアミド(13.85mL、56.5mmol)およびTMSOTf(2.92mL、16.15mmol)を加え、70℃で4時間撹拌した。反応液に氷冷下、酢酸エチル(50mL)、0.1mol/L塩酸(40mL)、テトラヒドロフラン(70mL)を加え、有機層と水層に分配した後、得られた有機層を0.1mol/L塩酸(110mL)および水(110mL)で洗浄した。溶媒を減圧留去して得られた残渣に酢酸エチル(50mL)、n-ヘキサン(50ml)を加えて、攪拌して得られたスラリーをろ過した。ろ取した固体を酢酸エチルとn-ヘキサンの混合溶媒(1:1、20ml)で洗浄した後、風乾することにより化合物33(3.58g、収率83%)を得た。
化合物33(309mg、0.578mmol)のエタノール(3ml)溶液に、0°Cで1mol/Lリチウムボロヒドリドーテトラヒドロフラン溶液(1.156ml)を加え、室温で3時間撹拌した。
反応液に4mol/L塩化水素―ジオキサン溶液(0.578ml)を加え、室温で1時間撹拌した後、EDC塩酸塩(222mg、1.156mmol.)を加え、65°Cで2時間撹拌した。放冷後、得られた固体をろ取、メタノールで洗浄した後、風乾することにより化合物34(187mg、収率77%)を得た。
LC-MS:UPLC 4min base 1.57 min, M+H = 420
窒素気流下、20mlのファルコンチューブに化合物34(149mg、0.354mmol)、メタノール(4.5mL)を加えた後、室温にてフッ化アンモニウム(52.5mg,1.417mmol)を加え、60℃で8時間加熱還流した.放冷後、メタノール(1.5ml)、テトラヒドロフラン(2ml)を加えた後、生成したスラリーをろ取することにより、化合物35(89.5mg、収率89.5%)を白色固体として得た。
500mlの1Lナスコルベンにて、化合物35(8.00g、19.9mmol)をピリジン(80ml)での共沸脱水操作を3回繰り返した後、ピリジン(80ml)に懸濁した。N,N’−ジメチルホルムアミドージメチルアセタール(8.0mL)を添加して室温で1時間撹拌した。生じた橙色溶液をそのまま濃縮し、残渣をピリジン(80ml)での1回共沸脱水操作を行った後にピリジン(80ml)に溶解した。4,4’−ジメトキシトリチルクロリド(10.1g、MR=1.5)を添加して室温で3時間撹拌した。反応液にメタノール(5.0ml)を滴加して40分間撹拌後、酢酸エチルで希釈した。有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で2回、飽和食塩水で洗浄後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過、濃縮した。再び、ピリジン(100ml)に溶解して、25%アンモニア水(30ml)を添加して室温で20時間撹拌した。反応液をそのまま濃縮した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(クロロホルム/メタノール, 10/0→9/1)にて精製することにより、化合物36(8.83g、純度93%, 収率73%)を黄色粉末として得た。
窒素気流下、100mLナスフラスコAにHOBt(1.38g,10.19mmol)、ジクロロメタン(20mL)、N−メチルモルホリン(2.17mL,19.72mmol)を加えた。その後、BzCl(1.15mL,9.86mmol)を室温にて滴下してBz−OBtを調整した。窒素気流下、100mLナスフラスコBに化合物36(2.00g,3.29mmol)、ピリジン(20mL)、N−メチルモルホリン(2.17mL, 19.72mmol)を加えた。続いて室温にて、クロロトリメチルシラン(1.68mL,13.14mmol)を滴下し、白色懸濁液を得た。フラスコBに対してフラスコAの溶液を室温で滴下し、一晩撹拌した。反応が5%程度しか進行しなかったため、同量のBzOt溶液を調製し、反応液に室温で滴下した。その後、50℃にて12時間撹拌し、室温で週末静置した。反応完結を確認後、反応溶液を酢酸エチルにあけ、有機層を分液操作により飽和重層水、飽和食塩水で洗浄した。得られた有機層に硫酸ナトリウムを添加し30分撹拌後、濾過、減圧濃縮、乾燥を行い、粗精製のジベンゾイル体を得た。残渣をメタノール(20mL)に溶解し、0℃で炭酸カリウム(2.72g,19.72mmol)を加え、0℃で1時間撹拌した。その後、濾過、減圧濃縮、乾燥を行い、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(クロロホルム/メタノール、10/0→9/1)にて精製し、化合物19(1.76g,75.1%)を白色泡状固体として得た。
化合物14をトリメチルシリルジアゾメタン-n-ヘキサン溶液/メタノールで処理することにより、化合物37を得た。
化合物37を実施例2の工程2と同様な条件に付すことにより、化合物38を得た。
窒素気流下、10mLナスフラスコに化合物37(78.0mg、0.10mmol)、N−ベンゾイルアデニン(47.8mg、0.20mmol)、1,2−ジクロロエタン(1mL)、BSA(0.15mL、0.60mmol)を加えた。反応溶液を60℃に加熱し40分間撹拌した後に室温へ放冷した。室温にてトリメチルシリルトリフルオロメタンスルホネート(0.020mL、0.11mmol)を加えた後に、4時間加熱還流した。原料消失後、室温へと放冷し、飽和重層水で反応を停止した。続いて反応溶液を酢酸エチルで希釈した後に、有機層を水、飽和食塩水で洗浄した。得られた有機層に硫酸ナトリウムを添加し30分撹拌後、濾過、減圧濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル/ヘキサン:1/9→2/3)にて精製し、化合物39(86.4mg、97.0%)を白色泡状固体として得た。得られた化合物の物性データは、以下のとおりであった。
1H-NMR(CDCl3, 5:1 mixture of rotamers)δ:8.80(1H, s), 8.19 (1H, s), 8.02 (2H, d, J=4.0 Hz), 7.72-7.30 (14H, m), 6.83 (1H, d, J=12.0 Hz), 5.32 (1H, t, J=8.0 Hz), 4.93 (1H, d, 8.0 Hz), 4.20 (1H, d, J=12.0Hz), 4.05 (1H, d, J=12.0 Hz), 3.80 (3H, s), 3.39 (3H, s), 1.14 (9H, s), 1.00 (9H, s), 0.03 (3H, s), 0.00 (3H, s). LC-MS: UPLC 4min base 3.60 min, M+H = 892
化合物39をNaOH/メタノールで処理することにより、化合物38を得た。
実施例4の工程3と同様な条件にて実施することにより化合物35を得た。
実施例4の脱TFA化反応を経由しない方法の工程5および実施例4の工程4と同条件で実施した。
[実施例5]
実施例4の脱TFA化反応を経由しない方法の工程1と同条件で実施した。
実施例4の工程2と同様なルートで合成した。
実施例4の脱TFA化反応を経由しない方法の工程4と同条件で実施した。
窒素気流下、100mLのナスフラスコに化合物40(5.68g、9.33mmol)、ピリジン(57ml、10V)、N−メチルモルホリン(6.2mL,MR=6)を入れ、撹拌溶解後、氷冷バスで冷却した。クロロトリメチルシラン(4.7mL,MR=4)を5分間滴加、そのまま20分間さらに室温で1時間撹拌した。
窒素気流下、200mLのナスフラスコにHOBt(3.91g,MR=3.1)、ジクロロメタン(57mL)を入れた懸濁液にN−メチルモルホリン(6.2mL,MR=6)を添加した。室温でPacCl(3.85mL)を3分間で滴下した後、20分間撹拌し、Pac−OBtを調製した。本反応液に上述のトリメチルシリル化反応液を添加して一晩撹拌した後、反応が未完結であったので、同量のPac−Bt溶液を追加して、さらに23時間撹拌した。反応液を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液にあけ、有機層を分離した後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で順次洗浄した。各水層をジクロロメタンで再抽出して、有機層を合一し、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過、濃縮した。残渣をトルエンで共沸操作を行ってピリジンを除いた後、乾燥し、テトラヒドロフラン(50ml)に溶解し、フッ化水素・トリエチルアミン錯体(4ml)を添加して室温で40分間撹拌した。反応液を酢酸エチルで希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で2回、飽和食塩水で順次洗浄して、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過、濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル/アセトン, 100/0→80/20)にて精製することにより、化合物42 (9.91g、純度96%, 収率84%)をベージュ色粉末として得た。
窒素雰囲気下、化合物42(5.54g、7.46mmol)のアセトニトリル(55mL)−テトラヒドロフラン(5.5ml)の混合溶液にジイソプロピルアンモニウムテトラゾリド(1.34g、MR=1.05)を添加した後、2−シアノエチル−N,N,N’,N’−テトライソプロピルホスホロアミダイト(3.37g、MR=1.5)を3分間程度で滴下し、室温で7時間撹拌した。反応液を酢酸エチルで希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で順次洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過、濃縮した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣を2回のシリカゲルカラムクロマトグラフィー(1回目)ヘキサン/酢酸エチル/アセトン 2/1/1、 (2回目)酢酸エチル)により精製し、化合物43(6.20g、収率71%、2種のジアステレオマー比(1H-NMRの積分値より算出)=60:40))を得た。
1H-NMR (CDCl3)δ:(major diastereomer)9.54 (1H, br s), 8.82 (1H, s), 8.54 (1H, s), 7.45 (2H, d, J=8.0 Hz), 7.40-7.25 (9H, m), 7.09 (2H, d, J=8.0 Hz), 7.08 (1H, m), 6.89-6.83 (4H, m), 5.96 (1H, s, H-1 of sugar), 4.88 (2H, s), 4.68 (1H, dd, J=8.5, 1.0 Hz), 4.64 (1H, s), 3.96 (1H, d, J = 12.8 Hz), 3.81 (3H, s), 3.80 (3H, s), 3.57-3.39 (4H, m), 3.47 (1H, d, J=12.8 Hz), 3.12 (3H, s, -NCH3), 2.27 (2H, t, J=6.3 Hz), 1.09 (6H, d, J=6.8 Hz), 0.90 (6H, d, J=6.8 Hz).(minor diastereomer)9.54 (1H, br s), 8.84 (1H, s), 8.54 (1H, s), 7.45 (2H, d, J=8.0 Hz), 7.40-7.25 (9H, m), 7.09 (2H, d, J=8.0 Hz), 7.08 (1H, m), 6.89-6.83 (4H, m), 5.96 (1H, s, H-1 of sugar), 4.88 (2H, s), 4.76 (1H, s, H-2 of sugar), 4.65 (1H, dd, J=5.0, 1.2 Hz), 3.89 (1H, d, J=12.3 Hz), 3.80 (6H, s), 3.70-3.55 (2H, m), 3.52 (1H, d, J = 12.3 Hz), 3.49-3.38 (2H, m), 3.14 (3H, s, -NCH3), 2.44-2.39 (2H, m), 1.08 (6H, d, J = 6.8 Hz), 0.89 (6H, d, J = 6.8 Hz).
