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JP6775422B2 - Cd38及びcd3に結合する二重特異性抗体 - Google Patents
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JP6775422B2 - Cd38及びcd3に結合する二重特異性抗体 - Google Patents

Cd38及びcd3に結合する二重特異性抗体 Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、35 U.S.C.§119の下、2014年3月28日出願の米国仮特許出願第61/972,172号、2014年7月7日出願の米国仮特許出願第62/025,974号、及び2014年7月17日出願の米国仮特許出願第62/025,931号に対する優先権を主張し、それらの内容全体が、本参照によって、あらゆる目的に向けて本明細書に組み込まれ、特に、本明細書に概要が記載される図、説明文、及びデータに向けて、本明細書に組み込まれる。
技術分野
本発明は、抗原を同時に共捕捉する新規のイムノグロブリン組成物に関して説明し、当該抗原の両方が、一価で結合される。説明される新規のイムノグロブリンは、ヘテロ二量体Fc領域を利用することが好ましい。新規のイムノグロブリン組成物の使用方法も本明細書で説明され、特に、治療目的のためのものである。
発明の背景
抗体に基づく治療は、癌及び自己免疫疾患/炎症疾患を含む様々な病気の処置に、成功裏に使用されてきた。しかしながら、このクラスの薬物には、依然として改善が必要であり、特に、その臨床的有効性の増進に関して改良が必要である。探索されている1つの手段は、単一イムノグロブリン分子が、2つの異なる抗原を共捕捉するように、追加かつ新規の抗原結合部位を操作し、抗体に基づく薬物にすることである。2つの異なる抗原を捕捉するそのような非天然または代替の抗体形式は、二重特異性体と呼ばれることが多い。抗体可変領域(Fv)の相当な多様性によって、実質的にいかなる分子でもそれを認識するFvを産生することが可能であるため、二重特異性の生成に対する典型的な手法は、新しい可変領域を抗体へ導入することである。
多くの代替抗体形式が、二重特異性ターゲッティングに向けて探索されてきた(Chames & Baty,2009,mAbs 1[6]:1−9、Holliger & Hudson,2005,Nature Biotechnology 23[9]:1126−1136、及びKontermann,2012 MAbs 4(2):182、これらのすべてが、参照によって、本明細書に明確に組み込まれる)。初期には、二重特異性抗体は、それぞれが単一のモノクローナル抗体を産生する2つの細胞株を融合することによって作られた(Milstein et al.,1983,Nature 305:537−540)。得られたハイブリッドのハイブリドーマまたはクアドローマは、二重特異性抗体を確かに産生はしたが、少数集団にすぎず、所望の抗体の単離には、広範な精製が必要であった。これに対する操作的な解決策は、抗体断片を使用して、二重特異性体を作ることであった。そのような断片は、全長抗体の複雑な四次構造を欠いているため、可変軽鎖及び可変重鎖を、単一の遺伝子構築物において連結できる。ダイアボディ、単鎖ダイアボディ、直列型scFv、及びFabの二重特異性体を含む、多くの異なる形態の抗体断片が作成されてきた(Chames & Baty,2009,mAbs 1[6]:1−9、Holliger & Hudson,2005,Nature Biotechnology 23[9]:1126−1136が、参照によって、本明細書に明確に組み込まれる)。こうした形式は、細菌において高水準で発現でき、サイズが小さいため、有利に浸透する利点を有し得るが、一方で、生体内において速やかに減失すると共に、生産及び安定性に関して、製造性上の障壁が存在し得る。こうした弱点の主要な原因は、抗体断片が、それに関連する機能特性を有する抗体の定常領域を通常は欠いていることにあり、当該関連機能特性には、サイズの大型化、高安定性、ならびに血清における長期半減期の維持(すなわち、新生児型Fc受容体であるFcRn)または精製のための結合部位として働く(すなわち、プロテインA及びプロテインG)様々なFc受容体及びFcリガンドへの結合が含まれる。
より最新の研究では、二重である結合を全長抗体様形式へと操作することによって、断片に基づく二重特異性体が有する欠点に対処することが試みられている(Wu et al.,2007,Nature Biotechnology 25[11]:1290−1297、USSN12/477,711、Michaelson et al.,2009,mAbs 1[2]:128−141、PCT/US2008/074693、 Zuo et al.,2000,Protein Engineering 13[5]:361−367、USSN09/865,198、Shen et al.,2006,J Biol Chem 281[16]:10706−10714、Lu et al.,2005,J Biol Chem 280[20]:19665−19672、PCT/US2005/025472、及びKontermann,2012 MAbs 4(2):182、これらはすべて、参照によって、本明細書に明確に組み込まれる)。こうした形式は、抗体断片二重特異性体が有する障壁のいくつかを克服しており、これは、それらがFc領域を含んでいることが主な理由である。こうした形式の1つの重大な弱点は、それらが、ホモ二量体定常鎖に追加で新しい抗原結合部位を構築するため、新しい抗原に対する結合が、常に二価であるということである。
治療用の二重特異性形式において、共標的(co−target)として注目される抗原に向けた所望の結合の多くは、二価というよりもむしろ一価である。多くの免疫受容体では、細胞活性化は、一価の結合相互作用の架橋結合によって達成される。架橋結合の機構は、通常は、抗体/抗原免疫複合体によって媒介されるものであるか、またはエフェクター細胞が、標的細胞へと会合することを介するものである。例えば、FcγRIIa、FcγRIIb、及びFcγRIIIaなどの低親和性Fcガンマ受容体(FcγR)は、抗体Fc領域に一価で結合する。一価の結合は、こうしたFcγRを発現している細胞を活性化しないが、免疫複合体形成または細胞対細胞接触の際は、受容体は、架橋結合され、細胞表面にクラスターを形成し、活性化を引き起こす。例えば、ナチュラルキラー(NK)細胞上のFcγRIIIaのような、細胞殺傷の媒介を担う受容体では、エフェクター細胞が、非常に親和性が高い形式において標的細胞を捕捉するとき、受容体の架橋結合及び細胞の活性化が起こる(Bowles & Weiner,2005,J Immunol Methods 304:88−99が、参照によって、明確に組み込まれる)。同様に、B細胞上で、抑制性受容体であるFcγRIIbは、B細胞活性化の下方制御を行い、これは、FcγRIIbが、細胞表面B細胞受容体(BCR)との免疫複合体へと取り込まれるときのみに起こるものであり、BCRによって認識されるものと同一の抗原と、可溶性IgGのものとの免疫複合体形成によって媒介される機構である(Heyman 2003,Immunol Lett 88[2]:157−161、Smith and Clatworthy,2010,Nature Reviews Immunology 10:328−343が、参照によって、本明細書に明確に組み込まれる)。別の例として、T細胞のCD3活性化は、その関連するT細胞受容体(TCR)が、非常に親和性が高い細胞対細胞シナプスにおいて、抗原提示細胞上の抗原負荷されたMHCを捕捉するときのみに起こる(Kuhns et al.,2006,Immunity 24:133−139)。実際、抗CD3抗体を使用したCD3の非特異的二価架橋結合は、サイトカインの暴発及び毒性を誘発する(Perruche et al.,2009,J Immunol 183[2]:953−61、Chatenoud & Bluestone,2007,Nature Reviews Immunology 7:622−632が、参照によって、明確に組み込まれる)。したがって、実践的な臨床使用に向けた、標的細胞の再配向化殺傷(redirected killing)のためのCD3共会合の好ましいモードは、共捕捉される標的との会合時にのみ活性化をもたらす一価の結合である。
