JP7714545B2 - キメラ抗原受容体及びその使用 - Google Patents
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Description
本出願は、2019年11月26日に提出された米国特許出願第62/940509号明細書(この内容全体が参照により本明細書に組み込まれる)に対する優先権を主張する。
本願は、ASCIIフォーマットで電子出願されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる配列表を含む。前記ASCIIコピーは、2020年11月24日に作成され、名称がN2067-7166WO_SL.txtであり、サイズが598,194バイトである。
(a)ステップ(ii)は、ステップ(i)と一緒に、又はステップ(i)の開始後の20時間以内、例えばステップ(i)の開始後の12、13、14、15、16、17若しくは18時間以内、例えばステップ(i)の開始後の18時間以内に実施され、及び
ステップ(iii)は、ステップ(i)の開始後の30(例えば、26)時間以内、例えばステップ(i)の開始後の22、23、24、25、26、27、28、29又は30時間以内、例えばステップ(i)の開始後の24時間以内に実施され、
(b)ステップ(ii)は、ステップ(i)と一緒に、又はステップ(i)の開始後の20時間以内、例えばステップ(i)の開始後の12、13、14、15、16、17若しくは18時間以内、例えばステップ(i)の開始後の18時間以内に実施され、及び
ステップ(iii)は、ステップ(ii)の開始後の30時間以内、例えばステップ(ii)の開始後の22、23、24、25、26、27、28、29又は30時間以内に実施されるか、又は
(c)ステップ(iii)からの細胞の集団は、増殖されないか、又は例えばステップ(i)の開始時の細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖され、
任意選択で、ステップ(ii)の核酸分子は、ウイルスベクター上にあり、任意選択で、ステップ(ii)の核酸分子は、ウイルスベクター上のRNA分子であり、任意選択で、ステップ(ii)は、CARをコードする核酸分子を含むウイルスベクターで細胞(例えば、T細胞)の集団を形質導入することを含む。
(a)ステップ(2)は、ステップ(1)と一緒に、又はステップ(1)の開始後の5時間以内、例えばステップ(1)の開始後の1、2、3、4若しくは5時間以内に実施され、及び
ステップ(3)は、ステップ(1)の開始後の26時間以内、例えばステップ(1)の開始後の22、23若しくは24時間以内、例えばステップ(1)の開始後の24時間以内に実施されるか、又は
(b)ステップ(3)からの細胞の集団は、増殖されないか、又は例えばステップ(1)の開始時の細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖され、
任意選択で、ステップ(2)の核酸分子は、ウイルスベクター上にあり、任意選択で、ステップ(ii)の核酸分子は、ウイルスベクター上のRNA分子であり、任意選択で、ステップ(ii)は、CARをコードする核酸分子を含むウイルスベクターで細胞(例えば、T細胞)の集団を形質導入することを含む。
(a)抗BCMA CARを含むが、抗CD19 CARを含まない第1細胞集団;
(b)抗CD19 CARを含むが、抗BCMA CARを含まない第2細胞集団;及び
(c)抗BCMA CARと抗CD19 CARとの両方を含む第3細胞集団
を含む。
(i)第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(ii)第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;
(iii)第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)である。
(i)第2集団の生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(ii)第2集団の生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約45%~約50%(例えば、約47%)以下;約50~約55%(例えば、約53%)以下;約60%~約65%(例えば、約63%)以下;又は約80~約85%(例えば、約82%)以下である。
(a)1回目用量は、約1×106~約1×107(例えば、約2×106~約8×106、約4×106~約6×106、約1×106~約5×106、約5×106~約1×107、約1×106~約3×106、約2×106~約4×106、約3×106~約5×106、約4×106~約6×106、約5×106~約7×106、約6×106~約8×106、約7×106~約9×106、約8×106~約1×107、約1×106、約2×106、約3×106、約4×106、約5×106、約6×106、約7×106、約8×106、約9×106若しくは約1×107)個のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)を含み;
(b)2回目用量は、約1×107~約1×108(例えば、約2×107~約8×107、約4×107~約6×107、約1×107~約5×107、約5×107~約1×108、約1×107~約3×107、約2×107~約4×107、約3×107~約5×107、約4×107~約6×107、約5×107~約7×107、約6×107~約8×107、約7×107~約9×107、約8×107~約1×108、約1×107、約2×107、約3×107、約4×107、約5×107、約6×107、約7×107、約8×107、約9×107若しくは約1×108)個のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)を含み;
(c)1回目用量中のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)の数は、2回目用量中のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)の数の1/X(ここで、Xは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90又は100である)以下であり;及び/又は
(d)1回目用量中のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)の数は、2回目用量中のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)の数の約1%~約100%(例えば、約10%~約90%、約20%~約80%、約30%~約70%、約40%~約60%、約10%~約50%、約50%~約90%、約10%~約30%、約20%~約40%、約30%~約50%、約50%~約70%、約60%~約80%若しくは約70%~約90%)である。
(a)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(b)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;
(c)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、得られる集団の生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)であり;
(d)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2集団の生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であるか;又は
(e)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第2集団の生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)である。一部の実施形態では、ステップ(ii)において、第2ウイルスベクターと細胞の集団を特定のMOIで接触させる(例えば、第1ウイルスベクターと細胞集団を接触させる際のMOIより十分に低いMOIで、それにより、得られる細胞集団中で、以下が達成されるMOI:
(a)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(b)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;
(c)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、得られる集団の生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)であり;
(d)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2集団の生存細胞の総数が、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であるか;又は
(e)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第2集団の生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)である。
(a)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(b)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;
(c)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、得られる集団の生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)であり;
(d)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2集団の生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であるか;又は
(e)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第2集団の生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)である。
(a)約1~約10(例えば、約2~約9、約3~約8、約4~約7、約5~約6、約1~約8、約1~約6、約1~約4、約8~約10、約6~約10、約4~約10、約1~3、約2~約4、約3~約5、約4~約6、約5~約7、約6~約8、約7~約9、約8~約10、約2.5~約5、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9又は約10)のMOIで第1ウイルスベクター;
(b)約0.1~約5(例えば、約0.2~約4、約0.3~約3、約0.4~約2、約0.5~約1、約0.6~約0.9、約0.7~約0.8、約0.1~約4、約0.1~約3、約0.1~約2、約0.1~約1、約0.1~約0.5、約4~約5、約3~約5、約2~約5、約1~約5、約0.5~約5、約0.2~約5、約0.1~約0.5、約0.2~約1、約0.5~約2、約1~約3、約2~約4、約3~約5、約0.5~約1、約0.1、約0.2、約0.3、約0.4、約0.5、約0.6、約0.7、約0.8、約0.9、約1、約2、約3、約4又は約5)のMOIで第2ウイルスベクター;
(c)第2ウイルスベクターと細胞集団を接触させる際のMOIより少なくとも10%(例えば、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%若しくは90%)高いか、又は少なくとも約1倍(例えば、少なくとも約2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90若しくは100倍、例えば約2~約50倍、約3~20倍、約5~約15倍若しくは約8~約10倍)のMOIで第1ウイルスベクター;及び/又は
(d)第1ウイルスベクターと細胞集団を接触させる際のMOIの1/X(ここで、Xは、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、15、20、30、40、50、60、70、80、90又は100である)以下のMOIで第2ウイルスベクター
と接触させる。
(a)約4~約5(例えば、約4.75)のMOIで第1ウイルスベクター;及び/又は
(b)約0.2~約1(例えば、約0.5)のMOIで第2ウイルスベクター
と接触させる。
(a)抗BCMA CARを含むが、抗CD19 CARを含まない第1細胞集団;
(b)抗CD19 CARを含むが、抗BCMA CARを含まない第2細胞集団;及び
(c)抗BCMA CARと抗CD19 CARとの両方を含む第3細胞集団
を含む。
(i)第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(ii)第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;及び/又は
(iii)第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、集団中の生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)である。
(i)第2集団の生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(ii)第2集団の生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約45%~約50%(例えば、約47%)以下;約50%~約55%(例えば、約53%)以下;約60%~約65%(例えば、約63%)以下;又は約80%~約85%(例えば、約82%)以下である。
(a)抗BCMA結合ドメイン、第1膜貫通ドメイン及び第1細胞内シグナル伝達ドメインを含む第1CARをコードする第1核酸分子であって、抗BCMA結合ドメインは、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)及び重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)及び軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号86、87、88、95、96及び97のアミノ酸配列を含む、第1核酸分子と;
(b)抗CD19結合ドメイン、第2膜貫通ドメイン及び第2細胞内シグナル伝達ドメインを含む第2CARをコードする第2核酸分子であって、抗CD19結合ドメインは、HC CDR1、HC CDR2及びHC CDR3を含むVHと、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3を含むVLとを含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号295、304及び297~300のアミノ酸配列を含む、第2核酸分子と
を含む単離細胞又は細胞の集団が本明細書に提供される。
(a)抗BCMA結合ドメイン、第1膜貫通ドメイン及び第1細胞内シグナル伝達ドメインを含む第1CARをコードする第1核酸分子であって、抗BCMA結合ドメインは、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)及び重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)及び軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号86、87、88、95、96及び97のアミノ酸配列を含む、第1核酸分子と;
(b)抗CD19結合ドメイン、第2膜貫通ドメイン及び第2細胞内シグナル伝達ドメインを含む第2CARをコードする第2核酸分子であって、抗CD19結合ドメインは、HC CDR1、HC CDR2及びHC CDR3を含むVHと、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3を含むVLとを含み、HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号295、304及び297~300のアミノ酸配列を含む、第2核酸分子と
を含む単離細胞が本明細書に提供される。
特に定義されない限り、本明細書で使用される全ての科学技術用語は、本発明が関係する技術分野の当業者が一般に理解するのと同じ意味を有する。
例えば、メモリーT細胞、例えばメモリーT細胞前駆体での下記マーカー:CD62Lhigh、CD127high、CD27+及びBCL2の1つ以上の発現の増大;
例えば、メモリーT細胞、例えばメモリーT細胞前駆体でのKLRG1の発現の減少;及び
例えば、下記の特徴:CD62Lhighの増加、CD127highの増加、CD27+の増加、KLRG1の減少及びBCL2の増加のいずれか1つ又はそれらの組み合わせを備えるメモリーT細胞前駆体の数の増加
の1つ以上をもたらし、ここで、前述した変化のいずれかは、例えば、非処置対象と比べて、少なくとも一時的に起こる。
本発明は、免疫エフェクター細胞を、癌に指向させる、1つ以上のCARを含有するように操作された免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞又はNK細胞)を提供する。これは、癌関連抗原に対して特異的であるCAR上の抗原結合ドメインを通して達成される。本明細書に記載のCARにより標的化され得る2つのクラスの癌関連抗原(腫瘍抗原)が存在する:(1)癌細胞の表面に発現される癌関連抗原;及び(2)それ自体は細胞内であるが、そのような抗原のフラグメント(ペプチド)がMHC(主要組織適合複合体)により癌細胞の表面に提示される、癌関連抗原。
一部の実施形態において、複数の免疫エフェクター細胞、例えばT制御性枯渇細胞の集団は、抗原結合ドメインとも称される標的特異的結合要素を含むCARをコードする核酸を含む。結合要素の選択は、標的細胞の表面を定義するリガンドのタイプ及び数に依存する。例えば、抗原結合ドメインは、特定の病状に関連する標的細胞上の細胞表面マーカーとして作用するリガンドを認識するように選択され得る。従って、本明細書に記載のCARにおいて抗原結合ドメインのリガンドとして作用し得る細胞表面マーカーの例には、ウイルス、細菌及び寄生虫感染、自己免疫疾患並びに癌細胞に関連するものが含まれる。
一部の実施形態において、本明細書に記載されるCAR発現細胞は、CD19CAR発現細胞(例えば、ヒトCD19に結合するCARを発現する細胞)である。
一部の実施形態において、本明細書に記載されるCAR発現細胞は、BCMA CAR発現細胞(例えば、ヒトBCMAに結合するCARを発現する細胞)である。例示的なBCMA CARは、国際公開第2016/014565号パンフレット(参照により本明細書に組み込まれる)の表1又は16に開示される配列を含み得る。BCMA CAR構築物は、任意選択のリーダー配列;任意選択ヒンジドメイン、例えばCD8ヒンジドメイン;膜貫通ドメイン、例えばCD8膜貫通ドメイン;細胞内ドメイン、例えば4-1BB細胞内ドメイン;及び機能的シグナル伝達ドメイン、例えばCD3ζドメインを含み得る。特定の実施形態において、ドメインは、隣接しており、同じリーディングフレーム内で単一の融合タンパク質を形成する。他の実施形態において、ドメインは、例えば、本明細書に記載されるRCAR分子と同様に、個別のポリペプチド内に存在する。
(1)以下から選択される1つ、2つ若しくは3つの軽鎖(LC)CDR:
(i)配列番号54のLC CDR1、配列番号55のLC CDR2及び配列番号56のLC CDR3;及び/又は
(2)以下の1つからの1つ、2つ若しくは3つの重鎖(HC)CDR:
(i)配列番号44のHC CDR1、配列番号45のHC CDR2及び配列番号84のHC CDR3;(ii)配列番号44のHC CDR1、配列番号45のHC CDR2及び配列番号46のHC CDR3;(iii)配列番号44のHC CDR1、配列番号45のHC CDR2及び配列番号68のHC CDR3;又は(iv)配列番号44のHC CDR1、配列番号45のHC CDR2及び配列番号76のHC CDR3。
(1)以下の1つからの1つ、2つ若しくは3つの軽鎖(LC)CDR:
(i)配列番号95のLC CDR1、配列番号131のLC CDR2及び配列番号132のLC CDR3;(ii)配列番号95のLC CDR1、配列番号96のLC CDR2及び配列番号97のLC CDR3;(iii)配列番号95のLC CDR1、配列番号114のLC CDR2及び配列番号115のLC CDR3;又は(iv)配列番号95のLC CDR1、配列番号114のLC CDR2及び配列番号97のLC CDR3;及び/又は
(2)以下の1つからの1つ、2つ若しくは3つの重鎖(HC)CDR:
(i)配列番号86のHC CDR1、配列番号130のHC CDR2及び配列番号88のHC CDR3;(ii)配列番号86のHC CDR1、配列番号87のHC CDR2及び配列番号88のHC CDR3;又は(iii)配列番号86のHC CDR1、配列番号109のHC CDR2及び配列番号88のHC CDR3。
(1)以下の1つからの1つ、2つ若しくは3つの軽鎖(LC)CDR:
(i)配列番号147のLC CDR1、配列番号182のLC CDR2及び配列番号183のLC CDR3;(ii)配列番号147のLC CDR1、配列番号148のLC CDR2及び配列番号149のLC CDR3;又は(iii)配列番号147のLC CDR1、配列番号170のLC CDR2及び配列番号171のLC CDR3;及び/又は
(2)以下の1つからの1つ、2つ若しくは3つの重鎖(HC)CDR:
(i)配列番号179のHC CDR1、配列番号180のHC CDR2及び配列番号181のHC CDR3;(ii)配列番号137のHC CDR1、配列番号138のHC CDR2及び配列番号139のHC CDR3;又は(iii)配列番号160のHC CDR1、配列番号161のHC CDR2及び配列番号162のHC CDR3。
一部の実施形態において、本明細書に記載のCAR発現細胞は、CD20 CAR発現細胞(例えば、ヒトCD20に結合するCARを発現する細胞)である。一部の実施形態では、CD20 CAR発現細胞は、本明細書に参照により組み込まれる国際公開第2016164731号パンフレット及び同第2018067992号パンフレットに従う抗原結合ドメインを含む。例示的なCD20結合配列又はCD20 CAR配列は、例えば、国際公開第2018067992号パンフレットの表1~5に開示されている。一部の実施形態では、CD20 CARは、国際公開第2018067992号パンフレット又は同第2016164731号パンフレットに開示されるCDR、可変領域、scFv又は完全長配列を含む。
一部の実施形態において、本明細書に記載のCAR発現細胞は、CD22 CAR発現細胞(例えば、ヒトCD20に結合するCARを発現する細胞)である。一部の実施形態では、CD22 CAR発現細胞は、本明細書に参照により組み込まれる国際公開第2016164731号パンフレット及び同第2018067992号パンフレットに従う抗原結合ドメインを含む。例示的なCD22結合配列又はCD22 CAR配列は、例えば、国際公開第2016164731号パンフレットの表6A、6B、7A、7B、7C、8A、8B、9A、9B、10A及び10B並びに国際公開第2018067992号パンフレットの表6~10に開示されている。一部の実施形態では、国際公開第2018067992号パンフレット又は同第2016164731号パンフレットに開示されるCD22 CARは、CDR、可変領域、scFv又は完全長配列を含む。
QSALTQPASASGSPGQSVTISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYTSSSTLYVFGTGTQLTVL(配列番号287)
一部の実施形態では、本明細書に記載されるCAR発現細胞は、EGFR CAR発現細胞(例えば、ヒトEGFRに結合するCARを発現する細胞)である。一部の実施形態では、本明細書に記載のCAR発現細胞は、EGFRvIII CAR発現細胞(例えば、ヒトEGFRvIIIに結合するCARを発現する細胞)である。例示的なEGFRvIII CARは、本明細書に参照により組み込まれる国際公開第2014/130657号パンフレット、例えば国際公開第2014/130657号パンフレットの表2に開示される配列を含む。
一部の実施形態では、本明細書に記載されるCAR発現細胞は、メソテリンCAR発現細胞(例えば、ヒトメソテリンに結合するCARを発現する細胞)である。例示的なメソテリンCARは、本明細書に参照により組み込まれる国際公開第2015090230号パンフレット及び同第2017112741号パンフレット、例えば国際公開第2017112741号パンフレットの表2、3、4及び5に開示される配列を含み得る。
他の実施形態では、CAR発現細胞は、CD123に特異的に結合することができ、例えば本明細書に参照により組み込まれる国際公開第2014/130635号パンフレットの表1~2のCAR分子(例えば、CAR1~CAR8)又は抗原結合ドメインを含み得る。CD123 CAR分子及び抗原結合ドメイン(例えば、Kabat若しくはChothiaに従う1つ、2つ、3つのVH CDR;及び1つ、2つ、3つのVL CDR)をコードするアミノ酸及びヌクレオチド配列は、国際公開第2014/130635号パンフレットに明示されている。他の実施形態では、CAR発現細胞は、CD123に特異的に結合することができ、例えば本明細書に参照により組み込まれる国際公開第2016/028896号パンフレットの表2、6及び9に従うCAR分子(例えば、CAR123-1~CAR123-4及びhzCAR123-1~hzCAR123-32のいずれか)又は抗原結合ドメインを含み得る。CD123 CAR分子及び抗原結合ドメイン(例えば、Kabat若しくはChothiaに従う1つ、2つ、3つのVH CDR;及び1つ、2つ、3つのVL CDR)をコードするアミノ酸及びヌクレオチド配列は、国際公開第2016/028896号パンフレットに明示されている。
膜貫通ドメインに関して、種々の実施形態において、CARは、CARの細胞外ドメインに結合する膜貫通ドメインを含むように設計できる。膜貫通ドメインは、膜貫通領域に隣接した1つ以上のさらなるアミノ酸、例えば膜貫通が由来するタンパク質の細胞外領域と関係する1つ以上のアミノ酸(例えば、細胞外領域の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10~最大で15のアミノ酸)及び/又は膜貫通タンパク質が由来するタンパク質の細胞内領域と関係する1つ以上のアミノ酸(例えば、細胞内領域の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10~最大で15のアミノ酸)を含み得る。一部の実施形態において、膜貫通ドメインは、CARの他のドメインの1つに関連して使用されるものである。ある例において、膜貫通ドメインは、このようなドメインが、同一又は異なる表面膜タンパク質の膜貫通ドメインと結合するのを避けるように、例えば受容体複合体の他のメンバーとの相互作用を最小化するように選択され又はアミノ酸置換による改変ができる。一部の実施形態において、膜貫通ドメインは、CAR発現細胞、例えばCART細胞表面上の別のCARとホモ二量体化できる。一部の実施形態において、膜貫通ドメインのアミノ酸配列は、同じCAR発現細胞、例えばCARTに存在する天然結合パートナーの結合ドメインとの相互作用を最小化するように改変又は置換され得る。
本発明のCARの細胞質ドメイン又は領域は、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。細胞内シグナル伝達ドメインは、一般的に、CARが導入されている免疫細胞の正常エフェクター機能の少なくとも1つの活性化を担う。
二重CAR
一実施形態では、免疫細胞(例えば、T細胞若しくはNK細胞)は、2つのCAR、例えば、第1抗原に結合する第1CARと、第2抗原に結合する第2CARを発現する。一実施形態では、第1抗原及び第2抗原は異なる。一実施形態では、第1若しくは第2抗原は、B細胞に発現される抗原、急性骨髄性白血病細胞に発現される抗原又は固形腫瘍細胞上の抗原から選択される。一実施形態では、第1若しくは第2抗原は、CD10、CD19、CD20、CD22、CD34、CD123、BCMA、FLT-3、ROR1、CD79b、CD179b、CD79a、CD34、CLL-1、葉酸受容体β、FLT3、EGFRvIII、メソテリン、GD2、Tn抗原、sTn抗原、Tn-O-糖ペプチド、sTn-O-糖ペプチド、PSMA、CD97、TAG72、CD44v6、CEA、EPCAM、KIT、IL-13Ra2、レグマン、GD3、CD171、IL-11Ra、PSCA、MAD-CT-1、MAD-CT-2、VEGFR2、ルイスY、CD24、PDGFR-β、SSEA-4、葉酸受容体α、ERBB(例えば、ERBB2)、Her2/neu、MUC1、EGFR、NCAM、エフリンB2、CAIX、LMP2、sLe、HMWMAA、o-アセチル-GD2、葉酸受容体β、TEM1/CD248、TEM7R、FAP、レグマイン、HPV E6若しくはE7、ML-IAP、CLDN6、TSHR、GPRC5D、ALK、ポリシアル酸、Fos関連抗原、好中球エラスターゼ、TRP-2、CYP1B1、精子タンパク質17、βヒト絨毛性ゴナドトロピン、AFP、チログロブリン、PLAC1、グロボH、RAGE1、MN-CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、腸カルボキシルエステラーゼ、mut hsp 70-2、NA-17、NY-BR-1、UPK2、HAVCR1、ADRB3、PANX3、NY-ESO-1、GPR20、Ly6k、OR51E2、TARP、GFRα4又はMHCに提示されるこれらの抗原のいずれかのペプチドから選択される。
一実施形態では、本発明のCARは、多重特異性CARである。一実施形態では、多重特異性CARは、二重特異性CARである。一実施形態では、二重特異性CARは、二重特異性抗体分子である抗原結合ドメインを含む。二重特異性抗体は、2つ以下の抗原に対する特異性を有する。二重特異性抗体分子は、第1エピトープに対する結合特異性を有する第1免疫グロブリン可変ドメイン配列と、第2エピトープに対する結合特異性を有する第2免疫グロブリン可変ドメイン配列を特徴とする。一実施形態では、第1及び第2エピトープは、同じ抗原、例えば、同じタンパク質(又は多量体タンパク質のサブユニット)上にある。一実施形態では、第1及び第2エピトープは、重複する。一実施形態では、第1及び第2エピトープは、重複しない。一実施形態では、第1及び第2エピトープは、異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(又は多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。一実施形態では、二重特異性抗体分子は、第1エピトープに対する結合特異性を含む重鎖可変ドメイン配列及び軽鎖可変ドメイン配列と、第2エピトープに対する結合特異性を含む重鎖可変ドメイン配列及び軽鎖可変ドメイン配列とを含む。一実施形態では、二重特異性抗体分子は、第1エピトープに対する結合特異性を有する半抗体と、第2エピトープに対する結合特異性を有する半抗体とを含む。一実施形態では、二重特異性抗体分子は、第1エピトープに対する結合特異性を有する半抗体又はその断片と、第2エピトープに対する結合特異性を有する半抗体又はその断片とを含む。一実施形態では、二重特異性抗体分子は、第1エピトープに対する結合特異性を有するscFv又はその断片と、第2エピトープに対する結合特異性を有するscFv又はその断片とを含む。
一部の実施形態では、本発明のCARは、二重特異性CARである。一部の実施形態では、本発明のCARは、ダイアボディCARである。一部の実施形態では、ダイアボディCARは、第1抗原及び第2抗原に結合する抗原結合ドメインを含む。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、VH1、VL1、VH2及びVL2を含み、VH1とVL1は、第1抗原に結合し、且つVH2とVL2は、第2抗原に結合する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VH1-任意選択でリンカー1(「L1」)-VH2-任意選択でリンカー2(「L2」)-VL2-任意選択でリンカー3(「L3」)-VL1を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VH1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VL1を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VL1-任意選択でL1-VH2-任意選択でL2-VL2-任意選択でL3-VH1を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VL1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VH1を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VH2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VL2を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VH2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VL2を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VL2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VH2を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VL2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VH2を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VH1-リンカー1(「L1」)-VH2-リンカー2(「L2」)-VL2-リンカー3(「L3」)-VL1を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VH1-L1-VL2-L2-VH2-L3-VL1を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VL1-L1-VH2-L2-VL2-L3-VH1を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VL1-L1-VL2-L2-VH2-L3-VH1を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VH2-L1-VH1-L2-VL1-L3-VL2を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VH2-L1-VL1-L2-VH1-L3-VL2を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VL2-L1-VH1-L2-VL1-L3-VH2を有する。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、N末端からC末端まで、以下の構成:VL2-L1-VL1-L2-VH1-L3-VH2を有する。一部の実施形態では、可変領域は、GGGGSGGGGS(配列番号5)のアミノ酸配列を含むリンカーにより融合される。一部の実施形態では、可変領域は、GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS(配列番号63)のアミノ酸配列を含むリンカーにより融合される。一部の実施形態では、L1は、配列番号5のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、L2は、配列番号63のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、L3は、配列番号5のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、VH1、VL1、VH2若しくはVL2は、本明細書に開示されるCDR、VH若しくはVL配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、本明細書に開示されるダイアボディは、例えば、抗体を安定化し、且つ/又はVH及びVLの正しい対合を促進するために、操作されたジスルフィド架橋を含む。一部の実施形態では、操作されたジスルフィド架橋は、ヒンジ領域に最も近位の可変領域(例えば、ヒンジ領域に最も近位のVH又はVL領域)と、その対応する対合パートナー(例えば、対応するVL又は対応するVH)の間にある。