窒素気流下、100mLナスフラスコに化合物40(1.82g,2.99mmol)、ピリジン(20mL)を加えた。その後、1,1−ジメトキシ−N,N−ジメチルメタンアミン(1.192ml,8.97mmol)を加え室温で30分撹拌した。反応溶液を減圧下で濃縮し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ジクロロメタン/メタノール、10/0→9/1)にて精製し、化合物44(1.74g、87.7%)を白色泡状固体として得た。
1H-NMR(CDCl3)δ:8.99(1H, s), 8.51 (1H, s), 8.25 (1H, s), 7.47-7.21 (9H, m), 6.86 (4H, d, J=8.0 Hz), 5.84 (1H, s), 4.50 (1H, s), 4.44 (1H, s), 3.91 (1H, d, J=12.0 Hz), 3.78 (6H, s), 3.71 (1H, d, J=12.0 Hz), 3.24 (3H, s), 3.21 (3H, s), 3.12 (3H, s).LC-MS: UPLC 4min base 2.05 min, M+H = 664
窒素気流下、100mLのナスフラスコに化合物44(1.70g,2.56mmol)、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(2.68mL、15.37mmol)、クロロホルム(17mL)を加えた。その後、0℃にて2−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルクロロホスホロアミジト(1.714ml、7.68mmol)を加え、室温まで昇温し4時間撹拌した。反応溶液に飽和重層水を加えて反応を停止した。溶液を酢酸エチルにあけ、有機層を水、飽和食塩水で洗浄した。得られた有機層に硫酸ナトリウムを添加し30分撹拌後、濾過、減圧濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル)にて精製することにより、化合物45(1.76g,79.5%)を白色泡状固体として得た。
1H-NMR(CDCl3, 1:1 mixture of diastereomers) δ:9.04(1H, s), 8.56 (1H, s), 8.42 (1H, s), 7.45 (2H, d, J=8.0 Hz), 7.36-7.21 (9H, m), 6.84 (4H, m), 5.93 (1H, s), 4.72 (1H, s), 4.60 (1H, s), 4.14 (1H, d, J=8.0Hz), 3.80 (6H, s), 3.52-3.40 (5H, m), 3.30 (3H, s), 3.24 (3H, s), 3.12 (3H, s), 2.38 (1H, m), 1.10 (6H, t, J=8.0 Hz), 0.90 (6H, t, J=8.0 Hz). 31P-NMR(CDCl3)δ:150.8 (s), 150.0 (s). LC-MS: UPLC 4min base 2.67 min, M+H = 864
[実施例6]
窒素雰囲気下、化合物14(15.0g、26.6mmol)およびグアニン(4.02g、26.6mmol)のシクロペンチルメチルエーテル(135mL)懸濁液にN,O−ビス(トリメチルシリル)アセトアミド(65.1mL、266mmol)およびシクロペンチルメチルエーテル(7.5mL)を加え、60〜70℃で10分間攪拌した後、TMSOTf(11.83g、53.20mmol)およびシクロペンチルメチルエーテル(7.5mL)を加え、2時間撹拌した。反応液に20〜30℃で酢酸エチル(150mL)を加え、さらに15〜30℃で2mol/L塩酸(75mL)、テトラヒドロフラン(150mL)および水(75mL)を加え、有機層を水(150mL)で2回洗浄した。洗浄液は合わせて酢酸エチル(150mL)で抽出し、水(75mL)で洗浄した。有機層を合わせて溶媒を減圧留去し、得られた残渣に酢酸エチル(37.5mL)およびn−ヘキサン(112.5mL)を加え、室温で20分間撹拌した。得られたスラリーをろ過し、ろ取した固体を酢酸エチル−n−ヘキサン(1:9、75mL)で洗浄した後、風乾することにより化合物21(14.35g、収率91.8%)を得た。
1H-NMR(DMSO-d6)δ :-0.09 (3H, s), 0.11 (3H, s), 0.85 (9H, s), 3.10 - 3.60 (4H, m), 3.74 (1H, dd, J = 11.8, 6.8Hz), 3.90 (1H, dd, J = 11.9, 9.4Hz), 4.65 (1H, m), 5.09 (1H, t, J = 8.2Hz), 6.50 - 6.70 (3H, m), 8.00 (1H, d, J = 9.0Hz), 10.74 (1H, s), 13.24 (1H, brs).
窒素雰囲気下、化合物21(14.0g、23.9mmol)およびN−メチルイミダゾール(7.60mL、95.4mmol)のDMA(70mL)溶液に、1mol/L TBAF−テトラヒドロフラン溶液(28.6mL、28.6mmol)およびDMA(14mL)を加え、70〜80℃で8時間撹拌した。EDC塩酸塩(13.72g、71.55mmol)およびDMA(7mL)を20〜30℃で加え、4時間撹拌した。反応液にN−メチルイミダゾール(7.60mL、95.4mmol)を加えた後、TBSクロリド(14.38g、95.40mmol)を20℃以下で加え、室温で2時間撹拌した。反応液に酢酸エチル(280mL)および10%食塩水(140mL)を加え、有機層を水(140mL)で2回洗浄した。洗浄液はそれぞれ酢酸エチル(140mL)で抽出した。有機層を合わせて溶媒を減圧留去し、得られた残渣にアセトニトリル(56mL)、イソプロピルアルコール(28mL)および水(266mL)を室温で順次加え、0〜10℃で1時間撹拌した。得られたスラリーをろ過し、ろ取した固体をアセトニトリル−水(1:9、70mL)で洗浄した後、減圧下、60℃で乾燥し、化合物22(7.71g、収率74.1%)を得た。
1H-NMR(DMSO-d6)δ :-0.09 (3H, s), 0.10 (3H, s), 0.81 (9H, s), 2.92 (3H, s), 3.89 (2H, dd, J = 33.0, 12.7Hz), 4.33 (2H, s), 5.67 (1H, s), 5.93 (1H, brs), 6.54 (2H, brs), 7.69 (1H, s), 10.72 (1H, brs).
窒素雰囲気下、化合物22(7.50g、17.2mmol)のピリジン(37.5mL、464mmol)懸濁液に、10〜20℃でトリメチルシリルクロリド(9.33g、85.9mmol)を滴下した後、室温で30分間撹拌した。次に0〜5℃でフェノキシアセチルクロリド(3.52g、20.6mmol)を滴下した後、室温で1時間撹拌した。反応液を酢酸エチル(150mL)で希釈した後、0〜10℃で10%食塩水(37.5mL)および濃塩酸(30.0mL)の混合液を滴下した。有機層を1mol/L塩酸(75mL)および水(75mL)で2回洗浄し、次に酢酸エチル(37.5mL)および2mol/L塩酸メタノール溶液(38.7mL、77.4mmol)を順次加え、室温で1時間撹拌した。得られたスラリーにメタノール(15mL)を加え、室温で30分間撹拌した後,ろ過し、ろ取した固体を酢酸エチル(45mL)で洗浄した後、風乾することにより化合物23(5.51g、収率70.3%)を得た。
1H-NMR(DMSO-d6)δ :2.95 (3H, s), 3.68 (1H, d, J = 13.6Hz), 3.82 (1H, d, J = 13.3Hz), 4.35 (1H, s), 4.41 (1H, s), 4.92 (2H, s), 5.80 (1H, s), 6.99 (3H, m), 7.32 (2H, m), 8.19(1H, s), 11.82(2H, br).
窒素雰囲気下、化合物23(500mg、1.10mmol)のDMA(3.5mL)溶液に、DMTrクロリド(1.11g、3.29mmol)およびDABCO(369mg、3.21mmol)を加え、室温で2.5時間撹拌した。反応液に10℃以下でDABCO(369mg、3.21mmol)および2−シアノエチルジイソプロピルクロロホスホロアミジト(0.587mL、2.63mmol)を加え、室温で1時間撹拌した。反応液に酢酸エチル(10mL)、5%炭酸水素ナトリウム水溶液(2.5mL)および10%食塩水(2.5mL)を加え、有機層を10%食塩水(5mL)で2回洗浄した。洗浄液は合わせて酢酸エチル(2.5mL)で抽出した。有機層を合わせて無水硫酸ナトリウムで乾燥した後、溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル)により精製し、化合物24(720mg、酢酸エチル9.9wt%含有、収率61.7%)を得た。
1H-NMR (DMSO-d6)δ: 11.87 (1.0H, br s), 11.77 (1.0H, br s), 8.07 (1.0H, s), 7.40 (1.9H, t, J = 7.4 Hz), 7.35-7.23 (9.0H, m), 7.02-6.97 (3.0H, m), 6.93-6.88 (4.0H, m), 6.08 (1.0H, s), 4.91 (2.0H, s), 4.78 (1.0H, s), 4.64 (0.7H, d, J = 8.8 Hz), 4.59 (0.3H, d, J = 6.0 Hz), 3.75 (4.2H, s), 3.74 (1.8H, s), 3.72-3.60 (0.6H, m), 3.60-3.49 (1.3H, m), 3.48-3.39 (1.4H, m), 3.21 (0.7H, dd, J = 15.4, 11.6 Hz), 2.98 (0.9H, s), 2.97 (2.1H, s), 2.70 (0.6H, dd, J = 10.1, 5.4 Hz), 2.58 (1.4H, t, J = 5.9 Hz), 1.09-1.05 (6.0H, m), 0.91-0.83 (6.0H, m).