サイクリックADPリボースヒドロラーゼとしても知られるCD38は、長いC末端細胞外ドメイン、及び短いN末端細胞質ドメインを有する2型膜貫通糖タンパク質である。造血細胞の中で、CD38が媒介するシグナル伝達に起因する機能性効果の種別には、リンパ球増殖、サイトカイン放出、B細胞及び骨髄細胞の発生と生存の制御、ならびに樹状細胞の成熟誘導が含まれる。多くの造血器悪性腫瘍、ならびに非ホジキンリンパ腫(NHL)、バーキットリンパ腫(BL)、多発性骨髄腫(MM)、B慢性リンパ性白血病(B−CLL)、B及びT急性リンパ性白血病(ALL)、T細胞リンパ腫(TCL)、急性骨髄性白血病(AML)、ヘアリー細胞白血病(HCL)、ホジキンリンパ腫(HL)、及び慢性骨髄性白血病(CML)を含む様々な造血器悪性腫瘍由来の細胞株において、CD38は、制御されていない。一方で、造血系の原始的な多能性幹細胞のほとんどが、CD38−である。抗癌物質の発見及び開発が、最近、進展しているにもかかわらず、CD38−を発現している腫瘍が関与する癌の形態のほとんどで、依然として予後は、不良である。したがって、癌のそのような形態を処置するための方法の改善が必要である。
したがって、抗体断片から生成された二重特異性体は、生物物理学的及び薬物動態学的なハードルに直面している上に、全長抗体様形式で構築されたこれらの弱点は、一次標的抗原が存在しない状態において、共標的抗原を多価で捕捉し、非特異的な活性化及び潜在的毒性を引き起こすことである。本発明は、この問題を、明確に異なる標的抗原の共会合を可能にする新規の二重特異性形式を導入することによって解決する。
Chames & Baty,2009,mAbs 1[6]:1−9 Holliger & Hudson,2005,Nature Biotechnology 23[9]:1126−1136 Kontermann,2012 MAbs 4(2):182 Milstein et al.,1983,Nature 305:537−540 Wu et al.,2007,Nature Biotechnology 25[11]:1290−1297 Michaelson et al.,2009,mAbs 1[2]:128−141 Zuo et al.,2000,Protein Engineering 13[5]:361−367 Shen et al.,2006,J Biol Chem 281[16]:10706−10714 Lu et al.,2005,J Biol Chem 280[20]:19665−19672 Kontermann,2012 MAbs 4(2):182 Bowles & Weiner,2005,J Immunol Methods 304:88−99 Heyman 2003,Immunol Lett 88[2]:157−161 Smith and Clatworthy,2010,Nature Reviews Immunology 10:328−343 Kuhns et al.,2006,Immunity 24:133−139 Perruche et al.,2009,J Immunol 183[2]:953−61 Chatenoud & Bluestone,2007,Nature Reviews Immunology 7:622−632
したがって、本発明は、CD3及びCD38に結合するヘテロ二量体抗体を提供する。ヘテロ二量体抗体は、第一可変Fcドメイン、及びCD3に結合する単鎖Fv領域(scFv)を含む第一重鎖を含む。ヘテロ二量体抗体は、第二Fc可変Fcドメイン、及び第一可変重ドメイン(first variable heavy domain)を含む第二重鎖も含む。ヘテロ二量体抗体は、第一可変軽ドメイン(first variable light domain)、及び第一定常軽ドメイン(first constant light domain)を含む第一軽鎖をさらに含み、ここで、当該第一可変重ドメイン、及び当該第一可変軽ドメインは、CD38に結合する。
さらなる態様では、本発明は、XENP13243、XENP13545、XENP13546、XENP13547、XENP13548、XENP13549、XENP13550、XENP13551、XENP13544、XENP13752、XENP13753、XENP13754、XENP13756、XENP13757、及びXENP13694からなる群から選択されるヘテロ二量体抗体を提供する。
追加の態様では、scFvは、Xaa1が、N、SまたはH(配列識別番号435)である配列T−Y−A−M−Xaa1を有するvhCDR1、Xaa1が、YまたはA、Xaa2が、NまたはS、Xaa3が、YまたはA、及びXaa4が、DまたはA(配列識別番号436)である配列R−I−R−S−K−Xaa1−N−Xaa2−Y−A−T−Xaa3−Y−Y−A−Xaa4−S−V−K−Gを有するvhCDR2、Xaa1が、N、D、またはQ、及びXaa2が、AまたはD(配列識別番号437)である配列H−G−N−F−G−Xaa1−S−Y−V−S−W−F−Xaa2−Yを有するvhCDR3、Xaa1が、G、R、またはK、Xaa2が、TまたはS、Xaa3が、SまたはG、及びXaa4が、NまたはH(配列識別番号438)である配列Xaa1−S−S−T−G−A−V−T−Xaa2−Xaa3−Xaa4−Y−A−Nを有するvlCDR1、Xaa1が、GまたはD、Xaa2が、KまたはN、及びXaa3が、PまたはS(配列識別番号439)である配列Xaa1−T−N−Xaa2−R−A−Xaa3を有するvlCDR2、ならびにXaa1が、AまたはL、及びXaa2が、LまたはH(配列識別番号440)である配列Xaa1−L−W−Y−S−N−Xaa2−W−Vを有するvlCDR3を含む配列を有する。
さらなる態様では、scFvは、H1.30_L1.47、H1.33_L1.47、及びH1.31_L1.47からなる群から選択される。
追加の態様では、抗CD3可変領域は、
a)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
b)配列識別番号412を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
c)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号414を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
d)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号417を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
e)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号418を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
f)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号421を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
g)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号422を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
h)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号427を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