一態様では、本発明の抗体及び抗体断片を、T細胞受容体(「TCR」)鎖、例えば、TCRα又はTCRβ鎖の1つ以上の定常ドメインに移植して、キメラTCRを作製することができる。理論に束縛されるものではないが、キメラTCRは、抗原結合時にTCR複合体を介してシグナル伝達すると考えられる。例えば、本明細書に開示されるscFvは、TCR鎖、例えば、TCRα鎖及び/又はTCRβ鎖の定常ドメイン、例えば、細胞外定常ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインの少なくとも一部に移植することができる。別の例として、抗体断片、例えば本明細書に記載されるVLドメインをTCRα鎖の定常ドメインに移植することができ、抗体断片、例えば本明細書に記載のVHドメインをTCRβ鎖の定常ドメインに移植することができる(又はVLドメインをTCRβ鎖の定常ドメインに移植することができ、VHドメインをTCRα鎖に移植することができる)。別の例として、抗体若しくは抗体断片のCDR、例えば本明細書に記載の抗体若しくは抗体断片のCDRをTCRα及び/又はα鎖に移植して、キメラTCRを作製することもできる。例えば、本明細書に開示されるLCDRをTCRα鎖の可変ドメインに移植し、本明細書に開示されるHCDRをTCRβ鎖の可変ドメインに移植し得るか、又はその逆も可能である。こうしたキメラTCRは、当技術分野で公知の方法により生産することができる(例えば、Willemsen RA et al,Gene Therapy 2000;7:1369-1377;Zhang T et al,Cancer Gene Ther 2004;11:487-496;Aggen et al,Gene Ther.2012 Apr;19(4):365-74)。
一態様では、本明細書に記載のCAR発現細胞は、第2CAR、例えば、同じ標的(BCMA)若しくは異なる標的(例えば、CD19、CD20若しくはCS-1又は他の多発性骨髄腫標的、例えば、κ軽鎖、CD138、ルイスY抗原若しくはCD38(Garfall et al.,Discovery Medicine,2014,17(91):37-46))に対して、異なる抗原結合ドメインを有する第2CARをさらに含み得る。一実施形態では、CAR発現細胞は、第1抗原をターゲティングし、且つ共刺激シグナル伝達ドメインを有するが、一次シグナル伝達ドメインはない細胞内シグナル伝達ドメインを含む第1CARと、第2の異なる抗原をターゲティングし、且つ一次シグナル伝達ドメインを有するが、共刺激シグナル伝達ドメインはない細胞内シグナル伝達ドメインを含む第2CARとを含む。理論に縛られることは意図しないが、共刺激シグナル伝達ドメイン、例えば、4-1BB、CD28、CD27 ICOS若しくはOX-40の第1CAR上の配置並びに一次シグナル伝達ドメイン、例えば、CD3ζの第2CAR上の配置は、両標的が発現される細胞に対するCAR活性を制限し得る。一実施形態では、CAR発現細胞は、BCMA結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び共刺激シグナル伝達ドメインを含む第1BCMA CARと、BCMA以外の抗原(例えば、白血病若しくはリンパ腫細胞に発現される抗原、例えば、CD19、CD20、CS-1,κ軽鎖、CD139、ルイスY抗原若しくはCD38)をターゲティングし、且つ抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び一次シグナル伝達ドメインを含む第2CARとを含む。別の実施形態では、CAR発現細胞は、BCMA結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び一次シグナル伝達ドメインを含む第1BCMA CARと、BCMA以外の抗原(例えば、白血病若しくはリンパ腫細胞に発現される抗原、例えば、CD19、CD20、CS-1,κ軽鎖、CD139、ルイスY抗原若しくはCD38)をターゲティングし、且つ抗原に対する抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び共刺激シグナル伝達ドメインを含む第2CARとを含む。一実施形態では、CAR発現細胞は、本明細書に記載のBCMA CARと、CD19をターゲティングするCAR(CD19 CAR)とを含む。
一実施形態において、本明細書に記載のCAR分子は、ナチュラルキラー細胞受容体(NKR)の1つ以上の成分を含み、それにより、NKR-CARを形成する。NKR成分は、以下のナチュラルキラー細胞受容体のいずれか由来の膜貫通ドメイン、ヒンジドメイン又は細胞質ドメインであり得る:キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)、例えば、KIR2DL1、KIR2DL2/L3、KIR2DL4、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、DIR2DS5、KIR3DL1/S1、KIR3DL2、KIR3DL3、KIR2DP1及びKIR3DP1;天然細胞傷害性受容体(NCR)、例えば、NKp30、NKp44、NKp46;免疫細胞受容体のシグナル伝達リンパ球活性化分子(SLAM)ファミリー、例えば、CD48、CD229、2B4、CD84、NTB-A、CRACC、BLAME及びCD2F-10;Fc受容体(FcR)、例えばCD16及びCD64;並びにLy49受容体、例えばLY49A、LY49C。本明細書に記載のNKR-CAR分子は、アダプター分子又は細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、DAP12と相互作用し得る。NKR要素を含むCAR分子の例示的な配置及び配列は、国際公開第2014/145252号パンフレットに記載され、その内容は参照により本明細書に援用される。
いくつかの実施形態では、抗原結合ドメインは、非抗体足場、例えば、フィブロネクチン、アンキリン、ドメイン抗体、リポカリン、小モジュラー免疫医薬品、マキシボディ、プロテインA又はアフィリンを含む。非抗体足場は、細胞上の標的抗原に結合する能力を有する。いくつかの実施形態において、抗原結合ドメインは、細胞上で発現される天然に存在するタンパク質のポリペプチド又はその断片である。一部の実施形態において、抗原結合ドメインは、非抗体足場を含む。得られるポリペプチドが、標的細胞上の標的抗原に特異的に結合する少なくとも1つの結合領域を含む限り、多様な非抗体足場を使用することができる。
CAR活性を制御することができる多くの方法がある。一部の実施形態において、CAR活性を制御することができる制御可能CAR(RCAR)は、CAR療法の安全性及び有効性を最適化するために望ましい。例えば、二量体化ドメインに融合したカスパーゼを用いた、例えば、アポトーシスの誘導(例えば、Di et al.,N Engl.J.Med.2011 Nov.3;365(18):1673-1683を参照されたい)を本発明のCAR療法の安全スイッチとして使用することができる。別の例において、CAR発現細胞は、誘導性カスパーゼ-9(iCaspase-9)分子も発現することができ、これは、二量体化因子薬物(例えば、リミズシド(rimiducid)(AP1903(Bellicum Pharmaceuticals)又はAP20187(Ariad)とも呼ばれる)の投与により、細胞のカスパーゼ-9の活性化及びアポトーシスを起こす。iCaspase-9分子は、二量体化(CID)結合ドメインの化学誘導因子を含み、これは、CIDの存在下で二量体化を媒介する。これは、CAR発現細胞の誘導的及び選択的枯渇を引き起こす。いくつかの事例では、iCaspase-9分子は、CARコードベクターとは別の核酸分子によってコードされる。いくつかの事例では、iCaspase-9分子は、CARコードベクターと同じ核酸分子によってコードされる。iCaspase-9は、CAR発現細胞のあらゆる毒性を回避するための安全スイッチを提供することができる。例えば、Song et al.Cancer Gene Ther.2008;15(10):667-75;Clinical Trial Id.No.NCT02107963;及びDi Stasi et al.N.Engl.J.Med.2011;365:1673-83を参照されたい。
二量体化スイッチは、非共有結合又は共有結合であり得る。非共有結合二量体化スイッチの場合、二量体化分子は、スイッチドメイン同士の非共有結合相互作用を促進する。共有結合二量体化スイッチの場合、二量体化分子は、スイッチドメイン同士の共有結合相互作用を促進する。
ILWHEMWHEG LEEASRLYFG ERNVKGMFEV LEPLHAMMER GPQTLKETSF NQAYGRDLME AQEWCRKYMK SGNVKDLTQA WDLYYHVFRR ISK(配列番号277)
二量体化分子によってスイッチドメイン同士の結合が促進される。二量体化分子の存在下で、スイッチドメイン同士の相互作用又は結合は、第1スイッチドメインと結合した、例えば、それと融合したポリペプチドと、第2スイッチドメインと結合した、例えば、それと融合したポリペプチドとの間のシグナル伝達を可能にする。非限定的なレベルの二量体化分子の存在下で、シグナル伝達は、例えば、本明細書に記載のシステムで測定して、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、5、10、50、100倍増大する。
一部の実施形態において、CAR発現細胞は、スプリットCARを使用する。スプリットCARアプローチは、本明細書に参照により組み込まれる国際公開第2014/055442号パンフレット及び同第2014/055657号パンフレットに、より詳細に記載されている。簡潔には、スプリットCAR系は、第1抗原結合ドメイン及び共刺激ドメイン(例えば、41BB)を有する第1CARを発現する細胞を含み、細胞は、第2抗原結合ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、CD3ζ)を有する第2CARも発現する。細胞が第1抗原に遭遇すると、共刺激ドメインが活性化され、細胞が増殖する。細胞が第2抗原に遭遇すると、細胞内シグナル伝達ドメインが活性化され、細胞殺傷活性が開始される。そのため、CAR発現細胞は、両方の抗原の存在下でのみ完全活性化される。いくつかの実施形態では、第1抗原結合ドメインは、BCMAを認識し、例えば、本明細書に記載の抗原結合ドメインを含み、第2抗原結合ドメインは、急性骨髄性白血病細胞に発現される抗原、例えば、CD123、CLL-1、CD34、FLT3若しくは葉酸受容体βを認識する。いくつかの実施形態では、第1抗原結合ドメインは、BCMAを認識し、例えば、本明細書に記載の抗原結合ドメインを含み、第2抗原結合ドメインは、B細胞に発現される抗原、例えば、CD10、CD19、CD20、CD22、CD34、CD123、FLT-3、ROR1、CD79b、CD179b又はCD79aを認識する。
第2のCARの共発現
一部の実施形態において、本明細書に記載のCAR発現細胞は、第2のCAR、例えば同じ標的(例えば、CD19)又は異なる標的(例えば、CD19以外の標的、例えば、本明細書に記載の標的)に対する、例えば第2のCARの異なる抗原結合ドメインをさらに含み得る。一部の実施形態において、CAR発現細胞は、第1の抗原を標的とし、共刺激シグナル伝達ドメインを有するが、一次シグナル伝達ドメインを有しない細胞内シグナル伝達ドメインを含む第1のCAR及び第2の、異なる、抗原を標的とし、一次シグナル伝達ドメインを有するが、共刺激シグナル伝達ドメインを有しない細胞内シグナル伝達ドメインを含む第2のCARを含む。第1のCARへの共刺激シグナル伝達ドメイン、例えば4-1BB、CD28、CD27、OX-40又はICOS及び一次シグナル伝達ドメイン、例えばCD3ζの第2のCARへの配置は、両標的が発現される細胞に対してCAR活性を制限する。一部の実施形態において、CAR発現細胞は、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び共刺激ドメインを含む第1のCAR及び他の抗原を標的とし、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び一次シグナル伝達ドメインを含む第2のCARを含む。一部の実施形態において、CAR発現細胞は、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び一次シグナル伝達ドメインを含む第1のCAR及び他の抗原を標的とし、抗原に対する抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び共刺激シグナル伝達ドメインを含む第2のCARを含む。
一部の実施形態において、本明細書に記載のCAR発現細胞は、別の薬剤、例えば、CAR発現細胞の活性又は適応度を増強する薬剤をさらに発現できる。
実施形態において、本明細書に記載のCAR発現細胞、例えばCD19CAR発現細胞は、さらに、ケモカイン受容体分子を含む。T細胞におけるケモカイン受容体CCR2b又はCXCR2のトランスジェニック発現は、黒色腫及び神経芽腫を含むCCL2-又はCXCL1分泌固形腫瘍への輸送を促進する(Craddock et al.,J Immunother.2010 Oct;33(8):780-8及びKershaw et al.,Hum Gene Ther.2002 Nov 1;13(16):1971-80)。そのため、理論に拘束されることを望むものではないが、腫瘍、例えば、固形腫瘍により分泌されるケモカインを認識するCAR発現細胞で発現されるケモカイン受容体は、CAR発現細胞の腫瘍への帰巣を改善し、CAR発現細胞の腫瘍への浸潤を促進し、及びCAR発現細胞の抗腫瘍効果を増強すると考えられる。ケモカイン受容体分子は、天然に存在する又は組換えケモカイン受容体又はそのケモカイン結合フラグメントを含み得る。本明細書に記載のCAR発現細胞(例えば、CAR-Tx)における発現に適するケモカイン受容体分子は、CXCケモカイン受容体(例えば、CXCR1、CXCR2、CXCR3、CXCR4、CXCR5、CXCR6又はCXCR7)、CCケモカイン受容体(例えば、CCR1、CCR2、CCR3、CCR4、CCR5、CCR6、CCR7、CCR8、CCR9、CCR10又はCCR11)、CX3Cケモカイン受容体(例えば、CX3CR1)、XCケモカイン受容体(例えば、XCR1)又はそのケモカイン結合フラグメントを含む。一部の実施形態において、本明細書に記載のCARと共に発現するケモカイン受容体分子は、腫瘍により分泌されるケモカインに基づき選択する。一部の実施形態において、本明細書に記載のCAR発現細胞は、さらに、CCR2b受容体又はCXCR2受容体を含む、例えば、発現する。一部の実施形態において、本明細書に記載のCAR及びケモカイン受容体分子は、同じベクターにある又は2つの異なるベクターにある。本明細書に記載のCAR及びケモカイン受容体分子が同じベクターに実施形態において、CAR及びケモカイン受容体分子は、各々、2つの異なるプロモーターの制御下にあるか又は同じプロモーターの制御下にある。
本発明は、本明細書に記載される1つ以上のCAR構築物をコードする核酸分子を含む免疫エフェクター細胞、例えば本明細書に記載の方法によって作製されたものも提供する。一部の実施形態において、核酸分子は、メッセンジャーRNA転写物として提供される。一部の実施形態において、核酸分子は、DNA構築物として提供される。
WT PGKプロモーター:
PGK100:
インビトロで転写されたRNA CARを産生する方法が本明細書に開示される。RNA CAR及びそれを使用する方法は、例えば、2015年3月13日に出願された国際公開第2015/142675号パンフレットの段落553~570に記載され、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
一部の実施形態において、非ウイルス方法を使用して、本明細書に記載のCARをコードする核酸を細胞又は組織又は対象に送達できる。
本発明は、本明細書に開示される細胞を作製する方法、例えば、本明細書に記載される1つ以上のCAR構築物をコードする核酸分子を発現するように、T細胞又はNK細胞を操作する方法も提供する。一部の実施形態では、本明細書に記載される製造方法を用いて、本明細書に開示される2つのCAR(例えば、本明細書に開示される抗BCMA CAR及び抗CD19 CAR)をコードする核酸分子を含む細胞を製造する。一部の実施形態では、本明細書に開示される製造方法を用いて、本明細書に開示のダイアボディCAR(例えば、本明細書に開示の抗BCMA/抗CD19ダイアボディCAR)をコードする核酸分子を含む細胞を製造する。一部の実施形態では、本明細書に記載される製造方法を用いて、各々が本明細書に開示のCARをコードする2つの核酸分子(例えば、抗BCMA CARをコードする1つの核酸分子と、抗CD19 CARをコードする1つの核酸分子)を含む細胞を製造する。一部の実施形態では、本明細書に記載される製造プロセスのいずれかによって作製された細胞(例えば、免疫エフェクター細胞、例えば、T細胞又はNK細胞)の集団が本明細書に提供される。
一部の実施形態において、本明細書に開示される方法は、1つ以上のCARを24時間以内に発現するように操作された免疫エフェクター細胞を製造することができる。理論に縛られることは意図しないが、本明細書に提供される方法は、製造工程中、T細胞、例えば、ナイーブT細胞の未分化表現型を保存する。未分化表現型を有するこれらのCAR発現細胞は、注入後インビボで、より長期に持続し、且つ/又は良好に拡大し得る。一部の実施形態では、本明細書に提供される製造方法により生産されるCART細胞は、例えば、scRNA-seqを用いて測定した場合(例えば、図25Aに関して、実施例7に記載の方法を用いて測定した場合)、伝統的製造方法により生産されるCART細胞と比べて、増加したパーセンテージの幹細胞メモリーT細胞を含む。一部の実施形態では、本明細書に提供される製造方法により生産されるCART細胞は、例えば、scRNA-seqを用いて測定した場合(例えば、図25Bに関して、実施例7に記載の方法を用いて測定した場合)、伝統的製造方法により生産されるCART細胞と比べて、増加したパーセンテージのエフェクターT細胞を含む。一部の実施形態では、本明細書に提供される製造方法により生産されるCART細胞は、例えば、scRNA-seqを用いて測定した場合(例えば、図25Cに関しては、実施例7に記載の方法を用いて測定した場合)、伝統的製造方法により生産されるCART細胞と比べて、T細胞の幹細胞的形質をより良好に維持する。一部の実施形態では、本明細書に提供される製造方法により生産されるCART細胞は、例えば、scRNA-seqを用いて測定した場合(例えば、図25Dに関しては、実施例7に記載の方法を用いて測定した場合)、伝統的製造方法により生産されるCART細胞と比べて、より低レベルの低酸素症を示す。一部の実施形態では、本明細書に提供される製造方法により生産されるCART細胞は、例えば、scRNA-seqを用いて測定した場合(例えば、図25Eに関しては、実施例7に記載の方法を用いて測定した場合)、伝統的製造方法により生産されるCART細胞と比べて、より低レベルのオートファジーを示す。一部の実施形態では、免疫エフェクター細胞は、本明細書に開示される2つのCAR(例えば、本明細書に開示される抗BCMA CARと抗CD19 CAR)をコードする核酸分子を含むように、操作される。一部の実施形態では、免疫エフェクター細胞は、本明細書に開示されるダイアボディCAR、例えば、本明細書に開示される抗BCMA及び/又は抗CD19ダイアボディCARをコードする核酸分子を含むように、操作される。一部の実施形態では、免疫エフェクター細胞は、各々が本明細書に記載のCARをコードする2つの核酸分子(例えば、抗BCMA CARをコードする1つの核酸分子と、抗CD19 CARをコードする1つの核酸分子)を含むように、操作される。
(a)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(b)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;
(c)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、得られる集団の生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)であり;
(d)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2集団の生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であるか;又は
(e)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第2集団の生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)である。
(a)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(b)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;
(c)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、得られる集団の生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)であり;
(d)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2集団の生存細胞の総数が、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であるか;又は
(e)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第2集団の生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)である。
(a)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(b)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;
(c)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、得られる集団の生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)であり;
(d)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第2集団の生存細胞の総数が、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であるか;又は
(e)例えば、実施例10に記載の方法によって決定されて、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数が、第2集団の生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)である。
(a)約1~約10(例えば、約2~約9、約3~約8、約4~約7、約5~約6、約1~約8、約1~約6、約1~約4、約8~約10、約6~約10、約4~約10、約1~3、約2~約4、約3~約5、約4~約6、約5~約7、約6~約8、約7~約9、約8~約10、約2.5~約5、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9又は約10)のMOIで第1ウイルスベクターと;
(b)約0.1~約5(例えば、約0.2~約4、約0.3~約3、約0.4~約2、約0.5~約1、約0.6~約0.9、約0.7~約0.8、約0.1~約4、約0.1~約3、約0.1~約2、約0.1~約1、約0.1~約0.5、約4~約5、約3~約5、約2~約5、約1~約5、約0.5~約5、約0.2~約5、約0.1~約0.5、約0.2~約1、約0.5~約2、約1~約3、約2~約4、約3~約5、約0.5~約1、約0.1、約0.2、約0.3、約0.4、約0.5、約0.6、約0.7、約0.8、約0.9、約1、約2、約3、約4又は約5)のMOIで第2ウイルスベクターと;
(c)細胞の集団を第2ウイルスベクターと接触させる際のMOIより少なくとも約10%(例えば、少なくとも約20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%若しくは90%)高いか、若しくは少なくとも約1倍(例えば、少なくとも約2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90若しくは100倍、例えば約2~約50倍、約3~20倍、約5~約15倍若しくは約8~約10倍)のMOIで第1ウイルスベクターと;及び/又は
(d)細胞の集団を第1ウイルスベクターと接触させる際のMOIの1/X(ここで、Xは、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、15、20、30、40、50、60、70、80、90又は100である)以下のMOIで第2ウイルスベクターと
接触させる。
(a)約4~約5(例えば、約4.75)のMOIで第1ウイルスベクターと;及び/又は
(b)約0.2~約1(例えば、約0.5)のMOIで第2ウイルスベクターと
接触させる。
一部の実施形態では、本開示は、キメラ抗原受容体(CAR)(例えば、1つ以上のCAR、例えば、2つのCAR)を発現する細胞(例えば、T細胞)の集団を作製する方法を提供し、これは、(1)細胞の集団を、IL-2、IL-7、IL-15、IL-21、IL-6又はそれらの組み合わせから選択されるサイトカインと接触させるステップ、(2)細胞(例えば、T細胞)の集団を、CARをコードする核酸分子(例えば、DNA又はRNA分子)と接触させ、それにより核酸分子を含む細胞(例えば、T細胞)の集団を提供するステップ、及び(3)保存(例えば、凍結保存培地中の細胞集団の再製剤化)又は投与のために細胞(例えば、T細胞)の集団を採取するステップを含み、(a)ステップ(2)は、ステップ(1)と一緒に、又はステップ(1)の開始後の5時間以内、例えばステップ(1)の開始後の1、2、3、4若しくは5時間以内に実施され、ステップ(3)は、ステップ(1)の開始後の26時間以内、例えばステップ(1)の開始後の22、23若しくは24時間以内、例えばステップ(1)の開始後の24時間以内に実施されるか、又は(b)ステップ(3)からの細胞の集団は、増殖されないか、又は例えばステップ(1)の開始時の細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖される。一部の実施形態では、ステップ(2)における核酸分子は、DNA分子である。一部の実施形態では、ステップ(2)における核酸分子は、RNA分子である。一部の実施形態では、ステップ(2)における核酸分子は、ウイルスベクター、例えば、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター又はレトロウイルスベクターから選択されるウイルスベクター上にある。一部の実施形態では、ステップ(2)における核酸分子は、非ウイルスベクター上にある。一部の実施形態では、ステップ(2)における核酸分子は、プラスミド上にある。一部の実施形態では、ステップ(2)における核酸分子は、いずれのベクター上にもない。一部の実施形態では、ステップ(2)は、CARをコードする核酸分子を含むウイルスベクターで、細胞(例えば、T細胞)の集団を形質導入することを含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される2つのCAR(例えば、本明細書に開示される抗BCMA CAR及び抗CD19 CAR)をコードする核酸分子を含むように細胞を操作する。一部の実施形態では、本明細書に開示されるダイアボディCAR(例えば、本明細書に開示される抗BCMA/抗CD19ダイアボディCAR)をコードする核酸分子を含むように細胞を操作する。一部の実施形態では、各々が本明細書に開示のCARをコードする2つの核酸分子(例えば、抗BCMA CARをコードする1つの核酸分子と、抗CD19 CARをコードする1つの核酸分子)を含むように細胞を操作する。
一部の実施形態では、細胞、例えば、T細胞若しくはNK細胞を、例えば、抗CD3/抗CD28抗体コーティングDynabeads(登録商標)を用いて活性化させ、CAR(例えば、1つ以上のCAR)をコードする1つ以上の核酸分子と接触させた後、例えば、7、8、9、10若しくは11日にわたってインビトロで増殖させる。一部の実施形態では、細胞、例えば、T細胞若しくはNK細胞は、ポジティブ又はネガティブ選択を用いて、新鮮若しくは凍結保存白血球アフェレーシスサンプルから選択される。一部の実施形態では、CAR(例えば、1つ以上のCAR)をコードする核酸分子(例えば、1つ以上の核酸分子)と、細胞を接触させる。一部の実施形態では、本明細書に開示される2つのCAR(例えば、抗BCMA CAR及び抗CD19 CAR)をコードする核酸分子と、細胞を接触させる。一部の実施形態では、2つの核酸分子(1つは、第1CAR(例えば、抗BCMA CAR)を発現し、他方は、第2CAR(例えば、抗CD19 CAR)を発現する)と、細胞を接触させる。一部の実施形態では、ダイアボディCAR(例えば、本明細書に開示される抗BCMA/抗CD19ダイアボディCAR)をコードする核酸分子と、細胞を接触させる。
一部の実施形態において、本明細書に記載の方法は、不要な細胞、例えば単球及び芽細胞を除去し、これにより、CAR発現に好適な所望の免疫エフェクター細胞の濃縮改善を達成する水簸法を特徴とする。一部の実施形態では、本明細書に記載の水簸法は、事前に凍結したサンプル、例えば解凍サンプルからのCAR発現に好適な所望の免疫エフェクター細胞の濃縮のために最適化される。一部の実施形態では、本明細書に記載の水簸法は、当技術分野で公知の水簸プロトコルから収集される細胞の調製物と比べて、純度が向上した細胞の調製物を提供する。一部の実施形態では、本明細書に記載の水簸法は、特定の等張液(例えば、PBS)を用いた希釈による出発サンプル、例えば細胞サンプル、例えば解凍した細胞サンプルの最適化された粘度の使用並びに水簸装置により収集される各画分の流量及び収集量の最適化された組み合わせの使用を含む。本発明に適用することができる例示的な水簸法は、国際公開第2017/117112号パンフレット(その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる)の48~51ページに記載されている。
養子細胞治療製品の製造は、末梢血アフェレーシス出発材料中に存在する血液細胞及び血液成分の複合混合物から離れて、所望の細胞、例えば免疫エフェクター細胞をプロセシングすることを必要とする。末梢血由来のリンパ球サンプルは、フィコール溶液による密度勾配遠心分離を用いた分離に成功している。しかし、フィコールは、臨床使用に適格ではないため、フィコールは、治療用途で細胞を分離するのに好ましい試薬ではない。さらに、フィコールは、グリコールを含有し、これは、細胞に対して毒性を有する可能性がある。さらに、凍結保存後の解凍アフェレーシス産物のフィコール密度勾配遠心分離は、例えば、本明細書の実施例に記載されるように、準最適なT細胞産物をもたらす。例えば、フィコール溶液による密度勾配遠心分離によって分離された細胞調製物では、非T細胞、特に望ましくないB細胞、芽細胞及び単球の相対的な増加と共に、最終産物でのT細胞の喪失が観察された。
CAR発現に適した所望の免疫エフェクター細胞の濃縮を改善するための特定の細胞の選択方法が本明細書に提供される。一部の実施形態において、選択は、ポジティブ選択、例えば所望の免疫エフェクター細胞の選択を含む。一部の実施形態では、選択は、ネガティブ選択、例えば望ましくない細胞の選択、例えば望ましくない細胞の除去を含む。複数の実施形態において、本明細書に記載されるポジティブ又はネガティブ選択方法は、例えば、フロースルー装置、例えば本明細書に記載のフロースルー装置の使用により、流動条件下で実施される。例示的なポジティブ及びネガティブ選択は、国際公開第2017/117112号パンフレット(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)の53~57ページに記載されている。選択方法は、細胞プロセシングシステムとも呼ばれるフロースルー装置を使用することにより流動条件下で実施して、CAR発現に好適な所望の免疫エフェクター細胞、例えばT細胞の細胞調製物をさらに濃縮することができる。例示的なフロースルー装置は、国際公開第2017/117112号パンフレット(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)の57~70ページに記載されている。例示的な細胞分離及び脱ビーズ(debeading)方法は、国際公開第2017/117112号パンフレット(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)の70~78ページに記載されている。
本明細書に記載のプロセス、全て臨床医薬品製造(cGMP)基準に従って実施することができる。
この項では、所望の免疫エフェクター細胞を含むインプットサンプルを取得し、所望の免疫エフェクター細胞、例えばT細胞を分離及びプロセシングし、且つ不要な物質、例えば不要な細胞を除去するための追加の方法又はステップを提供する。この項に記載される追加の方法又はステップは、先行項に記載される水簸、密度勾配遠心分離、流動条件下での選択又は改善された洗浄ステップのいずれかと組み合わせて使用することができる。
本明細書に記載の複数の実施形態において、免疫エフェクター細胞は、同種免疫エフェクター細胞、例えばT細胞又はNK細胞であり得る。例えば、細胞は、同種T細胞、例えば機能的T細胞受容体(TCR)及び/又はヒト白血球抗原(HLA)、例えばHLAクラスI及び/又はHLAクラスIIの発現を欠く同種T細胞であり得る。
一部の実施形態において、TCR発現及び/又はHLA発現を、細胞、例えばT細胞における、TCR及び/若しくはHLA並びに/又は本明細書に記載の阻害分子(例えば、PD1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3及び/又はCEACAM-5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14又はCD270)、KIR、A2aR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、アデノシン及びTGFβ)をコードする核酸を標的とするsiRNA又はshRNAを使用して、阻害することができる。