31P-NMR (CDCl3) δ: 148.90, 149.98
窒素気流下、化合物14(5.56g,8.88mmol)、2−アセタミド−9H−プリン−6−イル−ジフェニルカルバマート(3.79g、9.77mmol)のシクロペンチルメチルエーテル(50mL、10V)懸濁液に、N,O−ビス(トリメチルシリル)アセトアミド(BSA、21.75mL、89mmol)を加え、60℃で20分間撹拌した後、トリメチルシリルトリフルオロメタンスルホネート(3.95mL、17.76mmol)を加え、同温度で4時間加熱した.室温に冷却した後、酢酸エチル(100ml、20V)を加え、続いて市水(7.5ml、1.5V)を滴下した。不溶物をろ別した後、ろ液を10%食塩水(15ml、3V)に加え、有機層と水層に分配した。有機層を2mol/L塩酸(50ml、10V)および市水(50ml、10V)にて順次洗浄した後、濃縮することにより、化合物46(9.52g)の粗生成物を得た。
1H-NMR(DMSO-d6) δ:8.65(2H, d, J=8.0 Hz), 7.91 (2H, d, J=8.0 Hz), 7.51 (1H, t, J=4.0 Hz), 7.43 (2H, m), 6.89 (1H, d, 12.0 Hz), 5.36 (1H, t, J=8.0Hz), 4.61 (1H, d, J=8.0 Hz), 3.79 (1H, d, J=12.0 Hz), 3.70 (1H, d, J=12.0Hz), 3.26 (1H, s), 2.38 (3H, s), 0.77 (9H, s), 0.06 (3H, s), -0.19 (3H, s). LC-MS: UPLC 4min base 1.91 min, M+H = 789
粗製の化合物46(9.52g、8.88mmol相当)のメタノール(25ml)溶液に28%アンモニア水溶液(25ml)を加え、室温で4時間撹拌した。酢酸エチル(250ml)と10%食塩水(60ml)を加えた後、析出したスラリー状の固体をろ取した。得られた固体を酢酸エチル(25ml)で洗浄後、風乾することにより、化合物47(3.89g、純度=91.4wt%、化合物14からの収率70.6%)を得た。
化合物46(547mg、純度=91.4wt%、0.881mmol相当)のテトラヒドロフラン懸濁液(5ml)に1.8mol/L リチウムボロヒドリドーテトラヒドロフラン溶液(1.76ml)を滴下し、室温で15分間撹拌した。撹拌を継続しながら、メタノール(500・L)、アセトン(500・L)、2mol/L 塩酸−メタノール溶液(3.52ml)を順次加えた後、室温でEDC塩酸塩(507mg,2.64mmol、3eq.)を加え、60〜70℃で1.5時間撹拌した。EDC塩酸塩(422mg,2.20mmol、2.5eq.)、ジメチルアセタミド(1ml)を追加した後、同温度で2.5時間撹拌した。室温に冷却し、10%食塩水(10ml)を加えた後、反応液がスラリーになるまで、溶媒を留去した(残渣重量:12.95g)。一晩放置後、得られた固体をろ取し、固体を5%メタノール水溶液(5ml)で洗浄、風乾することにより、化合物48(273mg、収率70.9%)を得た。
LC-MS: UPLC 4min base 1.41 min, M+H = 437
化合物48(100mg、0.229mmol)に室温にてメタノール(1.5mL)、フッ化アンモニウム(17mg,0.458mmol)を加え、70℃で4.5時間加熱還流した。室温に冷却した後、析出物をろ取し、メタノール(0.5ml)にて洗浄、風乾することにより、化合物21a(51mg、収率68.9%)を得た。
比較例1の工程1と同条件で実施した。
比較例1の工程2と同条件で実施した。
化合物38(12mg, 15umol)およびO−N,N−ジフェニルカルバモイル−N−アセチルグアニン(12mg、31umol)をナスフラスコ(10mL)中でトルエン共沸した(1mL、1回)。真空ライン下で乾燥した後に、窒素雰囲気下で1,2−ジクロロエタン(1mL)を加えた。N,O−ビス(トリメチルシリル)アセトアミド(BSA,38μL、154μmol)を加えて,60℃に加熱して10分間撹拌した。室温まで冷却した後に、トリフルオロメタンスルホン酸トリメチルシリル(TMSOTf、3μL、28μmol)を加えた。13分間リフラックスして再び室温に戻した。反応液を炭酸水素ナトリウム飽和水溶液(10mL)と酢酸エチル(10mL,2回)で抽出し,有機層を合わせて無水硫酸マグネシウムで乾燥した。ろ過を行い、濃縮乾固したサンプルをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル=2:1から1:1)にて精製して無色アモルファス状の化合物49(10mg、9.6μmol,収率62%)を得た。
化合物49(5mg,4.8μmol)を尖端バイアル中で酢酸エチル(0.2mL)に溶解し、ヨウ化リチウム(1.2mg,9.6umol)を加えた。13.5時間リフラックスした後に反応液を10%硫酸ナトリウム水溶液(5mL)とクロロホルム(5mL、2回)で抽出した。有機層を合わせて0.1mol/L 塩酸、水、飽和食塩水で順に洗い、無水硫酸マグネシウムで乾燥した。ろ過後、濃縮乾固することにより、化合物50を無色アモルファス状サンプル(4mg)として得た。
実施例6の脱TFA化反応を経由しないルートの工程3と同様なルートで合成した。
実施例6の工程3と同様なルートで合成した。
実施例6の工程4と同条件で実施した。
[実施例7]
実施例6の工程1と同条件で実施した。
実施例6の工程2と同様な条件で実施した。
窒素気流下、化合物21a(19.5g、60.5mmol)をピリジン(200ml)、ジクロロメタン(20ml)でスラリー液とし、氷冷でクロロトリメチルシラン(65.7g、605mmol)の滴下を行った。滴下後、室温まで内温を上げ、1.5時間撹拌し、再び氷冷下まで反応液を冷却し、PacCl(11.5g、67.4mmol)の滴下を行った。滴下後、室温まで内温を上げ、1.5時間撹拌し、再び氷冷下まで反応液を冷却し、メタノール(60ml)の滴下を行った。その後、室温で2日間撹拌を行い、反応液を濃縮することにより、化合物23の粗生成物を得た。
化合物23の粗生成物をピリジン共沸(60mlx3回)して得られた残渣にピリジン(200g)、4,4’−ジメトキシトリチルクロリド(21.5g、63.5mmol)を加え、室温で2.5時間撹拌した。反応液を酢酸エチル(400ml)、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(500ml)に添加した後、分液を行い、水層を酢酸エチル(100ml)で再抽出、得られた有機層を合一し、飽和食塩水(100ml)で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥し濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル/アセトニトリル)で精製した後、アセトニトリル(100g)、酢酸エチル(145g)でスラリー洗浄を行い、次いでろ過、乾燥することにより、化合物23a(28.3g、収率62%)を得た。
化合物23a(28.3g,3 73mmol)に窒素気流下でアセトニトリル(220ml)、テトラヒドロフラン(30ml)を添加し、ジイソプロピルアンモニウムテトラゾリド(7.34g,42.9mmol)、次いで、2−シアノエチル N,N,N’,N’−テトライソプロピルホスホロアミダイト(16.9g,55.9mmol)を添加した。30℃で4時間撹拌した後、酢酸エチル(200ml)、飽和重曹水(20ml)に反応液を添加し、分液を行った。得られた水層を酢酸エチル(100ml)で再抽出し、有機層を合わせて、飽和食塩水(80ml)で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濃縮した後、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(イソプロピルエーテル/酢酸エチル/アセトニトリル)により精製し、化合物24(17.0g、収率49%)を得た。
[実施例8]
[実施例9]
化合物23(実施例6に記載の方法にて合成)のジクロロメタン溶液にレブリン酸、EDC塩酸塩、4−ジメチルアミノピリジンを加え、室温で1晩撹拌することにより、化合物58を得ることが出来る。
実施例6の工程4と同様な方法にて化合物59を合成できる。
[実施例10]
化合物21a(実施例6に記載の方法にて合成)のN,N−ジメチルホルムアミド溶液にtert-ブチル-ジフェニルシリルクロリドとイミダゾールを加え、室温で反応し、5’位水酸基がTBDPS化された生成物を得た後、ピリジン溶液にトリメチルシリルクロリド、フェノキシアセチルクロリドを加え、室温で反応させることにより、化合物60を得ることが出来る。
実施例6の工程4と同様な方法にて化合物61を合成できる。
[実施例11]
化合物15 108.1g(純度:92.53%、含量:100g、0.167mol)、DMF 300ml、イミダゾール47.8g(4.2eq.)、TBSCl 51.6g(2.05eq.)を仕込み25℃付近で23時間撹拌を行った。AcOEt 600ml、水 600mlを加えて分液を行い、水層をAcOEt 300mlで再抽出を行った。有機層を混合し、5%NaHCO3 600ml、5%NaCl 600mlで洗浄を行い、溶媒を回収した。TBSOHの除去を目的にトルエン 500ml×3回溶媒置換を行った後、アモルファスを固化させたものをほぐして目的の化合物25(132.6g、粗収率 111.2%)を得た。
1H-NMR (CDCl3)δ: 8.33 (1H, s), 7.89 (1H, s), 7.41 (2H, d, J = 7.0 Hz), 7.33-7.21 (7H, m), 6.82 (4H, dd, J = 8.8, 5.6 Hz), 5.43 (1H, s), 4.50 (1H, s), 4.04 (1H, s), 3.87 (1H, d, J = 11.8 Hz), 3.789 (3H, s), 3.787 (3H, s), 3.41 (1H, d, J = 11.8 Hz), 3.00 (3H, s), 1.56 (3H, s), 0.75 (9H, s), 0.04 (2H, s), -0.04 (2H, s).