i)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号428を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
j)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号431を有するvlCDR3を含む配列と、
k)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
l)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号423を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号432を有するvlCDR3を含む配列と、
m)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号424を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号432を有するvlCDR3を含む配列と、
n)配列識別番号412を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号417を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
o)配列識別番号412を有するvhCDR1、配列識別番号414を有するvhCDR2、配列識別番号419を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
p)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号415を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
q)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号415を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
r)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号417を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
s)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号419を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
t)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号417を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号433を有するvlCDR3を含む配列と、
u)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号433を有するvlCDR3を含む配列と、
v)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号434を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
からなる群から選択される配列を有する。
追加の態様では、抗CD3可変領域は、
配列識別番号5及び6、配列識別番号9及び10、配列識別番号13及び14、配列識別番号17及び18、配列識別番号21及び22、配列識別番号25及び26、配列識別番号29及び30、配列識別番号33及び34、配列識別番号37及び38、配列識別番号41及び42、配列識別番号45及び46、配列識別番号49及び50、配列識別番号53及び54、配列識別番号57及び58、配列識別番号61及び62、配列識別番号65及び66、配列識別番号69及び70、配列識別番号73及び74、配列識別番号77及び78、配列識別番号81及び82、配列識別番号85及び86、配列識別番号89及び90、配列識別番号93及び94、配列識別番号97及び98、配列識別番号101及び102、配列識別番号105及び106、配列識別番号109及び110、配列識別番号113及び114、配列識別番号117及び118、配列識別番号121及び122、配列識別番号125及び126、配列識別番号129及び130、配列識別番号133及び134、配列識別番号137及び138、配列識別番号141及び142、配列識別番号145及び146、配列識別番号149及び150、配列識別番号153及び154、配列識別番号157及び158、配列識別番号161及び162、配列識別番号165及び166、配列識別番号169及び170、配列識別番号173及び174、配列識別番号177及び178、配列識別番号181及び182、配列識別番号185及び186、配列識別番号189及び190、配列識別番号193及び194、配列識別番号197及び198、配列識別番号201及び202、配列識別番号205及び206、配列識別番号209及び210、配列識別番号213及び214、配列識別番号217及び218、配列識別番号221及び222、配列識別番号225及び226、配列識別番号229及び230、配列識別番号233及び234、配列識別番号237及び238、配列識別番号241及び242、配列識別番号245及び246、配列識別番号249及び250、配列識別番号253及び254、配列識別番号257及び258、配列識別番号261及び262、配列識別番号265及び266、配列識別番号269及び270、配列識別番号273及び274、配列識別番号277及び278、配列識別番号281及び282、配列識別番号285及び286、配列識別番号289及び290、配列識別番号293及び294、配列識別番号297及び298、配列識別番号301及び302、配列識別番号305及び306、配列識別番号309及び310、配列識別番号313及び314、配列識別番号317及び318、配列識別番号321及び322、配列識別番号325及び326、配列識別番号329及び330、配列識別番号333及び334、配列識別番号337及び338、配列識別番号341及び342、配列識別番号345及び346、配列識別番号349及び350、配列識別番号353及び354、配列識別番号357及び358、配列識別番号361及び362、配列識別番号365及び366、配列識別番号369及び370、配列識別番号373及び374、配列識別番号377及び378、配列識別番号381及び382、配列識別番号385及び386、配列識別番号389及び390、配列識別番号393及び394、配列識別番号397及び398、配列識別番号401及び402、配列識別番号405及び406、配列識別番号409及び410からなる群から選択される可変重領域及び可変軽領域を含む。
追加の態様では、ヘテロ二量体抗体は、H1及びL1と、H1及びL1.24と、H1及びL1.96と、H1.77及びL1.96と、H1.77及びL1.97と、H1.72及びL1.97と、H1.71及びL1.96と、H1.77及びL1.24と、からなる対から選択される第一可変重ドメイン及び第一可変軽ドメインを有する。
さらなる態様では、本発明は、上記のヘテロ二量体抗体を提供し、scFvは、荷電scFvリンカーを有する。荷電scFvリンカーは、3〜8の正の電荷を有し得、配列識別番号s443〜451からなる群から選択される。
