JP7633787B2 - 細胞外小胞の製造方法 - Google Patents
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Description
本発明では、3’末端及び5’末端がそれぞれ修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬を用いることで、核酸医薬が前記供給源細胞の細胞膜内層及び後期エンドソームの外層に結合しやすくなり、その結果、細胞内小胞の内部に含まれる核酸医薬量を向上させることが可能となると考えられる。また、本発明では、核酸医薬を導入する際に、細胞外小胞の細胞膜にエレクトロポレーション法等によって微小な穴をあける必要はないので、細胞外小胞の破壊は生じにくい。その結果、核酸医薬を内包した細胞外小胞の粒子数を増やすことができ、さらに、細胞外小胞内への核酸医薬の導入量を増やすことができると考えられる。
本発明の製造方法により得られる細胞外小胞は、目的の細胞に対して目的の薬剤(核酸医薬)を作用させる薬剤送達システムに好適に用いることができるので、核酸医薬の実用化において、極めて有用である。
Thermo社のカスタム核酸合成により、5’末端にアミノ基を含み、3’末端に核酸アプタマーを含む配列(1)の塩基配列を有する核酸1および配列(2)の塩基配列を有する核酸2を委託合成した。
核酸1をリン酸バッファー(pH7.5)に溶解し、2等量の直鎖型のポリエチレングリコールのN-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)エステル体(油化産業社製サンブライトME-200AS)を加えて室温で4時間架橋反応した。反応後の溶液をエタノール沈殿により精製し、核酸2と混合することで、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾され、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-1)を得た。核酸医薬(A-1)はルシフェラーゼの発現を阻害するsiRNAである。
[配列番号(1):センス鎖]
5’-cuuacgcugaguacuucgattaaaaga-3’
[配列番号(2):アンチセンス鎖]
5’-ucgaaguacucagcguaagttaaaaga-3’
製造例1において、2等量の直鎖型のポリエチレングリコールのN-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)エステル体に代えて、2等量の分岐型のポリエチレングリコールのN-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)エステル体(油化産業社製サンブライトGL2-200GS2)を用いたこと以外は、製造例1と同じ操作を行い、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾され、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-2)を得た。核酸医薬(A-2)はルシフェラーゼの発現を阻害するsiRNAである。
Thermo社のカスタム核酸合成により、5’末端にアミノ基を含み、3’末端に核酸アプタマーを含む配列(3)の塩基配列を有する核酸3および配列(4)の塩基配列を有する核酸4を委託合成した。
製造例1において、核酸1に代えて、核酸3を用いたこと、ならびに、核酸2に代えて核酸4を用いたこと以外は製造例1と同じ操作を行い、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾され、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-3)を得た。核酸医薬(A-3)はルシフェラーゼの発現を阻害するsiRNAである。
[配列番号(3):センス鎖]
5’-cuuacgcugaguacuucgattcaccccacctcgctcccgtgacactaatgcta-3’
[配列番号(4):アンチセンス鎖]
5’-ucgaaguacucagcguaagttcaccccacctcgctcccgtgacactaatgcta-3’
Thermo社のカスタム核酸合成により、5’末端にアミノ基を含み、3’末端に核酸アプタマーを含む配列(5)の塩基配列を有する核酸5および配列(6)の塩基配列を有する核酸6を委託合成した。
製造例1において、核酸1に代えて、核酸5を用いたこと、ならびに、核酸2に代えて核酸6を用いたこと以外は製造例1と同じ操作を行い、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾され、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-4)を得た。核酸医薬(A-4)はルシフェラーゼの発現を阻害するsiRNAである。