化合物25 132.6g(0.167mol相当)、MeCN 800ml、TEA 50.7g(3eq.)、DMAP 2.0g(0.1eq.)、TPBSO2Cl 65.8g(1.3eq.)を加え、25℃付近で22時間撹拌した。25%NH3aq. 800mlを加え25℃付近で2時間撹拌した。MeCNを粗く回収し、AcOEt 400ml、水 400mlを加えて分液を行い、水層をAcOEt 300mlで再抽出した。有機層を混合し、5%NaCl 400ml×2回洗浄を行い、溶媒を回収した。アモルファスを固化させたものをほぐして目的の化合物26(192.8g、粗収率 161.9 % from 化合物15)を得た。
1H-NMR (CDCl3)δ: 7.97 (1H, s), 7.53 (2H, d, J = 7.2 Hz), 7.35-7.25 (7H, m), 6.83 (4H, dd, J = 8.8, 6.8 Hz), 5.51 (1H, s), 4.46 (1H, s), 4.19 (1H, s), 3.88 (1H, d, J = 11.7 Hz), 3.79 (6H, s), 3.39 (1H, d, J = 11.7 Hz), 3.02 (3H, s), 1.85 (3H, s), 1.66 (3H, s), 0.74 (9H, s), 0.04 (2H, s), -0.04 (2H, s).
化合物26 192.8g(0.167mol相当)、DMF 500ml、Bz2O 75.6g(2eq.)を加え、25℃付近で22h撹拌した。AcOEt 1000ml、5%NaHCO3 1000mlを加えて分液を行い、水層をAcOEt 500mlで再抽出した。有機層を混合し、5%NaHCO3 500ml、5%NaCl 500mlで洗浄を行い、溶媒を回収して粗製の化合物5を得た。シリカゲル1.3kg、展開溶媒Hex/AcOEt=8/2→6/4で精製を行い、アモルファスを固化させたものをほぐして目的の化合物27(124.1g、 収率 91 % from 化合物15)を得た。
1H-NMR (CDCl3)δ: 8.33 (2H, d, J = 7.2 Hz), 8.05 (1H, s), 7.53 (1H, dd, J = 7.4, 7.4 Hz), 7.49-7.41 (5H, m), 7.35-7.28 (7H, m), 7.25 (1H, m), 6.84 (4H, dd, J = 8.8, 6.4 Hz), 5.49(1H, s), 4.51 (1H, s), 4.10 (1H, s), 3.90 (1H, d, J = 11.7 Hz), 3.803 (3H, s), 3.800 (3H, s), 3.42 (1H, d, J = 11.7 Hz), 3.11 (3H, s), 1.85 (3H, s), 0.74 (9H, s), 0.04 (2H, s), -0.04 (2H, s).
化合物27 124.1g(0.152mol)、THF 869ml、1M−TBAF/THF 182ml(1.2eq.)を加え2時間撹拌を行った。溶媒を回収し、AcOEt 620ml、5%NaHCO3 620mlを加えて分液を行った。5%NaCl 620mlで洗浄し溶媒を回収した。TBSOHの除去を目的にトルエン 620ml×3回溶媒置換を行った後、アモルファスを固化させたものをほぐして目的の化合物28(119.2g、 収率 119 % from 化合物27)を得た。
1H-NMR (CDCl3)δ: 13.44 (1H, br s), 8.32 (2H, d, J = 7.5 Hz), 7.92 (1H, s), 7.55 (1H, dd, J = 7.3, 7.3 Hz), 7.50-7.43 (4H, m), 7.40-7.30 (7H, m), 7.26 (1H, m), 6.86 (4H, dd, J = 8.8, 3.6 Hz), 5.46 (1H, s), 4.37 (1H, br.s), 4.16 (1H, s), 3.92 (1H, d, J = 12.3 Hz), 3.803 (3H, s), 3.800 (3H, s), 3.57-3.42 (4H, m), 3.63 (1H, d, J = 12.3 Hz), 3.03 (3H, s), 1.90 (3H, s).
化合物28 108.2g(0.138mol相当)、ジクロロメタン 564ml、DIPEA 35.7g(2eq.)を仕込み5℃以下で2−シアノエチルジイソプロピルクロロホスフォロアミダイト 49.0g(1.5eq.)を滴下した。その後、25℃付近で2時間撹拌した。5%NaHCO3 564mlを加え分液し、溶媒を回収して粗製のMeC(Bz)を得た。シリカゲル2.3kg、展開溶媒Hex/AcOEt=7/3→5/5で精製を行い、アモルファスを固化させたものをほぐして目的の化合物29(MeC(Bz)アミダイト、105.2g、 収率 84% from 化合物27、2種のジアステレオマー比(HPLCの積分値より算出)=54:46)を得た。
1H-NMR (CDCl3)δ:(major diastereomer)13.47 (1H, br s), 8.33 (2H, d, J = 7.4 Hz), 7.98 (1H, s), 7.52 (1H, dd, J = 7.4, 7.4 Hz),7.50-7.42 (4H, m), 7.37-7.24 (8H, m), 6.86 (4H, dd, J = 8.8, 6.6 Hz), 5.52 (1H, s), 4.64 (1H, d, J = 6.9 Hz), 4.37 (1H, s), 3.92 (1H, d, J = 11.7 Hz), 3.812 (3H, s), 3.807 (3H, s), 3.57-3.42 (4H, m), 3.51 (1H, d, J = 11.7 Hz), 3.02 (3H, s), 2.36 (2H, t, J = 5.9 Hz), 1.77 (3H, s), 1.14 (6H, d, J = 6.8 Hz), 1.05 (6H, d, J = 6.8 Hz).(minor diastereomer)13.47 (1H, br s), 8.33 (2H, d, J = 7.3 Hz), 7.98 (1H, s), 7.56 (1H, dd, J = 7.3, 7.3 Hz), 7.47-7.43 (4H, m), 7.35-7.28 (7H, m), 7.22 (1H, m), 6.86 (4H, dd, J = 8.8, 5.5 Hz), 5.51 (1H, s), 4.60 (1H, d, J = 4.3 Hz), 4.43 (1H, s), 3.88 (1H, d, J = 11.7 Hz), 3.802 (3H, s), 3.798 (3H, s), 3.64 (1H, m), 3.52 (1H, d, J = 11.7 Hz), 3.52-3.44 (3H, m), 3.04 (3H, s), 2.60-2.52 (2H, m), 1.79 (3H, s), 1.11 (6H, d, J = 6.8 Hz), 0.99 (6H, d, J = 6.8 Hz).
31P-NMR (CDCl3) δ: 151.24, 151.05.
[実施例12]
窒素雰囲気下、化合物14(100mg、0.177mmol)および6−N−ベンゾイルメチルシトシン(49mg、0.213mmol)のシクロペンチルメチルエーテル(2mL)懸濁液に、N,O−ビス(トリメチルシリル)アセトアミド(0.304mL、1.24mmol)およびTMSOTf(0.0641mL、0.355mmol)を加え、70℃で4時間撹拌した。反応液に氷冷下、テトラヒドロフラン(20mL)、1mol/L塩酸(20mL)を加えて分配した後、有機層を0.1mol/L塩酸(110mL)および水(110mL)で洗浄、無水硫酸マグネシウムにて乾燥後、溶媒を減圧下濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(クロロホルム/メタノール)にて精製することにより,化合物62(84mg、収率75%)を得た。1H-NMRでは71:29のロータマー混合物として観測された。
1H-NMR(CD3OD)δ:(Major) 8.30-8.17 (2H, m), 7.96 (1H, br.s), 7.56 (1H, dd, J=7.3
7.3 Hz), 7.48 (2H, d, J=7.5, 7.3 Hz), 6.95 (1H, J=8.6 Hz, H-1 of sugar), 4.99 (1H, dd,
J=8.6, 8.0 Hz), 4.79 (1H, d, J=8.0 Hz), 4.10 (1H, d, J=11.9 Hz), 3.90 (1H, d, J=11.9 Hz), 2.11 (3H, s), 0.93 (9H, s), 0.21 (3H, s), -0.01 (3H, s). (Minor) 8.30-8.17 (2H, m), 7.98 (1H, br.s), 7.56 (1H, dd, J=7.3, 7.3 Hz), 7.48 (2H, d, J=7.5, 7.3 Hz), 6.90 (1H, J=7.8 Hz, H-1 of sugar), 4.73 (1H, d, J=6.8 Hz), 4.51 (1H, dd, J=7.8, 6.8 Hz), 4.12 (1H, d, J=11.9 Hz), 3.86 (1H, d, J=11.9 Hz), 2.11 (3H, s), 0.93 (9H, s), 0.21 (3H, s), -0.01 (3H, s).