追加の態様では、scFvは、配列識別番号4、配列識別番号8、配列識別番号12、配列識別番号16、配列識別番号20、配列識別番号24、配列識別番号28、配列識別番号32、配列識別番号36、配列識別番号40、配列識別番号44、配列識別番号48、配列識別番号52、配列識別番号56、配列識別番号60、配列識別番号64、配列識別番号68、配列識別番号72、配列識別番号76、配列識別番号80、配列識別番号84、配列識別番号88、配列識別番号92、配列識別番号96、配列識別番号100、配列識別番号104、配列識別番号108、配列識別番号112、配列識別番号116、配列識別番号120、配列識別番号124、配列識別番号128、配列識別番号132、配列識別番号136、配列識別番号140、配列識別番号144、配列識別番号148、配列識別番号152、配列識別番号156、配列識別番号160、配列識別番号164、配列識別番号168、配列識別番号172、配列識別番号176、配列識別番号180、配列識別番号184、配列識別番号188、配列識別番号192、配列識別番号196、配列識別番号200、配列識別番号204、配列識別番号208、配列識別番号212、配列識別番号216、配列識別番号220、配列識別番号224、配列識別番号228、配列識別番号232、配列識別番号236、配列識別番号240、配列識別番号244、配列識別番号248、配列識別番号252、配列識別番号256、配列識別番号260、配列識別番号264、配列識別番号268、配列識別番号272、配列識別番号276、配列識別番号280、配列識別番号284、配列識別番号288、配列識別番号292、配列識別番号296、配列識別番号300、配列識別番号304、配列識別番号308、配列識別番号312、配列識別番号316、配列識別番号320、配列識別番号324、配列識別番号328、配列識別番号332、配列識別番号336、配列識別番号340、配列識別番号344、配列識別番号348、配列識別番号352、配列識別番号356、配列識別番号360、配列識別番号364、配列識別番号368、配列識別番号372、配列識別番号376、配列識別番号380、配列識別番号384、配列識別番号388、配列識別番号392、配列識別番号396、配列識別番号400、配列識別番号404、配列識別番号408からなる群から選択される配列を有する。
さらなる態様では、重鎖のFc領域は、FcRn変異体をさらに含み、限定はされないが、428L/434Sが含まれる。
さらなる態様では、本発明は、Fc領域及びCD3に結合するscFvを含む第一重鎖をコードする第一核酸と、重定常鎖及び重可変鎖を含む第二重鎖をコードする第二核酸と、軽鎖をコードする第三核酸と、を含む核酸組成物を提供し、第二重鎖及び軽鎖のFv領域は、CD38に結合する。こうした核酸は、異なる発現ベクターまたは同一のものに存在し得る。本発明は、核酸組成物を含む宿主細胞を提供する。
さらなる態様では、本発明は、本発明の二量体抗体の産生方法を提供し、当該方法は、第一Fcドメイン及び第一可変重鎖を含む第一重鎖をコードする第一核酸を含む第一発現ベクターの提供と、第一Fcドメイン及びCD3に結合する単鎖Fv領域(scFv)を含む第二重鎖をコードする第二核酸を含む第二発現ベクターの提供と、軽鎖を含む核酸を含む第三発現ベクターの提供と、を含み、当該第一可変重鎖及び当該軽鎖の可変軽ドメインは、CD38に結合する。第一、第二、及び第三発現ベクターは、1:1.5:1.5、1:2:1.5、1:0.667:2、1:1:2、1:1.5:2、及び1:2:2からなる群から選択される比で、宿主細胞へトランスフェクトされる。宿主細胞において、第一、第二、及び第三核酸は、第一、第二、及び第三アミノ酸配列をそれぞれ産生し、その結果、当該第一、第二、及び第三アミノ酸配列は、ヘテロ二量体抗体を形成する。
追加の態様では、本発明は、本発明によるヘテロ二量体抗体の投与によって、その必要がある患者の処置方法を提供する。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される:
(項目1)
a)i)第一可変Fcドメインと、
ii)CD3に結合する単鎖Fv領域(scFv)と、
を含む第一重鎖と、
b)i)第二Fc可変Fcドメインと、
ii)第一可変重ドメインと、
を含む第二重鎖と、
c)第一可変軽ドメイン及び第一定常軽ドメインを含む第一軽鎖と、
を含むヘテロ二量体抗体であって、
前記第一可変重ドメイン及び前記第一可変軽ドメインが、CD38に結合する、前記ヘテロ二量体抗体。
(項目2)
前記ヘテロ二量体抗体が、XENP13551であって、前記第一重鎖、前記第二重鎖、及び前記第一軽鎖が、図20または図22に示される配列を有する、項目1に記載のヘテロ二量体抗体。
(項目3)
前記scFvが、配列T−Y−A−M−Xaa1であって、Xaa1が、N、SまたはH(配列識別番号435)である前記配列T−Y−A−M−Xaa1を有するvhCDR1、配列R−I−R−S−K−Xaa1−N−Xaa2−Y−A−T−Xaa3−Y−Y−A−Xaa4−S−V−K−Gであって、Xaa1が、YまたはA、Xaa2が、NまたはS、Xaa3が、YまたはA、及びXaa4が、DまたはA(配列識別番号436)である前記配列R−I−R−S−K−Xaa1−N−Xaa2−Y−A−T−Xaa3−Y−Y−A−Xaa4−S−V−K−Gを有するvhCDR2、配列H−G−N−F−G−Xaa1−S−Y−V−S−W−F−Xaa2−Yであって、Xaa1が、N、D、またはQ、及びXaa2が、AまたはD(配列識別番号437)である前記配列H−G−N−F−G−Xaa1−S−Y−V−S−W−F−Xaa2−Yを有するvhCDR3、配列Xaa1−S−S−T−G−A−V−T−Xaa2−Xaa3−Xaa4−Y−A−Nであって、Xaa1が、G、R、またはK、Xaa2が、TまたはS、Xaa3が、SまたはG、及びXaa4が、NまたはH(配列識別番号438)である前記配列Xaa1−S−S−T−G−A−V−T−Xaa2−Xaa3−Xaa4−Y−A−Nを有するvlCDR1、配列Xaa1−T−N−Xaa2−R−A−Xaa3であって、Xaa1が、GまたはD、Xaa2が、KまたはN、及びXaa3が、PまたはS(配列識別番号439)である前記配列Xaa1−T−N−Xaa2−R−A−Xaa3を有するvlCDR2、ならびに配列Xaa1−L−W−Y−S−N−Xaa2−W−Vであって、Xaa1が、AまたはL、及びXaa2が、LまたはH(配列識別番号440)である前記配列Xaa1−L−W−Y−S−N−Xaa2−W−Vを有するvlCDR3を含む配列を有する、項目1に記載のヘテロ二量体抗体。
(項目4)
前記scFvが、H1.30_L1.47、H1.33_L1.47、及びH1.31_L1.47からなる群から選択される、項目1〜3のいずれかに記載の組成物。
(項目5)
前記抗CD3可変領域が、
a)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
b)配列識別番号412を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
c)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号414を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
d)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号417を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
e)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号418を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
f)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号421を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
g)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号422を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
h)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号427を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