[配列番号(5):センス鎖]
5’-cuuacgcugaguacuucgattaaagac-3’
[配列番号(6):アンチセンス鎖]
5’-ucgaaguacucagcguaagttaaagac-3’
Thermo社のカスタム核酸合成により、5’末端にアミノ基を含み、3’末端に核酸アプタマーを含む配列(7)の塩基配列を有する核酸7および配列(8)の塩基配列を有する核酸8を委託合成した。
製造例1において、核酸1に代えて、核酸7を用いたこと、ならびに、核酸2に代えて核酸8を用いたこと以外は製造例1と同じ操作を行い、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾され、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-5)を得た。核酸医薬(A-5)はルシフェラーゼの発現を阻害するsiRNAである。
[配列番号(7):センス鎖]
5’-cuuacgcugaguacuucgattggggaggcgattcggtgtgtcctccagaagatatttccga-3’
[配列番号(8):アンチセンス鎖]
5’-ucgaaguacucagcguaagttggggaggcgattcggtgtgtcctccagaagatatttccga-3’
Thermo社のカスタム核酸合成により、5’末端にアミノ基を含み、3’末端に核酸アプタマーを含む配列(9)の塩基配列を有する核酸9(ルシフェラーゼRNA)及び配列(10)の塩基配列を有する核酸10(ルシフェラーゼDNA)を委託合成した。
核酸9をリン酸バッファー(pH7.5)に溶解し、2等量の直鎖型のポリエチレングリコールのN-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)エステル体(油化産業社製サンブライトME-200AS)を加えて室温で4時間架橋反応した。反応後の溶液をエタノール沈殿により精製し、核酸10と混合することで、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾され、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-6)を得た。核酸医薬(A-6)は、ルシフェラーゼの発現を阻害するヘテロ二本鎖核酸である。
[配列番号(9):センス鎖]
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[配列番号(10):アンチセンス鎖]
5’-tcgaagtactcagcgtaagaaaaga-3’
製造例6において、2等量の直鎖型のポリエチレングリコールのN-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)エステル体に代えて、2等量の分岐型のポリエチレングリコールのN-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)エステル体(油化産業社製サンブライトGL2-200GS2)を用いたこと以外は、製造例6と同じ操作を行い、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾され、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-7)を得た。核酸医薬(A-7)はルシフェラーゼの発現を阻害するヘテロ二本鎖核酸である。
Thermo社のカスタム核酸合成により、5’末端にアミノ基を含み、3’末端に核酸アプタマーを含む配列(11)の塩基配列を有する核酸11(ルシフェラーゼRNA)及び配列(12)の塩基配列を有する核酸12(ルシフェラーゼDNA)を委託合成した。
製造例1において、核酸1に代えて、核酸11を用いたこと、ならびに、核酸2に代えて核酸12を用いたこと以外は製造例1と同じ操作を行い、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾され、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-8)を得た。核酸医薬(A-8)は、ルシフェラーゼの発現を阻害するヘテロ二本鎖核酸である。
[配列番号(11):センス鎖]
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[配列番号(12):アンチセンス鎖]
5’-tcgaagtactcagcgtaagcaccccacctcgctcccgtgacactaatgcta-3’
Thermo社のカスタム核酸合成により、5’末端にアミノ基を含み、3’末端に核酸アプタマーを含む配列(13)の塩基配列を有する核酸13(ルシフェラーゼRNA)及び配列(14)の塩基配列を有する核酸14(ルシフェラーゼDNA)を委託合成した。