本明細書で使用する「CRISPR」又は「TCR及び/又はHLAに対するCRISPR」又は「TCR及び/又はHLAを阻害するためのCRISPR」は、一連の群生性等間隔短回文反復配列又はこのような一連の反復を含む系を指す。本明細書で使用する「Cas」は、CRISPR関連タンパク質を指す。「CRISPR/Cas」系は、細胞、例えばT細胞における、TCR及び/若しくはHLA遺伝子並びに/又は本明細書に記載の阻害分子(例えば、PD1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3及び/又はCEACAM-5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14又はCD270)、KIR、A2aR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、アデノシン及びTGFβ)の発現抑制又は変異に使用することができる、CRISPR及びCas由来の系を指す。
「TALEN」又は「HLA及び/又はTCRに対するTALEN」又は「HLA及び/又はTCRを阻害するためのTALEN」は、細胞、例えばT細胞における、HLA及び/若しくはTCR遺伝子並びに/又は本明細書に記載の阻害分子(例えば、PD1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3及び/又はCEACAM-5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14又はCD270)、KIR、A2aR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、アデノシン及びTGFβ)の編集に使用することができる人工ヌクレアーゼである、転写アクティベーター様エフェクターヌクレアーゼを指す。
「ZFN」又は「亜鉛フィンガーヌクレアーゼ」又は「HLA及び/又はTCRに対するZFN」又は「HLA及び/又はTCRを阻害するためのZFN」は、細胞、例えばT細胞における、HLA及び/若しくはTCR遺伝子並びに/又は本明細書に記載の阻害分子(例えば、PD1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3及び/又はCEACAM-5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14又はCD270)、KIR、A2aR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、アデノシン及びTGFβ)の編集に使用することができる人工ヌクレアーゼである、亜鉛フィンガーヌクレアーゼを指す。
テロメアは、体細胞の持続に重要な役割を果たし、その長さはテロメラーゼ(TERT)によって維持される。CLL細胞のテロメア長は非常に短い可能性があり(Roth et al.,“Significantly shorter telomeres in T-cells of patients with ZAP-70+/CD38 chronic lymphocytic leukaemia”British Journal of Haematology,143,383-386.,August 28 2008)、製造されたCAR発現細胞、例えばCART19細胞ではさらに短くなる可能性があるため、患者への養子移入後にそれが増殖する可能性が制限される。テロメラーゼの発現は、CAR発現細胞を複製疲弊から救済することができる。
本明細書に記載の方法により生成又は濃縮されたT細胞などの免疫エフェクター細胞は、例えば、米国特許第6,352,694号明細書;同第6,534,055号明細書;同第6,905,680号明細書;同第6,692,964号明細書;同第5,858,358号明細書;同第6,887,466号明細書;同第6,905,681号明細書;同第7,144,575号明細書;同第7,067,318号明細書;同第7,172,869号明細書;同第7,232,566号明細書;同第7,175,843号明細書;同第5,883,223号明細書;同第6,905,874号明細書;同第6,797,514号明細書;同第6,867,041号明細書;及び米国特許出願公開第20060121005号明細書に記載する方法を使用して、一般的に活性化及び増殖され得る。
CARリガンド(任意選択で標識CARリガンド、例えばタグ、ビーズ、放射活性又は蛍光標識を含むCARリガンド)を提供し;
CAR発現細胞を獲得し(例えば、製造サンプル又は臨床サンプルなどのCAR発現細胞含有サンプルの獲得);
CAR発現細胞とCARリガンドを、結合が生じる条件下で接触させ、それにより存在するCAR発現細胞のレベル(例えば、量)を検出することを含む。CAR発現細胞とCARリガンドの結合は、FACS、ELISAなどのような標準技術を使用して検出できる。
CAR発現細胞(例えば、第1のCAR発現細胞又は一過性に発現されるCAR細胞)を提供し);
前記CAR発現細胞とCARリガンド、例えば、本明細書に記載されるようなCARリガンドを、免疫細胞増殖及び/又は増殖が生じる条件下で接触させ、それにより活性化及び/又は増殖集団を産生することを含む。
1)抗原結合ドメイン、例えば、本明細書に記載の抗原結合ドメイン;
膜貫通ドメイン;及び
細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば第1の共刺激ドメイン、例えばICOSドメイン
を含む、CARを含むCD4+T細胞(CARCD4+);及び
2)CARを含むCD8+T細胞(CARCD8+)であって、
抗原結合ドメイン、例えば、本明細書に記載の抗原結合ドメイン;
膜貫通ドメイン;及び
細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば第2の共刺激ドメイン、例えば4-1BBドメイン、CD28ドメイン又はICOSドメイン以外の別の共刺激ドメイン
を含むもの
を投与することを含み、ここで、CARCD4+とCARCD8+は互いに異なる。任意選択で、方法は、さらに、
3)CARを含む第2のCD8+T細胞(第2のCARCD8+)であって、
抗原結合ドメイン、例えば、本明細書に記載の抗原結合ドメイン;
膜貫通ドメイン;及び
第2のCARCD8+が、CARCD8+上に存在しない細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば共刺激シグナル伝達ドメインを含み、任意選択でICOSシグナル伝達ドメインを含まない、細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む。
一部の実施形態において、本明細書に開示する1つ以上のCAR発現細胞を、バイオポリマー足場、例えば、バイオポリマーインプラントにより対象に投与又は送達し得る。バイオポリマー足場は、本明細書に記載のCAR発現細胞の送達、増殖及び/分散を支持又は強化することができる。バイオポリマー足場は、生体適合性(例えば、炎症性又は免疫応答を実質的に誘発しない)及び/又は天然に存在し得るか又は合成である生分解性ポリマーを含む。例示的なバイオポリマーは、例えば、2015年3月13日に出願された国際公開第2015/142675号パンフレットの段落1004~1006に記載され、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
一部の実施形態において、本開示は、本明細書に記載されるように産生されたCAR発現細胞を、任意選択で1つ以上の他の治療と組み合わせて、投与することを含む、患者を処置する方法を提供する。一部の実施形態において、本開示は、本明細書に記載されるようなCAR発現細胞を含む反応混合物を、任意選択で1つ以上の他の治療と組み合わせて、投与することを含む、患者を処置する方法を提供する。一部の実施形態において、本開示は、本明細書に記載されるようなCAR発現細胞を含む反応混合物を発送又は受領する方法を提供する。一部の実施形態において、本開示は、本明細書に記載されるように産生されたCAR発現細胞を受領することを含み、CAR発現細胞を、任意選択で1つ以上の他の治療と組み合わせて、患者に投与することをさらに含む、患者を処置する方法を提供する。一部の実施形態において、本開示は、本明細書に記載されるようなCAR発現細胞を産生することを含み、CAR発現細胞を、任意選択で1つ以上の他の治療と組み合わせて、患者に投与することをさらに含む、患者を処置する方法を提供する。他の療法は、例えば、化学療法などの癌療法であり得る。
一部の実施形態において、BCMA/CD19二重CART細胞組成物は、2つのユニークなベクターを用いた共形質導入により生産される。従って、一部の実施形態では、細胞組成物は、異種細胞集団を含む。一部の実施形態では、異種細胞組成物は、未形質導入T細胞、モノBCMA特異的CART細胞、モノCD19特異的CART細胞並びにBCMA特異的CAR分子及びCD19特異的CAR分子の両方を発現する二重CART細胞を含む。これらの異なる細胞集団は、対象における疾患の処置に関して、異なる活性を呈示し得る。
(a)抗BCMA CARを含むが、抗CD19 CARを含まない細胞の第1集団;
(b)抗CD19 CARを含むが、抗BCMA CARを含まない細胞の第2集団;及び
(c)抗BCMA CARと抗CD19 CARとの両方を含む細胞の第3集団
を含む。
(i)第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(ii)第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;
(iii)第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)である。
一部の実施形態において、CAR細胞(例えば、CD19CAR細胞)の用量は、約1×106、1.1×106、2×106、3.6×106、5×106、1×107、1.8×107、2×107、5×107、1×108、2×108又は5×108細胞/kgを含む。一部の実施形態において、CAR細胞(例えば、CD19CAR細胞)の用量は、少なくとも約1×106、1.1×106、2×106、3.6×106、5×106、1×107、1.8×107、2×107、5×107、1×108、2×108又は5×108細胞/kgを含む。一部の実施形態において、CAR細胞(例えば、CD19CAR細胞)の用量は、最大約1×106、1.1×106、2×106、3.6×106、5×106、1×107、1.8×107、2×107、5×107、1×108、2×108又は5×108細胞/kgを含む。一部の実施形態において、CAR細胞(例えば、CD19CAR細胞)の用量は、約1.1×106~1.8×107細胞/kgを含む。一部の実施形態において、CAR細胞(例えば、CD19CAR細胞)の用量は、約1×107、2×107、5×107、1×108、2×108、5×108、1×109、2×109又は5×109細胞を含む。一部の実施形態において、CAR細胞(例えば、CD19CAR細胞)の用量は、少なくとも約1×107、2×107、5×107、1×108、2×108、5×108、1×109、2×109又は5×109細胞を含む。一部の実施形態において、CAR細胞(例えば、CD19CAR細胞)の用量は、最大約1×107、2×107、5×107、1×108、2×108、5×108、1×109、2×109又は5×109細胞を含む。
一部の実施形態において、本明細書に開示される方法は、細胞(例えば、本明細書に記載されるような免疫エフェクター細胞)での処置後にT細胞枯渇剤を投与すること、それにより、CAR発現細胞(例えば、CD19CAR発現細胞)を減少させる(例えば、枯渇させる)ことをさらに含む。そのようなT細胞枯渇剤は、CAR発現細胞(例えば、CD19CAR発現細胞)を効果的に枯渇させて、毒性を緩和するために使用することができる。一部の実施形態において、CAR発現細胞は、本明細書に記載の方法に従って製造され、例えば、本明細書に記載の方法に従ってアッセイされた(例えば、トランスフェクション若しくは形質導入の前又は後)。
一部の実施形態では、1用量の生存CAR発現細胞(例えば、生存CD19、BCMA、CD20若しくはCD22 CAR発現細胞)又は前記細胞を含む医薬組成物は、約1×106~約1×108個(例えば、約2×106~約5×107、約5×106~約2×107、約1×106~約1×107、約1×107~約1×108、約1×106~約3×106、約2×106~約4×106、約3×106~約5×106、約4×106~約6×106、約5×106~約7×106、約6×106~約8×106、約7×106~約9×106、約8×106~約1×107、約9×106~約2×107、約1×107~約3×107、約2×107~約4×107、約3×107~約5×107、約4×107~約6×107、約5×107~約7×107、約6×107~約8×107、約7×107~約9×107、約8×107~約1×108、約1×106、約2×106、約3×106、約4×106、約5×106、約6×106、約7×106、約8×106、約9×106、約1×107、約2×107、約3×107、約4×107、約5×107、約6×107、約7×107、約8×107、約9×107又は約1×108個)のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)を含む。一部の実施形態では、1用量の生存CAR発現細胞(例えば、生存CD19、BCMA、CD20又はCD22 CAR発現細胞)は、約0.5×106個の生存CAR発現細胞~約1.25×109個の生存CAR発現細胞(例えば、0.5×106個の生存CAR発現細胞~1.25×109個の生存CAR発現細胞)を含む。一部の実施形態では、1用量の生存CAR発現細胞(例えば、生存CD19、BCMA、CD20又はCD22 CAR発現細胞)は、約1×106、約2.5×106、約5×106、約1.25×107、約2.5×107、約5×107、約5.75×107又は約8×107個の生存CAR発現細胞を含む。
(a)1回目用量は、約1×106~約1×107個(例えば、約2×106~約8×106、約4×106~約6×106、約1×106~約5×106、約5×106~約1×107、約1×106~約3×106、約2×106~約4×106、約3×106~約5×106、約4×106~約6×106、約5×106~約7×106、約6×106~約8×106、約7×106~約9×106、約8×106~約1×107、約1×106、約2×106、約3×106、約4×106、約5×106、約6×106、約7×106、約8×106、約9×106若しくは約1×107個)の生存CAR陽性細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)を含み;
(b)2回目用量は、約1×107~約1×108個(例えば、約2×107~約8×107、約4×107~約6×107、約1×107~約5×107、約5×107~約1×108、約1×107~約3×107、約2×107~約4×107、約3×107~約5×107、約4×107~約6×107、約5×107~約7×107、約6×107~約8×107、約7×107~約9×107、約8×107~約1×108、約1×107、約2×107、約3×107、約4×107、約5×107、約6×107、約7×107、約8×107、約9×107若しくは約1×108個)のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)を含み;
(c)1回目用量中のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)の数は、2回目用量中のCAR陽性(例えば、BCMA CAR+T細胞)の数の1/X(ここで、Xは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90又は100である)以下であり;及び/又は
(d)1回目用量中のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)の数は、2回目用量中のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)の数の約1%~約100%(例えば、約10%~約90%、約20%~約80%、約30%~約70%、約40%~約60%、約10%~約50%、約50%~約90%、約10%~約30%、約20%~約40%、約30%~約50%、約50%~約70%、約60%~約80%若しくは約70%~約90%)である。
対象を処置する方法又は本明細書に開示される使用のための組成物のいずれかの一部の実施形態では、対象は、癌、例えば血液癌を有する。一部の実施形態では、癌は、リンパ性白血病(CLL)、マントル細胞リンパ腫(MCL)、多発性骨髄腫、急性リンパ性白血病(ALL)、ホジキンリンパ腫、B細胞急性リンパ性白血病(BALL)、T細胞急性リンパ性白血病(TALL)、小リンパ球性白血病(SLL)、B細胞前リンパ球性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞新生物、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性炎症を伴うDLBCL、慢性骨髄性白血病、骨髄増殖性腫瘍、濾胞性リンパ腫、小児性濾胞性リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、小細胞型若しくは大細胞型濾胞性リンパ腫、悪性リンパ球増殖性病態、MALTリンパ腫(粘膜関連リンパ組織型節外性濾胞辺縁帯リンパ腫)、辺縁帯リンパ腫、骨髄形成異常、骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞新生物、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、脾辺縁帯リンパ腫、脾リンパ腫/白血病、脾臓びまん性赤脾髄小細胞型B細胞リンパ腫、ヘアリー細胞白血病-変異型、リンパ形質細胞性リンパ腫、H鎖病、プラズマ細胞骨髄腫、孤立性骨形質細胞腫、骨外性形質細胞腫、節性辺縁帯リンパ腫、小児性節性辺縁帯リンパ腫、原発性皮膚濾胞中心リンパ腫、リンパ腫様肉芽腫症、原発性縦隔(胸腺)大細胞型B細胞リンパ腫、血管内大細胞型B細胞リンパ腫、ALK+大細胞型B細胞リンパ腫、HHV8関連多中心性キャッスルマン病に発生する大細胞型B細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、B細胞リンパ腫、急性骨髄性白血病(AML)又は分類不能なリンパ腫から選択される。一部の実施形態では、癌は、再発及び/又は難治性癌である。
BCMA関連疾患及び/又は障害
一態様において、本発明は、BCMA発現に関連する疾患を処置する方法を提供する。一態様において、本発明は、腫瘍の一部がBCMA陰性であり、且つ腫瘍の一部がBCMA陽性である疾患を処置する方法を提供する。例えば、本発明のCARは、BCMAの発現増大に関連する疾患の処置を受けたことがある対象を処置するのに有用であり、その場合、BCMAの発現増大に関連する疾患の処置を受けたことがある対象は、BCMAの発現増大に関連する疾患を呈示する。いくつかの実施形態において、本発明のCARは、BCMAの発現に関連する疾患を受けたことがある対象を処置するに有用であり、その場合、BCMAの発現に関連する疾患の処置を受けたことがある対象は、BCMAの発現に関連する疾患を呈示する。
-クローン骨髄腫プラズマ細胞≧10%
-血清及び/又は尿モノクローナルタンパク質の存在(真性非分泌型多発性骨髄腫患者の場合を除く)
-基礎的なプラズマ細胞増殖障害に起因する末端器官障害のエビデンス、具体的には、下記のもの:
・高カルシウム血症:血清カルシウム≧11.5mg/100ml
・腎不全:血清クレアチニン≧1.73mmol/l
・貧血:ヘモグロビン値が、正常の下限より>2g/100ml低いか、又はヘモグロビン値<10g/100mlである、正色素性、正赤血球性。
・骨病変:溶解性病変、重症骨粗鬆症又は病的骨折。
本明細書に記載されるCAR発現細胞は、他の公知の薬剤及び治療法と組み合わせて使用することができる。本明細書に記載されるCAR発現細胞と、少なくとも1つの別の治療薬とを同じ又は個別の組成物中で同時に又は順次投与することができる。順次投与する場合、本明細書に記載のCAR発現細胞を最初に投与し、別の薬剤を2番目に投与することができるか、又は投与の順序を逆にし得る。CAR療法及び/若しくは他の治療薬、手順又はモダリティは、活動性疾患の期間中又は寛解若しくは低活動性疾患の期間中に投与することができる。CAR療法は、他の処置前、それと同時、処置後又は疾患の寛解中に投与することができる。組み合わせて投与する場合、CAR療法及び/又は追加の薬剤(例えば、第2若しくは第3薬剤)又は全部を、各薬剤が個別に、例えば、単剤療法として使用される量若しくは用量よりも高いか、低いか若しくはそれと同じ量で投与することができる。一部の実施形態では、CAR療法、追加の薬剤(例えば、第2若しくは第3薬剤)又は全部の投与量若しくは用量は、各薬剤が個別に、例えば、単剤療法として使用される量若しくは用量よりも(例えば、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%若しくは少なくとも50%)低い。他の実施形態では、所望の効果(例えば、癌の治療)をもたらす、CAR療法、追加の薬剤(例えば、第2若しくは第3薬剤)又は全部の投与量若しくは用量は、同じ治療効果を達成するのに必要な、各薬剤が個別に、例えば、単剤療法として使用される量若しくは用量よりも(例えば、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%若しくは少なくとも50%)低い。別の態様では、本明細書に記載のCAR発現細胞は、手術、化学療法、放射線、免疫抑制剤と組み合わせた処置レジメンに使用され得る。本明細書に記載のCAR発現細胞と併用することができる例示的な薬剤及び治療法は、国際公開第2016164731号パンフレット(その全体が、参照により本明細書に組み込まれる)の第266~313頁に開示されている。
一部の実施形態では、対象(例えば、癌、例えば血液癌を有する対象)において、CAR発現細胞療法(例えば、CD19若しくはBCMA CAR療法)の有効性を評価又はモニターする方法が本明細書に開示される。この方法は、CAR療法に対する有効性の値を取得することを含み、ここで、前記値は、CAR発現細胞療法の有効性又は適合性を示す。
(i)サンプル(例えば、アフェレーシスサンプル若しくは製造されたCAR発現細胞産物サンプル)中のBTKをコードする遺伝子の突然変異;
(ii)サンプル(例えば、アフェレーシスサンプル若しくは製造されたCAR発現細胞産物サンプル)中のPLCg2をコードする遺伝子の突然変異;
(iii)サンプル(例えば、対象からのアフェレーシスサンプル若しくは腫瘍サンプル)中の;例えばCD8、CD4、CD3、CD5、CD19、CD20、CD22、CD43、CD79b、CD27、CD45RO、CD45RA、CCR7、CD95、Lag3、PD-1、Tim-3及び/若しくはCD81のレベル及び/若しくは活性により評価される;又は免疫グロブリンディープシーケンシングにより評価されるような微小残存病変;又は
(iv)サンプル、例えば対象からのアフェレーシスサンプル中の、IFN-g、IL-2、IL-4、IL-6、IL-8、IL-10、IL-15、TNF-a、IP-10、MCP1,MIP1aから選択される1、2、3、4、5、6、7、8、9、10若しくは全部のレベル又は活性。
(i)サンプル(例えば、対象からのアフェレーシスサンプル若しくは腫瘍サンプル)中の;例えばCD8、CD4、CAR19、CD3、CD27、CD45RO、CD45RA、CCR7、CD95、Lag3、PD-1及び/若しくはTim-3のレベル及び/若しくは活性により評価される;又は免疫グロブリンディープシーケンシングにより評価されるような微小残存病変;又は
(ii)サンプル(例えば、対象からアフェレーシスサンプル)中の、IFN-g、IL-2、IL-4、IL-6、IL-8、IL-10、IL-15、TNF-a、IP-10、MCP1,MIP1aから選択される1、2、3、4、5、6、7、8、9、10若しくは全部のレベル又は活性。
(i)サンプル(例えば、アフェレーシスサンプル若しくは製造されたCAR発現細胞産物サンプル)中の、休止TEFF細胞、休止TREG細胞、より若いT細胞(例えば、ナイーブT細胞(例えば、ナイーブCD4若しくはCD8 T細胞、ナイーブγ/δ T細胞)、若しくはステムメモリーT細胞(例えば、ステムメモリーCD4若しくはCD8T細胞若しくはステムメモリーγ/δ T細胞)、若しくは早期メモリーT細胞又はそれらの組み合わせの1、2、3つ若しくはそれを超えるもの(例えば、全部)のレベル又は活性;
(ii)サンプル(例えば、アフェレーシスサンプル若しくは製造されたCAR発現細胞産物サンプル)中の、活性化TEFF細胞、活性化TREG細胞、より経時的なT細胞(例えば、より経時的なCD4若しくはCD8細胞)若しくは後期メモリーT細胞又はそれらの組み合わせの1、2、3つ若しくはそれを超えるもの(例えば、全部)のレベル又は活性;
(iii)サンプル(例えば、アフェレーシスサンプル若しくは製造されたCAR発現細胞産物サンプル)中の、免疫細胞疲弊マーカー、例えば1、2つ若しくはそれを超えるものの免疫チェックポイント阻害因子(例えば、PD-1、PD-L1、TIM-3、TIGIT及び/又はLAG-3)のレベル又は活性。一部の実施形態において、免疫細胞は、疲弊表現型を有し、例えば少なくとも2つの疲弊マーカー、例えばPD-1及びTIM-3を同時発現する。他の実施形態では、免疫細胞は、疲弊表現型を有し、例えば少なくとも2つの疲弊マーカー、例えばPD-1及びLAG-3を同時発現する;
(iv)サンプル(例えば、アフェレーシスサンプル若しくは製造されたCAR発現細胞産物サンプル)中の、例えばCD4+若しくはCD8+T細胞集団における、CD27及び/又はCD45RO-(例えば、CD27+CD45RO-)免疫エフェクター細胞のレベル又は活性;
(v)CCL20、IL-17a、IL-6、PD-1、PD-L1、LAG-3、TIM-3、CD57、CD27、CD122、CD62L、KLRG1から選択されるバイオマーカーの1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11若しくは全部のレベル又は活性;
(vi)CAR発現細胞産物サンプル、例えばCLL-1発現細胞産物サンプル中のサイトカインレベル又は活性(例えば、サイトカインレパトアの品質);又は
(vii)製造されたCAR発現細胞産物サンプル中のCAR発現細胞の形質導入効率。
(i)参照値、例えばCD27+免疫エフェクター細胞の非応答者数と比べて、高い数のCD27+免疫エフェクター細胞を有する;
(ii)参照値、例えばCD8+T細胞の非応答者数と比べて、高い数のCD8+T細胞を有する;
(iii)参照値、例えば1つ以上のチェックポイント阻害因子を発現する細胞の非応答者数と比べて、少数の、1つ以上のチェックポイント阻害因子、例えばPD-1、PD-L1、LAG-3、TIM-3若しくはKLRG-1又はそれらの組み合わせから選択されるチェックポイント阻害因子を発現する免疫細胞を有する;又は
(iv)参照値、例えば休止TEFF細胞、休止TREG細胞、ナイーブCD4細胞、非刺激メモリーT細胞若しくは早期メモリーT細胞の非応答者数と比べて、高い数で、休止TEFF細胞、休止TREG細胞、ナイーブCD4細胞、非刺激メモリーT細胞若しくは早期メモリーT細胞又はそれらの組み合わせの1つ、2つ、3つ、4つ若しくはそれを超えるもの(全部)を有する。
例えば、応答者又は非応答者に、CAR発現細胞療法を投与する;
変更された用量設定のCAR発現細胞療法を投与する;
CAR発現細胞療法のスケジュール又はタイムコースを変更する;
例えば、非応答者又は部分応答者に、CAR発現細胞療法と組み合わせて、追加薬剤、例えばチェックポイント阻害因子、例えば本明細書に記載のチェックポイント阻害因子を投与する;
非応答者又は部分応答者に、CAR発現細胞療法による処置前に対象中の若いT細胞の数を増加させる療法を実施する;
例えば、非応答者又は部分応答者として識別された対象の場合、CAR発現細胞療法の製造プロセスを改変する、例えばCARをコードする核酸の導入前に若いT細胞を濃縮するか又は形質導入効率を高める;
例えば、非応答者若しくは部分応答者又は再発者の場合、代替療法を実施する;又は
対象が、非応答者又は再発者であるか又はそれとして識別される場合、例えばCD25枯渇、シクロホスファミド、抗GITR抗体の投与の1つ以上又はそれらの組み合わせにより、TREG細胞集団及び/又はTREG遺伝子シグネチャーを低減する。
1セットの完全ヒト一本鎖可変フラグメント(scFv)を、CD3ζ鎖及び4-1BB刺激分子:R1B6、R1F2、R1G5、PI61、B61-10、B61-02、Hy03及びHy52を含むレンチウイルスCAR発現ベクターにクローニングした。初めに、自動化細胞リポーターアッセイを用いて、これらの構築物をスクリーニングした後、初代T細胞での発現並びにBCMA発現(「BCMA+」又は「BCMA陽性」)標的に応答するエフェクターT細胞応答(「BCMA CART」又は「BCMA CART細胞」)の量及び質に基づく最適クローンの選択を実施した。エフェクターT細胞応答として、限定されないが、細胞拡大、増殖、倍加、サイトカイン産生及び標的細胞殺傷又は細胞溶解活性(脱顆粒)が挙げられる。
前述したscFvコード化レンチウイルストランスファーベクターを全て使用して、VSVg偽型レンチウイルス粒子にパッケージングされたゲノム物質を生成した。CARをコードするレンチウイルストランスファーベクターDNAを、3つのパッケージング成分:VSVg、gag/pol及びrevをリポフェクタミン試薬と組み合わせて混合して、Lenti-X 293T細胞(Clontech)をトランスフェクトした後、12~18h後に培地を取り換えた。培地の交換から30時間後、培地を収集し、濾過し、-80℃で保存した。
リポーターアッセイのために、96ウェルプレートにおいて、自動化された小規模様式で、2つの異なる細胞密度(40,000細胞(1×H293)又は80,000細胞(2×H293))のHEK293細胞中でBCMA CARをコードするレンチウイルスを作製し、この場合、トランスフェクションから48h後にウイルス含有上清を回収し、凍結せずに、Jurkat T細胞リポーター細胞株の形質導入のために新鮮な状態で使用した。Jurkat NFATルシフェラーゼ(JNL)リポーター細胞株は、急性T細胞白血病株Jurkatを基材とする。この細胞株を、活性化T細胞の核内因子(NFAT)応答エレメントの制御下でルシフェラーゼを発現するように修飾した。BCMA CARでの形質導入のために、96ウェルプレートの10,000JNL細胞/ウェルを50μlの新鮮な、45μmの濾過済ウイルス含有上清で形質導入した。プレートを5日間培養した後、標的細胞と共培養した。
次の8つのCARを初代T細胞におけるCAR発現、安定性及び有効性の分析のために選択した:R1B6、R1F2、R1G5、PI61、B61-10、B61-02、Hy03及びHy52。健康なアフェレーシス済ドナー(そのT細胞(CD4+及びCD8+リンパ球)をCD3+T細胞についてのネガティブ選択により取得した)からの血液で開始することにより、BCMA CAR T細胞を作製した。これらの細胞を、T細胞培地(RPMI1640、10%熱不活性化ウシ胎仔血清(FCS)、2mM L-グルタミン、1×ペニシリン/ストレプトマイシン、100μM非必須アミノ酸、1mMピルビン酸ナトリウム、10mM Hepes及び55μM2-メルカプトエタノール)中に、CD3/CD28ビーズ(Dynabeads(登録商標)Human T-Expander CD3/CD28,Thermo Fisher Scientific)を1:3(T細胞:ビーズ)の比で添加することにより活性化した。37℃、5%CO2にて、24ウェルプレートのウェル当たり1mL培地中0.5×106T細胞でT細胞を培養した。24時間後、T細胞をブラスト処理し、T細胞を5の感染多重度(MOI)でBCMA CARウイルスにより形質導入した。T細胞は対数増殖パターンで分裂を開始し、これを、1mL当たりの細胞数を測定することによりモニターし、2日毎にT細胞を新鮮な培地で希釈し、脱ビーズした後、第9日にさらなる分析のために採取した。T細胞のアリコートを染色して、FACS Fortessa(BD)で第5及び9日にフローサイトメトリーによりCAR発現を測定した。BCMA CAR T細胞は全て、研究グレード(即ち、臨床グレードではない)製造条件下で生産した。
BCMA CAR-T細胞の機能的能力を評価するために、BCMA-陽性及び-陰性癌細胞株と一緒に共培養物をセットアップした。CAR-T細胞を解凍し、計数した後、標的細胞と一緒に共培養して、それらの殺傷能力及びサイトカインの分泌の読み出しを行った。BCMA CAR-クローンR1B6、R1F2、R1G5、PI61、B61-10、B61-02、Hy03及びHy52を試験した。非形質導入T細胞(「UTD」)を非ターゲティングT細胞対照として使用した。
CAR T細胞に関して、新しいBCMA結合scFvを試験した。JNLリポーターアッセイ並びに初代T細胞において8つのCARをアッセイした:R1B6、R1F2、R1G5、B61-02、B61-10、PI61、Hy03及びHy52。8つのCAR-T細胞は全て、標的特異的殺傷を示した。R1F2、R1G5又はPI61を発現するT細胞は、標的細胞の存在下で最高量のIFN-γを産生した。全体として、初代T細胞へのBCMA CARの移入は、抗BCMA CAR反応性を誘導したが、オフターゲット機能は誘導しなかった。
2つの完全CAR(キメラ抗原受容体)鎖(一方はBCMAを、他方はCD19を指向する)を含む1セットのバイシストロン構築物をレンチウイルスベクター中で操作した(表28)。CAR発現は、EF1αプロモーターにより駆動する。このようなCARは、BCMAをターゲティングする1セットのヒト一本鎖可変フラグメント(scFv)(duBCMA.4、PI61、R1G5及びR1B6)を含む。CD19をターゲティングする同じヒト化scFvを全ての構築物で操作した。各scFvのN末端で、CD8α由来のシグナルペプチドは、CARを分泌経路にターゲティングさせる。このようなシグナルペプチドは、同時翻訳的に切断されるため、細胞表面に展示されるCARの成熟形態には存在しないと予想される。各scFvのC末端では、CD8αのヒンジ及び膜貫通ドメインが4-1BBの細胞内ドメインに、続いてCD3ζの細胞内ドメインに融合される。2つのCARの間で、より正確には、第1CD3ζドメインの最後のアミノ酸と、続くCARのシグナルペプチドの間で、リンカー(GSG(配列番号206))、続いてブタテシオウイルス-1 2A由来の2A自己切断ペプチド(即ち、P2A配列)が操作される。他のリンカー及び/又は自己切断ペプチドも同様に使用することができる。この設計は、単一のmRNA転写物から、2つの独立したCARの発現を可能にする。2つのCARの間の重複領域(シグナルペプチド、ヒンジ、膜貫通ドメイン、4-1BB及びCD3ζ)をコードするDNA配列は、組換えの可能性を最小限にするために、互いに異なっている。
前述した二重BCMA/CD19CARをコードする5つの構築物を使用して、VSVg偽型レンチウイルス粒子にパッケージングされたゲノム物質を生成した。2つの構築物を対照として使用した:一方は、BCMAに対するモノCARをコードし(duBCMA.4)、また他方は、CD19に対するモノCARをコードする。7つの構築物は全て、同じプラスミドバックボーン中で操作した。これらDNAの各々を、リポフェクタミン試薬と組み合わせた3つのパッケージング成分VSVg、gag/pol及びrevと混合して、Lenti-X 293T細胞(Clontech)をトランスフェクトした後、12~18h後に培地を取り換えた。培地の交換から30分後、培地を収集し、濾過してから、-80℃で保存した。
