JP7744004B2 - Fucα1-3GlcNAc構造を検出するための組成物及び方法 - Google Patents
Fucα1-3GlcNAc構造を検出するための組成物及び方法Info
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Description
(Hisタグ融合組換えCLA発現用大腸菌株の作製)
CLA cDNAがコードする翻訳領域の配列情報(配列番号2を参照)をもとにCLAコード合成DNAを設計し、Integrated DNA Technologies社に依頼して作製した。制限酵素認識部位を5’末端に付加したプライマー(Forward primer:NheI付加、Reverse primer:XhoI付加)、及びPrimeSTAR HS DNA Polymerase(タカラバイオ社製)を用いたPCRによりCLAコードDNA断片を増幅した。増幅したDNA断片を制限酵素NheI及びXhoIで処理し、同じく両制限酵素で処理したベクターpET-28a(+)(Merck社)にサブクローニングし、CLA発現用プラスミドpET28a-rCLAを得た。さらにこのpET28a-rCLAを用いて発現用大腸菌SHuffle T7 Express株(New England Biolabs社)を形質転換し、Hisタグ融合組換えCLA発現株pET28a-rCLA/SHuffle T7 Expressを得た。
上記のようにして得られたHisタグ融合組換えCLA(His-rCLA)発現用大腸菌株(pET28a-CLA/SHuffle T7 Express)を3mLのカナマイシン含有LB液体培地に植菌し、37℃で一晩培養した。その後、培養液を250mLのカナマイシン含有LB液体培地に加え、37℃で対数増殖期中期になるまで振盪培養した。OD600が0.5に達したところで、終濃度が0.5mMとなるようにイソプロピルβ-D-1-チオガラクトピラノシド(IPTG)を添加することで発現誘導を開始し、20℃で16時間振盪培養した。これを遠心分離(10000×g、4℃、20min)により集菌し、培養液に対し1/20容の超音波破砕用緩衝液(20mMのリン酸緩衝液(PB)(pH7.4)、500mMのNaCl、20mMのイミダゾール)を添加及び懸濁した後、氷上で冷却しながら超音波破砕を行った。超音波破砕時の条件は「超音波破砕1分-休止1分」のセットを7回行った。破砕処理後、遠心分離(10000×g、4℃、20min)し、上清を可溶性画分とした。
ニッケルキレートカラム(Vt=1mL、His GraviTrap、GEヘルスケア)を同緩衝液10mLで平衡化後、可溶性画分をカラムに添加し、Hisタグ融合組換えレクチンを吸着させた。カラムに非特異的に吸着した夾雑成分を洗浄するため、イミダゾールを150mM含有する緩衝液(20mMのPB(pH7.4)、500mMのNaCl)を用いてカラムを洗浄した。その後、溶出用緩衝液(20mMのPB(pH7.4)、500mMのNaCl、500mMのイミダゾール)を3mL、2mLの順に添加して回収して、精製Hisタグ融合組換えCLAを得た。以下の試験では、CLAとして当該精製Hisタグ融合組換えCLAを用いて行った。
(遠心限外ろ過-HPLC法による糖鎖結合特異性解析)
CLAの糖鎖結合特異性について遠心限外ろ過-HPLC法によって測定した。遠心限外ろ過-HPLC法は、レクチンや糖鎖の固定化を必要とせず、簡便にレクチンと糖鎖間の相互作用を分析可能な手法である。この手法では、レクチンをバッファー中で蛍光標識糖鎖と混合し、遠心限外ろ過によって回収された非結合糖鎖をHPLCによって分離及び定量する。結合活性は、結合糖鎖量と添加糖鎖量の比率で表し、結合糖鎖量は添加糖鎖量から非結合糖鎖量を差し引くことで求められる。レクチンの糖鎖結合特異性は、複数の糖鎖の結合活性を比較することで決定する。以下に具体的な方法及び結果について説明する。
さらに、種々の糖鎖に対するCLAの結合特異性について評価するために、グリカンアレイを行った。グリカンアレイは、糖鎖と生体分子間の相互作用を調べるためのツールであり、一度の試験で複数の糖鎖間との相互作用を分析することができる。原理としては、まず、複数種の糖鎖がスポットされたガラススライドに生体分子を添加し、生体分子と糖鎖を反応させる。その後、蛍光標識された二次抗体を生体分子に結合させ、蛍光標識のシグナルを定量し、糖鎖と生体分子間の結合性の評価を行う。本実施例では、CLAを対象に100種のN-結合型糖鎖、94種のO-結合型糖鎖及び58種のスフィンゴ糖脂質糖鎖との結合活性をグリカンアレイで網羅的に解析した。具体的には図4~図6に示す100種のN-結合型糖鎖を搭載する、Z Biotech社の糖鎖固定化マイクロアレイスライドN-Glycan Array(8-subarray slide)、図7及び図8に示す94種のO-結合型糖鎖を搭載するZ Biotech社の糖鎖固定化マイクロアレイスライドO-Glycan Array及び図9に示す58種のスフィンゴ糖脂質糖鎖を搭載するZ Biotech社の糖鎖固定化マイクロアレイスライドGlycosphingolipid-Glycan Arrayをそれぞれ用いた。以下にその方法及び結果を説明する。
Claims (7)
- CLAレクチンを含むことを特徴とするFucα1-3GlcNAc構造を検出するための組成物。
- 前記CLAレクチンには、標識分子が結合されている請求項1に記載の組成物。
- 試料に対してCLAレクチンを接触させるステップと、
Fucα1-3GlcNAc構造に結合したCLAレクチンを定量するステップと、
前記Fucα1-3GlcNAc構造に結合したCLAレクチンの量が所定の閾値以上である場合に、試料中にFucα1-3GlcNAc構造が存在すると判定するステップとを含む、試料中のFucα1-3GlcNAc構造を検出する方法。 - 前記CLAレクチンには、標識分子が結合されている請求項3に記載の方法。
- 前記定量するステップは、前記CLAレクチンに結合する結合分子と、前記Fucα1-3GlcNAc構造に結合したCLAレクチンとを接触するステップを含む請求項3に記載の方法。
- 前記定量するステップは、前記標識分子に結合する結合分子と、前記Fucα1-3GlcNAc構造に結合したCLAレクチンとを接触するステップを含む請求項4に記載の方法。
- 前記定量するステップは、前記結合分子を定量することによりFucα1-3GlcNAc構造に結合したCLAレクチンを定量するステップを含む請求項5又は6に記載の方法。
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Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| ダナルプラセプテイアンガ,Comparative Biochemical Studis of Lectins from the Green Algal Genus Codium,生物圏科学,51,2012年,P131-132 |
Also Published As
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| JP2023035113A (ja) | 2023-03-13 |
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