製造例1において、核酸1に代えて、核酸13を用いたこと、ならびに、核酸2に代えて核酸14を用いたこと以外は製造例1と同じ操作を行い、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾され、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-9)を得た。核酸医薬(A-9)は、ルシフェラーゼの発現を阻害するヘテロ二本鎖核酸である。
[配列番号(13):センス鎖]
5’-cuuacgcugaguacuucgaaaagac-3’
[配列番号(14):アンチセンス鎖]
5’-tcgaagtactcagcgtaagaaagac-3’
Thermo社のカスタム核酸合成により、5’末端にアミノ基を含み、3’末端に核酸アプタマーを含む配列(15)の塩基配列を有する核酸15(ルシフェラーゼRNA)及び配列(16)の塩基配列を有する核酸16(ルシフェラーゼDNA)を委託合成した。
製造例1において、核酸1に代えて、核酸15を用いたこと、ならびに、核酸2に代えて核酸16を用いたこと以外は製造例1と同じ操作を行い、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾され、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-10)を得た。核酸医薬(A-10)は、ルシフェラーゼの発現を阻害するヘテロ二本鎖核酸である。
[配列番号(15):センス鎖]
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[配列番号(16):アンチセンス鎖]
5’-tcgaagtactcagcgtaagggggaggcgattcggtgtgtcctccagaagatatttccga-3’
Thermo社のカスタム核酸合成により、配列(17)の塩基配列を有する核酸17(5’末端および3’末端のいずれも修飾なし)及び配列(18)の塩基配列を有する核酸18(ルシフェラーゼRNA)を委託合成した。
核酸17と、核酸18とを混合することで、5’末端および3’末端が修飾されていないセンス鎖とアンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-11)を得た。核酸医薬(A-11)はルシフェラーゼの発現を抑制するsiRNAである。
[配列番号(17):センス鎖]
5’-cuuacgcugaguacuucgatt-3’
[配列番号(18):アンチセンス鎖]
5’-ucgaaguacucagcguaagtt-3’
Thermo社のカスタム核酸合成により、5’末端にアミノ基を含む配列(17)の塩基配列を有する核酸17(3’末端の修飾なし)および配列(18)の塩基配列を有する核酸18(ルシフェラーゼRNA)を委託合成した。
製造例1において、核酸1に代えて、核酸17を用いたこと、ならびに、核酸2に代えて核酸18を用いたこと以外は製造例1と同じ操作を行い、5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-12)を得た。核酸医薬(A-12)はルシフェラーゼの発現を抑制するsiRNAである。
Thermo社のカスタム核酸合成により、3’末端に核酸アプタマーを含む配列(19)の塩基配列を有する核酸19(5’末端の修飾なし)および配列(20)の塩基配列を有する核酸20(ルシフェラーゼRNA)を委託合成した。
核酸19と、核酸20とを混合することで、3’末端が核酸アプタマーにより修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-13)を得た。核酸医薬(A-13)はルシフェラーゼの発現を抑制するsiRNAである。
[配列番号(19):センス鎖]
5’-cuuacgcugaguacuucgattaaaaga-3’
[配列番号(20):アンチセンス鎖]
5’-ucgaaguacucagcguaagttaaaaga-3’
Thermo社のカスタム核酸合成により、5’末端に核酸アプタマーを含み、3’末端にアミノ基を含む配列(21)の塩基配列を有する核酸21(ルシフェラーゼRNA)及び配列(22)の塩基配列を有する核酸22(ルシフェラーゼDNA)を委託合成した。
製造例1において、核酸1に代えて、核酸21を用いたこと、ならびに、核酸2に代えて核酸22を用いたこと以外は製造例1と同じ操作を行い、5’末端が核酸アプタマーにより修飾され、3’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖とを有する核酸医薬(A-14)を得た。核酸医薬(A-14)は、ルシフェラーゼの発現を阻害するヘテロ二本鎖核酸である。
[配列番号(21):センス鎖]
5’-aaagaccuuacgcugaguacuucga-3’