(%CAR+)×(#接種されたSup-T1細胞)×(希釈率)/(ウイルスの量(mL))
に従って、上流CAR陽性又は二重陽性CAR集団のいずれかを用いて、ウイルス力価を算出した。
健康なアフェレーシス済ドナーからの血液の処理時に、Prodigyを用いたネガティブ選択又はポジティブ選択により取得したヒト初代T細胞(CD4+及びCD8+リンパ球)を用いて、BCMA-CD19二重又はモノBCMA若しくはモノCD19 CART細胞を作製した。形質導入前に、これらのT細胞を、T細胞培地(RPMI1640、10%熱不活性化ウシ胎仔血清(FCS)、2mM L-グルタミン、1×ペニシリン/ストレプトマイシン、100μM非必須アミノ酸、1mMピルビン酸ナトリウム、10mM Hepes及び55μM2-メルカプトエタノール)中に、CD3/CD28ビーズ(Dynabeads(登録商標)Human T-Expander CD3/CD28,Thermo Fisher Scientific)を1:3(T細胞:ビーズ)の比で添加することにより活性化した。37℃、5%CO2にて、24ウェルプレート中ウェル当たり0.5×106/mL培地の密度で細胞を培養した。24時間後、T細胞をブラスト処理し、それらを、上流CAR力価に基づく5の感染多重度(MOI)で、ウイルスにより形質導入した。T細胞は対数増殖パターンで分裂を開始し、これを、1mL当たりの細胞数を測定することによりモニターし、2日毎にT細胞を新鮮な培地で希釈し、脱ビーズした後、細胞のサイズに応じて、第8日又はそれ以降にさらなる分析のために採取した。T細胞のアリコートを染色して、FACS Fortessa(BD)で第7又は8日にフローサイトメトリーによりCAR発現を測定した。
二重BCMA-CD19 CART細胞内のCAR各々の抗腫瘍効力を評価するために、BCMA陽性(KMS11)、CD19陽性(NALM6)及びBCMA/CD19陰性癌細胞株(CD19KO;NALM6由来)と一緒に共培養物をセットアップした。CART細胞を解凍し、計数した後、標的細胞と一緒に共培養して、それらの殺傷能力及びサイトカインの分泌の読み出しを行った。非形質導入T細胞(UTD)を非ターゲティングT細胞対照として使用した。
一部の実施形態において、このARMプロセスは、凍結された又は新鮮な白血球アフェレーシス産物から出発する。計数及びQCのためのサンプルを取得した後、産物をセルソーティング機(例えば、取り付けられたCliniMACS Prodig装置キット)に付着させて、プログラムを開始する。細胞を洗浄し、所望の表面マーカー、例えば、CD4及びCD8などに結合するマイクロビーズと一緒にインキュベートする。細胞を磁気カラムに通過させることにより、ビーズ標識した細胞を選択する。単離した細胞を再度洗浄してから、分離バッファーを細胞培地と交換する。次に、単離したT細胞を培養するか、又は後の使用のために凍結保存する。単離したT細胞の純度は、フローサイトメトリー評価によるQCステップを通過するであろう。凍結保存した細胞を解凍し、予熱した細胞培地中で洗浄してから、細胞培地中に再懸濁させる。新鮮な細胞を培地に直接添加する。細胞を0.4~1.2e6細胞/cm2膜で、膜バイオリアクターに接種し、活性化試薬、例えば、抗CD3/CD28ビーズ/ポリマー、ナノ粒子又はナノコロイドなどを添加し、細胞培地を0.25~2ml/cm2膜の最終量まで添加する。インビトロCAR発現動態試験のために、24ウェルGrexを使用する。Grex100、フラスコ又はcentricultを用いて、この製造プロセスが、スケーラブルであるか否かを検証すると共に、インビボ抗腫瘍効果を試験する。平板培養時に、1又は2の感染多重度(MOI)で、BCMA-CD19二重CARをコードするレンチウイルスベクターを用いて、細胞を形質導入する。MOIは、2A配列の上流で操作されるCARの力価に基づき、Sup-T1細胞で得られたウイルス力価に基づいて決定する。24時間で、細胞を洗浄し、不要な試薬を除去した後、染色して、フローサイトメトリーによりCAR発現を測定し、インビボ試験用の「第1日CART産物」として凍結保存培地中で再製剤化する。全てのケースにおいて、形質導入から72h後に、インビトロでのCAR発現動態を測定するために細胞のアリコートを採取する。第1日CART応答として、限定されないが、インビボ細胞溶解活性及び拡大が挙げられる。
Centricult又はフラスコシステムを用いて作製した第1日CARTを、3つのマウスモデル:播種性KMS-11-luc(BCMA+CD19-)多発性骨髄腫モデル、Nalm6-Luc(CD19+BCMA-)異種移植マウスモデル及び95%KMS-lucと5%NALM6-Luc細胞の混合モデルを用いて、インビボでそれらの抗腫瘍活性について調べた。このインビボ試験の目標は、下記の3つからなる:(1)二重CARTのBCMA及びCD19アーム両方の有効性を実証すること;(2)混合モデル(BCMA+腫瘍細胞とCD19+腫瘍細胞を含む)をKMS-11-luc多発性骨髄腫モデル(BCMA+CD19-)と比べて、CD19標的を介した二重CARTの潜在的活性化を理解すること;並びに(3)Nalm6単独モデル(CD19+BCMA-)中の二重CARTを試験して、CD19アームの活性を調べること。BLI測定は、毎週2回実施した。フローサイトメトリー解析のために、第6、13、20及び27日に、末梢血を採取した。サイトカイン解析のために、第2日に加えて、前述した日に血漿を収集した。試験設計及び用量の情報を表30にまとめる。
この実施例は、ダイアボディCAR JL1~JL10の特性決定を説明する。JL1~JL8は、PI61/CTL119ダイアボディ構築物であり、JL9~JL10は、R1G5/CTL119ダイアボディ構築物である。JL1~JL10の配列情報は、表31に開示する。
一部の実施形態において、このARMプロセスは、凍結された又は新鮮な白血球アフェレーシス産物から出発する。計数及びQCのためのサンプルを取得した後、産物をセルソーティング機(例えば、取り付けられたCliniMACS Prodig装置キット)に付着させて、プログラムを開始する。細胞を洗浄し、所望の表面マーカー、例えば、CD4及びCD8などに結合するマイクロビーズと一緒にインキュベートする。細胞を磁気カラムに通過させることにより、ビーズ標識した細胞を選択する。単離したT細胞を再度洗浄してから、分離バッファーを細胞培地と交換する。次に、精製したT細胞を培養するか、又は後の使用のために凍結保存する。単離T細胞の純度は、フローサイトメトリー評価によるQCステップを通過するであろう。凍結保存した細胞を解凍し、予熱した細胞培地で洗浄してから、細胞培地中に再懸濁させる。新鮮な細胞を培地に直接添加する。凍結したPan T単離細胞のアリコートを37℃の水浴中で解凍し、Optimizer CM(サプリメント+100U/mLのヒトIL2を含むGibco Optimizer Media)中に導入して、1500rpmで5分スピンした。細胞を計数し、24ウェルプレート中に、3e6/mL、1mL/ウェルで平板培養した。TransActを各ウェルに1/100(10μL/ウェル)で添加した。
伝統的製造(TM)プロセスは、活性化及び形質導入後にT細胞をエクスビボで8~9日間エクスビボで増殖した後に、回収するプロセスである。Prodigy処理T細胞を温かいRPMI完全T細胞培地(RPMI、10%熱不活性化FBS、2mM L-グルタミン、100U/mLのPen/Strep、1×NEAA、1mM ピルビン酸ナトリウム、10mM HEPES及び55μMβ-メルカプトエタノール)に再懸濁させてから、ウェル当たり0.5e6細胞/mLで24ウェルプレートにおいて平板培養した。3:1のビーズ:細胞比で、ヒトT-エキスパンダーCD3/CD28ビーズと一緒に、T細胞を37℃で一晩インキュベートした。
様々なダイアボディ構築物で操作されたT細胞が、BCMA又はCD19発現標的細胞に応答して殺傷する能力を、20:1から出発する2倍E:T比の希釈で、CART細胞を標的細胞と一緒にインキュベートすることにより評価した。標的細胞の数を2.5×105細胞/ウェルで固定し、細胞を96ウェル平底プレート内で培養した。エフェクター細胞は、T細胞をダイアボディで形質導入することによる伝統的製造を用いて作製したCART細胞であった。標的細胞は、BCMA陽性KMS11-luc細胞又はBCMA陰性NALM6-luc細胞を含む。このアッセイのために、BCMA CARTへのUTDの添加により、CAR-T細胞の%形質導入を正規化した。これにより、各サンプル中の同じ数のCARTと同じ総T細胞数の比較が可能になった。
特異的溶解(%)=100-(サンプルルミネセンス/平均最大ルミネセンス)*100
MSD V-PLEX ヒトIFN-□□及びIL-2分析に使用するために、20時間インキュベーション後の上記殺傷アッセイに使用した共培養物(1.25:1の比)から上清を収集した。KMS11又はNALM6細胞による刺激に応答して、ダイアボディ形質導入細胞によるIFN-□又はIL-2の様々な程度の標的特異的誘導が観察された(図18A及び18B)。UTD細胞は、いずれの標的細胞に応答する非特異的IFN-□□分泌も示さなかった(図18A)。殺傷アッセイからの結果と一致して、クローンJL6、JL5、JL3及びJL8は、標的細胞に応答して、より多くのサイトカインを産生した(図18A及び18B)。
凍結されたPan T単離細胞のアリコートを37℃の水浴中で解凍し、Optimizer CM(サプリメント+100U/mLのヒトIL2を含むGibco Optimizer Media)中に導入して、1500rpmで5分スピンした。細胞を計数し、24ウェルプレート中に、3e6/mL、1mL/ウェルで平板培養した。TransActを各ウェルに1/100(10μL/ウェル)で添加した。PI61のSUP-T1力価又はCTL119のqPCR力価のいずれかに基づく様々な感染多重度(MOI)でウイルスを添加した。PI61は2のMOIで使用し、3つの異なるCTL119 MOI:1、0.5及び0.25と組み合わせた。モノCARを、PI61には1又は2のMOIで、CTL119には1のMOIで添加し、UTD対照も平板培養した。24時間の培養後に、細胞を採取し、PBS+1%HSA中で3回洗浄した。次に、細胞を計数し、24ウェルプレートにおいて最終1e6/mLで再平板培養した。
一部の実施形態では、連続的活性化高速製造(ARM)プロセスを用いて、約2日かけてCART細胞を製造するが、これにより恐らくより多数の低分化T細胞(Tナイーブ及びTSCM(ステムセントラルメモリーT)細胞)をインビボ細胞増殖のために患者に戻すことが可能になるであろう。短い製造期間により、早期分化T細胞プロフィールは、その所望の最終分化状態に向けて、エクスビボ培養容器内ではなく、体内で増殖することが可能になる。
CART細胞のARMプロセスは、表25に概略を示すように、培地の調製から開始する。
CART細胞の高速製造プロセスは、表33に概略を示すように、培地の調製から開始する。
方法
単一細胞RNAseq
10X Genomics Chromium Controller instrument及び支持ライブラリー構築キットを用いて、単一細胞RNAseqライブラリーを作製した。
全トランスクリプトーム10X Genomics単一細胞ライブラリーを鋳型材料として使用して、免疫細胞プロファイリング及びレパトア解析を作成した。T細胞受容体配列をChromium Single Cell 5‘LibrariesからPCR増幅した後、Illuminaシーケンシング装置で解析した。
単一細胞RNAseqデータを、FASTQファイルで開始するCell Ranger解析パイプラインで処理した。Cell Ranger解析パイプラインの詳細な説明は、support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/pipelines/latest/what-is-cell-rangerに見出すことができる。一般的パイプラインは、アラインメント、フィルタリング、バーコードカウント及びUMIカウントを含んだ。細胞バーコードを用いて、遺伝子バーコードマトリックスを作成し、クラスターを決定して、遺伝子発現解析を実施した。遺伝子発現カウントデータは、Seurat Bioconductorパッケージを用いて正規化した。200未満の発現遺伝子を有する細胞を解析から廃棄した。2つ以下の細胞にのみ発現された遺伝子を解析から廃棄した。残ったデータを、10,000のスケール因子を用いてSeurat log正規化法により正規化した。1細胞当たりの検出分子の数に対する回帰によりデータをスケーリングした。遺伝子セット内の全遺伝子の平均log正規化遺伝子発現値を取得することにより、遺伝子セットスコア(GeneSetScore)を算出した。各遺伝子は、サンプル全体の遺伝子の平均発現が0であり、標準偏差が1であるように正規化されたz-スコアである。次に、遺伝子セットスコアを、遺伝子セット内の遺伝子の正規化値の平均として計算する。遺伝子セットスコア計算例を以下に説明する。
この実施例は、インプット細胞として使用される精製T細胞、ARMプロセスを用いて製造されるCART細胞(「第1日」細胞と標識される)及びTMプロセスを用いて製造されるCART細胞(「第9日」細胞と標識される)間のT細胞状態を単一細胞RNA-seq(scRNA-seq)により比較することを目標とする。加えて、単一細胞TCR-seq(scTCR-seq)を実施して、クローン性を調べ、インプットから製造後材料への細胞分化を追跡する。
第1日及び第9日産物間に有意なT細胞状態の差があった。第1日細胞は、インプット細胞とはるかによく類似し、幹細胞性シグネチャーが豊富であったが、これは、より有効な産物を示す。
この実施例では、BCMA CARをコードするレンチウイルスベクター及びCD19 CARをコードするレンチウイルスベクターでT細胞を共形質導入することにより製造されるCART細胞の特性決定を説明する。BCMA CARは、配列番号107のアミノ酸配列を含み、CD19 CARは、配列番号225のアミノ酸配列を含む。
T細胞の形質導入においてBCMA及びCD19 CARの4つの異なるMOI組み合わせを24ウェルフォーマットで試験した。BCMA CARレンチウイルスベクター及びCD19 CARレンチウイルスベクターは、それぞれ5及び1のMOIで(図28A及び28Bの5/1);それぞれ5及び0.5のMOIで(図28A及び28Bの5/0.5);それぞれ2.5及び1のMOIで(図28A及び28Bの2.5/1);又はそれぞれ2.5及び0.5のMOIで(図28A及び28Bの2.5/0.5)使用した。Prodigyにより精製したT細胞を3e6/mL、1/mLで24ウェルプレートに接種し、BCMA及びCD19 CARベクターの両方を、上に示す異なるMOIで添加した。接種時に、抗CD3及び抗CD28アゴニストに共役したポリマーナノマトリックスであるTransAct(Milenyi Biotec)を添加した。100IU/mLのヒト組換えIL-2(Prometheus,San Diego,CA)及び2%ICRS(Life Technologies)を含有するOpTmizer(商標)完全T細胞培地中で細胞を37℃及び5%CO2で24時間インキュベートして採取した。
サンプルをフローサイトメーター(BD LSRFortessa)で測定し、データをFlowJoソフトウェアで解析した。ARMプロセスを用いた場合、CARは、24h以内に十分に組み込まれてエクスビボで発現されない可能性があるため、CARが安定して発現されている場合、ウイルス添加後96hをインビトロ及びインビボ用量設定戦略のための代替時点として使用することができた。二重ターゲティングカクテルCAR測定のために同じ戦略を採用した。
qPCR力価に基づいて、BCMA-CARウイルスの力価測定を実施して、BCMA-CAR/CD19-CARの最適ベクター比を決定した。手短には、T細胞を解凍し、3×106VNC/mL又は6×106VNC/mLの密度で再懸濁した。試験した各MOIについて、1mLの細胞懸濁物を24ウェルプレート中に平板培養し、時点0で形質導入した後、20~24時間インキュベートした。次に、各1mLの培養物を、3×2mLのPBS+1%HSAを用い、手で洗浄した。培養及びハーベスト洗浄の後、生存率及び細胞数を評価して、最終産物に対するベクター力価測定の影響を決定した。続いて、採取した細胞を1×106VNC/mLで培養物に導入し、採取後72時間及び144時間(採取後(PH)の第3日及び第6日(形質導入後の第4日及び第7日)表34及び図31)でCAR(BCMA及びCD19)発現を測定した。
この実施例では、実施例9に記載のように作製されたBCMA/CD19CART細胞産物のさらなる特性決定を説明する。この細胞産物は、3つの異なるCAR+集団:モノ抗BCMA CAR-T細胞、モノ抗CD19CAR-T細胞及び二重陽性抗BCMA/抗CD19CAR-T細胞を含む。加えて、この細胞産物は、非形質導入T細胞の集団も含有する。
IFN-γは、標的結合に応答するCAR-T細胞活性化の目印である。実施例9に記載したインビボ試験において血漿IFN-γの動態を解析した。図33A及び33Bに示すように、全てのCAR-T処置群が、第2日に低レベルの循環IFN-γ(10~50pg/ml)を示し、その後も引き続きIFN-γ分泌を増加した。
末梢血(モノ抗BCMA、モノ抗CD19又は二重陽性抗BCMA/抗CD19CAR-T細胞を含む)中のBCMA/CD19二重CART細胞産物の増殖を注入から3週間後までフローサイトメトリーにより解析し、KMS-11-lucモデルの基準BCMA CARTと比較した。CD3+T細胞及びCAR+T細胞増殖の両方が、全てのCAR-T処置群に観察された。二重又はモノCAR+T細胞集団中のBCMA/CD19二重CART細胞産物について、用量依存的細胞増殖が観察された。2つの試験からのデータに基づいて、BCMA/CD19二重CART細胞産物は、BCMA CARTと比べて、わずかにより高いBCMAターゲティングCAR+T細胞及び総CAR+T細胞の増殖を示した。
BCMA/CD19二重CART細胞産物は、高速製造プロセスを用いて作製される新規の抗BCMA及び抗CD19二重ターゲティングCAR-T細胞産物であり、これは、T細胞の幹細胞性を保存する。
この実施例では、再発及び/又は難治性多発性骨髄腫を有する成人患者におけるARMプロセスを用いて製造された抗BCMA CART細胞療法の安全性及び忍容性を評価するためのオープンラベル、第I相試験を説明する。
IMiD(例えば、レナリドミド又はポマリドミド)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ)、さらに、利用可能であれば、承認済抗CD38抗体(例えば、ダラツムマブ)を含む処置レジメンの少なくとも2週間前に再発し、且つ/又はそうした処置に対して治療不応性であり、及び疾患進行(IMWG)の記録を有する、MMを有する対象;
プロトコルにより定義される通り、測定可能な疾患;
スクリーニング時に0又は1のいずれかであるECOGパフォーマンスステータス;
適切な血液検査値;及び
製造に容認される非動員細胞の白血球アフェレーシス材料を有していなければならない。
過去のBCMA CAR-T治療歴を含め、過去の遺伝子修飾細胞産物の投与歴。過去にBCMA指向二重特異性抗体又は抗体-薬物コンジュゲート(ADC)を受けたことがある患者は除外されない;
登録前の6週間以内の自家HSCT又は同種異系造血幹細胞移植の過去のあらゆる医療歴(HSCT);
アフェレーシス前の2週間以内の化学療法又はあらゆる同時抗癌療法(プロトコル処方リンパ球枯渇(LD)化学療法以外);
アフェレーシス収集の2週間以内又は5半減期以内のいずれか短い方の小分子標的化抗腫瘍薬による処置;並びに
アフェレーシス収集前の4週間以内に抗体又は免疫療法薬(ダラツムマブ以外)を受けたことがある。アフェレーシス収集前の3週間以内のダラツムマブ。
NALM-6ルシフェラーゼ処置モデルを用いて、新規の単鎖ダイアボディCART中のCD19抗原応答性エレメントの有効性を評価する。1×106NALM-6 Luc細胞をCART投与の第-7日に、外側尾静脈注射から移植する。体重を測定し、インビボ生物発光イメージング(BLI)を実施して、腫瘍進行を週2回実施した。動物を週2回測定し、腫瘍負荷が3×106光量子束(光子/秒)に達したら、動物をその特定の群にランダム化する(第-1日)。第0日に、ダイアボディCAR-Tを液体窒素から取り出し、注射のために解凍する。1×106二重CAR陽性細胞を外側尾静脈注射から注射する。数週間の期間にわたって実験評価を実施して、BLIの減少を経時的に評価することにより、いずれの構築物が最良の機能的有効性を有するかを決定する。
本明細書に引用するそれぞれの及び全ての特許、特許出願及び刊行物の開示は、その全体が参照により本明細書に援用される。本発明は、特定の実施形態を参照して開示しているが、本発明のさらなる実施形態及び変形形態は、本発明の真の趣旨及び範囲から逸脱することなく他の当業者によって考案され得ることが明らかである。下記の特許請求の範囲は、全てのこのような実施形態及び均等な変形形態を含むと解釈されることを意図する。
本開示は、例えば以下を提供する。
[項1]
単離細胞であって、
(a)抗BCMA結合ドメインである第1抗原結合ドメインであって、前記抗BCMA結合ドメインは、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)及び重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)及び軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、
(i)それぞれ配列番号86、130、88、95、131及び132;
(ii)それぞれ配列番号44、45、84、54、55及び56;又は
(iii)それぞれ配列番号179、180、181、147、182及び183
のアミノ酸配列を含む、第1抗原結合ドメインと;
(b)第2抗原結合ドメインと
を含む単離細胞。
[項2]
前記第1抗原結合ドメインと前記第2抗原結合ドメインとは、2つのキメラ抗原受容体(CAR)に配置されるか、又は
前記第1抗原結合ドメインと前記第2抗原結合ドメインとは、1つのCARに配置される、項1に記載の単離細胞。
[項3]
前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号86、130、88、95、131及び132のアミノ酸配列を含む、項1又は2に記載の単離細胞。
[項4]
前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、
(i)それぞれ配列番号86、87、88、95、96及び97;
(ii)それぞれ配列番号86、109、88、95、114及び115;又は
(iii)それぞれ配列番号86、109、88、95、114及び97
のアミノ酸配列を含む、項3に記載の単離細胞。
[項5]
(i)前記VHは、配列番号93若しくは112のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(ii)前記VHは、配列番号260、94若しくは113の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項3又は4に記載の単離細胞。
[項6]
(i)前記VLは、配列番号102、118若しくは124のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(ii)前記VLは、配列番号261、103、119若しくは125の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項3~5のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項7]
前記VH及びVLは、
(i)それぞれ配列番号93及び102;
(ii)それぞれ配列番号112及び118;又は
(iii)それぞれ配列番号112及び124
のアミノ酸配列を含む、項3~6のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項8]
(i)前記第1抗原結合ドメインは、配列番号105、120若しくは126のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む単鎖可変領域フラグメント(scFv)を含み;及び/又は
(ii)前記第1抗原結合ドメインは、配列番号253、106、121若しくは127の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項3~7のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項9]
前記第1抗原結合ドメインは、第1CARに配置され、
(i)前記第1CARは、配列番号107、226、122若しくは128のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(ii)前記第1CARは、配列番号259、258、108、123若しくは129の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項3~8のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項10]
前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号44、45、84、54、55及び56のアミノ酸配列を含む、項1又は2に記載の単離細胞。
[項11]
前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、
(i)それぞれ配列番号44、45、76、54、55及び56;
(ii)それぞれ配列番号44、45、46、54、55及び56:又は
(iii)それぞれ配列番号44、45、68、54、55及び56
のアミノ酸配列を含む、項10に記載の単離細胞。
[項12]
(i)前記VHは、配列番号78、52若しくは70のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(ii)前記VHは、配列番号79、53若しくは71の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項10又は11に記載の単離細胞。
[項13]
(i)前記VLは、配列番号61のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(ii)前記VLは、配列番号62の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項10~12のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項14]
前記VH及びVLは、
(i)それぞれ配列番号78及び61;
(ii)それぞれ配列番号52及び61:又は
(iii)それぞれ配列番号70及び61
のアミノ酸配列を含む、項10~13のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項15]
(i)前記第1抗原結合ドメインは、配列番号80、64若しくは72のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む単鎖可変領域フラグメント(scFv)を含み;及び/又は
(ii)前記第1抗原結合ドメインは、配列番号81、65若しくは73の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項10~14のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項16]
前記第1抗原結合ドメインは、第1CARに配置され、
(i)前記第1CARは、配列番号224、82、66若しくは74のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(ii)前記第1CARは、配列番号83、67若しくは75の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項10~15のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項17]
前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号179、180、181、147、182及び183のアミノ酸配列を含む、項1又は2に記載の単離細胞。
[項18]
前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、
(i)それぞれ配列番号137、138、139、147、148及び149;又は
(ii)それぞれ配列番号160、161、162、147、170及び171
のアミノ酸配列を含む、項17に記載の単離細胞。
[項19]
(i)前記VHは、配列番号145若しくは168のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(ii)前記VHは、配列番号146若しくは169の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項17又は18に記載の単離細胞。
[項20]
(i)前記VLは、配列番号154若しくは173のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(ii)前記VLは、配列番号155若しくは174の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項17~19のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項21]
前記VH及びVLは、
(i)それぞれ配列番号145及び154、又は
(ii)それぞれ配列番号168及び173
のアミノ酸配列を含む、項17~20のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項22]
(i)前記第1抗原結合ドメインは、配列番号156若しくは175のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む単鎖可変領域フラグメント(scFv)を含み;
(ii)前記第1抗原結合ドメインは、配列番号157若しくは176の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項17~21のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項23]
前記抗原結合ドメインは、第1CARに配置され、
(i)前記第1CARは、配列番号158若しくは177のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(iii)前記第1CARは、配列番号159若しくは178の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項17~22のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項24]
単離細胞であって、
(a)抗BCMA結合ドメインである第1抗原結合ドメインであって、前記抗BCMA結合ドメインは、
(i)表20又は26に列挙される抗BCMA配列のHC CDR1、HC CDR2及びHC CDR3を含むVHと、表20又は26に列挙される抗BCMA配列のLC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3を含むVLとであって、配列番号243のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される、VH及びVL;
(ii)それぞれ配列番号239及び242のアミノ酸配列を含むVH及びVLであって、配列番号243のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される、VH及びVL;又は
(iii)配列番号200のアミノ酸配列を含むscFv
を含む、第1抗原結合ドメインと;
(b)第2抗原結合ドメインと
を含む単離細胞。
[項25]
前記第1抗原結合ドメインと前記第2抗原結合ドメインとは、2つのキメラ抗原受容体(CAR)に配置されるか、又は
前記第1抗原結合ドメインと前記第2抗原結合ドメインとは、1つのCARに配置される、項24に記載の単離細胞。
[項26]
前記第2抗原結合ドメインは、CD19、CD5、CD10、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD25、CD27、CD30、CD34、CD37、CD38、CD40、CD53、CD69、CD72、CD73、CD74、CD75、CD77、CD79a、CD79b、CD80、CD81、CD82、CD83、CD84、CD85、CD86、CD123、CD135、CD138、CD179、CD269、Flt3、ROR1、FcRn5、FcRn2、CS-1、CXCR4、5、7、IL-7/3R、IL7/4/3R又はIL4Rから選択される抗原に結合し、任意選択で、前記B細胞抗原は、CD19、CD20、CD22、FcRn5、FcRn2、CS-1、CD138、CD123、CD33、CD34、CLL-1、葉酸受容体β又はFLT3から選択され、任意選択で、前記第2抗原結合ドメインは、CD19に結合する、項1~25のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項27]
前記第2抗原結合ドメインは、EGFRvIII、メソテリン、GD2、Tn抗原、sTn抗原、Tn-O-糖ペプチド、sTn-O-糖ペプチド、PSMA、CD97、TAG72、CD44v6、CEA、EPCAM、KIT、IL-13Ra2、レグマン、GD3、CD171、IL-11Ra、PSCA、MAD-CT-1、MAD-CT-2、VEGFR2、ルイスY、CD24、PDGFR-β、SSEA-4、葉酸受容体α、ERBB(例えば、ERBB2)、Her2/neu、MUC1、EGFR、NCAM、エフリンB2、CAIX、LMP2、sLe、HMWMAA、o-アセチル-GD2、葉酸受容体β、TEM1/CD248、TEM7R、FAP、レグマイン、HPV E6若しくはE7、ML-IAP、CLDN6、TSHR、GPRC5D、ALK、ポリシアル酸、Fos関連抗原、好中球エラスターゼ、TRP-2、CYP1B1、精子タンパク質17、βヒト絨毛性ゴナドトロピン、AFP、チログロブリン、PLAC1、グロボH、RAGE1、MN-CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、腸カルボキシルエステラーゼ、mut hsp 70-2、NA-17、NY-BR-1、UPK2、HAVCR1、ADRB3、PANX3、NY-ESO-1、GPR20、Ly6k、OR51E2、TARP、GFRα4又はMHCに提示される前記抗原のいずれかのペプチドから選択される抗原に結合する、項1~25のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項28]
前記第2抗原結合ドメインは、CD19に結合し、任意選択で、
(i)前記第2抗原結合ドメインは、表19又は表22に列挙される抗CD19配列のHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及び/又はLC CDR3、例えばそれぞれ配列番号295及び245~249の配列を含むHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3を含み;
(ii)前記第2抗原結合ドメインは、表19又は表22に列挙される抗CD19配列のVH及び/又はVL、例えばそれぞれ配列番号250及び251のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH及びVLを含み;