i)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号428を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
j)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号431を有するvlCDR3を含む配列と、
k)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
l)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号423を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号432を有するvlCDR3を含む配列と、
m)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号424を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号432を有するvlCDR3を含む配列と、
n)配列識別番号412を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号417を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
o)配列識別番号412を有するvhCDR1、配列識別番号414を有するvhCDR2、配列識別番号419を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
p)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号415を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
q)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号415を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
r)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号417を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
s)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号419を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
t)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号417を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号433を有するvlCDR3を含む配列と、
u)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号413を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号433を有するvlCDR3を含む配列と、
v)配列識別番号411を有するvhCDR1、配列識別番号434を有するvhCDR2、配列識別番号416を有するvhCDR3、配列識別番号420を有するvlCDR1、配列識別番号425を有するvlCDR2、及び配列識別番号430を有するvlCDR3を含む配列と、
からなる群から選択される配列を有する、項目1または3に記載の組成物。
(項目6)
前記第一可変重ドメイン及び前記第一可変軽ドメインが、H1及びL1と、H1及びL1.24と、H1及びL1.96と、H1.77及びL1.96と、H1.77及びL1.97と、H1.72及びL1.97と、H1.71及びL1.96と、H1.77及びL1.24と、からなる対から選択される、項目1〜5のいずれかに記載のヘテロ二量体抗体。
(項目7)
前記scFvが、荷電scFvリンカーを有する、項目1〜6のいずれかに記載のヘテロ二量体抗体。
(項目8)
前記抗CD3可変領域が、
配列識別番号5及び6、配列識別番号9及び10、配列識別番号13及び14、配列識別番号17及び18、配列識別番号21及び22、配列識別番号25及び26、配列識別番号29及び30、配列識別番号33及び34、配列識別番号37及び38、配列識別番号41及び42、配列識別番号45及び46、配列識別番号49及び50、配列識別番号53及び54、配列識別番号57及び58、配列識別番号61及び62、配列識別番号65及び66、配列識別番号69及び70、配列識別番号73及び74、配列識別番号77及び78、配列識別番号81及び82、配列識別番号85及び86、配列識別番号89及び90、配列識別番号93及び94、配列識別番号97及び98、配列識別番号101及び102、配列識別番号105及び106、配列識別番号109及び110、配列識別番号113及び114、配列識別番号117及び118、配列識別番号121及び122、配列識別番号125及び126、配列識別番号129及び130、配列識別番号133及び134、配列識別番号137及び138、配列識別番号141及び142、配列識別番号145及び146、配列識別番号149及び150、配列識別番号153及び154、配列識別番号157及び158、配列識別番号161及び162、配列識別番号165及び166、配列識別番号169及び170、配列識別番号173及び174、配列識別番号177及び178、配列識別番号181及び182、配列識別番号185及び186、配列識別番号189及び190、配列識別番号193及び194、配列識別番号197及び198、配列識別番号201及び202、配列識別番号205及び206、配列識別番号209及び210、配列識別番号213及び214、配列識別番号217及び218、配列識別番号221及び222、配列識別番号225及び226、配列識別番号229及び230、配列識別番号233及び234、配列識別番号237及び238、配列識別番号241及び242、配列識別番号245及び246、配列識別番号249及び250、配列識別番号253及び254、配列識別番号257及び258、配列識別番号261及び262、配列識別番号265及び266、配列識別番号269及び270、配列識別番号273及び274、配列識別番号277及び278、配列識別番号281及び282、配列識別番号285及び286、配列識別番号289及び290、配列識別番号293及び294、配列識別番号297及び298、配列識別番号301及び302、配列識別番号305及び306、配列識別番号309及び310、配列識別番号313及び314、配列識別番号317及び318、配列識別番号321及び322、配列識別番号325及び326、配列識別番号329及び330、配列識別番号333及び334、配列識別番号337及び338、配列識別番号341及び342、配列識別番号345及び346、配列識別番号349及び350、配列識別番号353及び354、配列識別番号357及び358、配列識別番号361及び362、配列識別番号365及び366、配列識別番号369及び370、配列識別番号373及び374、配列識別番号377及び378、配列識別番号381及び382、配列識別番号385及び386、配列識別番号389及び390、配列識別番号393及び394、配列識別番号397及び398、配列識別番号401及び402、配列識別番号405及び406、配列識別番号409及び410からなる群から選択される可変重領域及び可変軽領域を含む、項目1〜6のいずれかに記載の組成物。
(項目9)
荷電scFvリンカーが、3〜8の正電荷を有し、配列識別番号443〜451からなる群から選択される、項目7に記載の組成物。
(項目10)