実施例2の工程2と同様な条件で合成した。
実施例2の工程3と同様な条件で合成した。
実施例11の工程5と同条件で合成した。
[実施例13]
実施例11の工程1と同条件で合成した。
実施例11の工程2と同条件で合成した。
窒素気流下、2Lの4口フラスコに化合物26(粗製、101.7g)、ピリジン(300ml)を加え、撹拌溶解した。無水酢酸(50mL)を添加して室温で1時間撹拌した後、酢酸エチルで希釈、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(2回)、飽和食塩水で順次洗浄した。無水硫酸ナトリウムにて乾燥後、ろ過、濃縮して得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(トルエン/酢酸エチル=2/1→1/1→ 2/3→ 0/1)で精製することにより、化合物64(49.1g、化合物25からの収率77%)をベージュ粉末として得た。
窒素気流下、1Lの4口フラスコに化合物64(61.7g)、テトラヒドロフラン(305ml)を加え、撹拌溶解した。1mol/l テトラブチルアンモニウムフロリド/テトラヒドロフラン溶液(98ml、1.2eq.)を加え、室温で1時間撹拌した後、そのまま濃縮した。残渣を酢酸エチルと水で分配して得られた有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムにて乾燥後、ろ過、濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(トルエン/酢酸エチル=1/0→1/1)で精製して、化合物65(17.1g)を得た。
窒素雰囲気下、500mLの4口フラスコに化合物65(17.0g、26.5mmol)、ジイソプロピルアンモニウムテトラゾリド(3.41g、MR=0.75)を入れ、アセトニトリル(170mL)、テトラヒドロフラン(57ml)を加えて、15分間撹拌した後、2−シアノエチルーN,N、N’、N’−テトライソプロピルホスホロアミダイト(9.60g、MR=1.2)を添加して30℃で3時間撹拌した。室温にて酢酸エチルー5%炭酸水素ナトリウム水溶液にて分配後、有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ過、濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル/アセトン 10/1)にて精製した後、ジクロロメタンとヘキサンの混合溶媒にて洗浄することにより、化合物66(15.4g、2種のジアステレオマー比(1H-NMRの積分値より算出)=72:28))を得た。
1H-NMR (CDCl3)δ:(major diastereomer)8.06 (1H, br s), 7.44 (2H, d, J=7.3 Hz), 7.37-7.24 (8H, m), 6.88-6.80 (4H, m), 5.56 (1H, br.s, H-1 of sugar), 4.59 (1H, d, J=7.5 Hz), 4.47 (1H, br.s), 3.90 (1H, d, J = 11.8 Hz), 3.802 (3H, s), 3.798 (3H, s), 3.58-3.40 (5H, m), 3.03 (3H, s, -NCH3), 2.69 (2H, br.s), 1.58 (3H, s), 1.14 (6H, d, J=6.8 Hz), 1.03 (6H, d, J=6.8 Hz).(minor diastereomer)8.06 (1H, br s), 7.43 (2H, d, J=7.3 Hz), 7.37-7.24 (8H, m), 6.88-6.80 (4H, m), 5.54 (1H, br.s, H-1 of sugar), 4.57 (1H, dd, J=5.8, 1.5 Hz), 4.47 (1H, br.s), 3.87 (1H, d, J = 11.8 Hz), 3.792 (3H, s), 3.789 (3H, s), 3.78 (1H, m), 3.61 (1H, m), 3.54 (1H, d, J = 11.8 Hz), 3.52-3.41 (2H, m), 3.05 (3H, s, -NCH3), 2.69 (2H, br.s), 1.58 (3H, s), 1.10 (6H, d, J=6.8 Hz), 0.98 (6H, d, J=6.8 Hz).
[実施例14]
窒素雰囲気下、化合物14(100mg、0.177mmol)および6−N−ベンゾイルウリジン(49mg、0.213mmol)のシクロペンチルメチルエーテル(2mL)懸濁液に、N,O−ビス(トリメチルシリル)アセトアミド(0.304mL、1.24mmol)およびTMSOTf(0.0641mL、0.355mmol)を加え、70℃で4時間撹拌した。反応液に氷冷下、テトラヒドロフラン(20mL)、1mol/L塩酸(20mL)を加えて分配した後、有機層を0.1mol/L塩酸(110mL)および水(110mL)で洗浄、無水硫酸マグネシウムにて乾燥後、溶媒を減圧下濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(クロロホルム/メタノール)にて精製することにより、化合物67(80mg、収率75%)を得た。
実施例2の工程2と同様な条件で合成した。
実施例2の工程3と同様な条件で合成した。
実施例11の工程5と同様な条件で合成した。
以下に、アミド架橋型核酸誘導体のその他の架橋型核酸誘導体の合成ルートを示す。
2'-(R)-(トリフルオロアセチル)-N-メチルアミノ-3',5'-ジ-O-ベンジル-4'-tert-ブチルジフェニルシリルオキシメチルチミジン(2'-(R)-(trifluoroacetyl)-N-methylamino-3',5'-di-O-benzyl-4'-tert-butyldiphenylsilyloxymethylthymidine)の合成法(その1)
国際公開第2011/052436号に記載の方法にてD−グルコースより誘導した化合物101(3.5kg、4.782mo1)のN,N’−ジメチルホルムアミド溶液(10.5L、3V)に、炭酸カリウム(1652g、11.95mol、2.5eq)、パラメトキシベンジルクロリド(823.8g、5.260mol, 1.1eq)を加え、室温にて19時間撹拌した。この反応液に酢酸エチル 35.00L(10v/w)、市水 35.00L(10v/w)を加えて抽出、分液を行い、有機層Iと水層Iを得た。そして、水層Iを酢酸エチル 10.50L(3v/w)で抽出を行い、有機層IIを得た。得られた有機層IとIIを合わせ、水 24.50L(7v/w)、10%食塩水24.50L(7v/w)でそれぞれ洗浄し、濃縮、減圧乾燥を行い、化合物102(4470g)の粗生成物を褐色油状物として得た。得られた化合物102は精製を行わず、収率は定量的とし次工程に進めた。
化合物102(粗製、4470g)をテトラヒドロフラン(16.30L、4v/w)に溶解させ、市水(407.5g、0.1w/w)を加えた。次いで、液温30℃以下でn−トリブチルホスフィン(1258g、6.218mol、1.3eq)を滴下し、同温にて5時間撹拌した。この反応液にジクロロメタン(24.50L、6v/w)、市水(4.100L、1v/w)を加えて抽出、分液を行い、得られた有機層を留出がほぼなくなるまで濃縮を行った。ジクロロメタン(5.000L、1.2v/w)×2回で共沸させた後、減圧乾燥を行い、化合物103(5557g)の粗生成物を褐色油状物として得た。前工程同様、得られた化合物103は精製を行わず、収率は定量的とし次工程に進めた。
化合物103(粗製、5557g)をジクロロメタン(7.900L(2v/w))に溶解させ、ピリジン(945.6g、11.95mol、2.5eq)を加えた。次いで、液温35℃以下でTFAA(1507g、7.175mol、1.5eq)を滴下し、同温にて2時間撹拌した。この反応液をCH2Cl2(19.75L、5v/w)、冷10% Na2CO3 aq.(11.85L、3v/w)に滴下し、抽出、分液を行い、得られた有機層を5%NaHCO3 aq.(24.50L、7v/w)で洗浄し、濃縮、減圧乾燥を行い、化合物104(6550g)を赤褐色固体として得た。これにジクロロメタン(2.000L、0.5v/w)を加え、液温40℃にて加熱溶解させ、イソプロピルエーテル(39.50L、10v/w)を徐々に加えて、室温まで自然放冷した後、18時間撹拌した。そして、液温5℃以下にて1時間撹拌し、析出した結晶をろ過した。得られた結晶をイソプロピルエーテル(10.00L、2.5v/w)で洗浄後、減圧乾燥を行い、化合物104+n−Bu3PO(4392g)を淡桃色結晶化合物として得た。この結晶の1H−NMRを測定し、化合物104は3544g(3.844mol)含有していると換算した。化合物101からの収率=80.4%。
化合物104+n−Bu3PO(4392g)を液温50℃でDMF 10.60L(3v/w)に溶解させ、炭酸カリウム(1062g、7.684mol、2eq)を加えた。次いで、液温55℃以下でヨードメタン(818.3g、5.765mol, 1.5eq)を滴下し、同温にて7時間、室温にて15時間撹拌した。この反応液に酢酸エチル(35.50L、10v/w)、5%食塩水(24.80L、7v/w)を加えて抽出、分液を行い、有機層Iと水層Iを得た。そして、水層Iを酢酸エチル(10.00L、2.8v/w)で抽出を行い、有機層IIを得た。得られた有機層IとIIを合わせ、Na2S2O3・5H2O 1908g(7.688mol、2eq)+市水 24.80L(7v/w)、5%炭酸水素ナトリウム水溶液(24.80L、7v/w)、10%食塩水(24.80L、7v/w)でそれぞれ洗浄し、濃縮、減圧乾燥を行い、化合物105の粗生成物(4386g)を黄褐色油状物として得た。得られた化合物105の粗生成物は精製を行わず、収率は定量的とし次工程に進めた。
化合物105の粗生成物(4386g)をアセトニトリル(25.20L、7v/w)に溶解させ、液温30℃以下で、CAN 7586g(13.84mol,3.6eq)+市水(9.000L、2.5v/w)溶液を30分間で滴下し、同温にて2時間撹拌した。この反応液に酢酸エチル(36.00L、10v/w)、市水(25.20L、7v/w)を加えて抽出、分液を行い、得られた有機層を市水(25.20L、7v/w)で洗浄した。ここに5%酸水素ナトリウム水溶液(25.20L、7v/w)を加え、生成した不溶物をろ過後(洗浄でAcOEt 8.000L(2.2v/w)使用)、分液を行い、得られた有機層を5%炭酸水素ナトリウム水溶液(25.20L、7v/w)、10%食塩水(25.20L、7v/w)でそれぞれ洗浄し、濃縮、減圧乾燥を行った。
得られた残渣を10% 酢酸エチル−n−ヘキサン溶液(5.000L)溶解させたものを、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(シリカゲル:43.00kg、酢酸エチル/ n−ヘキサン=0/1〜1/4(v/v))により精製した後、トルエン(4000g)にて再結晶することにより、化合物106(2398g、化合物104からの収率=76.5%)を微黄色結晶として得た。1H-NMRでは8:2のロータマー混合物として観測された。
1H-NMR(CDCl3)・:(Major) 8.17 (1H, br.s), 7.66-7.05 (21H, m), 6.58 (1H, d, J=9.7 Hz), 5.17 (1H, dd, J = 9.7, 5.7Hz), 4.69-4.48 (4H, m), 4.44 (1H, d, J = 11.3 Hz), 3.97 (1H, d, J = 10.2 Hz), 3.75 (1H, d, J = 10.2 Hz), 3.65 (1H, d, J = 10.2 Hz), 3.60 (1H, d, J = 10.2 Hz), 3.20 (3H, s), 2.36 (3H, s), 1.03 (9H, s).(Minor)8.10 (1H, br.s), 7.66-7.05 (21H, m), 6.53 (1H, d, J=9.0 Hz), 3.69 (1H, d, J = 10.2 Hz), 3.55 (1H, d, J = 10.2 Hz), 3.15 (3H, s), 2.36 (3H, s), 1.03 (9H, s).