[配列番号(22):アンチセンス鎖]
5’-aaagactcgaagtactcagcgtaag-3’
(1)細胞外小胞の製造
1×106個/10cmの培養プレートで培養したヒト由来間葉系幹細胞(hMSC)に、製造例1~14で合成した核酸医薬5μgをトランスフェクション試薬(Thermo社製Lipofectamine2000)を用いて導入し、37℃、5%CO2条件下で24時間培養した。24時間経過後、培養液から上清をピペットで回収し、以下(a)~(d)の手順に従って遠心分離を行い、細胞外小胞を精製し回収した。
(a)前記培養液から回収した上清を、2,000×gで15分間遠心分離し、上清を回収した。
(b)(a)で得られた上清を、10,000×gで30分間遠心分離し、上清を回収した。
(c)(b)で得られた上清を、100,000×gで60分間遠心分離し、沈殿を回収した。
(d)(c)で得られた沈殿を、10mLのリン酸緩衝生理食塩水(PBS)により懸濁し、100,000×gで60分間遠心分離し、沈殿を回収することにより核酸医薬を内包した細胞外小胞(EV)を得た。
(1)(d)で得られた沈殿(核酸医薬を内包したEV)に0.5mLのPBSを加えて懸濁させ、EVサンプル液を調製した。当該EVサンプル液1mLあたりのEVの粒子数を、ナノ粒子マルチアナライザーqNanoを用いて測定した。比較例4のEVサンプル液の1mLあたりのEVの粒子数を1.00としたときの、各例のEVサンプル液1mLあたりのEVの粒子数の比を算出した。結果を表1に示す。
リシスバッファーを用いて、(2)で調製したEVサンプル液からEV内の核酸を抽出し、定量PCR法によりEVに内包された核酸医薬量を測定した。比較例4のEVサンプル液1mLあたりの核酸医薬量に対する各例のEVサンプル液1mLあたりの核酸医薬量の比を算出した。結果を表1に示す。
(1)細胞外小胞の製造
1×106個/10cm培養プレートで培養したヒト由来間葉系幹細胞(hMSC)を、37℃、5%CO2条件下で24時間培養した。24時間経過後、培養液から上清をピペットで回収し、以下の(a)~(e)の手順に従って遠心分離を行い、細胞外小胞を精製し回収した。
(a)前記培養液から回収した上清を、2,000×gで15分間遠心分離し、上清を回収した。
(b)(a)で得られた上清を、10,000×gで30分間遠心分離し、上清を回収した。
(c)(b)で得られた上清を、100,000×gで60分間遠心分離し、沈殿を回収した。
(d)(c)で得られた沈殿を、10mLのPBSにて懸濁し、100,000×gで60分間遠心分離し、沈殿を回収した。
(e)(d)で得られた沈殿を、細胞外小胞(EV)として、10μLのPBSにより懸濁しEV懸濁液を得た。このEV懸濁液に核酸医薬(A-1)を5μg加え、ExoFectin(登録商標) sRNA-into-Exosome Kit(101 Bio社製)を用いて、エレクトロポレーション法により遺伝子導入を行い、核酸医薬を内包した細胞外小胞を製造した。
(1)(e)で得られた溶液にPBSを添加して0.5mLの懸濁液とすることでEVサンプル液を調製した。当該EVサンプル液1mLあたりのEVの粒子数を、ナノ粒子マルチアナライザーqNanoを用いて測定した。
リシスバッファーを用いて(2)で調製したEVサンプル液からEV内の核酸を抽出し、定量PCR法によりEVに内包された核酸医薬量を測定した。
(1)細胞外小胞の精製
1×106個/10cm培養プレートで培養したヒト由来間葉系幹細胞(hMSC)に、核酸医薬5μgをトランスフェクション試薬(Thermo社製Lipofectamine2000)を用いて導入し、37℃、5%CO2条件下で24時間培養した。核酸医薬としては製造例1~14で製造した核酸医薬(A-1)~(A-14)であって表2に示す種類のものを用いた。24時間経過後、培養液から上清をピペットで回収し、以下の手順に従って遠心分離を行い、細胞外小胞を精製回収した。
(a)前記培養液から回収した上清を、2,000×gで15分間遠心分離し、上清を回収した。
(b)(a)で得られた上清を、10,000×gで30分間遠心分離し、上清を回収した。
(c)(b)で得られた上清を、100,000×gで60分間遠心分離し、沈殿を回収した。
(d)(c)で得られた沈殿を、10mLのPBSにて懸濁し、100,000×gで60分間遠心分離し、沈殿を回収した。
(e)(d)で得られた沈殿を、0.2mLのPBSにより懸濁しEVサンプルとした。
(2)ルシフェラーゼ活性抑制効果の評価
1×105個/ウェルの細胞濃度にて24ウェル培養プレート上で培養したルシフェラーゼを発現するHela細胞に、(1)で得られたEVサンプルを0.1mL添加して16時間培養した。培養後のHela細胞に150μg/mLの濃度のPBSで調製したルシフェリン試薬を100μL添加し、in vivoイメージングシステム IVIS Lumina(Xenogen社製)を使用して、細胞内のルシフェラーゼ活性を測定した。比較例5(コントロール例:下記参照)のルシフェラーゼ活性を1.00としたときの各例のルシフェラーゼ活性の比を算出した。結果を表2に示す。