(iii)前記第2抗原結合ドメインは、表19又は表22に列挙される抗CD19配列のscFv、例えば配列番号211のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むscFvを含み;及び/又は
(iv)前記第2抗原結合ドメインは、第2CARに配置され、前記CARは、表19又は表22に列挙される抗CD19配列のCAR、例えば配列番号225若しくは229のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むCARを含む、項1~25のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項29]
(i)前記第1抗原結合ドメインは、
(a)それぞれ配列番号86、87、88、95、96及び97;
(b)それぞれ配列番号44、45、76、54、55及び56;又は
(c)それぞれ配列番号44、45、46、54、55及び56
のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDRを含み、及び前記第2抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号295及び245~249のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3を含むか;
(ii)前記第1抗原結合ドメインは、
(a)それぞれ配列番号93及び102;
(b)それぞれ配列番号78及び61;又は
(c)それぞれ配列番号52及び61
のアミノ酸配列を含むVH及びVLを含み、及び前記第2抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号250及び251のアミノ酸配列を含むVH及びVLを含むか;
(iii)前記第1抗原結合ドメインは、配列番号105、80又は64のアミノ酸配列を含むscFvを含み、及び前記第2抗原結合ドメインは、配列番号211のアミノ酸配列を含むscFvを含むか;又は
(iv)前記第1抗原結合ドメインは、配列番号253、106、81又は65の核酸配列によってコードされ、及び前記第2抗原結合ドメインは、配列番号212の核酸配列によってコードされる、項1~25又は28のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項30]
前記第1抗原結合ドメインは、第1CARに配置され、及び前記第2抗原結合ドメインは、第2CARに配置され、前記第1CARは、第1膜貫通ドメインと、第1細胞内シグナル伝達ドメインとをさらに含み、及び/又は前記第2CARは、第2膜貫通ドメインと、第2細胞内シグナル伝達ドメインとをさらに含む、項1~29のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項31]
前記第1CARは、第1核酸配列によってコードされ、及び前記第2CARは、第2核酸配列によってコードされ、前記第1及び第2核酸配列は、個別の核酸分子上に配置される、項30に記載の単離細胞。
[項32]
前記第1CARは、第1核酸配列によってコードされ、及び前記第2CARは、第2核酸配列によってコードされ、前記第1及び第2核酸配列は、単一の核酸分子上に配置される、項30に記載の単離細胞。
[項33]
前記単一の核酸分子は、5’から3’の方向に、以下の構成:
(i)前記第1抗原結合ドメインをコードする核酸配列-第1膜貫通ドメインをコードする核酸配列-第1細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列-リンカーをコードする核酸配列-前記第2抗原結合ドメインをコードする核酸配列-第2膜貫通ドメインをコードする核酸配列-第2細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列;又は
(ii)前記第2抗原結合ドメインをコードする核酸配列-第2膜貫通ドメインをコードする核酸配列-第2細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列-リンカーをコードする核酸配列-前記第1抗原結合ドメインをコードする核酸配列-第1膜貫通ドメインをコードする核酸配列-第1細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列
を含み、
任意選択で、前記リンカーは、自己切断部位を含み、任意選択で、前記リンカーは、P2A部位、T2A部位、E2A部位又はF2A部位を含み、任意選択で、前記リンカーは、P2A部位を含み、任意選択で、
前記リンカーは、配列番号209の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされるか、又は
前記リンカーは、配列番号208のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、項32に記載の単離細胞。
[項34]
(i)前記単一の核酸分子は、配列番号215、217、219、221若しくは223の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列を含むか;又は
(ii)前記単一の核酸分子は、配列番号214、216、218、220若しくは222のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする、項32又は33に記載の単離細胞。
[項35]
前記第1抗原結合ドメイン及び前記第2抗原結合ドメインは、1つのCARに配置され、前記CARは、膜貫通ドメインと細胞内シグナル伝達ドメインとをさらに含む、項1~29のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項36]
前記第1抗原結合ドメインは、第1VH(VH1)と第1VL(VL1)とを含み、及び第2抗原結合ドメインは、第2VH(VH2)と第2VL(VL2)とを含み、前記VH1、VL1、VH2及びVL2は、N末端からC末端まで、以下の構成:
(i)VH2-任意選択でリンカー1(「L1」)-VL1-任意選択でリンカー2(「L2」)-VH1-任意選択でリンカー3(「L3」)-VL2;
(ii)VH1-任意選択でL1-VH2-任意選択でL2-VL2-任意選択でL3-VL1;
(iii)VL2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VH2;
(iv)VL2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VH2;
(v)VH2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VL2;
(vi)VL1-任意選択でL1-VH2-任意選択でL2-VL2-任意選択でL3-VH1;
(vii)VL1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VH1;又は
(viii)VH1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VL1
で配列される、項35に記載の単離細胞。
[項37]
(i)前記VH1及びVL1は、
(a)それぞれ配列番号93及び102のアミノ酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);
(b)それぞれ配列番号333及び334のアミノ酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);
(c)それぞれ配列番号78及び61のアミノ酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);又は
(d)それぞれ配列番号335及び336のアミノ酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含み、及び/又は
(ii)前記VH2及びVL2は、
(a)それぞれ配列番号250及び251のアミノ酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);又は
(b)それぞれ配列番号331及び332のアミノ酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含む、項36に記載の単離細胞。
[項38]
L1又はL3は、配列番号5のアミノ酸配列を含み、及び/又はL2は、配列番号63のアミノ酸配列を含む、項36又は37に記載の単離細胞。
[項39]
(i)前記CARは、配列番号321~330からなる群から選択されるアミノ酸配列又はそれと少なくとも80、85、90、95若しくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか;又は
(ii)前記CARは、配列番号339~348からなる群から選択されるアミノ酸配列又はそれと少なくとも80、85、90、95若しくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、項35~38のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項40]
前記CARは、5’から3’の方向に、以下の構成:
(i)前記第1抗原結合ドメインをコードする核酸配列-任意選択でリンカーをコードする核酸配列-前記第2抗原結合ドメインをコードする核酸配列-膜貫通ドメインをコードする核酸配列-細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列;又は
(ii)前記第2抗原結合ドメインをコードする核酸配列-任意選択でリンカーをコードする核酸配列-前記第1抗原結合ドメインをコードする核酸配列-膜貫通ドメインをコードする核酸配列-細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列
を含む核酸分子によってコードされる、項35~39のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項41]
前記CARは、NからCの方向に、以下の構成:
(i)前記第1抗原結合ドメイン-任意選択でリンカー-前記第2抗原結合ドメイン-膜貫通ドメイン-細胞内シグナル伝達ドメイン;又は
(ii)前記第2抗原結合ドメイン-任意選択でリンカー-前記第1抗原結合ドメイン-膜貫通ドメイン-細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、項35~40のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項42]
前記第1抗原結合ドメイン又は第2抗原結合ドメインは、VH及びVLを含み、前記VH及びVLは、リンカーによって連結され、任意選択で、前記リンカーは、配列番号5、63、104若しくは243のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、項1~41のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項43]
(i)前記膜貫通ドメイン、第1膜貫通ドメイン又は第2膜貫通ドメインは、T細胞受容体のα、β若しくはζ鎖、CD28、CD3ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137又はCD154から選択されるタンパク質の膜貫通ドメインを含むか;
(ii)前記膜貫通ドメイン、第1膜貫通ドメイン又は第2膜貫通ドメインは、配列番号6のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか;又は
(iii)前記膜貫通ドメイン、第1膜貫通ドメイン又は第2膜貫通ドメインは、配列番号17の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項30~42のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項44]
前記第1抗原結合ドメイン又は第2抗原結合ドメインは、ヒンジ領域(例えば、第1又は第2ヒンジ領域)により、前記膜貫通ドメイン、第1膜貫通ドメイン又は第2膜貫通ドメインに連結され、任意選択で、
(i)前記ヒンジ領域は、配列番号2、3若しくは4のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか;
(ii)前記ヒンジ領域は、配列番号13、14若しくは15の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされるか;
(iii)前記ヒンジ領域及び前記膜貫通ドメインは、配列番号202のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか;又は
(iv)前記ヒンジ領域及び前記膜貫通ドメインは、配列番号203若しくは213の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項30~43のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項45]
前記細胞内シグナル伝達ドメイン、第1細胞内シグナル伝達ドメイン又は第2細胞内シグナル伝達ドメインは、一次シグナル伝達ドメイン(例えば、第1又は第2一次シグナル伝達ドメイン)を含み、任意選択で、
(i)前記一次シグナル伝達ドメインは、CD3ζ、TCRζ、FcRγ、FcRβ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD5、CD22、CD79a、CD79b、CD278(ICOS)、FcεRI、DAP10、DAP12又はCD66dに由来する機能性シグナル伝達ドメインを含むか;
(ii)前記一次シグナル伝達ドメインは、配列番号9若しくは10のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか;又は
(iii)前記一次シグナル伝達ドメインは、配列番号20、21若しくは205の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項30~44のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項46]
前記細胞内シグナル伝達ドメイン、第1細胞内シグナル伝達ドメイン又は第2細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメイン(例えば、第1又は第2共刺激シグナル伝達ドメイン)を含み、任意選択で、
(i)前記共刺激シグナル伝達ドメインは、MHCクラスI分子、TNF受容体タンパク質、免疫グロブリン様タンパク質、サイトカイン受容体、インテグリン、シグナル伝達リンパ球活性化分子(SLAMタンパク質)、活性化NK細胞受容体、BTLA、Tollリガンド受容体、OX40、CD2、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CDS、ICAM-1、4-1BB(CD137)、B7-H3、ICOS(CD278)、GITR、BAFFR、LIGHT、HVEM(LIGHTR)、KIRDS2、SLAMF7、NKp80(KLRF1)、NKp44、NKp30、NKp46、CD19、CD4、CD8α、CD8β、IL2Rβ、IL2Rγ、IL7Rα、ITGA4、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA-1、ITGAM、CD11b、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、ITGB7、NKG2D、NKG2C、TNFR2、TRANCE/RANKL、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244、2B4)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9(CD229)、CD160(BY55)、PSGL1、CD100(SEMA4D)、CD69、SLAMF6(NTB-A、Ly108)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO-3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、LAT、GADS、SLP-76、PAG/Cbp、CD19a、CD28-OX40、CD28-4-1BB又はCD83と特異的に結合するリガンドに由来する機能性シグナル伝達ドメインを含むか;
(ii)前記共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号7のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか;又は
(iii)前記共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号18若しくは204の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項30~45のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項47]
前記細胞内シグナル伝達ドメイン、第1細胞内シグナル伝達ドメイン又は第2細胞内シグナル伝達ドメインは、4-1BBに由来する機能性シグナル伝達ドメインと、CD3ζに由来する機能性シグナル伝達ドメインとを含み、任意選択で、前記細胞内シグナル伝達ドメイン、第1細胞内シグナル伝達ドメイン又は第2細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号7のアミノ酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)と、配列番号9若しくは10のアミノ酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)とを含み、任意選択で、前記細胞内シグナル伝達ドメイン、第1細胞内シグナル伝達ドメイン又は第2細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号7のアミノ酸配列と、配列番号9又は10のアミノ酸配列とを含む、項30~46のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項48]
前記CAR、第1CAR又は第2CARは、リーダー配列(例えば、第1又は第2リーダ配列)をさらに含み、
(i)前記リーダー配列は、配列番号1のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか;又は
(ii)前記リーダー配列は、配列番号199若しくは210の核酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、項30~47のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項49]
(i)前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ;
(ii)前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ;
(iii)前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ;及び/又は
(iv)前記第1細胞内シグナル伝達ドメイン及び前記第2細胞内シグナル伝達ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、任意選択で、前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、及び/又は前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされる、項30~34又は42~48のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項50]
(i)前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、同じアミノ酸配列を含む(例えば、前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、配列番号1のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む)か、又は異なるアミノ酸配列を含み;
(ii)前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、同じアミノ酸配列を含む(例えば、前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、配列番号2のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む)か、又は異なるアミノ酸配列を含み;
(iii)前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、同じアミノ酸配列を含む(例えば、前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、配列番号6のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む)か、又は異なるアミノ酸配列を含み;及び/又は
(iv)前記第1細胞内シグナル伝達ドメイン及び前記第2細胞内シグナル伝達ドメインは、同じアミノ酸配列を含むか、又は異なるアミノ酸配列を含み、
任意選択で、前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、同じアミノ酸配列を含む(例えば、前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、配列番号10のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む)か、又は異なるアミノ酸配列を含み、及び/又は
前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、同じアミノ酸配列を含む(例えば、前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号7のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む)か、又は異なるアミノ酸配列を含む(例えば、前記第1及び第2共刺激シグナル伝達ドメインは、それぞれ4-1BB共刺激ドメイン配列及びCD28共刺激ドメイン配列を含むか;又はそれぞれCD28共刺激ドメイン配列及び4-1BB共刺激ドメイン配列を含む)、項49に記載の単離細胞。
[項51]
(i)前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、それぞれ配列番号199及び210を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)又はそれぞれ配列番号210及び199を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)によってコードされ;
(ii)前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、それぞれ配列番号337及び13を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)又はそれぞれ配列番号13及び337を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)によってコードされ;
(iii)前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、それぞれ配列番号338及び17を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列);又はそれぞれ配列番号17及び338を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)によってコードされ;
(iv)前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、それぞれ配列番号204及び18を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列);又はそれぞれ配列番号18及び204を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)によってコードされ;及び/又は
(v)前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、それぞれ配列番号205及び21を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列);又はそれぞれ配列番号21及び205を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)によってコードされる、項49又は50に記載の単離細胞。
[項52]
前記CAR、第1CAR又は第2CARは、ウッドチャック肝炎転写後調節エレメント(WPRE)を含む核酸配列によってコードされる、項30~51のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項53]
単離核酸分子であって、
(a)抗BCMA結合ドメインである第1抗原結合ドメインをコードする第1核酸配列であって、前記抗BCMA結合ドメインは、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)及び重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)及び軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、
(i)それぞれ配列番号86、130、88、95、131及び132;
(ii)それぞれ配列番号44、45、84、54、55及び56;又は
(iii)それぞれ配列番号179、180、181、147、182及び183
のアミノ酸配列を含む、第1核酸配列と;
(b)第2抗原結合ドメインをコードする第2核酸配列と
を含む単離核酸分子。
[項54]
個別の核酸分子である第1核酸分子及び第2核酸分子を含み、前記第1核酸配列は、前記第1核酸分子上に配置され、及び前記第2核酸配列は、前記第2核酸分子上に配置される、項53に記載の単離核酸分子。
[項55]
単離核酸分子であって、
(a)抗BCMA結合ドメインである第1抗原結合ドメインをコードする第1核酸配列であって、前記抗BCMA結合ドメインは、
(i)表20又は26に列挙される抗BCMA配列のHC CDR1、HC CDR2及びHC CDR3を含むVHと、表20又は26に列挙される抗BCMA配列のLC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3を含むVLとであって、配列番号243のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される、VH及びVL;
(ii)それぞれ配列番号239及び242のアミノ酸配列を含むVH及びVLであって、配列番号243のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される、VH及びVL;又は
(iii)配列番号200のアミノ酸配列を含むscFv
を含む、第1核酸配列と;
(b)第2抗原結合ドメインをコードする第2核酸配列と
を含む単離核酸分子。
[項56]
第1CARをコードする第1核酸配列と、第2CARをコードする第2核酸配列とを含む単離核酸分子であって、前記第1CARは、抗BCMA結合ドメインである第1抗原結合ドメイン、第1膜貫通ドメイン及び第1細胞内シグナル伝達ドメインを含み、前記第2CARは、抗CD19結合ドメインである第2抗原結合ドメイン、第2膜貫通ドメイン及び第2細胞内シグナル伝達ドメインを含み、
(i)前記第1抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号86、87、88、95、96及び97のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDRを含み、及び前記第2抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号295及び245~249のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDRを含むか;
(ii)前記第1抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号93及び102のアミノ酸配列を含むVH及びVLを含み、及び前記第2抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号250及び251のアミノ酸配列を含むVH及びVLを含むか;
(iii)前記第1抗原結合ドメインは、配列番号105のアミノ酸配列を含むscFvを含み、及び前記第2抗原結合ドメインは、配列番号211のアミノ酸配列を含むscFvを含むか;
(iv)前記第1CARは、配列番号107又は226のアミノ酸配列を含み、及び前記第2CARは、配列番号225又は229のアミノ酸配列を含むか;又は
(v)前記単離核酸分子は、配列番号271の核酸配列を含む、単離核酸分子。
[項57]
第1CARをコードする第1核酸配列と、第2CARをコードする第2核酸配列とを含む核酸分子であって、前記第1CARは、抗BCMA結合ドメインである第1抗原結合ドメイン、第1膜貫通ドメイン及び第1細胞内シグナル伝達ドメインを含み、前記第2CARは、抗CD19結合ドメインである第2抗原結合ドメイン、第2膜貫通ドメイン及び第2細胞内シグナル伝達ドメインを含み、
(i)前記第1抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号44、45、76、54、55及び56のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDRを含み、前記第2抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号295及び245~249のアミノ酸配列を含むHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3を含むか;
(ii)前記第1抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号78及び61のアミノ酸配列を含むVH及びVLを含み、及び前記第2抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号250及び251のアミノ酸配列を含むVH及びVLを含むか;
(iii)前記第1抗原結合ドメインは、配列番号80のアミノ酸配列を含むscFvを含み、及び前記第2抗原結合ドメインは、配列番号211のアミノ酸配列を含むscFvを含むか;
(iv)前記第1CARは、配列番号82又は224のアミノ酸配列を含み、及び前記第2CARは、配列番号225又は229のアミノ酸配列を含むか;又は
(v)前記単離核酸分子は、配列番号215の核酸配列を含む、単離核酸分子。
[項58]
項53~57のいずれか一項に記載の核酸分子によってコードされる単離ポリペプチド分子。
[項59]
単離CARであって、
(a)抗BCMA結合ドメインである第1抗原結合ドメインであって、前記抗BCMA結合ドメインは、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)及び重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)及び軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、
(i)それぞれ配列番号86、130、88、95、131及び132;
(ii)それぞれ配列番号44、45、84、54、55及び56;又は
(iii)それぞれ配列番号179、180、181、147、182及び183
のアミノ酸配列を含む、第1抗原結合ドメインと;
(b)第2抗原結合ドメインと
を含む単離CAR。
[項60]
単離CARであって、
(a)抗BCMA結合ドメインである第1抗原結合ドメインであって、前記抗BCMA結合ドメインは、
(i)表20又は26に列挙される抗BCMA配列のHC CDR1、HC CDR2及びHC CDR3を含むVHと、表20又は26に列挙される抗BCMA配列のLC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3を含むVLとであって、配列番号243のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される、VH及びVL;
(ii)それぞれ配列番号239及び242のアミノ酸配列を含むVH及びVLであって、配列番号243のアミノ酸配列を含むリンカーによって連結される、VH及びVL;又は
(iii)配列番号200のアミノ酸配列を含むscFv
を含む、第1抗原結合ドメインと;
(b)第2抗原結合ドメインと
を含む単離CAR。
[項61]
項53~57のいずれか一項に記載の核酸分子又は項59若しくは60に記載のCARをコードする核酸分子を含むベクターであって、任意選択で、DNAベクター、RNAベクター、プラスミド、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター又はレトロウイルスベクターから選択されるベクター。
[項62]
配列番号11の核酸配列を含むEF-1プロモーターをさらに含む、項61に記載のベクター。
[項63]
項53~57のいずれか一項に記載の核酸分子、項58に記載のポリペプチド分子、項59若しくは60に記載のCAR又は項61若しくは62に記載のベクターを含む単離細胞。
[項64]
T細胞又はNK細胞である、項1~52又は63のいずれか一項に記載の単離細胞。
[項65]
細胞を作製する方法であって、項62又は63に記載のベクターで細胞を形質導入するステップを含み、任意選択で、前記細胞は、T細胞又はNK細胞である、方法。
[項66]
RNA操作細胞を作製する方法であって、インビトロで転写されたRNA又は合成RNAを細胞に導入するステップを含み、前記RNAは、項53~57のいずれか一項に記載の核酸分子又は項59若しくは60に記載のCARをコードする核酸分子を含み、任意選択で、前記細胞は、T細胞又はNK細胞である、方法。
[項67]
キメラ抗原受容体(CAR)を発現する細胞(例えば、T細胞)の集団を作製する方法であって、
(i)細胞(例えば、T細胞、例えば凍結された又は新鮮な白血球アフェレーシス産物から単離されたT細胞)の集団を、CD3/TCR複合体を刺激する薬剤及び/又は前記細胞の表面上の共刺激分子を刺激する薬剤と接触させる(例えば、結合させる)ステップ;
(ii)前記細胞(例えば、T細胞)の集団を、項53~57のいずれか一項に記載の核酸分子又は項59若しくは60に記載のCARをコードする核酸分子と接触させ、それにより前記核酸分子を含む細胞(例えば、T細胞)の集団を提供するステップ、及び
(iii)保存(例えば、凍結保存培地中の前記細胞の集団の再製剤化)又は投与のために前記細胞(例えば、T細胞)の集団を採取するステップ
を含み、
(a)ステップ(ii)は、ステップ(i)と一緒に、又はステップ(i)の開始後の20時間以内、例えばステップ(i)の開始後の12、13、14、15、16、17若しくは18時間以内、例えばステップ(i)の開始後の18時間以内に実施され、及び