国際公開第2011/052436号に記載の方法にてD−グルコースより誘導した化合物100(2.38mmol)をメチルアミン(20mL、2.0mol/L THF溶液,40mmol)に溶解させ,マイクロウェーブを用いて60℃まで加熱し8時間攪拌した。反応液を濃縮乾固し、化合物107を得た。得られた化合物は精製せずそのまま次の反応に進めた。
前工程で得られた化合物107をジクロロメタン(10mL)に溶解させ、ピリジン(481μl、5.96mmol)加え、TFAA(504μL、3.58mmol)を滴下し室温で2時間攪拌した。飽和塩化アンモニウム水溶液を加え、抽出した。得られた有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液及び飽和食塩水で洗浄し、硫酸マグネシムにて乾燥した。減圧下溶媒を留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル=3/1)にて精製し、化合物106(1g、収率51%)を得た。
LC-MS: UPLC 4min acid 3.29 min, M+H = 816
窒素気流下、20Lフラスコに化合物106(599.60g,734.85mmol)、Bz−アデニン(351.82g,2eq.)、1,2−DCE(3000ml,5v/w)を加えてこれを撹拌溶解した。この溶液にBSA(899.50g、6eq.)を加え昇温し、49℃に保ちながら1時間撹拌した。24℃まで冷却後、TMSOTf(49.55g,0.3eq.)を加え再度昇温し、60℃に保ちながら5.5時間撹拌した。反応溶液を5℃まで冷却した後、8%炭酸水素ナトリウム水溶液(900g)を滴加した。滴加終了後、室温でこれを15時間撹拌した(ベージュ色スラリー状)。これにDCM(7800g)を加え、1時間室温で撹拌し、セライト濾過により固体を濾別した。濾別した残渣をDCM(4800g)により再度スラリー洗浄し、セライト濾過により固体を濾別した。さらにその残渣をDCM(3000g)によりスラリー洗浄し、吸引濾過により固体を濾別した(この操作を2回繰り返した)。得られた母液全てを20L水洗釜に移し、8%炭酸水素ナトリウム水溶液(900g)を加えて有機層を洗浄し、水層をDCM(900g)で再抽出した。得られた有機層に硫酸ナトリウム(600g)を添加し30分撹拌後、濾過、減圧濃縮、乾燥を行い、化合物107(645g,収率94.4%)を黄褐色アモルファス固体として得た。
窒素気流下、化合物107(645g,694.24mmol)のTHF(1290ml,2v/w)溶液に1.0mol/L−TBAF/THF溶液(766.44g、1.2eq.)を室温で加えた後、24℃で21時間保温撹拌した。反応溶液を減圧濃縮した後、これを酢酸エチル(1743g)に溶解して10L水洗釜に移し、市水(2142g)で洗浄した。有機層を5%食塩水(1290g)で再度洗浄し、この食塩水を酢酸エチル(322g)で再度抽出した。得られた有機層を減圧濃縮した後、トルエン(1000g)共沸を行った。これを乾燥して得られた粗体(405g)にジクロロメタン(712g)を加えて、40℃に加温溶解した。これをシリカゲル(シリカゲルの担体量:3870g、酢酸エチル/トルエン=1/2→1/1→ 2/1→1/0)により精製し、化合物108(405g、収率84.5%)を白色固体として得た。
窒素気流下、10Lの四つ口フラスコに化合物108(402g、582.04mmol)、アセトニトリル(3216ml、8v/w)、1mol/l酢酸水溶液(543ml、1.35v/w)、1mol/l酢酸ナトリウム水溶液(1085ml,2.7v/w)、TEMPO(9.09g,0.1eq.)、80%亜塩素酸ナトリウム(138.13g,2.1eq.)、9%次亜塩素酸ナトリウム(6.0ml,0.015v/w)を順次加え、内温を36℃まで昇温し、保温撹拌した。4.5時間撹拌後、9%次亜塩素酸ナトリウム(2ml、0.005v/w)を追加し、さらに16時間保温撹拌した。反応溶液を6℃まで冷却した後、20%亜硫酸ナトリウム水溶液(804g)を滴加し、続けて酢酸(177g)を添加した。この混合溶液を分液し、水層を酢酸エチル(1123g)で再抽出し、得られた有機層を15%食塩水(1373g)で洗浄した。この有機層を減圧濃縮し、トルエン(1200ml×2)共沸、乾燥を行い、化合物109(468g)を白色固体として得た。
窒素気流下、化合物109(468g、中身量410g,582.04mmol)のメタノール(2800ml、6v/w)溶液に25%アンモニア水(468ml,1v/w)を室温下で加えた後、39℃まで昇温し、保温撹拌した。6時間撹拌後、25%アンモニア水(140ml、0.3v/w)を追加し、さらに16時間撹拌後、25%アンモニア水(94ml、0.2v/w)を追加した。8時間保温撹拌後、反応溶液を放冷し、さらに16時間撹拌した。反応溶液を減圧濃縮し、トルエン(2500ml×2)共沸、乾燥を行い、化合物110(470g、HPLCから算出した純度:80.8%)を橙色固体として得た。
窒素気流下、10Lの四つ口フラスコに化合物110(470g、中身量294g、582.04mmol)、DMF(1800ml、6.1v/w)を加え、24℃で保温撹拌した。溶解確認後、EDC塩酸塩(169g、1.5eq.)を加え、保温撹拌した。5時間撹拌後、EDC塩酸塩(23g、0.2eq.)を追加しさらに17.5時間保温撹拌した後、市水(5124g)を15分かけて滴加した。このスラリー溶液を1時間撹拌した後、吸引濾過により結晶を濾過、市水でかけ洗い、結晶を乾燥し、化合物111(226g,化合物108から3工程での収率79.9%)をクリーム色結晶として得た。
窒素気流下、3Lフラスコに化合物111(225g、462.47mmol)と酢酸(1125ml、5v/w)を加え、50℃まで昇温し撹拌溶解した。これに20%Pd(OH)2−C(44.98g、0.2w/w)を添加し系内を水素置換した後、続けて水素を反応溶液に吹き込みながら保温撹拌した。6時間撹拌後、20%Pd(OH)2−C(22.49g、0.1w/w)を追加した。2.5時間撹拌後、20%Pd(OH)2−C(11.25g、0.05w/w)をさらに追加し、さらに3時間撹拌した。その後反応溶液を吸引濾過し、メタノール(2030g)でかけ洗い、母液を約1Lまで減圧濃縮した。トルエン(1300ml×2)共沸を行った後(約1Lまで減圧濃縮)、トルエン(1000ml)を加え室温で撹拌し、吸引濾過により固体をろ取、乾燥し、化合物112(139.7g、98.7%)を淡い灰色固体として得た。
前出の参考例1のA(Bz)アミダイトの合成の工程2と同様な条件で合成できる。
前出の参考例1のA(Bz)アミダイトの合成の工程3と同様な条件で合成できる。
化合物114(14mg、0.023mmol)をジクロロエタン1mLに溶解させ、N−ベンゾイルグアニン16mg(0.069mmol)と(E)−トリメチルシリル N−トリメチルシリルアセトアミド 42mg(0.21mmol)を加え60℃まで加熱し20分攪拌した。反応液を室温まで低下させた後にTMSOTf(4μl、0.023mmol)を加え再び60℃まで加熱し6時間攪拌した。反応液をそのまま、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(クロロホルム/メタノール=10/1)にて精製することにより、化合物110(5mg、収率30%)を得た。LC-MS: UPLC 4min acid 2.50, 2.59(回転異性体) min, M+H = 719
窒素気流下、O−N,N−ジフェニルカルバモイル−N−イソブチルグアニン(93.0g,223mmol),1、2―ジクロロエタン(760ml)を仕込み、氷冷下でBSA(136.2g,670mmol)の滴下を行った。内温を60℃まで加熱し、30分間撹枠した。その後氷冷下まで内温を下げ、化合物106(152g,186mmol)を添加、1,2―ジクロロエタン(l50ml)で洗い込みを行った後、TMSOTf(l2.4g、55.8mmol)の滴下を行った。再び60℃まで加温し、2時間撹拌を行った。反応液を氷冷下にて飽和重曹水(675ml)を滴下し、次いでろ過助剤としてKCフロック(45g)を添加した。反応液をろ過した後、酢酸エチルでヌッチェ洗浄を行い、有機溶媒を濃縮した。濃縮液を酢酸エチルで3回抽出した後、飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムにて乾燥、濃縮することにより、化合物115(l92.9g,174mmol、収率94%)を得た。
化合物115(192.5g,1.74mmol)のメタノール(500g)溶液に室温でフッ化アンモニウム(77.3g,2.09mol)を加えた後、バス温を68℃まで上げ、3.5時間撹枠を行った。室温まで冷却し、水(1L)と酢酸エチル(1.5L)に反応液を添加した。分液を行い、さらに水層を酢酸エチル(500mlx2)で抽出した後、有機層を合わせて飽和食塩水(500ml)で洗浄、濃縮した。得られた粗体を
シリカゲルカラムクロマトクロマトグラフィー(シリカゲルの担体量:1.1kg、ヘキサン・酢酸エチル・メタノール)で精製することにより、化合物116(87.0g、収率68.5%)を得た。
室温下、化合物116(87g)をアセトニトリル(440g)に溶解させ、1mol/L 酢酸(87ml)、1mol/L 酢酸ナトリウム(174ml)を添加した。さらにTEMPO(1.8g,11.6mmol)を加え、80%亜塩素酸ソーダ(NaClO2、27.5g,243mmol)及び12%次亜塩素酸ソーダ(NaClO、1.5ml)を加えた。28℃付近で2.5時間撹拌し、12%次亜塩素酸ソーダ(NaClO、1.5ml)を追加した(反応液が燈色から茶褐色へと変化した)。そのまま1夜撹拌した後、2―メチルー2―ブテン(80ml)を添加し、40分間撹拌した(反応液が茶褐色から燈色に変化)。この溶液に酢酸(35ml)を添加し、酢酸エチル(200ml)で抽出した後、飽和食塩水(50ml)で洗浄、濃縮し、トルエン(100mlx3回)で共沸を行うことにより、化合物117(113g)の粗生成物を得た。
粗製の化合物117(113g)をメタノール(400g)に溶解させ、25%アンモニア水(200ml)を加え、40℃で一晩撹拌した。反応液を濃縮し、トルエン(200mlx3回)で共沸を行うことにより、化合物118(112.8g)の粗生成物を得た。
窒素気流下、室温で化合物118(112.8g,115.7mmol相当とする)をN,N’−ジメチルホルムアミド(440g)に溶解させ、EDC塩酸塩(33.3g,173.6mmol)を添加した。そのまま撹枠を行い、反応進行を確認しながら、EDC塩酸塩(17.8g,92.8mmol)を添加した。反応の終了確認後、反応液を水(1760g)と酢酸エチル(25g)撹拌下で分散を行った。生じた結晶をろ取し、水(300g)及び酢酸エチル/ヘキサン(1/4)(150ml)にて洗浄、減圧乾燥を行うことにより、化合物119(40g,79.6mmol、化合物116から収率:45.9%)を無色固体として得た。
窒素気流下、室温で化合物119(40g,79.6mmol)を酢酸(400ml)と混合し、水酸化パラジウム(12.5g)を添加後、水素雰囲気下で24時間、30℃で撹拌した。反応系中で結晶が析出するため、水(80g)を添加し、さらに2日間撹拌した後、触媒をろ別し、ろ液を濃縮した。トルエン(80gx2回)で共沸を行った後、得られた固体をメタノール(50g)にてスラリー洗浄、乾燥し、化合物21a(19.5g,60.5mmol、収率76.2%)で得た。
化合物106から化合物14bへの変換は以下のスキームに記載の方法で実施できる。化合物14bからは、実施例3あるいは国際公開第2011/052436号に記載の方法で合成することができる。
Chemische Berichte、101(7), 2289−93(1968).に記載の方法にて、D-グルコサミン塩酸塩より化合物124を得た。
窒素気流下、水素化ナトリウム(0.89g,22.2mmol)のN,N’−ジメチルホルムアミド(30mL)懸濁液に、5〜7℃で化合物124(5.2g,17.1mmol)のN,N’−ジメチルホルムアミド(30mL)溶液を滴下し、30分間撹拌した。続いて臭化ベンジル(2.4mL,20.5mmol)を7〜8℃で反応液に滴下して、室温にて90分間撹拌した。飽和塩化アンモニウム水溶液を加えて、tert−ブチルメチルエーテルで抽出後、有機層を水および飽和食塩水で洗浄した。その後硫酸ナトリウムで乾燥し、減圧留去した。得られた粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘキサン/酢酸エチル)にて精製し、化合物125(5.1g,12.9mmol)を淡黄色固体として得た。
1H-NMR (CDCl3)δ: 8.04 (2H, dt, J = 6.71, 1.60 Hz), 7.53-7.32 (10H, m), 6.25 (1H, d, J = 5.19 Hz), 5.02 (1H, d, J = 11.44 Hz), 4.84 (1H, dd, J = 6.71, 5.34 Hz), 4.71 (1H, d, J = 11.29 Hz), 4.42 (1H, td, J = 7.02, 2.90 Hz), 4.28 (1H, dd, J = 8.69, 6.86 Hz), 4.04-3.88 (3H, m), 1.40 (3H, s), 1.39 (4H, s).