核酸医薬を用いなかったこと以外は実施例11と同様の操作を行い、ルシフェラーゼ活性を測定した。
(1)細胞外小胞の精製
1×106個/10cm培養プレートで培養したヒト由来間葉系幹細胞(hMSC)を37℃、5%CO2条件下で24時間培養した。24時間経過後、培養液から上清をピペットで回収し、以下の手順に従って遠心分離を行い、細胞外小胞を精製回収した。
(a)前記培養液を、2,000×gで15分間遠心分離し、上清を回収した。
(b)(a)で得られた上清を、10,000×gで30分間遠心分離し、上清を回収した。
(c)(b)で得られた上清を、100,000×gで60分間遠心分離し、沈殿を回収した。
(d)(c)で得られた沈殿を、10mLのPBSで懸濁し、100,000×gで60分間遠心分離し、沈殿を回収した。
(e)(d)で得られた沈殿を、EVとして、10μLのPBSにより懸濁しEV懸濁液を得た。得られたEV懸濁液に核酸医薬(A-1)を5μg加え、ExoFectin(登録商標)sRNA-into-Exosome Kit(101 Bio社製)を用いてエレクトロポレーション法により遺伝子の導入を行った。得られた溶液にPBSを添加して懸濁し0.2mLのEVサンプルを得た。
(2)ルシフェラーゼ活性抑制効果の評価
1×105個/ウェルの細胞濃度にて24ウェル培養プレート上で培養したルシフェラーゼを発現するHela細胞に(1)で得られたEVサンプルを0.1mL添加して16時間培養した。培養後のHela細胞に150μg/mLの濃度のPBSで調製したルシフェリン試薬を100μL添加し、in vivoイメージングシステム IVIS Lumina(Xenogen社製)を使用して、細胞内のルシフェラーゼ活性を測定した。比較例5(コントロール例:下記参照)のルシフェラーゼ活性を1.00としたときの本例のルシフェラーゼ活性の比を算出した。結果を表2に示す。
さらに、表2に示すように、実施例12~22の方法で標的遺伝子の活性抑制を行うと、比較例5~8の方法と比較して、標的遺伝子の活性抑制効果が顕著に高いことが分かる。また、実施例12~22の方法では、比較例9の方法(エレクトロポレーション法により作製したEVを用いる方法)よりも、標的遺伝子の発現抑制効果が顕著に高いことが分かる。
これらの結果から、本発明によれば、核酸医薬の内包量を向上させることが可能な細胞外小胞の製造方法を提供でき、かつ、標的遺伝子の発現抑制効果の高い核酸医薬内包細胞外小胞を容易に製造できることがわかる。
Claims (3)
- 核酸医薬を内包する細胞外小胞の製造方法であって、
核酸医薬の存在下、細胞外小胞の供給源細胞を培養する工程1を含み、
工程1で用いる核酸医薬は、3’末端及び5’末端がそれぞれ修飾されたセンス鎖と、アンチセンス鎖と、を有する核酸医薬であり、
前記核酸医薬は、3’末端が核酸アプタマーで修飾され、かつ5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾されたセンス鎖を有するか、5’末端が核酸アプタマーで修飾され、かつ3’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾されたセンス鎖を有し、
前記核酸医薬は細胞外小胞の供給源細胞の細胞膜内層及び後期エンドソームの外層と結合するものであり、
前記アンチセンス鎖は、5’末端または3’末端が、核酸アプタマーにより修飾されているものであり、
前記核酸医薬が、3’末端が核酸アプタマーで修飾され、かつ5’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾されたセンス鎖を有するものである場合、当該核酸医薬が有するセンス鎖及びアンチセンス鎖は、3’末端に、同一の塩基配列を有し、その塩基配列は、塩基配列(AAAAGA)、塩基配列(CACCCCACCTCGCTCCCGTGACACTAATGCTA)、塩基配列(AAAGAC)または塩基配列(GGGGAGGCGATTCGGTGTGTCCTCCAGAAGATATTTCCGA)であり、
前記核酸医薬が、5’末端が核酸アプタマーで修飾され、かつ3’末端がポリエチレングリコール鎖を有する化合物により修飾されたセンス鎖を有するものである場合、当該核酸医薬が有するセンス鎖及びアンチセンス鎖は、それぞれ、5’末端に、塩基配列(AAAGAC)を有する、細胞外小胞の製造方法。 - 細胞外小胞の直径が10nm~200nmである請求項1に記載の細胞外小胞の製造方法。
- 細胞外小胞がエクソソームである請求項1又は2に記載の細胞外小胞の製造方法。
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