ステップ(iii)は、ステップ(i)の開始後の30(例えば、26)時間以内、例えばステップ(i)の開始後の22、23、24、25、26、27、28、29又は30時間以内、例えばステップ(i)の開始後の24時間以内に実施されるか、
(b)ステップ(ii)は、ステップ(i)と一緒に、又はステップ(i)の開始後の20時間以内、例えばステップ(i)の開始後の12、13、14、15、16、17若しくは18時間以内、例えばステップ(i)の開始後の18時間以内に実施され、及び
ステップ(iii)は、ステップ(ii)の開始後の30時間以内、例えばステップ(ii)の開始後の22、23、24、25、26、27、28、29又は30時間以内に実施されるか、又は
(c)ステップ(iii)からの前記細胞の集団は、増殖されないか、又は例えばステップ(i)の開始時の前記細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖され、
任意選択で、ステップ(ii)の前記核酸分子は、ウイルスベクター上にあり、任意選択で、ステップ(ii)の前記核酸分子は、ウイルスベクター上のRNA分子であり、任意選択で、ステップ(ii)は、前記CARをコードする核酸分子を含むウイルスベクターで前記細胞(例えば、T細胞)の集団を形質導入することを含む、方法。
[項68]
CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤は、CD3を刺激する薬剤(例えば、抗CD3抗体)であり、共刺激分子を刺激する前記薬剤は、CD28、ICOS、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、CD2、CD226又はそれらの任意の組み合わせを刺激する薬剤であり、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤又は共刺激分子を刺激する前記薬剤は、抗体(例えば、単一ドメイン抗体(例えば、重鎖可変ドメイン抗体)、ペプチボディ、Fabフラグメント又はscFv)、小分子又はリガンド(例えば、天然に存在する、組換え又はキメラリガンド)から選択され、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤又は共刺激分子を刺激する前記薬剤は、ビーズを含まず、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤は、抗CD3抗体を含み、及び共刺激分子を刺激する前記薬剤は、抗CD28抗体を含み、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤は、コロイドポリマーナノマトリックスに共有結合された抗CD3抗体を含み、及び共刺激分子を刺激する前記薬剤は、コロイドポリマーナノマトリックスに共有結合された抗CD28抗体を含み、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤及び共刺激分子を刺激する前記薬剤は、T Cell TransAct(商標)を含む、項67に記載の方法。
[項69]
ステップ(i)及び/又は(ii)は、IL-2、IL-15(例えば、hetIL-15(IL15/sIL-15Ra))、IL-7、IL-21、IL-6(例えば、IL-6/sIL-6Ra)、LSD1阻害剤、MALT1阻害剤又はそれらの組み合わせを含む細胞培地(例えば、無血清培地)中で実施される、項67又は68に記載の方法。
[項70]
ステップ(i)及び/又は(ii)は、血清代替品を含む無血清細胞培地中で実施され、任意選択で、前記血清代替品は、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(ICSR)である、項67~69のいずれか一項に記載の方法。
[項71]
ステップ(i)前に、
(iv)(任意選択で)実体、例えば研究室、病院又は医療提供者から、新鮮な白血球アフェレーシス産物(或いは新鮮な全血液産物、新鮮な骨髄産物又は新鮮な腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去からの新鮮な産物)などの造血組織の代替供給源)を受け取るステップ、及び
(v)新鮮な白血球アフェレーシス産物(或いは新鮮な全血液産物、新鮮な骨髄産物又は新鮮な腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去からの新鮮な産物)などの造血組織の代替供給源)から、ステップ(i)で接触される前記細胞(例えば、T細胞、例えばCD8+及び/又はCD4+T細胞)の集団を単離するステップ
をさらに含み、任意選択で、
ステップ(iii)は、ステップ(v)の開始後の35時間以内、例えばステップ(v)の開始後の27、28、29、30、31、32、33、34又は35時間以内、例えばステップ(v)の開始後の30時間以内に実施されるか、又は
ステップ(iii)からの前記細胞の集団は、ステップ(v)の終了時の前記細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて、増殖されないか、又は5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖される、項67~70のいずれか一項に記載の方法。
[項72]
ステップ(i)前に、実体、例えば研究室、病院又は医療提供者から、白血球アフェレーシス産物(或いは全血液、骨髄又は腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去)から単離された凍結保存T細胞などの造血組織の代替供給源)から単離された凍結保存T細胞を受け取るステップをさらに含む、項67~70のいずれか一項に記載の方法。
[項73]
ステップ(i)前に、
(iv)(任意選択で)実体、例えば研究室、病院又は医療提供者から、凍結保存白血球アフェレーシス産物(或いは凍結保存全血液産物、凍結保存骨髄産物又は凍結保存腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去からの凍結保存産物)などの造血組織の代替供給源)を受け取るステップ、及び
(v)凍結保存白血球アフェレーシス産物(或いは凍結保存全血液産物、凍結保存骨髄産物又は凍結保存腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去からの凍結保存産物)などの造血組織の代替供給源)から、ステップ(i)で接触される前記細胞(例えば、T細胞、例えばCD8+及び/又はCD4+T細胞)の集団を単離するステップ
をさらに含み、任意選択で、
ステップ(iii)は、ステップ(v)の開始後の35時間以内、例えばステップ(v)の開始後の27、28、29、30、31、32、33、34又は35時間以内、例えばステップ(v)の開始後の30時間以内に実施されるか、又は
ステップ(iii)からの前記細胞の集団は、ステップ(v)の終了時の前記細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて、増殖されないか、又は5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖される、項67~70のいずれか一項に記載の方法。
[項74]
ステップ(vi):
ステップ(iii)からの前記細胞の集団の一部を少なくとも2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5又は7日、例えば少なくとも2日且つ7日以下にわたって培養し、及び前記一部におけるCAR発現レベルを測定する(例えば、前記一部における生存CAR発現細胞のパーセンテージを測定する)ステップ
をさらに含み、任意選択で、
ステップ(iii)は、前記細胞(例えば、T細胞)の集団を採取及び凍結することを含み、且つステップ(vi)は、ステップ(iii)からの前記細胞の集団の一部を解凍し、前記一部を少なくとも2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5又は7日、例えば少なくとも2日且つ7日以下にわたって培養し、及び前記一部におけるCAR発現レベルを測定する(例えば、前記一部における生存CAR発現細胞のパーセンテージを測定する)ことを含む、項67~73のいずれか一項に記載の方法。
[項75]
キメラ抗原受容体(CAR)を発現する細胞(例えば、T細胞)の集団を作製する方法であって、
(1)細胞(例えば、T細胞、例えば凍結白血球アフェレーシス産物から単離されたT細胞)の集団を、IL-2、IL-7、IL-15(例えば、hetIL-15(IL15/sIL-15Ra)、IL-21、IL-6(例えば、IL-6/sIL-6Ra)又はそれらの組み合わせから選択されるサイトカインと接触させるステップ、
(2)前記細胞(例えば、T細胞)の集団を、項53~57のいずれか一項に記載の核酸分子又は項59若しくは60に記載のCARをコードする核酸分子と接触させ、それにより前記核酸分子を含む細胞(例えば、T細胞)の集団を提供するステップ、及び
(3)保存(例えば、凍結保存培地中の前記細胞の集団の再製剤化)又は投与のために前記細胞(例えば、T細胞)の集団を採取するステップ
を含み、
(a)ステップ(2)は、ステップ(1)と一緒に、又はステップ(1)の開始後の5時間以内、例えばステップ(1)の開始後の1、2、3、4又は5時間以内に実施され、及び
ステップ(3)は、ステップ(1)の開始後の26時間以内、例えばステップ(1)の開始後の22、23又は24時間以内、例えばステップ(1)の開始後の24時間以内に実施されるか、又は
(b)ステップ(3)からの前記細胞の集団は、例えば、ステップ(1)の開始時の前記細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて、増殖されないか、又は5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖され、
任意選択で、ステップ(2)の前記核酸分子は、ウイルスベクター上にあり、任意選択で、ステップ(ii)の前記核酸分子は、ウイルスベクター上のRNA分子であり、任意選択で、ステップ(ii)は、前記細胞(例えば、T細胞)の集団を、前記CARをコードする核酸分子を含むウイルスベクターで形質導入することを含む、方法。
[項76]
前記細胞の集団は、CD3/TCR複合体を刺激する薬剤及び/若しくは前記細胞の表面上の共刺激分子を刺激する薬剤とインビトロで接触されないか、又は接触される場合、前記接触させるステップは、2時間未満、例えば1若しくは1.5時間以下である、項75に記載の方法。
[項77]
CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤は、CD3を刺激する薬剤(例えば、抗CD3抗体)であり、共刺激分子を刺激する前記薬剤は、CD28、ICOS、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、CD2、CD226又はそれらの任意の組み合わせを刺激する薬剤であり、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤又は共刺激分子を刺激する前記薬剤は、抗体(例えば、単一ドメイン抗体(例えば、重鎖可変ドメイン抗体)、ペプチボディ、Fabフラグメント又はscFv)、小分子又はリガンド(例えば、天然に存在する、組換え又はキメラリガンド)から選択される、項76に記載の方法。
[項78]
ステップ(1)及び/又は(2)は、
5、4、3、2、1又は0%以下の血清を含む細胞培地中で実施され、任意選択で、ステップ(1)及び/又は(2)は、約2%の血清を含む細胞培地中で実施されるか、又は
LSD1阻害剤又はMALT1阻害剤を含む細胞培地中で実施される、項75~77のいずれか一項に記載の方法。
[項79]
実体、例えば研究室、病院又は医療提供者から、凍結保存白血球アフェレーシス産物(或いは凍結保存全血液産物、凍結保存骨髄産物又は凍結保存腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去からの凍結保存産物)などの造血組織の代替供給源)を受け取るステップをさらに含む、項75~78のいずれか一項に記載の方法。
[項80]
ステップ(i)又はステップ(1)の開始時の前記細胞の集団は、IL6R発現細胞(例えば、IL6Rα及び/又はIL6Rβについて陽性の細胞)について濃縮されているか;又は
ステップ(i)又はステップ(1)の開始時の前記細胞の集団は、50、60又は70%以上のIL6R発現細胞(例えば、IL6Rα及び/又はIL6Rβについて陽性の細胞)を含む、項67~79のいずれか一項に記載の方法。
[項81]
ステップ(i)及び(ii)又はステップ(1)及び(2)は、IL-15(例えば、hetIL-15(IL15/sIL-15Ra))を含む細胞培地中で実施される、項67~80のいずれか一項に記載の方法。
[項82]
項67~81のいずれか一項に記載の方法によって作製される細胞の集団。
[項83]
CARを発現するように操作された細胞の集団(「CAR発現細胞の集団」)であって、
(a)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞のパーセンテージと比べて、ほぼ同じパーセンテージのナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞;
(b)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞のパーセンテージと比べて、ナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞の約5%~約10%以内の変化;
(c)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞のパーセンテージと比べて、増加したパーセンテージの、例えば少なくとも1.2、1.4、1.6、1.8、2.0、2.2、2.4、2.6、2.8又は3倍増加したナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞;
(d)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のセントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞のパーセンテージと比べて、ほぼ同じパーセンテージのセントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞;
(e)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のセントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞のパーセンテージと比べて、セントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞の約5%~約10%以内の変化;
(f)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のセントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞のパーセンテージと比べて、減少したパーセンテージの、例えば少なくとも20、25、30、35、40、45又は50%減少したセントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞;
(g)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中の幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞のパーセンテージと比べて、ほぼ同じパーセンテージの幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞;
(h)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中の幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞のパーセンテージと比べて、幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞の約5%~約10%以内の変化;又は
(i)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中の幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞のパーセンテージと比べて、増加したパーセンテージの幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞
を含み、
(a)抗BCMA結合ドメインである第1抗原結合ドメインであって、前記抗BCMA結合ドメインは、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)及び重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)及び軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、
(i)それぞれ配列番号86、130、88、95、131及び132;
(ii)それぞれ配列番号44、45、84、54、55及び56;又は
(iii)それぞれ配列番号179、180、181、147、182及び183
のアミノ酸配列を含む、第1抗原結合ドメインと;
(b)第2抗原結合ドメインと
を含む細胞の集団(「CAR発現細胞の集団」)。
[項84]
項1~52、63若しくは64のいずれか一項に記載の細胞又は項82若しくは83に記載の細胞の集団及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
[項85]
対象において抗腫瘍免疫を提供する方法であって、有効量の、項1~52、63若しくは64のいずれか一項に記載の細胞、項82若しくは83に記載の細胞の集団又は項84に記載の医薬組成物を前記対象に投与するステップを含む方法。
[項86]
BCMAの発現に関連する疾患を有する対象を処置する方法であって、有効量の、項1~52、63若しくは64のいずれか一項に記載の細胞、項82若しくは83に記載の細胞の集団又は項84に記載の医薬組成物を前記対象に投与するステップを含む方法。
[項87]
BCMAの発現に関連する前記疾患は、
(i)骨髄形成異常、骨髄異形成症候群又は前白血病の1つ以上から選択される癌若しくは悪性疾患又は前癌状態、又は
(ii)BCMAの発現に関連する非癌関連適応症
である、項86に記載の方法。
[項88]
前記疾患は、血液癌又は固形癌である、項86又は87に記載の方法。
[項89]
前記疾患は、急性白血病、B細胞急性リンパ性白血病(「BALL」)、T細胞急性リンパ性白血病(「TALL」)、急性リンパ性白血病(ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性リンパ球性白血病(CLL)、B細胞前リンパ球性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞新生物、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、小細胞型若しくは大細胞型濾胞性リンパ腫、悪性リンパ球増殖性病態、MALTリンパ腫、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯リンパ腫、多発性骨髄腫、骨髄形成異常及び骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞新生物、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、前立腺癌(例えば、去勢抵抗性若しくは治療抵抗性前立腺癌又は転移性前立腺癌)、膵臓癌、肺癌、形質細胞増殖異常症(例えば、無症候性骨髄腫(くすぶり型多発性骨髄腫又は無症候性骨髄腫)、意義不明の単クローン性γグロブリン血症(MGUS)、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、形質細胞腫(例えば、形質細胞異常増殖症、孤立性骨髄腫、孤立性形質細胞腫、髄外性形質細胞腫及び多発性形質細胞腫)、全身性アミロイド軽鎖アミロイドーシス若しくはPOEMS症候群(クロウ・深瀬症候群、高月病及びPEP症候群としても知られる))又はそれらの組み合わせから選択される、項86~88のいずれか一項に記載の方法。
[項90]
前記疾患は、多発性骨髄腫である、項86~89のいずれか一項に記載の方法。
[項91]
前記細胞の集団又は医薬組成物は、約1×106~約1×108(例えば、約2×106~約5×107、約5×106~約2×107、約1×106~約1×107、約1×107~約1×108、約1×106~約3×106、約2×106~約4×106、約3×106~約5×106、約4×106~約6×106、約5×106~約7×106、約6×106~約8×106、約7×106~約9×106、約8×106~約1×107、約9×106~約2×107、約1×107~約3×107、約2×107~約4×107、約3×107~約5×107、約4×107~約6×107、約5×107~約7×107、約6×107~約8×107、約7×107~約9×107、約8×107~約1×108、約1×106、約2×106、約3×106、約4×106、約5×106、約6×106、約7×106、約8×106、約9×106、約1×107、約2×107、約3×107、約4×107、約5×107、約6×107、約7×107、約8×107、約9×107又は約1×108)個のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)の用量で前記対象に投与され、
任意選択で、前記細胞の集団又は医薬組成物は、約5×106~約2×107個のCAR陽性生存細胞(例えば、BCMA CAR+T細胞)の用量で前記対象に投与される、項85~90のいずれか一項に記載の方法。
[項92]
前記対象に第2治療薬を投与するステップをさらに含み、任意選択で、前記第2治療薬は、
(i)PD-1阻害剤であって、任意選択で、PDR001、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、ピジリズマブ、MEDI0680、REGN2810、TSR-042、PF-06801591及びAMP-224からなる群から選択されるPD-1阻害剤;
(ii)PD-L1阻害剤であって、任意選択で、FAZ053、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ及びBMS-936559からなる群から選択されるPD-L1阻害剤;
(iii)LAG-3阻害剤であって、任意選択で、LAG525、BMS-986016、TSR-033、MK-4280及びREGN3767からなる群から選択されるLAG-3阻害剤;
(iv)TIM-3阻害剤であって、任意選択で、MBG453、TSR-022及びLY3321367からなる群から選択されるTIM-3阻害剤;
(v)CTLA-4阻害剤であって、任意選択で、イピリムマブ又はトレメリムマブであるCTLA-4阻害剤;
(vi)インターロイキン-15(IL-15)ポリペプチド、インターロイキン-15受容体α(IL-15Ra)ポリペプチド又はIL-15ポリペプチドとIL-15Raポリペプチドとの両方の組み合わせ、例えばhetIL-15;
(vii)インターロイキン-12(IL-12)ポリペプチド;又は
(viii)mTOR阻害剤であって、任意選択で、RAD001又はラパマイシンであるmTOR阻害剤
から選択される、項85~91のいずれか一項に記載の方法。
[項93]
単離細胞であって、
(a)第1抗原に結合する第1抗原結合ドメイン、第1膜貫通ドメイン及び第1細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、第1一次シグナル伝達ドメイン及び/又は第1共刺激シグナル伝達ドメイン)を含む第1CARであって、任意選択で、第1リーダー配列及び/又は第1ヒンジ領域を含む、第1CARと;
(b)第2抗原に結合する第2抗原結合ドメイン、第2膜貫通ドメイン及び第2細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、第2一次シグナル伝達ドメイン及び/又は第2共刺激シグナル伝達ドメイン)を含む第2CARであって、任意選択で、第2リーダー配列及び/又は第2ヒンジ領域を含む、第2CARと
を含み、
(i)前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、任意選択で、前記第1及び第2リーダー配列は、同じアミノ酸配列を含み;
(ii)前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、任意選択で、前記第1及び第2ヒンジ領域は、同じアミノ酸配列を含み;
(iii)前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、任意選択で、前記第1及び第2膜貫通ドメインは、同じアミノ酸配列を含み;及び/又は
(iv)前記第1細胞内シグナル伝達ドメイン及び前記第2細胞内シグナル伝達ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、
任意選択で、前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、及び/又は
前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされる、単離細胞。
[項94]
単離核酸分子であって、
(a)第1CARをコードする第1核酸配列であって、前記第1CARは、第1抗原に結合する第1抗原結合ドメイン、第1膜貫通ドメイン及び第1細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、第1一次シグナル伝達ドメイン及び/又は第1共刺激シグナル伝達ドメイン)を含み、任意選択で、前記第1CARは、第1リーダー配列及び/又は第1ヒンジ領域を含む、第1核酸配列と;
(b)第2CARをコードする第2核酸配列であって、前記第2CARは、第2抗原に結合する第2抗原結合ドメイン、第2膜貫通ドメイン及び第2細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、第2一次シグナル伝達ドメイン及び/又は第2共刺激シグナル伝達ドメイン)を含み、任意選択で、前記第2CARは、第2リーダー配列及び/又は第2ヒンジ領域を含む、第2核酸配列と
を含み、
(i)前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、任意選択で、前記第1及び第2リーダー配列は、同じアミノ酸配列を含み;
(ii)前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、任意選択で、前記第1及び第2ヒンジ領域は、同じアミノ酸配列を含み;
(iii)前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、任意選択で、前記第1及び第2膜貫通ドメインは、同じアミノ酸配列を含み;及び/又は
(iv)前記第1細胞内シグナル伝達ドメイン及び前記第2細胞内シグナル伝達ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、
任意選択で、前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされ、及び/又は
前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、異なる(例えば、少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%又は100%異なる)核酸配列によってコードされる、単離核酸分子。
[項95]
前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、同じアミノ酸配列を含むか、若しくは異なるアミノ酸配列を含み、及び/又は前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、同じアミノ酸配列を含むか、若しくは異なるアミノ酸配列を含む(例えば、前記第1及び第2共刺激シグナル伝達ドメインは、それぞれ4-1BB共刺激ドメイン配列及びCD28共刺激ドメイン配列を含むか;又はそれぞれCD28共刺激ドメイン配列及び4-1BB共刺激ドメイン配列を含む)、項93に記載の単離細胞又は項94に記載の単離核酸分子。
[項96]
(i)前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、配列番号1のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;
(ii)前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、配列番号2のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;
(iii)前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、配列番号6のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;
(iv)前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号7のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(v)前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、配列番号10のアミノ酸配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、項93若しくは95に記載の単離細胞又は項94若しくは95に記載の単離核酸分子。
[項97]
(i)前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、それぞれ配列番号199及び210を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)又はそれぞれ配列番号210及び199を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)によってコードされ;
(ii)前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、それぞれ配列番号337及び13を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)又はそれぞれ配列番号13及び337を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)によってコードされ;
(iii)前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、それぞれ配列番号338及び17を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列);又はそれぞれ配列番号17及び338を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)によってコードされ;
(iv)前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、それぞれ配列番号204及び18を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列);又はそれぞれ配列番号18及び204を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)によってコードされ;及び/又は
(iv)前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、それぞれ配列番号205及び21を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列);又はそれぞれ配列番号21及び205を含む核酸配列(又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列)によってコードされる、項93、95若しくは96のいずれか一項に記載の単離細胞又は項94~96のいずれか一項に記載の単離核酸分子。
[項98]
前記第1又は第2抗原は、BCMA、CD19、CD5、CD10、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD25、CD27、CD30、CD34、CD37、CD38、CD40、CD53、CD69、CD72、CD73、CD74、CD75、CD77、CD79a、CD79b、CD80、CD81、CD82、CD83、CD84、CD85、CD86、CD123、CD135、CD138、CD179、CD269、Flt3、ROR1、FcRn5、FcRn2、CS-1、CXCR4、5、7、IL-7/3R、IL7/4/3R又はIL4Rから選択され、任意選択で、前記B細胞抗原は、CD19、CD20、CD22、FcRn5、FcRn2、CS-1、CD138、CD123、CD33、CD34、CLL-1、葉酸受容体β、FLT3、EGFRvIII、メソテリン、GD2、Tn抗原、sTn抗原、Tn-O-糖ペプチド、sTn-O-糖ペプチド、PSMA、CD97、TAG72、CD44v6、CEA、EPCAM、KIT、IL-13Ra2、レグマン、GD3、CD171、IL-11Ra、PSCA、MAD-CT-1、MAD-CT-2、VEGFR2、ルイスY、CD24、PDGFR-β、SSEA-4、葉酸受容体α、ERBB(例えば、ERBB2)、Her2/neu、MUC1、EGFR、NCAM、エフリンB2、CAIX、LMP2、sLe、HMWMAA、o-アセチル-GD2、葉酸受容体β、TEM1/CD248、TEM7R、FAP、レグマイン、HPV E6若しくはE7、ML-IAP、CLDN6、TSHR、GPRC5D、ALK、ポリシアル酸、Fos関連抗原、好中球エラスターゼ、TRP-2、CYP1B1、精子タンパク質17、βヒト絨毛性ゴナドトロピン、AFP、チログロブリン、PLAC1、グロボH、RAGE1、MN-CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、腸カルボキシルエステラーゼ、mut hsp 70-2、NA-17、NY-BR-1、UPK2、HAVCR1、ADRB3、PANX3、NY-ESO-1、GPR20、Ly6k、OR51E2、TARP、GFRα4又はMHCに提示される前記抗原のいずれかのペプチドから選択される、項93若しくは95~97のいずれか一項に記載の単離細胞又は項94~97のいずれか一項に記載の単離核酸分子。
[項99]
前記第1又は第2抗原結合ドメインは、本明細書に開示されるCDR、VH、VL若しくはscFv又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、項93若しくは95~98のいずれか一項に記載の単離細胞又は項94~98のいずれか一項に記載の単離核酸分子。
[項100]
単離CARであって、第1VH(VH1)、第1VL(VL1)、第2VH(VH2)、第2VL(VL2)、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、前記VH1及びVL1は、第1抗原に結合し、且つ前記VH2及びVL2は、第2抗原に結合し、前記VH1、VL1、VH2及びVL2は、N末端からC末端まで、以下の構成:
(i)VH1-任意選択でリンカー1(「L1」)-VH2-任意選択でリンカー2(「L2」)-VL2-任意選択でリンカー3(「L3」)-VL1;