窒素気流下、チミン(1.43g,11.4mmol)のアセトニトリル(15mL)懸濁液にN,O−ビストリメチルシリルアセトアミド(4.7mL,18.9mmol)を加えて80℃下で60分間撹拌した。その後、化合物125(3.0g,7.6mmol)のアセトニトリル(15mL)溶液および四塩化スズ(0.89mL,7.6mmol)を加えて、80℃下で6時間撹拌した。室温まで冷ました後飽和重層水を加えて、析出した固体をセライトろ過により除去した。反応液を減圧濃縮後、残渣から酢酸エチルで抽出し、水および飽和食塩水で洗浄した。硫酸ナトリウムで乾燥し、減圧濃縮することで粗生成物125a(4.1g)を得た。続いて、粗生成物126(4.1g)をメタノール(30mL)および水(10mL)に溶解させ、室温にてカンファースルホン酸(0.73g,3.1mmol)を加えて2時間撹拌した。1mol/L水酸化ナトリウム水溶液を加えて中和した後、減圧濃縮した。残渣から酢酸エチルで抽出して水および飽和食塩水で洗浄後、硫酸ナトリウムで乾燥し減圧濃縮した。再結晶(n−ヘキサン/酢酸エチル)により化合物126(3.2g,6.7mmol)を白色固体として得た。
1H-NMR (CD3OD)δ: 7.83 (1H, d, J = 1.18 Hz), 7.75-7.72 (2H, m), 7.55-7.52 (1H, m), 7.46-7.25 (7H, m), 6.19 (1H, d, J = 8.39 Hz), 4.91 (1H, dd, J = 8.48, 5.79 Hz), 4.75 (1H, d, J = 11.92 Hz), 4.55 (1H, d, J = 11.92 Hz), 4.36-4.32 (2H, m), 3.90 (1H, td, J = 5.75, 3.58 Hz), 3.61 (2H, d, J = 5.88 Hz), 1.91 (3H, d, J = 1.18 Hz).
室温下、化合物126(3.4g,7.1mmol)のテトラヒドロン―水混合溶液(1:1,30mL)に過ヨウ素酸ナトリウム(2.3g,10.6mmol)を加えて、1時間撹拌した。エチレングリコール(0.4mL,7.1mmol)を加えてしばらく撹拌した後、生じた白色固体をろ過により除去した。有機層を酢酸エチルで抽出した後、水および飽和食塩水で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥した。有機層を減圧留去して、粗生成物127(3.6g)を得た。
粗生成物127(3.4g、7.3mmol)のテトラヒドロンフラン(20mL)溶液を−10℃まで冷却後、37%ホルムアルデヒド(1.4mL、18.2mmol)および2mol/L水酸化ナトリウム水溶液(11mL、22mmol)を加えて、2℃下で3時間撹拌した。2mol/L塩酸水溶液で中和後、酢酸エチルで抽出した。有機層を水および飽和食塩水で洗浄後、硫酸ナトリウムで乾燥した。有機層を減圧留去して、粗生成物128(3.6g)を得た。
室温下、粗生成物128(3.6g)のtert−ブタノール‐水‐テトラヒドロフラン(5:5:1, 33mL)混合溶液に2−メチル−2−ブテン(7.8mL、75mmol)、リン酸二水素ナトリウム(2.7g、22.5mmol)、亜塩素酸ナトリウム(1.4g、15mmol)を加えて2時間30分撹拌した。1mol/L塩酸水溶液を加えて反応液をpH2〜3に調整した後、クロロホルムで抽出した。有機層を水および飽和食塩水で洗浄後、硫酸ナトリウムで乾燥した。有機層を減圧留去して、粗生成物129(3.7g)を得た。
室温にて、粗生成物129(3.7g)のトルエン−メタノール溶液(2:1、30mL)に2mol/Lトリメチルシリルジアゾメタン溶液(4.9mL、9.7mmol)を滴下して40分間撹拌した。酢酸(0.2mL)を加えた後、反応液を減圧濃縮した。得られた固体を酢酸エチル/メタノールから再結晶して、化合物130(1.54g、3.1mmol)を白色固体として得た。
1H-NMR (CD3OD)δ: 7.81 (1H, d, J = 1.22 Hz), 7.68-7.66 (2H, m), 7.53-7.51 (1H, m), 7.42-7.40 (3H, m), 7.26-7.21 (6H, m), 6.36 (1H, d, J = 8.69 Hz), 4.96-4.87 (28H, m), 4.66 (1H, d, J = 11.13 Hz), 4.60-4.51 (3H, m), 4.12 (1H, dd, J = 13.12, 9.46 Hz), 3.88 (2H, t, J = 10.98 Hz), 3.72 (3H, s), 1.91 (3H, t, J = 3.13 Hz).
既知の手法(Tetrahedron、1998、54、3607.など)により合成した化合物148(2.0g、 4.70mmol)をアセトニトリル(20ml)及び酢酸緩衝液(6ml)に溶解させた。氷冷下2,2,6,6−テトラメチルピペリジニルオキシラジカル (74mg、 0.47 mmol)、亜塩素酸ナトリウム(894mg、9.88mmol)及び5%次亜塩素酸ナトリウム水溶液(1ml)を加え、室温にて一晩攪拌した。反応液に2-メチル-2-ブテン(2ml)を加え、室温にて2時間攪拌し、酢酸エチルにて抽出した。得られた有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムにて乾燥した。減圧下溶媒を留去し、淡オレンジ色のオイルを得た。再結晶(酢酸エチル/ヘキサン)により、化合物149(1.58g、収率81%)を白色固体として得た。
1H-NMR (DMSO-D6)δ: 12.68 (1H, s), 7.37-7.29 (10H, m), 5.78 (1H, d, J = 3.8 Hz), 4.76 (1H, t, J = 4.5 Hz), 4.60 (2H, dd, J = 50.7, 11.9 Hz), 4.14 (1H, d, J = 5.3 Hz), 3.66 (2H, t, J = 10.7 Hz), 1.49 (3H, s), 1.29 (3H, s).
第1工程で得られた化合物149(720mg、1.74mmol)をN,N−ジメチルホルムアミド(5.5ml)に溶解させた。室温にて2mol/Lメタンアミンのテトラヒドロフラン溶液(2.6ml、5.22mmol)、1−ヒドロキシベンゾトリアゾール一水和物(293mg、1.91mmol)及び1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(366mg、1.91mmol)を加え、室温にて8時間攪拌した。反応液に飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、酢酸エチルにて抽出した。得られた有機層を1mol/L塩酸水、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液及び飽和食塩水で洗浄し、硫酸マグネシウムにて乾燥した。減圧下溶媒を留去し、化合物150(753mg)を淡オレンジ色固体として得た。
1H-NMR (DMSO-D6)δ: 7.44 (1H, d, J = 4.6 Hz), 7.37-7.27 (10H, m), 5.86 (1H, d, J = 4.3 Hz), 4.82 (1H, t, J = 4.8 Hz), 4.60 (2H, dd, J = 40.0, 12.0 Hz), 4.48 (2H, dd, J = 14.2, 12.8 Hz), 4.12 (1H, d, J = 5.5 Hz), 3.63 (2H, dd, J = 56.9, 10.2 Hz), 2.63 (3H, d, J = 4.6 Hz), 1.41 (3H, s), 1.30 (3H, s).