前記scFvが、配列識別番号4、配列識別番号8、配列識別番号12、配列識別番号16、配列識別番号20、配列識別番号24、配列識別番号28、配列識別番号32、配列識別番号36、配列識別番号40、配列識別番号44、配列識別番号48、配列識別番号52、配列識別番号56、配列識別番号60、配列識別番号64、配列識別番号68、配列識別番号72、配列識別番号76、配列識別番号80、配列識別番号84、配列識別番号88、配列識別番号92、配列識別番号96、配列識別番号100、配列識別番号104、配列識別番号108、配列識別番号112、配列識別番号116、配列識別番号120、配列識別番号124、配列識別番号128、配列識別番号132、配列識別番号136、配列識別番号140、配列識別番号144、配列識別番号148、配列識別番号152、配列識別番号156、配列識別番号160、配列識別番号164、配列識別番号168、配列識別番号172、配列識別番号176、配列識別番号180、配列識別番号184、配列識別番号188、配列識別番号192、配列識別番号196、配列識別番号200、配列識別番号204、配列識別番号208、配列識別番号212、配列識別番号216、配列識別番号220、配列識別番号224、配列識別番号228、配列識別番号232、配列識別番号236、配列識別番号240、配列識別番号244、配列識別番号248、配列識別番号252、配列識別番号256、配列識別番号260、配列識別番号264、配列識別番号268、配列識別番号272、配列識別番号276、配列識別番号280、配列識別番号284、配列識別番号288、配列識別番号292、配列識別番号296、配列識別番号300、配列識別番号304、配列識別番号308、配列識別番号312、配列識別番号316、配列識別番号320、配列識別番号324、配列識別番号328、配列識別番号332、配列識別番号336、配列識別番号340、配列識別番号344、配列識別番号348、配列識別番号352、配列識別番号356、配列識別番号360、配列識別番号364、配列識別番号368、配列識別番号372、配列識別番号376、配列識別番号380、配列識別番号384、配列識別番号388、配列識別番号392、配列識別番号396、配列識別番号400、配列識別番号404、配列識別番号408からなる群から選択される配列を有する、項目1〜9のいずれかに記載の組成物。
(項目11)
前記scFvが、配列識別番号396の配列を有する、項目2に記載の組成物。
(項目12)
XENP13243、XENP13545、XENP13546、XENP13547、XENP13548、XENP13549、XENP13550、XENP13551、XENP13544、XENP13752、XENP13753、XENP13754、XENP13756、XENP13757、及びXENP13694からなる群から選択される、項目1〜11のいずれかに記載のヘテロ二量体抗体。
(項目13)
前記重鎖のFc領域が、FcRn変異体をさらに含む、項目1〜12のいずれかに記載のヘテロ二量体抗体。
(項目14)
前記変異体が、428L/434Sである、項目13に記載のヘテロ二量体抗体。
(項目15)
a)項目1に記載の第一重鎖をコードする第一核酸と、
b)項目1に記載の第二重鎖をコードする第二核酸と、
c)前記軽鎖をコードする第三核酸と、
を含む、核酸組成物。
(項目16)
a)項目1に記載の第一重鎖をコードする第一核酸を含む第一発現ベクターと、
b)項目1に記載の第二重鎖をコードする第二核酸を含む第二発現ベクターと、
c)前記軽鎖をコードする第三核酸を含む第三発現ベクターと、
を含む、核酸組成物。
(項目17)
項目15に記載の核酸組成物を含む、宿主細胞。
(項目18)
項目16からなる核酸を含む、宿主細胞。
(項目19)
a)i)第一Fcドメインと、
ii)第一可変重鎖と、
を含む第一重鎖をコードする第一核酸を含む第一発現ベクターの供給と、
b)i)第一Fcドメインと、
ii)CD3に結合する単鎖Fv領域(scFv)と、
を含む第二重鎖をコードする第二核酸を含む第二発現ベクターの供給と、
c)軽鎖を含む核酸を含む第三発現ベクターの供給と、
を含む、項目1〜14のいずれかに記載のヘテロ二量体抗体の産生方法であって、
前記第一可変重鎖及び前記軽鎖の可変軽ドメインが、CD38に結合し、
d)前記第一、第二、及び第三発現ベクターが、1:1.5:1.5、1:2:1.5、1:0.667:2、1:1:2、1:1.5:2、及び1:2:2からなる群から選択される比で、宿主細胞にトランスフェクトされ、
e)前記宿主細胞において、前記第一、第二、及び第三核酸を発現し、それぞれが第一、第二、及び第三アミノ酸配列を産生し、その結果、前記第一、第二、及び第三アミノ酸配列が、前記ヘテロ二量体抗体を形成する、
前記産生方法。
(項目20)
項目1〜14のいずれかに記載のヘテロ二量体抗体の投与による、必要とする患者の処置方法。
図1A及び図1Bは、ヒトCD38の配列を示す。図1Aは、全長配列を示し、図1Bは、細胞外ドメインを示す。 図1A及び図1Bは、ヒトCD38の配列を示す。図1Aは、全長配列を示し、図1Bは、細胞外ドメインを示す。 ヒトCD3の配列を示す。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light 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sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図3A〜図3YYは、安定性が最適化されたヒト化抗CD3変異体scFv配列、可変重配列(variable heavy sequence)、及び可変軽配列(variable light sequence)のアミノ酸配列を示す。(1番目の配列は、精製を容易にするためにヒスチジンタグを有する型であることにも留意されたい)。CDRには、下線が引かれている。最適化可変鎖及び最適化軽鎖(ならびにscFv鎖)の安定性の増加は、フレームワーク領域及びCDRに帰属し得ることを理解されるべきである。したがって、全体可変領域の開示は、別々に番号付けされていないが、フレームワーク領域の開示を含むと理解されるべきである。さらに、scFvリンカーは、グレーで示される。それぞれのscFvリンカーは、図5に示される荷電scFvリンカーで置き換えることができる。すなわち、正であっても、負であっても、図5に示すものを含めて、何らかの荷電scFvリンカーで、図3A〜図3YY中で強調されている領域を、置換することができる。 図4A〜図4Iは、本発明及びコンセンサスCDRにおいて有用である、CD3のvhCDR1−3配列及びvlCDR1−3配列のすべての照合を示す。 図4A〜図4Iは、本発明及びコンセンサスCDRにおいて有用である、CD3のvhCDR1−3配列及びvlCDR1−3配列のすべての照合を示す。 図4A〜図4Iは、本発明及びコンセンサスCDRにおいて有用である、CD3のvhCDR1−3配列及びvlCDR1−3配列のすべての照合を示す。 図4A〜図4Iは、本発明及びコンセンサスCDRにおいて有用である、CD3のvhCDR1−3配列及びvlCDR1−3配列のすべての照合を示す。 図4A〜図4Iは、本発明及びコンセンサスCDRにおいて有用である、CD3のvhCDR1−3配列及びvlCDR1−3配列のすべての照合を示す。 図4A〜図4Iは、本発明及びコンセンサスCDRにおいて有用である、CD3のvhCDR1−3配列及びvlCDR1−3配列のすべての照合を示す。 図4A〜図4Iは、本発明及びコンセンサスCDRにおいて有用である、CD3のvhCDR1−3配列及びvlCDR1−3配列のすべての照合を示す。 図4A〜図4Iは、本発明及びコンセンサスCDRにおいて有用である、CD3のvhCDR1−3配列及びvlCDR1−3配列のすべての照合を示す。 図4A〜図4Iは、本発明及びコンセンサスCDRにおいて有用である、CD3のvhCDR1−3配列及びvlCDR1−3配列のすべての照合を示す。 適した正荷電または負荷電のscFvリンカーを示す。単一電荷を有する、単一の先行技術scFvリンカーは、Whitlow et al.,Protein Engineering 6(8):989−995(1993)にちなんで、「Whitlow」と呼ばれる。このリンカーは、scFvにおいて、凝集の低減、及びタンパク質分解に対する安定性の増進に向けて使用されることに留意されたい。 