(ii)VH1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VL1;
(iii)VL1-任意選択でL1-VH2-任意選択でL2-VL2-任意選択でL3-VH1;
(iv)VL1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VH1;
(v)VH2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VL2;
(vi)VH2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VL2;
(vii)VL2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VH2;又は
(viii)VL2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VH2
で配列される、単離CAR。
[項101]
前記VH1、VL1、VH2及びVL2は、N末端からC末端まで、以下の構成:
(i)VH1-リンカー1(「L1」)-VH2-リンカー2(「L2」)-VL2-リンカー3(「L3」)-VL1;
(ii)VH1-L1-VL2-L2-VH2-L3-VL1;
(iii)VL1-L1-VH2-L2-VL2-L3-VH1;
(iv)VL1-L1-VL2-L2-VH2-L3-VH1;
(v)VH2-L1-VH1-L2-VL1-L3-VL2;
(vi)VH2-L1-VL1-L2-VH1-L3-VL2;
(vii)VL2-L1-VH1-L2-VL1-L3-VH2;又は
(viii)VL2-L1-VL1-L2-VH1-L3-VH2
で配列される、項100に記載の単離CAR。
[項102]
L1又はL3は、配列番号5のアミノ酸配列を含み、及び/又はL2は、配列番号63のアミノ酸配列を含む、項100又は101に記載の単離CAR。
[項103]
N末端からC末端まで、以下の構成:
(i)VH1-任意選択でリンカー1(「L1」)-VH2-任意選択でリンカー2(「L2」)-VL2-任意選択でリンカー3(「L3」)-VL1-任意選択でヒンジ領域-膜貫通ドメイン-細胞内シグナル伝達ドメイン;
(ii)VH1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VL1-任意選択でヒンジ領域-膜貫通ドメイン-細胞内シグナル伝達ドメイン;
(iii)VL1-任意選択でL1-VH2-任意選択でL2-VL2-任意選択でL3-VH1-任意選択でヒンジ領域-膜貫通ドメイン-細胞内シグナル伝達ドメイン;
(iv)VL1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VH1-任意選択でヒンジ領域-膜貫通ドメイン-細胞内シグナル伝達ドメイン;
(v)VH2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VL2-任意選択でヒンジ領域-膜貫通ドメイン-細胞内シグナル伝達ドメイン;
(vi)VH2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VL2-任意選択でヒンジ領域-膜貫通ドメイン-細胞内シグナル伝達ドメイン;
(vii)VL2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VH2-任意選択でヒンジ領域-膜貫通ドメイン-細胞内シグナル伝達ドメイン;又は
(viii)VL2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VH2-任意選択でヒンジ領域-膜貫通ドメイン-細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、項100~102のいずれか一項に記載の単離CAR。
[項104]
前記第1又は第2抗原は、異なり、且つ前記第1又は第2抗原は、BCMA、CD19、CD5、CD10、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD25、CD27、CD30、CD34、CD37、CD38、CD40、CD53、CD69、CD72、CD73、CD74、CD75、CD77、CD79a、CD79b、CD80、CD81、CD82、CD83、CD84、CD85、CD86、CD123、CD135、CD138、CD179、CD269、Flt3、ROR1、FcRn5、FcRn2、CS-1、CXCR4、5、7、IL-7/3R、IL7/4/3R又はIL4Rから選択され、任意選択で、前記B細胞抗原は、CD19、CD20、CD22、FcRn5、FcRn2、CS-1、CD138、CD123、CD33、CD34、CLL-1、葉酸受容体β、FLT3、EGFRvIII、メソテリン、GD2、Tn抗原、sTn抗原、Tn-O-糖ペプチド、sTn-O-糖ペプチド、PSMA、CD97、TAG72、CD44v6、CEA、EPCAM、KIT、IL-13Ra2、レグマン、GD3、CD171、IL-11Ra、PSCA、MAD-CT-1、MAD-CT-2、VEGFR2、ルイスY、CD24、PDGFR-β、SSEA-4、葉酸受容体α、ERBB(例えば、ERBB2)、Her2/neu、MUC1、EGFR、NCAM、エフリンB2、CAIX、LMP2、sLe、HMWMAA、o-アセチル-GD2、葉酸受容体β、TEM1/CD248、TEM7R、FAP、レグマイン、HPV E6若しくはE7、ML-IAP、CLDN6、TSHR、GPRC5D、ALK、ポリシアル酸、Fos関連抗原、好中球エラスターゼ、TRP-2、CYP1B1、精子タンパク質17、βヒト絨毛性ゴナドトロピン、AFP、チログロブリン、PLAC1、グロボH、RAGE1、MN-CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、腸カルボキシルエステラーゼ、mut hsp 70-2、NA-17、NY-BR-1、UPK2、HAVCR1、ADRB3、PANX3、NY-ESO-1、GPR20、Ly6k、OR51E2、TARP、GFRα4又はMHCに提示される前記抗原のいずれかのペプチドから選択される、項100~103のいずれか一項に記載の単離CAR。
[項105]
(i)前記VH1、VL1、VH2又はVL2は、本明細書に開示されるCDR、VH若しくはVL配列又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み;及び/又は
(ii)前記ヒンジ領域、膜貫通ドメイン又は細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、一次シグナル伝達ドメイン及び/又は共刺激シグナル伝達ドメイン)は、本明細書に開示されるヒンジ領域配列、膜貫通ドメイン配列若しくは細胞内シグナル伝達ドメイン配列(例えば、一次シグナル伝達ドメイン配列及び/若しくは共刺激シグナル伝達ドメイン配列)又はそれと少なくとも約85%、90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、項100~104のいずれか一項に記載の単離CAR。
[項106]
項100~105のいずれか一項に記載のCARをコードする単離核酸分子。
[項107]
項106に記載の核酸分子を含む単離ベクター。
[項108]
項100~105のいずれか一項に記載のCAR、項106に記載の核酸分子又は項107に記載のベクターを含む単離細胞。
[項109]
キメラ抗原受容体(CAR)を発現する細胞(例えば、T細胞)の集団を作製する方法であって、
(i)細胞(例えば、T細胞、例えば凍結された又は新鮮な白血球アフェレーシス産物から単離されたT細胞)の集団を、CD3/TCR複合体を刺激する薬剤及び/又は前記細胞の表面上の共刺激分子を刺激する薬剤と接触させる(例えば、結合させる)ステップ;
(ii)前記細胞(例えば、T細胞)の集団を、前記CARをコードする核酸分子(例えば、DNA又はRNA分子)と接触させ、それにより前記核酸分子を含む細胞(例えば、T細胞)の集団を提供するステップ、及び
(iii)保存(例えば、凍結保存培地中の前記細胞の集団の再製剤化)又は投与のために前記細胞(例えば、T細胞)の集団を採取するステップ
を含み、
(a)ステップ(ii)は、ステップ(i)と一緒に、又はステップ(i)の開始後の20時間以内、例えばステップ(i)の開始後の12、13、14、15、16、17若しくは18時間以内、例えばステップ(i)の開始後の18時間以内に実施され、及び
ステップ(iii)は、ステップ(i)の開始後の30(例えば、26)時間以内、例えばステップ(i)の開始後の22、23、24、25、26、27、28、29又は30時間以内、例えばステップ(i)の開始後の24時間以内に実施されるか、
(b)ステップ(ii)は、ステップ(i)と一緒に、又はステップ(i)の開始後の20時間以内、例えばステップ(i)の開始後の12、13、14、15、16、17若しくは18時間以内、例えばステップ(i)の開始後の18時間以内に実施され、及び
ステップ(iii)は、ステップ(ii)の開始後の30時間以内、例えばステップ(ii)の開始後の22、23、24、25、26、27、28、29又は30時間以内に実施されるか、又は
(c)ステップ(iii)からの前記細胞の集団は、例えば、ステップ(i)の開始時の前記細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて、増殖されないか、又は5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖され、
任意選択で、ステップ(ii)の前記核酸分子は、ウイルスベクター上にあり、任意選択で、ステップ(ii)の前記核酸分子は、ウイルスベクター上のRNA分子であり、任意選択で、ステップ(ii)は、前記細胞(例えば、T細胞)の集団を、前記CARをコードする核酸分子を含むウイルスベクターで形質導入することを含み、
(I)前記核酸分子は、第1CARをコードする第1核酸配列と、第2CARをコードする第2核酸配列とを含み、
前記第1及び第2核酸配列は、単一の核酸分子上に配置され、例えば、前記第1核酸配列及び前記第2核酸配列は、自己切断部位(例えば、P2A部位、T2A部位、E2A部位又はF2A部位)をコードする第3核酸配列によって隔てられるか、又は
前記第1及び第2核酸配列は、個別の核酸分子上に配置されるか;又は
(II)前記核酸分子は、CARをコードする核酸配列を含み、前記CARは、第1VH(VH1)、第1VL(VL1)、第2VH(VH2)、第2VL(VL2)、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、前記VH1及びVL1は、第1抗原に結合し、且つ前記VH2及びVL2は、第2抗原に結合し、前記VH1、VL1、VH2及びVL2は、N末端からC末端まで、以下の構成:VH1-任意選択でリンカー1(「L1」)-VH2-任意選択でリンカー2(「L2」)-VL2-任意選択でリンカー3(「L3」)-VL1、VH1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VL1、VL1-任意選択でL1-VH2-任意選択でL2-VL2-任意選択でL3-VH1、VL1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VH1、VH2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VL2、VH2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VL2、VL2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VH2;又はVL2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VH2で配列される、方法。
[項110]
前記核酸分子は、第1CARをコードする第1核酸配列と、第2CARをコードする第2核酸配列とを含み、前記第1及び第2核酸配列は、個別の核酸分子上に配置される、項109に記載の方法。
[項111]
前記第1及び第2核酸分子は、個別のウイルスベクター上にあり、ステップ(ii)は、前記第1CARをコードする前記核酸分子を含む第1ウイルスベクターと、前記第2CARをコードする前記第2核酸分子を含む第2ウイルスベクターとで前記細胞(例えば、T細胞)の集団を形質導入することを含む、項110に記載の方法。
[項112]
前記第1CARは、抗BCMA結合ドメイン(例えば、抗BCMA CAR)を含み、及び前記第2CARは、抗CD19結合ドメイン(例えば、抗CD19 CAR)を含む、項111に記載の方法。
[項113]
ステップ(ii)において、前記細胞の集団は、前記細胞の集団が前記第2ウイルスベクターと接触される感染多重度(MOI)より高いか、それと等しいか又はそれより低いMOIで前記第1ウイルスベクターと接触され、
任意選択で、ステップ(ii)において、前記細胞の集団は、前記細胞の集団が前記第2ウイルスベクターと接触される感染多重度(MOI)より高いMOIで前記第1ウイルスベクターと接触される、項112に記載の方法。
[項114]
ステップ(ii)において、前記細胞の集団は、得られる細胞の集団が、前記抗BCMA CARを含むが、前記抗CD19 CARを含まない第1の細胞の集団、前記抗CD19 CARを含むが、前記抗BCMA CARを含まない第2の細胞の集団及び前記抗BCMA CARと前記抗CD19 CARとの両方を含む第3の細胞の集団を含むように、第1MOIで前記第1ウイルスベクターと、且つ第2MOIで前記第2ウイルスベクターと接触され、例えば実施例10に記載の方法によって決定されて、
(i)前記第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、前記第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(ii)前記第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、前記第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;及び/又は
(iii)前記第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、前記得られる集団の生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)である、項112又は113に記載の方法。
[項115]
ステップ(ii)において、前記細胞の集団は、
(a)約1~約10(例えば、約2~約9、約3~約8、約4~約7、約5~約6、約1~約8、約1~約6、約1~約4、約8~約10、約6~約10、約4~約10、約1~3、約2~約4、約3~約5、約4~約6、約5~約7、約6~約8、約7~約9、約8~約10、約2.5~約5、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9又は約10)のMOIで前記第1ウイルスベクターと接触され、
任意選択で、前記細胞の集団は、約2.5~約5のMOIで前記第1ウイルスベクターと接触され;
(b)約0.1~約5(例えば、約0.2~約4、約0.3~約3、約0.4~約2、約0.5~約1、約0.6~約0.9、約0.7~約0.8、約0.1~約4、約0.1~約3、約0.1~約2、約0.1~約1、約0.1~約0.5、約4~約5、約3~約5、約2~約5、約1~約5、約0.5~約5、約0.2~約5、約0.1~約0.5、約0.2~約1、約0.5~約2、約1~約3、約2~約4、約3~約5、約0.5~約1、約0.1、約0.2、約0.3、約0.4、約0.5、約0.6、約0.7、約0.8、約0.9、約1、約2、約3、約4又は約5)のMOIで前記第2ウイルスベクターと接触され、
任意選択で、前記細胞の集団は、約0.5~約1.0のMOIで前記第2ウイルスベクターと接触され;
(c)前記細胞の集団が前記第2ウイルスベクターと接触されるMOIより少なくとも10%(例えば、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%若しくは90%)高いか、又は少なくとも約1倍(例えば、少なくとも約2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90若しくは100倍、例えば約2~約50倍、約3~20倍、約5~約15倍若しくは約8~約10倍)のMOIで前記第1ウイルスベクターと接触され、
任意選択で、前記細胞の集団が前記第2ウイルスベクターと接触されるMOIの約8~約10倍のMOIで前記第1ウイルスベクターと接触され;及び/又は
(d)前記細胞の集団が前記第1ウイルスベクターと接触されるMOIの1/X(ここで、Xは、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、15、20、30、40、50、60、70、80、90又は100である)以下のMOIで前記第2ウイルスベクターと接触され、
任意選択で、前記細胞の集団が前記第1ウイルスベクターと接触されるMOIの1/X(ここで、Xは、6、8、10又は12である)以下のMOIで前記第2ウイルスベクターと接触される、項112又は113に記載の方法。
[項116]
ステップ(ii)において、前記細胞の集団は、
(a)約4~約5(例えば、約4.75)のMOIで前記第1ウイルスベクターと;及び/又は
(b)約0.2~約1(例えば、約0.5)のMOIで前記第2ウイルスベクターと
と接触される、項113~115のいずれか一項に記載の方法。
[項117]
ステップ(ii)において、前記細胞の集団は、約1×108~約5×109(例えば、約2×108~約2×109又は約4×108~約1×109個の総生存細胞を含み、任意選択で、前記細胞は、約1×106~約1×107(例えば、約2×106~約5×106又は約3×106~約4×106)個の生存細胞/mLの濃度で培養物中に懸濁される、項109~116のいずれか一項に記載の方法。
[項118]
CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤は、CD3を刺激する薬剤(例えば、抗CD3抗体)であり、共刺激分子を刺激する前記薬剤は、CD28、ICOS、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、CD2、CD226又はそれらの任意の組み合わせを刺激する薬剤であり、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤又は共刺激分子を刺激する前記薬剤は、抗体(例えば、単一ドメイン抗体(例えば、重鎖可変ドメイン抗体)、ペプチボディ、Fabフラグメント又はscFv)、小分子又はリガンド(例えば、天然に存在する、組換え又はキメラリガンド)から選択され、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤又は共刺激分子を刺激する前記薬剤は、ビーズを含まず、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤は、抗CD3抗体を含み、及び共刺激分子を刺激する前記薬剤は、抗CD28抗体を含み、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤は、コロイドポリマーナノマトリックスに共有結合された抗CD3抗体を含み、及び共刺激分子を刺激する前記薬剤は、コロイドポリマーナノマトリックスに共有結合された抗CD28抗体を含み、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤及び共刺激分子を刺激する前記薬剤は、T Cell TransAct(商標)を含む、項109~117のいずれか一項に記載の方法。
[項119]
ステップ(i)及び/又は(ii)は、IL-2、IL-15(例えば、hetIL-15(IL15/sIL-15Ra))、IL-7、IL-21、IL-6(例えば、IL-6/sIL-6Ra)、LSD1阻害剤、MALT1阻害剤又はそれらの組み合わせを含む細胞培地(例えば、無血清培地)中で実施される、項109~118のいずれか一項に記載の方法。
[項120]
ステップ(i)及び/又は(ii)は、血清代替品を含む無血清細胞培地中で実施され、任意選択で、前記血清代替品は、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(ICSR)である、項109~119のいずれか一項に記載の方法。
[項121]
ステップ(i)前に、
(iv)(任意選択で)実体、例えば研究室、病院又は医療提供者から、新鮮な白血球アフェレーシス産物(或いは新鮮な全血液産物、新鮮な骨髄産物又は新鮮な腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去からの新鮮な産物)などの造血組織の代替供給源)を受け取るステップ、及び
(v)新鮮な白血球アフェレーシス産物(或いは新鮮な全血液産物、新鮮な骨髄産物又は新鮮な腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去からの新鮮な産物)などの造血組織の代替供給源)から、ステップ(i)で接触される前記細胞(例えば、T細胞、例えばCD8+及び/又はCD4+T細胞)の集団を単離するステップ
をさらに含み、任意選択で、
ステップ(iii)は、ステップ(v)の開始後の35時間以内、例えばステップ(v)の開始後の27、28、29、30、31、32、33、34又は35時間以内、例えばステップ(v)の開始後の30時間以内に実施されるか、又は
ステップ(iii)からの前記細胞の集団は、ステップ(v)の終了時の前記細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて、増殖されないか、又は5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖される、項109~120のいずれか一項に記載の方法。
[項122]
ステップ(i)前に、実体、例えば研究室、病院又は医療提供者から、白血球アフェレーシス産物(或いは全血液、骨髄又は腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去)から単離された凍結保存T細胞などの造血組織の代替供給源)から単離された凍結保存T細胞を受け取るステップをさらに含む、項109~120のいずれか一項に記載の方法。
[項123]
ステップ(i)前に、
(iv)(任意選択で)実体、例えば研究室、病院又は医療提供者から、凍結保存白血球アフェレーシス産物(或いは凍結保存全血液産物、凍結保存骨髄産物又は凍結保存腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去からの凍結保存産物)などの造血組織の代替供給源)を受け取るステップ、及び
(v)凍結保存白血球アフェレーシス産物(或いは凍結保存全血液産物、凍結保存骨髄産物又は凍結保存腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去からの凍結保存産物)などの造血組織の代替供給源)から、ステップ(i)で接触される前記細胞(例えば、T細胞、例えばCD8+及び/又はCD4+T細胞)の集団を単離するステップ
をさらに含み、任意選択で、
ステップ(iii)は、ステップ(v)の開始後の35時間以内、例えばステップ(v)の開始後の27、28、29、30、31、32、33、34又は35時間以内、例えばステップ(v)の開始後の30時間以内に実施されるか、又は
ステップ(iii)からの前記細胞の集団は、ステップ(v)の終了時の前記細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて、増殖されないか、又は5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖される、項109~120のいずれか一項に記載の方法。
[項124]
ステップ(vi):
ステップ(iii)からの前記細胞の集団の一部を少なくとも2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5又は7日、例えば少なくとも2日且つ7日以下にわたって培養し、及び前記一部におけるCAR発現レベルを測定する(例えば、前記一部における生存CAR発現細胞のパーセンテージを測定する)ステップ
をさらに含み、任意選択で、
ステップ(iii)は、前記細胞(例えば、T細胞)の集団を採取及び凍結することを含み、且つステップ(vi)は、ステップ(iii)からの前記細胞の集団の一部を解凍し、前記一部を少なくとも2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5又は7日、例えば少なくとも2日且つ7日以下にわたって培養し、及び前記一部におけるCAR発現レベルを測定する(例えば、前記一部における生存CAR発現細胞のパーセンテージを測定する、例えば前記一部における生存抗BCMA CAR発現細胞のパーセンテージを測定する)ことを含む、項109~123のいずれか一項に記載の方法。
[項125]
ステップ(iii)からの前記細胞は、前記一部におけるCAR発現レベルを測定する(例えば、前記一部における生存CAR発現細胞のパーセンテージを測定する、例えば前記一部における生存抗BCMA CAR発現細胞のパーセンテージを測定する)前に、約2~約4日、例えば約3日(例えば、採取後約72時間)にわたって培養される、項124に記載の方法。
[項126]
CAR発現の前記測定は、ステップ(ii)から約4日(例えば、96時間)後に行われる、項125に記載の方法。
[項127]
前記CAR発現レベルは、フローサイトメトリーによって測定される、項124~126のいずれか一項に記載の方法。
[項128]
キメラ抗原受容体(CAR)を発現する細胞(例えば、T細胞)の集団を作製する方法であって、
(1)細胞(例えば、T細胞、例えば凍結された白血球アフェレーシス産物から単離されたT細胞)の集団を、IL-2、IL-7、IL-15(例えば、hetIL-15(IL15/sIL-15Ra))、IL-21、IL-6(例えば、IL-6/sIL-6Ra)又はそれらの組み合わせから選択されるサイトカインと接触させるステップ、
(2)前記細胞(例えば、T細胞)の集団を、前記CARをコードする核酸分子(例えば、DNA又はRNA分子)と接触させ、それにより前記核酸分子を含む細胞(例えば、T細胞)の集団を提供するステップ、及び
(3)保存(例えば、凍結保存培地中の前記細胞の集団の再製剤化)又は投与のために前記細胞(例えば、T細胞)の集団を採取するステップ
を含み、
(a)ステップ(2)は、ステップ(1)と一緒に、又はステップ(1)の開始後の5時間以内、例えばステップ(i)の開始後の1、2、3、4若しくは5時間以内に実施され、及び
ステップ(3)は、ステップ(1)の開始後の26時間以内、例えばステップ(i)の開始後の22、23若しくは24時間以内、例えばステップ(i)の開始後の24時間以内に実施されるか、又は
(b)ステップ(3)からの前記細胞の集団は、例えば、ステップ(1)の開始時の前記細胞の集団と比べて、生存細胞の数によって評価されて、増殖されないか、又は5、10、15、20、25、30、35若しくは40%以下、例えば10%以下だけ増殖され、
任意選択で、ステップ(2)の前記核酸分子は、ウイルスベクター上にあり、任意選択で、ステップ(ii)の前記核酸分子は、ウイルスベクター上のRNA分子であり、任意選択で、ステップ(ii)は、前記細胞(例えば、T細胞)の集団を、前記CARをコードする核酸分子を含むウイルスベクターで形質導入することを含み、
(I)前記核酸分子は、第1CARをコードする第1核酸配列と、第2CARをコードする第2核酸配列とを含み、
前記第1及び第2核酸配列は、単一の核酸分子上に配置され、例えば、前記第1核酸配列及び前記第2核酸配列は、自己切断部位(例えば、P2A部位、T2A部位、E2A部位又はF2A部位)をコードする第3核酸配列によって隔てられるか、又は
前記第1及び第2核酸配列は、個別の核酸分子上に配置されるか;又は
(II)前記核酸分子は、CARをコードする核酸配列を含み、前記CARは、第1VH(VH1)、第1VL(VL1)、第2VH(VH2)、第2VL(VL2)、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、前記VH1及びVL1は、第1抗原に結合し、且つ前記VH2及びVL2は、第2抗原に結合し、前記VH1、VL1、VH2及びVL2は、N末端からC末端まで、以下の構成:VH1-任意選択でリンカー1(「L1」)-VH2-任意選択でリンカー2(「L2」)-VL2-任意選択でリンカー3(「L3」)-VL1、VH1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VL1、VL1-任意選択でL1-VH2-任意選択でL2-VL2-任意選択でL3-VH1、VL1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VH1、VH2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VL2、VH2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VL2、VL2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VH2;又はVL2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VH2で配列される、方法。
[項129]
前記細胞の集団は、CD3/TCR複合体を刺激する薬剤及び/若しくは前記細胞の表面上の共刺激分子を刺激する薬剤とインビトロで接触されないか、又は接触される場合、前記接触させるステップは、2時間未満、例えば1若しくは1.5時間以下である、項128に記載の方法。
[項130]
CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤は、CD3を刺激する薬剤(例えば、抗CD3抗体)であり、共刺激分子を刺激する前記薬剤は、CD28、ICOS、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、CD2、CD226又はそれらの任意の組み合わせを刺激する薬剤であり、任意選択で、CD3/TCR複合体を刺激する前記薬剤又は共刺激分子を刺激する前記薬剤は、抗体(例えば、単一ドメイン抗体(例えば、重鎖可変ドメイン抗体)、ペプチボディ、Fabフラグメント又はscFv)、小分子又はリガンド(例えば、天然に存在する、組換え又はキメラリガンド)から選択される、項129に記載の方法。
[項131]
ステップ(1)及び/又は(2)は、
5、4、3、2、1又は0%以下の血清を含む細胞培地中で実施され、任意選択で、ステップ(1)及び/又は(2)は、約2%の血清を含む細胞培地中で実施されるか、又は
LSD1阻害剤又はMALT1阻害剤を含む細胞培地中で実施される、項128~130のいずれか一項に記載の方法。
[項132]
実体、例えば研究室、病院又は医療提供者から、凍結保存白血球アフェレーシス産物(或いは凍結保存全血液産物、凍結保存骨髄産物又は凍結保存腫瘍若しくは臓器生検若しくは切除(例えば、胸腺除去からの凍結保存産物)などの造血組織の代替供給源)を受け取るステップをさらに含む、項128~131のいずれか一項に記載の方法。
[項133]
ステップ(i)又はステップ(1)の開始時の前記細胞の集団は、IL6R発現細胞(例えば、IL6Rα及び/又はIL6Rβについて陽性の細胞)について濃縮されているか;又は
ステップ(i)又はステップ(1)の開始時の前記細胞の集団は、50、60又は70%以上のIL6R発現細胞(例えば、IL6Rα及び/又はIL6Rβについて陽性の細胞)を含む、項109~132のいずれか一項に記載の方法。
[項134]
ステップ(i)及び(ii)又はステップ(1)及び(2)は、IL-15(例えば、hetIL-15(IL15/sIL-15Ra))を含む細胞培地中で実施される、項109~133のいずれか一項に記載の方法。
[項135]
項109~134のいずれか一項に記載の方法によって作製される細胞の集団。
[項136]
項112~114のいずれか一項に記載の方法によって作製される細胞の集団。
[項137]
前記細胞の集団は、
抗BCMA CARを含むが、抗CD19 CARを含まない第1の細胞の集団;
抗CD19 CARを含むが、抗BCMA CARを含まない第2の細胞の集団;及び
抗BCMA CARと抗CD19 CARとの両方を含む第3の細胞の集団
を含む、項136に記載の細胞の集団。
[項138]
(i)前記第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、前記第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約110%以下(例えば、約105%、100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%、5%、1%又はそれ未満以下)であり;
(ii)前記第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、前記第2及び第3集団を合わせた生存細胞の総数の約90%以上(例えば、約100%、125%、150%、175%、200%、250%、300%、400%、500%、750%、1000%、2000%、5000、10000%又はそれを超えるもの以上)であり;及び/又は
(iii)前記第1及び第3集団を合わせた生存細胞の総数は、前記集団の生存細胞の総数の約5%以上(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%又は90%以上)である、項137に記載の細胞の集団。
[項139]
CARを含まない第4の細胞の集団をさらに含む、項137又は138に記載の細胞の集団。
[項140]
CARを発現するように操作された細胞の集団(「CAR発現細胞の集団」)であって、
(a)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞のパーセンテージと比べて、ほぼ同じパーセンテージのナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞;
(b)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞のパーセンテージと比べて、ナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞の約5%~約10%以内の変化;
(c)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞のパーセンテージと比べて、増加したパーセンテージの、例えば少なくとも1.2、1.4、1.6、1.8、2.0、2.2、2.4、2.6、2.8又は3倍増加したナイーブ細胞、例えばナイーブT細胞、例えばCD45RO-CCR7+T細胞;
(d)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のセントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞のパーセンテージと比べて、ほぼ同じパーセンテージのセントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞;
(e)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のセントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞のパーセンテージと比べて、セントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞の約5%~約10%以内の変化;