第2工程で得られた化合物150(500mg、1.11mmol)を酢酸(1.2ml、21.13mmol)に溶解させた。無水酢酸(0.58ml、6.12mmol)を加え、氷冷下濃硫酸(0.012ml、0.22mmol)を滴下し、室温にて7時間攪拌した。反応液を酢酸エチル(5ml)にて希釈し、氷水に注いだ。氷冷下、水酸化ナトリウム水溶液にて中和し、酢酸エチルにて抽出した。得られた有機層を20%炭酸ナトリウム水溶液及び飽和食塩水にて洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥した。減圧下溶媒を留去し、化合物151(543mg)を粗オイルとして得た。
第3工程で得られた化合物151(540mg、1.11mmol)をアセトニトリル(3ml)に溶解した。室温にて5−メチルウリジン(188mg、1.49mmol)、N,O−ビストリメチルシリルアセトアミド(0.56ml、2.29mmol)を加え、55℃にて15分間攪拌した。トリメチルシリルトリフラート(0.23ml、1.26mmol)を加え、75℃にて3.5時間攪拌した。氷冷下、反応液に3%飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、酢酸エチルにて抽出した。有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液及び飽和食塩水にて洗浄し、無水硫酸マグネシウムを用いて乾燥した。減圧下溶媒を留去し、化合物152(549mg、収率93%)をアモルファスとして得た。
1H-NMR (DMSO-D6)δ: 11.39 (1H, s), 8.26 (1H, d, J = 4.5 Hz), 7.61 (1H, s), 7.36 (10H, m), 6.31 (1H, d, J = 8.4 Hz), 5.39 (1H, dd, J = 8.3, 4.9 Hz), 4.72 (1H, d, J = 11.7 Hz), 4.62 (2H, dd, J = 11.2, 6.9 Hz), 4.49 (2H, dd, J = 16.1, 7.8 Hz), 4.12 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.73 (1H, d, J = 10.3 Hz), 2.61 (3H, d, J = 4.3 Hz), 2.02 (3H, s), 1.43 (3H, s).
第4工程で得られた化合物152(549mg、1.03mmol)をテトラヒドロフラン(1.5ml)に溶解させた。室温にて40%メタンアミン水溶液(0.49ml、5.89mmol)を加え、室温にて3時間攪拌した。氷冷下反応液に飽和塩化アンモニウム水溶液を加え、酢酸エチルにて抽出した。得られた有機層を飽和食塩水で洗浄し、硫酸マグネシウムにて乾燥した。減圧下溶媒を留去し、化合物153(498mg、収率98%)をアモルファスとして得た。
1H-NMR (DMSO-D6)δ: 11.36 (1H, s), 8.08 (1H, d, J = 4.6 Hz), 7.57 (1H, s), 7.38-7.29 (10H, m), 6.09 (1H, d, J = 8.4 Hz), 5.59 (1H, d, J = 6.3 Hz), 4.80 (1H, d, J = 11.2 Hz), 4.66 (1H, d, J = 11.7 Hz), 4.58 (2H, d, J = 10.7 Hz), 4.44 (1H, dd, J = 12.4, 6.8 Hz), 4.17 (1H, d, J = 4.3 Hz), 4.05 (1H, d, J = 10.7 Hz), 3.68 (1H, d, J = 10.2 Hz), 2.60 (3H, d, J = 4.5 Hz), 1.50 (3H, s).
第5工程で得られた化合物153(480mg、0.97mmol)をピリジン(1.5ml)に溶解させた。氷冷下メシルクロライド(0.18ml、2.28mmol)を加え、0℃にて30分間攪拌した。反応液を酢酸エチルにて希釈し、水を加え、抽出を行なった。得られた有機層を2mol/L塩酸水で3回洗浄後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液及び飽和食塩水で洗浄し、硫酸マグネシムにて乾燥した。減圧下溶媒を留去し、化合物154(520mg、収率93%)をアモルファスとして得た。
1H-NMR (DMSO-D6)δ: 11.46 (1H, s), 8.28 (1H, d, J = 4.6 Hz), 7.55 (1H, s), 7.40-7.32 (10H, m), 6.31 (1H, d, J = 8.2 Hz), 5.36 (1H, dd, J = 8.0, 4.6 Hz), 4.73-4.60 (5H, m), 4.10 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.77 (1H, d, J = 10.3 Hz), 3.23 (3H, s), 2.61 (3H, d, J = 4.5 Hz), 1.43 (3H, s).
工程6で得られた化合物154(515mg、0.90mmol)をアセトニトリル(5ml)に溶解させた。室温にてジアザビシクロウンデセン(0.18ml、1.20mmol)を加え、室温にて7時間攪拌した。氷冷下反応液に酢酸エチルを加えて希釈し、5%クエン酸水溶液を加え、抽出した。得られた有機層を5%クエン酸水溶液、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液及び飽和食塩水で洗浄し、硫酸マグネシムにて乾燥した。減圧下溶媒を留去し、淡黄色オイルを得た。再結晶(酢酸エチル/ヘキサン)により化合物155(374mg、収率87%)を白色固体として得た。
1H-NMR (DMSO-D6)δ: 7.96 (1H, d, J = 4.6 Hz), 7.75 (1H, s), 7.37-7.26 (8H, m), 7.08 (2H, d, J = 7.2 Hz), 6.53 (1H, d, J = 5.9 Hz), 5.47 (1H, d, J = 5.9 Hz), 4.65 (2H, dd, J = 57.6, 11.5 Hz), 4.43 (1H, s), 4.24 (2H, dd, J = 32.7, 12.6 Hz), 3.69 (1H, d, J = 10.4 Hz), 3.32 (1H, d, J = 10.8 Hz), 2.61 (3H, d, J = 4.5 Hz), 1.84 (3H, s).
ナトリウムtert−ブトキシド(18mg、0.19mmol)のN,N−ジメチルホルムアミド(0.6ml)溶液に、第7工程で得られた化合物155(30mg、0.06mmol)を加え、室温にて1.5時間攪拌した。氷冷下酢酸エチルにて希釈し、飽和塩化アンモニウム水溶液を加え、抽出した。得られた有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液及び飽和食塩水で洗浄し、硫酸マグネシムにて乾燥した。減圧下溶媒を留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル)にて精製し、化合物122(19mg、収率63%)をアモルファスとして得た。
1H-NMR (DMSO-D6)δ: 11.47 (1H, s), 7.38-7.28 (11H, m), 5.48 (1H, s), 4.62 (4H, dd, J = 20.7, 10.5 Hz), 4.40 (1H, s), 4.14 (1H, s), 3.92 (1H, d, J = 11.9 Hz), 3.79 (1H, d, J = 11.8 Hz), 2.87 (3H, s), 1.48 (3H, s).
第8工程で得られた化合物122(17mg、0.90mmol)をテトラヒドロフラン(1ml)及びメタノール(0.2ml)の混合溶媒に溶解させた。20%水酸化パラジムカーボン(8mg)を加え、水素雰囲気下2時間攪拌した。窒素置換を行い、触媒をろ過により除去し、ろ液を減圧下溶媒を留去した。得られた無色オイルの再結晶(メタノール/クロロホルム)により化合物14b(10mg、収率93%)を白色固体として得た。
1H-NMR (MeOD)δ: 7.84 (1H, s), 5.47 (1H, s), 4.30 (1H, s), 4.15 (1H, s), 4.06 (1H, d, J = 13.3 Hz), 3.89 (1H, d, J = 13.6 Hz), 3.03 (3H, s), 1.91 (3H, s).
工程9で行う環化反応の条件検討を行った。具体的には、塩基、溶媒の種類、反応温度について検討を行ない、生成物(化合物122)、副生成物(化合物156)をHPLC等で分析した。その結果、以下の表のように条件8に示す組み合わせが目的物の生成率が最も高く、原料残存率および副生物生成率が最も低い結果を与える最適条件であることを見出した。
Claims (16)
- 一般式(I)で表される化合物を塩基の存在下でアルドール反応に付する以下に示す工程:
(式中、R1及びR2は、同一または異なって、水素原子、核酸合成のアミノ基の保護基、アルキル基、アルケニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基、アシル基、シリル基、リン酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸基、−P(R7)R8[式中、R7およびR8は、同一または異なって、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1〜5のアルコキシ基、炭素数1〜5のアルキルチオ基、炭素数1〜6のシアノアルコキシ基、または、炭素数1〜5のアルキル基で置換されたアミノ基を示す];
R3は、水素原子、核酸合成の水酸基の保護基、アルキル基、アルケニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基、アシル基、シリル基、リン酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸基、−P(R9)R10[式中、R9およびR10は、同一または異なって、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数1〜5のアルコキシ基、炭素数1〜5のアルキルチオ基、炭素数1〜6のシアノアルコキシ基、または、炭素数1〜5のアルキル基で置換されたアミノ基を示す];
R4は、水素原子、水酸基、または、炭素数1〜5のアルコキシ基;
R5及びR6は、同一または異なって、水素原子、炭素数1〜5のアルキル基、またはアリール基;
Bは、置換基を有していてもよい核酸塩基部分)
を含む、一般式(II)で表される化合物の製造方法。 - 前記塩基が、共役酸のpKaが6〜10のものである請求項1または2記載の製造方法。
- 前記塩基が、トリエチルアミン、またはN−メチルモルホリンである請求項3記載の製造方法。
- R1およびR2のいずれか一方が核酸合成のアミノ基の保護基であり、その他方が水素原子またはアルキル基である請求項1〜5のいずれかに記載の製造方法。
- R3が核酸合成の水酸基の保護基である請求項1〜6のいずれかに記載の製造方法。
- R4が水素原子である請求項1〜7のいずれかに記載の製造方法。
- R5およびR6がいずれも水素原子である請求項1〜8のいずれかに記載の製造方法。
- Bが置換基を有していてもよい、ピリミジン核酸塩基もしくはプリン核酸塩基である請求項1〜9のいずれかに記載の製造方法。
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