図6A、図6B、図6C、及び図6Dは、新規の立体変異体(steric variant)を示す。当業者によって理解されるように、それぞれの表の第一列は、「対応する」単量体の対を表し、すなわち、単量体1は、405Aを有し、対応する立体変異体は、394Fである。非対称の三重F形式の構成においては、いずれかの単量体が、いずれかの変異体を有し得ることに留意することが重要である。すなわち、scFv単量体は、単量体1または単量体2であり得る。かさねて、こうしたセットは、「鎖性(strandedness)」が、幾分か維持される限り、他の立体変異体、ならびに電荷対、アイソタイプ変異体、等比体積変異体(isosteric variant)、pI変異体等を含む他のヘテロ二量体化変異体と、任意選択かつ独立に組み合わせることができる。さらに、「単量体」は、Fcドメインを指し、すなわち、三重F形式においては、Fab構築物(重鎖及び軽鎖)を含む2つのアミノ酸配列が実際は存在するという事実にもかかわらず、一方の単量体は、scFv構築物であり、もう一方の単量体は、Fab構築物である。本発明において使用される、多くの適した立体または「歪曲(skew)」変異体を示す。図a6は、単独またはpI変異体と組み合わせて使用できる多くの立体変異体を示す(図6に示す変異体のすべてにあてはまる)が、pI変異体が存在するのであれば、pI変異体及び立体変異体の「鎖性」は、維持されるべきであることは、当業者によって理解されよう。すなわち、例えば、pI変異体であるS364K/E357Q(単量体1)及びL368D/K370S(単量体2)を、図29Cの変異体と組み合わせることになるのであれば、立体変異体のpIが考慮され、正しい単量体に割り当てられるべきである。すなわち、電荷を変える立体変異体、例えば、(T411E)は、「負の」単量体に加えられる。 図6A、図6B、図6C、及び図6Dは、新規の立体変異体(steric variant)を示す。当業者によって理解されるように、それぞれの表の第一列は、「対応する」単量体の対を表し、すなわち、単量体1は、405Aを有し、対応する立体変異体は、394Fである。非対称の三重F形式の構成においては、いずれかの単量体が、いずれかの変異体を有し得ることに留意することが重要である。すなわち、scFv単量体は、単量体1または単量体2であり得る。かさねて、こうしたセットは、「鎖性(strandedness)」が、幾分か維持される限り、他の立体変異体、ならびに電荷対、アイソタイプ変異体、等比体積変異体(isosteric variant)、pI変異体等を含む他のヘテロ二量体化変異体と、任意選択かつ独立に組み合わせることができる。さらに、「単量体」は、Fcドメインを指し、すなわち、三重F形式においては、Fab構築物(重鎖及び軽鎖)を含む2つのアミノ酸配列が実際は存在するという事実にもかかわらず、一方の単量体は、scFv構築物であり、もう一方の単量体は、Fab構築物である。本発明において使用される、多くの適した立体または「歪曲(skew)」変異体を示す。図a6は、単独またはpI変異体と組み合わせて使用できる多くの立体変異体を示す(図6に示す変異体のすべてにあてはまる)が、pI変異体が存在するのであれば、pI変異体及び立体変異体の「鎖性」は、維持されるべきであることは、当業者によって理解されよう。すなわち、例えば、pI変異体であるS364K/E357Q(単量体1)及びL368D/K370S(単量体2)を、図29Cの変異体と組み合わせることになるのであれば、立体変異体のpIが考慮され、正しい単量体に割り当てられるべきである。すなわち、電荷を変える立体変異体、例えば、(T411E)は、「負の」単量体に加えられる。 図6A、図6B、図6C、及び図6Dは、新規の立体変異体(steric variant)を示す。当業者によって理解されるように、それぞれの表の第一列は、「対応する」単量体の対を表し、すなわち、単量体1は、405Aを有し、対応する立体変異体は、394Fである。非対称の三重F形式の構成においては、いずれかの単量体が、いずれかの変異体を有し得ることに留意することが重要である。すなわち、scFv単量体は、単量体1または単量体2であり得る。かさねて、こうしたセットは、「鎖性(strandedness)」が、幾分か維持される限り、他の立体変異体、ならびに電荷対、アイソタイプ変異体、等比体積変異体(isosteric variant)、pI変異体等を含む他のヘテロ二量体化変異体と、任意選択かつ独立に組み合わせることができる。さらに、「単量体」は、Fcドメインを指し、すなわち、三重F形式においては、Fab構築物(重鎖及び軽鎖)を含む2つのアミノ酸配列が実際は存在するという事実にもかかわらず、一方の単量体は、scFv構築物であり、もう一方の単量体は、Fab構築物である。本発明において使用される、多くの適した立体または「歪曲(skew)」変異体を示す。図a6は、単独またはpI変異体と組み合わせて使用できる多くの立体変異体を示す(図6に示す変異体のすべてにあてはまる)が、pI変異体が存在するのであれば、pI変異体及び立体変異体の「鎖性」は、維持されるべきであることは、当業者によって理解されよう。すなわち、例えば、pI変異体であるS364K/E357Q(単量体1)及びL368D/K370S(単量体2)を、図29Cの変異体と組み合わせることになるのであれば、立体変異体のpIが考慮され、正しい単量体に割り当てられるべきである。すなわち、電荷を変える立体変異体、例えば、(T411E)は、「負の」単量体に加えられる。 図6A、図6B、図6C、及び図6Dは、新規の立体変異体(steric variant)を示す。当業者によって理解されるように、それぞれの表の第一列は、「対応する」単量体の対を表し、すなわち、単量体1は、405Aを有し、対応する立体変異体は、394Fである。非対称の三重F形式の構成においては、いずれかの単量体が、いずれかの変異体を有し得ることに留意することが重要である。すなわち、scFv単量体は、単量体1または単量体2であり得る。かさねて、こうしたセットは、「鎖性(strandedness)」が、幾分か維持される限り、他の立体変異体、ならびに電荷対、アイソタイプ変異体、等比体積変異体(isosteric variant)、pI変異体等を含む他のヘテロ二量体化変異体と、任意選択かつ独立に組み合わせることができる。さらに、「単量体」は、Fcドメインを指し、すなわち、三重F形式においては、Fab構築物(重鎖及び軽鎖)を含む2つのアミノ酸配列が実際は存在するという事実にもかかわらず、一方の単量体は、scFv構築物であり、もう一方の単量体は、Fab構築物である。本発明において使用される、多くの適した立体または「歪曲(skew)」変異体を示す。図a6は、単独またはpI変異体と組み合わせて使用できる多くの立体変異体を示す(図6に示す変異体のすべてにあてはまる)が、pI変異体が存在するのであれば、pI変異体及び立体変異体の「鎖性」は、維持されるべきであることは、当業者によって理解されよう。すなわち、例えば、pI変異体であるS364K/E357Q(単量体1)及びL368D/K370S(単量体2)を、図29Cの変異体と組み合わせることになるのであれば、立体変異体のpIが考慮され、正しい単量体に割り当てられるべきである。すなわち、電荷を変える立体変異体、例えば、(T411E)は、「負の」単量体に加えられる。 操作されたヘテロ二量体歪曲(例えば、「立体ヘテロ二量体化」)Fc変異体の一覧を、ヘテロ二量体の収率(HPLC−CIEXにより決定)及び熱安定性(DSCにより決定)と共に示す。未決定の熱安定性は、「n.d.」と示される。 図8A〜図8C。二重特異性イムノグロブリン向けの「三重F」形式の図。図8Aは、scFv−Fc形式を示す。図8Cは、より標準的な二重特異性形式であり、本発明のpI変異体(及び任意選択かつ独立に他のヘテロ二量体化変異体)も利用するものである。図8Bは、「三重F」形式を示す(「ボトルオープナー(bottle−opener)」立体配置とも呼ばれることがあり、(任意選択かつ独立に他の二量体化変異体を利用する)。