(f)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中のセントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞のパーセンテージと比べて、減少したパーセンテージの、例えば少なくとも20、25、30、35、40、45又は50%減少したセントラルメモリー細胞、例えばセントラルメモリーT細胞、例えばCCR7+CD45RO+T細胞;
(g)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中の幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞のパーセンテージと比べて、ほぼ同じパーセンテージの幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞;
(h)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中の幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞のパーセンテージと比べて、幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞の約5%~約10%以内の変化;又は
(i)前記CARを発現するように操作される前の同じ細胞の集団中の幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞のパーセンテージと比べて、増加したパーセンテージの幹メモリーT細胞、例えばCD45RA+CD95+IL-2受容体β+CCR7+CD62L+T細胞
を含み、
前記CARをコードする核酸配列(例えば、DNA又はRNA分子)を含む細胞を含み、
(I)前記核酸分子は、第1CARをコードする第1核酸配列と、第2CARをコードする第2核酸配列とを含み、
前記第1及び第2核酸配列は、単一の核酸分子上に配置され、例えば、前記第1核酸配列及び前記第2核酸配列は、自己切断部位(例えば、P2A部位、T2A部位、E2A部位又はF2A部位)をコードする第3核酸配列によって隔てられるか、又は
前記第1及び第2核酸配列は、個別の核酸分子上に配置されるか;又は
(II)前記核酸分子は、CARをコードする核酸配列を含み、前記CARは、第1VH(VH1)、第1VL(VL1)、第2VH(VH2)、第2VL(VL2)、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、前記VH1及びVL1は、第1抗原に結合し、且つ前記VH2及びVL2は、第2抗原に結合し、前記VH1、VL1、VH2及びVL2は、N末端からC末端まで、以下の構成:VH1-任意選択でリンカー1(「L1」)-VH2-任意選択でリンカー2(「L2」)-VL2-任意選択でリンカー3(「L3」)-VL1、VH1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VL1、VL1-任意選択でL1-VH2-任意選択でL2-VL2-任意選択でL3-VH1、VL1-任意選択でL1-VL2-任意選択でL2-VH2-任意選択でL3-VH1、VH2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VL2、VH2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VL2、VL2-任意選択でL1-VH1-任意選択でL2-VL1-任意選択でL3-VH2;又はVL2-任意選択でL1-VL1-任意選択でL2-VH1-任意選択でL3-VH2で配列される、細胞の集団(「CAR発現細胞の集団」)。
[項141]
項112~114のいずれか一項に記載の方法によって作製される単離細胞又は細胞の集団であって、
(a)抗BCMA結合ドメイン、第1膜貫通ドメイン及び第1細胞内シグナル伝達ドメインを含む第1CARをコードする第1核酸分子であって、前記抗BCMA結合ドメインは、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)及び重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)及び軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号86、87、88、95、96及び97のアミノ酸配列を含む、第1核酸分子と;
(b)抗CD19結合ドメイン、第2膜貫通ドメイン及び第2細胞内シグナル伝達ドメインを含む第2CARをコードする第2核酸分子であって、前記抗CD19結合ドメインは、HC CDR1、HC CDR2及びHC CDR3を含むVHと、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3を含むVLとを含み、前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号295、304及び297~300のアミノ酸配列を含む、第2核酸分子と
を含む単離細胞又は細胞の集団。
[項142]
単離細胞であって、
(a)抗BCMA結合ドメイン、第1膜貫通ドメイン及び第1細胞内シグナル伝達ドメインを含む第1CARをコードする第1核酸分子であって、前記抗BCMA結合ドメインは、重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)及び重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)及び軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号86、87、88、95、96及び97のアミノ酸配列を含む、第1核酸分子と;
(b)抗CD19結合ドメイン、第2膜貫通ドメイン及び第2細胞内シグナル伝達ドメインを含む第2CARをコードする第2核酸分子であって、前記抗CD19結合ドメインは、HC CDR1、HC CDR2及びHC CDR3を含むVHと、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3を含むVLとを含み、前記HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2及びLC CDR3は、それぞれ配列番号295、304及び297~300のアミノ酸配列を含む、第2核酸分子と
を含む単離細胞。
[項143]
(i)前記抗BCMA結合ドメインの前記VH及びVLは、それぞれ配列番号93及び102のアミノ酸配列を含み;
(ii)前記抗CD19結合ドメインの前記VH及びVLは、それぞれ配列番号250及び251のアミノ酸配列を含み;
(iii)前記抗BCMA結合ドメインは、配列番号105のアミノ酸配列を含み;
(iv)前記抗CD19結合ドメインは、配列番号293のアミノ酸配列を含み;
(v)前記第1CARは、配列番号107のアミノ酸配列を含み;及び/又は
(vi)前記第2CARは、配列番号225のアミノ酸配列を含む、項141又は142に記載の単離細胞又は細胞の集団。
[項144]
項141~143のいずれか一項に記載の細胞又は細胞の集団を含む医薬組成物。
[項145]
BCMAの発現に関連する疾患を有する対象において抗腫瘍免疫を提供するか、又は対象を処置する方法であって、有効量の、項141~143のいずれか一項に記載の細胞若しくは細胞の集団又は項144に記載の医薬組成物を前記対象に投与するステップを含む方法。
[項146]
BCMAの発現に関連する前記疾患は、血液癌又は固形癌である、項145に記載の方法。
[項147]
前記疾患は、急性白血病、B細胞急性リンパ性白血病(「BALL」)、T細胞急性リンパ性白血病(「TALL」)、急性リンパ性白血病(ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性リンパ球性白血病(CLL)、B細胞前リンパ球性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞新生物、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、小細胞型若しくは大細胞型濾胞性リンパ腫、悪性リンパ球増殖性病態、MALTリンパ腫、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯リンパ腫、多発性骨髄腫、骨髄形成異常及び骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞新生物、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、前立腺癌(例えば、去勢抵抗性若しくは治療抵抗性前立腺癌又は転移性前立腺癌)、膵臓癌、肺癌、形質細胞増殖異常症(例えば、無症候性骨髄腫(くすぶり型多発性骨髄腫又は無症候性骨髄腫)、意義不明の単クローン性γグロブリン血症(MGUS)、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、形質細胞腫(例えば、形質細胞異常増殖症、孤立性骨髄腫、孤立性形質細胞腫、髄外性形質細胞腫及び多発性形質細胞腫)、全身性アミロイド軽鎖アミロイドーシス若しくはPOEMS症候群(クロウ・深瀬症候群、高月病及びPEP症候群としても知られる))又はそれらの組み合わせから選択される、項145又は146に記載の方法。
[項148]
前記疾患は、多発性骨髄腫である、項145~147のいずれか一項に記載の方法。
Claims (27)
- キメラ抗原受容体(CAR)を含む単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団であって、前記CARは以下:
(a)重鎖可変ドメイン(VH)および軽鎖可変ドメイン(VL)を含み、BCMAに結合する第1抗原結合ドメインと、第1膜貫通ドメインと、第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び第1一次シグナル伝達ドメインを含む第1細胞内シグナル伝達ドメインとを含む第1CAR(BCMA CAR);並びに
(b)VHおよびVLを含み、CD19に結合する第2抗原結合ドメインと、第2膜貫通ドメインと、第2共刺激シグナル伝達ドメイン及び第2一次シグナル伝達ドメインを含む第2細胞内シグナル伝達ドメインとを含む第2CAR(CD19 CAR);を含み、
ここで第1CAR及び第2CARがそれぞれ、配列番号214、216、218、220または222のうちの1つにおいて記載されるHCDR1、HCHR2、HCDR3、LCDR1、LCHR2およびLCDR3を含み、
ここで前記CARは配列番号214、216、218、220、222のアミノ酸配列、又はそれと少なくとも95%、96%、97%、98%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、細胞又は細胞の集団。 - 前記第1CARが第1核酸配列によってコードされ、及び前記第2CARが第2核酸配列によってコードされ、ここで前記第1及び第2核酸配列は、単一の核酸分子上に配置される、請求項1に記載の単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団。
- (a)前記単一の核酸分子が5’から3’の方向に、以下の構成:
(i)前記第1抗原結合ドメインをコードする核酸配列、第1膜貫通ドメインをコードする核酸配列、第1細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列、P2A部位を含むリンカーをコードする核酸配列、前記第2抗原結合ドメインをコードする核酸配列、第2膜貫通ドメインをコードする核酸配列、第2細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列、又は
(ii)前記第2抗原結合ドメインをコードする核酸配列、第2膜貫通ドメインをコードする核酸配列、第2細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列、P2A部位を含むリンカーをコードする核酸配列、前記第1抗原結合ドメインをコードする核酸配列、第1膜貫通ドメインをコードする核酸配列、第1細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列、を含む;
(b)前記単一の核酸分子が、配列番号215、217、219、221若しくは223の核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列を含む;又は
(c)前記単一の核酸分子が、配列番号214、216、218、220若しくは222のアミノ酸配列又はそれと少なくとも95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする、請求項2に記載の単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団。 - 前記P2A部位を含むリンカーが、
(I)配列番号209の核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされるか、又は
(II)配列番号208のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項3に記載の単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団。 - 前記第1抗原結合ドメイン又は第2抗原結合ドメインはVH及びVLを含み、前記VH及びVLは、リンカーによって連結され、前記リンカーは、配列番号5のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団。
- (i)前記第1膜貫通ドメイン又は第2膜貫通ドメインは、配列番号6のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む;
(ii)前記第1膜貫通ドメイン又は第2膜貫通ドメインは、配列番号17の核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる;
(iii)前記第1抗原結合ドメイン又は第2抗原結合ドメインは、ヒンジ領域により、それぞれ前記第1膜貫通ドメイン又は第2膜貫通ドメインに連結される;
(iv)前記一次シグナル伝達ドメインは、CD3ζに由来する機能性シグナル伝達ドメインを含み、
(a)前記一次シグナル伝達ドメインは、配列番号9若しくは10のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は
(b)前記一次シグナル伝達ドメインは、配列番号20、21若しくは205の核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる;
(v)前記共刺激シグナル伝達ドメインは4-1BB(CD137)に由来する機能性シグナル伝達ドメインを含み、
(a)前記共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号7のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は
(b)前記共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号18若しくは204の核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる;
(vi)前記第1細胞内シグナル伝達ドメイン又は第2細胞内シグナル伝達ドメインは、4-1BBに由来する機能性シグナル伝達ドメインと、CD3ζに由来する機能性シグナル伝達ドメインとを含み、
(a)前記第1細胞内シグナル伝達ドメイン又は第2細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号7のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列と、配列番号9若しくは10のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列とを含むか、又は
(b)前記第1細胞内シグナル伝達ドメイン又は第2細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号7のアミノ酸配列と、配列番号9若しくは10のアミノ酸配列とを含む;又は
(vii)前記第1CARは、第1リーダー配列をさらに含むか、又は前記第2CARは第2リーダー配列をさらに含み、
(a)前記第1又は第2リーダー配列は、配列番号1のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は
(b)前記第1又は第2リーダー配列は、配列番号199若しくは210の核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、請求項2に記載の単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団。 - (a)前記ヒンジ領域は、配列番号2のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、
(b)前記ヒンジ領域は、配列番号13の核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされるか、
(c)前記ヒンジ領域及び前記膜貫通ドメインは、配列番号202のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、又は
(d)前記ヒンジ領域及び前記膜貫通ドメインは、配列番号203若しくは213の核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、請求項6に記載の単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団。 - (a)(i)前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、異なる核酸配列によってコードされる、
(ii)前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、異なる核酸配列によってコードされる、
(iii)前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、異なる核酸配列によってコードされる、及び/又は
(iv)前記第1細胞内シグナル伝達ドメイン及び前記第2細胞内シグナル伝達ドメインは、異なる核酸配列によってコードされる;
(b)(i)前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、同じアミノ酸配列を含むか、又は異なるアミノ酸配列を含む、
(ii)前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、同じアミノ酸配列を含むか、又は異なるアミノ酸配列を含む、
(iii)前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、同じアミノ酸配列を含むか、又は異なるアミノ酸配列を含む、及び/又は
(iv)前記第1細胞内シグナル伝達ドメイン及び前記第2細胞内シグナル伝達ドメインは、同じアミノ酸配列を含むか、又は異なるアミノ酸配列を含む;並びに/又は
(c)(i)前記第1リーダー配列及び前記第2リーダー配列は、それぞれ配列番号199及び210を含む核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列又はそれぞれ配列番号210及び199を含む核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、
(ii)前記第1ヒンジ領域及び前記第2ヒンジ領域は、それぞれ配列番号337及び13を含む核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列又はそれぞれ配列番号13及び337を含む核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、
(iii)前記第1膜貫通ドメイン及び前記第2膜貫通ドメインは、それぞれ配列番号338及び17を含む核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列;又はそれぞれ配列番号17及び338を含む核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、
(iv)前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、それぞれ配列番号204及び18を含む核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列;又はそれぞれ配列番号18及び204を含む核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる、及び/又は
(v)前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、それぞれ配列番号205及び21を含む核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列;又はそれぞれ配列番号21及び205を含む核酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有する核酸配列によってコードされる;又は
(d)前記第1CAR又は第2CARは、ウッドチャック肝炎転写後調節エレメント(WPRE)を含む核酸分子によってコードされる、請求項6に記載の単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団。 - (a)前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、異なる核酸配列によってコードされる、
(b)前記第1共刺激シグナル伝達及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、異なる核酸配列によってコードされる、
(c)前記第1リーダー配列および前記第2リーダー配列は、配列番号1のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、
(d)前記第1ヒンジ領域および前記第2ヒンジ領域は、配列番号2のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、
(e)前記第1膜貫通ドメインおよび前記第2膜貫通ドメインは、配列番号6のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、
(f)前記第1一次シグナル伝達ドメイン及び前記第2一次シグナル伝達ドメインは、配列番号10のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、又は
(g)前記第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び前記第2共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号7のアミノ酸配列又はそれと少なくとも90%、95%若しくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項8に記載の単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団。 - キメラ抗原受容体(CAR)をコードする単離核酸分子であって、前記核酸分子は以下:
(a)重鎖可変ドメイン(VH)および軽鎖可変ドメイン(VL)を含み、BCMAに結合する第1抗原結合ドメインと、第1膜貫通ドメインと、第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び第1一次シグナル伝達ドメインを含む第1細胞内シグナル伝達ドメインとを含む第1CAR(BCMA CAR)をコードする第1核酸配列;並びに
(b)VHおよびVLを含み、CD19に結合する第2抗原結合ドメインと、第2膜貫通ドメインと、第2共刺激シグナル伝達ドメイン及び第2一次シグナル伝達ドメインを含む第2細胞内シグナル伝達ドメインとを含む第2CAR(CD19 CAR)をコードする第2核酸配列、を含み、
ここで第1CAR及び第2CARがそれぞれ、配列番号214、216、218、220または222のうちの1つにおいて記載されるHCDR1、HCHR2、HCDR3、LCDR1、LCHR2およびLCDR3を含み、
ここでコードされるCARは配列番号214、216、218、220、222のアミノ酸配列、又はそれと少なくとも95%、96%、97%、98%もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、及びここで、前記第1核酸配列及び前記第2核酸配列は、単一の核酸分子上に配置される、単離核酸分子。 - (a)重鎖可変ドメイン(VH)および軽鎖可変ドメイン(VL)を含み、BCMAに結合する第1抗原結合ドメインと、第1膜貫通ドメインと、第1共刺激シグナル伝達ドメイン及び第1一次シグナル伝達ドメインを含む第1細胞内シグナル伝達ドメインとを含む第1CAR(BCMA CAR);及び
(b)VHおよびVLを含み、CD19に結合する第2抗原結合ドメインと、第2膜貫通ドメインと、第2共刺激シグナル伝達ドメイン及び第2一次シグナル伝達ドメインを含む第2細胞内シグナル伝達ドメインとを含む第2CAR(CD19 CAR)、を含む、単離CARであって、
ここで第1CAR及び第2CARがそれぞれ、配列番号214、216、218、220または222のうちの1つにおいて記載されるHCDR1、HCHR2、HCDR3、LCDR1、LCHR2およびLCDR3を含み、
ここで前記CARは配列番号214、216、218、220、222のアミノ酸配列、又はそれと少なくとも95%、96%、97%、98%もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、単離CAR。 - 請求項10に記載の核酸分子を含むベクター。
- 前記ベクターがDNAベクター、RNAベクター、プラスミド、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター又はレトロウイルスベクターから選択されるベクターである、請求項12に記載のベクター。
- 請求項10に記載の核酸分子を含む単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団。
- T細胞又はNK細胞を作製する方法であって、請求項12または13に記載のベクターを細胞に形質導入するステップを含む、方法。
- RNA操作細胞を作製する方法であって、インビトロで転写されたRNA又は合成RNAを細胞に導入するステップを含み、前記RNAは請求項10に記載の核酸分子を含み、前記細胞はT細胞又はNK細胞である、方法。
- 請求項1~9又は14のいずれか一項に記載のT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団、及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
- 有効量の
(a)(i)請求項10に記載の核酸分子
(ii)請求項11に記載のCAR分子、又は
(iii)請求項12または13に記載のベクター、を含む、T細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団;
(b)請求項1~9又は14のいずれか一項に記載のT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団;又は
(c)請求項17に記載の医薬組成物、
を含む医薬組成物であって、対象における抗腫瘍免疫の提供における使用のための、又はBCMAの発現に関連する疾患の処置における使用のための医薬組成物。 - BCMAの発現に関連する前記疾患が、
(i)骨髄形成異常、骨髄異形成症候群又は前白血病の1つ以上から選択される癌若しくは悪性疾患又は前癌状態、
(ii)BCMAの発現に関連する非癌関連適応症、
(iii)血液癌又は固形癌、
(iv)急性白血病、B細胞急性リンパ芽球性白血病(「BALL」)、T細胞急性リンパ芽球性白血病(「TALL」)、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性リンパ球性白血病(CLL)、B細胞前リンパ球性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞新生物、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、小細胞型若しくは大細胞型濾胞性リンパ腫、悪性リンパ球増殖性病態、MALTリンパ腫、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯リンパ腫、多発性骨髄腫、骨髄形成異常及び骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞新生物、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、前立腺癌、膵臓癌、肺癌、形質細胞増殖異常症、意義不明の単クローン性γグロブリン血症(MGUS)、形質細胞腫、全身性アミロイド軽鎖アミロイドーシス若しくはPOEMS症候群(クロウ・深瀬症候群、高月病及びPEP症候群としても知られる)又はそれらの組み合わせから選択される、又は
(v)多発性骨髄腫
である、請求項18に記載の医薬組成物。 - 前記単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団が、第2治療薬と組み合わせて投与するために製剤化される、請求項18又は19に記載の医薬組成物。
- 記第2治療薬が、
(i)PD-1阻害剤;
(ii)PD-L1阻害剤;
(iii)LAG-3阻害剤;
(iv)TIM-3阻害剤;
(v)CTLA-4阻害剤;
(vi)インターロイキン-15(IL-15)ポリペプチド、インターロイキン-15受容体α(IL-15Ra)ポリペプチド又はIL-15ポリペプチドとIL-15Raポリペプチドとの両方の組み合わせ;
(vii)インターロイキン-12(IL-12)ポリペプチド;又は
(viii)mTOR阻害剤、
から選択される、請求項20に記載の医薬組成物。 - (i)前記PD-1阻害剤が、PDR001、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、ピジリズマブ、MEDI0680、REGN2810、TSR-042、PF-06801591及びAMP-224からなる群から選択される;
(ii)前記PD-L1阻害剤が、FAZ053、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ及びBMS-936559からなる群から選択される;
(iii)前記LAG-3阻害剤が、LAG525、BMS-986016、TSR-033、MK-4280及びREGN3767からなる群から選択される;
(iv)前記TIM-3阻害剤がMBG453、TSR-022及びLY3321367からなる群から選択される;
(v)前記CTLA-4阻害剤がイピリムマブ又はトレメリムマブである;
(vi)前記mTOR阻害剤が、RAD001又はラパマイシンである、
請求項21に記載の医薬組成物。 - 対象における抗腫瘍免疫を提供するための医薬、又はBCMAの発現に関連する疾患を処置するための医薬の製造における、有効量の、
(a)(i)請求項10に記載の核酸分子、
(ii)請求項11に記載のCAR分子、または
(iii)請求項12または13に記載のベクター、を含む、T細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団;
(b)請求項1~9又は14のいずれか一項に記載の単離されたT細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団;又は
(c)請求項17に記載の医薬組成物、
の使用。 - BCMAの発現に関連する前記疾患が、
(i)骨髄形成異常、骨髄異形成症候群又は前白血病の1つ以上から選択される癌若しくは悪性疾患又は前癌状態、
(ii)BCMAの発現に関連する非癌関連適応症、
(iii)血液癌又は固形癌、
(iv)急性白血病、B細胞急性リンパ芽球性白血病(「BALL」)、T細胞急性リンパ芽球性白血病(「TALL」)、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性リンパ球性白血病(CLL)、B細胞前リンパ球性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞新生物、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、小細胞型若しくは大細胞型濾胞性リンパ腫、悪性リンパ球増殖性病態、MALTリンパ腫、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯リンパ腫、多発性骨髄腫、骨髄形成異常及び骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞新生物、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、前立腺癌、膵臓癌、肺癌、形質細胞増殖異常症、意義不明の単クローン性γグロブリン血症(MGUS)、形質細胞腫、全身性アミロイド軽鎖アミロイドーシス若しくはPOEMS症候群(クロウ・深瀬症候群、高月病及びPEP症候群としても知られる)又はそれらの組み合わせから選択される、又は
(v)多発性骨髄腫
である、請求項23に記載の使用。 - 前記T細胞若しくはNK細胞、又はT細胞若しくはNK細胞の集団が第2治療薬と組み合わせて投与するために製剤化される、請求項23または24に記載の使用。
- 前記第2治療薬が、
(i)PD-1阻害剤;
(ii)PD-L1阻害剤;
(iii)LAG-3阻害剤;
(iv)TIM-3阻害剤;
(v)CTLA-4阻害剤;
(vi)インターロイキン-15(IL-15)ポリペプチド、インターロイキン-15受容体α(IL-15Ra)ポリペプチド又はIL-15ポリペプチドとIL-15Raポリペプチドとの両方の組み合わせ;
(vii)インターロイキン-12(IL-12)ポリペプチド;又は
(viii)mTOR阻害剤、
から選択される、請求項25に記載の使用。 - (i)前記PD-1阻害剤が、PDR001、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、ピジリズマブ、MEDI0680、REGN2810、TSR-042、PF-06801591及びAMP-224からなる群から選択される;
(ii)前記PD-L1阻害剤が、FAZ053、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ及びBMS-936559からなる群から選択される;
(iii)前記LAG-3阻害剤が、LAG525、BMS-986016、TSR-033、MK-4280及びREGN3767からなる群から選択される;
(iv)前記TIM-3阻害剤がMBG453、TSR-022及びLY3321367からなる群から選択される;
(v)前記CTLA-4阻害剤がイピリムマブ又はトレメリムマブである;
(vi)前記mTOR阻害剤が、RAD001又はラパマイシンである、
請求項26に記載の使用。
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