本明細書に記載される実施形態の多くが、二重特異性抗体の抗CD3成分をscFvとして、抗CD38成分をFab断片として有するが、これらは、荷電リンカーを任意選択で有する、scFvである抗CD38成分、及び本明細書でFab断片へと再操作される抗CD3配列のscFvのFv領域と、交換してよいことは、当業者によって理解されよう。 FcγR受容体のいくつか、またはすべてに対する結合の低減に適した多くの「ノックアウト」(「KO」)変異体を示す。こうしたKO変異体は、図9で説明されるセット内のもの、ならびに立体変異体及びpI変異体を含む、本明細書に概要が記載されるいずれかのヘテロ二量体化変異体のどちらとでも独立かつ任意選択で組み合わせることができ、これは、本明細書に記載される変異体のすべてにではないが、その多くにあてはまることである。例えば、E233P/L234V/L235A/G236delは、一覧にあるいずれかの他の単一または二重変異体と組み合わせることができる。さらに、いくつかの実施形態では、両単量体が、同一KO変異体を含むことが好ましい一方で、異なる単量体上に異なるKO変異体を組み込むこと、及びKO変異体を含む単量体を1つだけ有することが可能である。USSN61/913,870の図及び説明文に対する参照もなされ、「ノックアウト」変異体または「消去(ablation)」変異体に関連するため、それらはすべて、全体が、参照によって、明確に組み込まれる。 操作されたヘテロ二量体歪曲Fc変異体の一覧をヘテロ二量体の収率(HPLC−CIEXにより決定)及び熱安定性(DSCにより決定)と共に示す。未決定の熱安定性は、「n.d.」と示される。 抗CD38x抗CD3二重特異性分子の構造を模式的に示す図である。 親和性/安定性が操作された変異体である抗CD38x抗CD3二重特異性分子の表面プラズモン共鳴(SPR)のデータである。 抗CD28x抗CD3二重特異性分子によるRPMI8226多発性骨髄腫細胞の殺傷を示す蛍光LDH再配向化T細胞細胞傷害性(re−directed T−cell cytotoxicity)(RTCC)アッセイである。 抗CD38x抗CD3二重特異性分子によるRPMI8226多発性骨髄腫細胞の殺傷を示すRTCCアッセイ(アネキシンV+)アッセイを示す。RPMI8226細胞に対するT細胞の比、及びインキュベーション時間を変動させている。 親和性/安定性が操作された変異体である抗CD38x抗CD3二重特異性分子の特性を記載した表である。番号付けは、Kabatに従った。 抗CD38x抗CD3二重特異性分子のカニクイザル(Macaca fascicularis)CD20+細胞に対する結合く。 huPBMCが移植されたSCIDマウスにおける、抗CD38x抗CD3二重特異性体によるヒト形質細胞の殺傷。ヒトIgG2アイソタイプ及びヒトIgEアイソタイプの顕著な減少がみられる。22日目の平均値±SEMが示される。IgG2のBLQは、<1μg/mLであり、IgEのBLQは、<16ng/mLである。BLQ未満のデータポイントは、BLQ値に割り当てた。 huPBMCが移植されたSCIDマウスにおける、抗CD38x抗CD3二重特異性体によるヒト形質細胞の殺傷。ヒトIgMの顕著な減少がみられる。22日目の平均値±SEMが示される。IgMのBLQは、<0.03μg/mLである。BLQ未満のデータポイントは、BLQ値に割り当てた。 抗CD38x抗CD3二重特異性抗体による、MM PBMCにおけるCD38+CD138+細胞の欠乏。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 図20A〜図20Qは、本発明のCD38XCD3scFvボトルオープナーの配列を示す。 CD38XCD3ボトルオープナーの、いくつかの有用なFcドメインの変異体を示す。 図22A及び図22Bは、抗CD38x抗CD3二重特異性体であるXENP13243及びXENP13551向けのアミノ酸配列を、下線を引いたCDR、及び荷電リンカー(荷電を有さなくてもよく、または図7に示される、正若しくは負のいずれかである、他の荷電リンカーと置換してよい)と共に示す。 図22A及び図22Bは、抗CD38x抗CD3二重特異性体であるXENP13243及びXENP13551向けのアミノ酸配列を、下線を引いたCDR、及び荷電リンカー(荷電を有さなくてもよく、または図7に示される、正若しくは負のいずれかである、他の荷電リンカーと置換してよい)と共に示す。 図23A、図23B、図23C、及び図23Dは、抗CD38x抗CD3二重特異性体であるXENP13243及びXENP13551をコードするDNA配列を示す。 図23A、図23B、図23C、及び図23Dは、抗CD38x抗CD3二重特異性体であるXENP13243及びXENP13551をコードするDNA配列を示す。 図23A、図23B、図23C、及び図23Dは、抗CD38x抗CD3二重特異性体であるXENP13243及びXENP13551をコードするDNA配列を示す。 図23A、図23B、図23C、及び図23Dは、抗CD38x抗CD3二重特異性体であるXENP13243及びXENP13551をコードするDNA配列を示す。 XENP13243及びXENP13551向けの安定プール生成のためのDNAトランスフェクション比のチャートを示す。HC−Fab、HC−scFv、及びLC向けにトランスフェクトされたDNAの相対量が記載される。 図25A、25B、25C、及び25Dは、XENP13243及びXENP13551向けの回分培養7日後に回収された安定プールの上清からプロテインAで精製された材料の陽イオン交換クロマトグラムを示す。DNAトランスフェクション比が、図24は記載される。統合ピークエリアが記載される。 図25A、25B、25C、及び25Dは、XENP13243及びXENP13551向けの回分培養7日後に回収された安定プールの上清からプロテインAで精製された材料の陽イオン交換クロマトグラムを示す。DNAトランスフェクション比が、図24は記載される。統合ピークエリアが記載される。 図25A、25B、25C、及び25Dは、XENP13243及びXENP13551向けの回分培養7日後に回収された安定プールの上清からプロテインAで精製された材料の陽イオン交換クロマトグラムを示す。DNAトランスフェクション比が、図24は記載される。統合ピークエリアが記載される。 図25A、25B、25C、及び25Dは、XENP13243及びXENP13551向けの回分培養7日後に回収された安定プールの上清からプロテインAで精製された材料の陽イオン交換クロマトグラムを示す。DNAトランスフェクション比が、図24は記載される。統合ピークエリアが記載される。 図25に示される陽イオン交換クロマトグラムによって同定された、安定プールから生成された異なるタンパク質種の概要。DNAトランスフェクション比は、図24に記載されるとおりである。 C57BL/6マウス(群当たりn=5マウス)における、抗CD38x抗CD3二重特異性体であるXENP13243及びXENP13551の薬物動態。非区画解析によって計算された半減期の値が図の説明に記載される。 CD38+RPMI8226細胞の再配向化T細胞細胞傷害性。400,000個の精製されたヒトT細胞と共に、10,000個のRPMI8226を、37℃で24時間インキュベートし、アッセイを実施した。細胞傷害性の計測は、乳酸脱水素酵素(LDH)によるものである。 ヒト及びカニクイザルのCD38及びCD3のXENP13243及びXENP13551に対する結合の動力学であり、表面プラズモン共鳴によって決定された。アッセイ形式が、明記される。 XENP13243(上パネル)及びXENP13551(下パネル)による、カニクイザルにおけるCD20−CD38+細胞の欠乏。 XENP13243(上パネル)及びXENP13551(下パネル)による、カニクイザルにおけるCD8+T細胞のCD69の上方制御。 等比体積変異体抗体の定常領域、及びそのそれぞれの置換の一覧を示す。pI_(−)は、より低いpI変異体であり、pI_(+)は、より高いpI変異体を示す。これらは、本発明の他の二量体化変異体と、任意選択かつ独立に組み合わせることができる。 特定の抗CD3scFv向けのいくつかの荷電リンカー及びデータを示す。 本明細書で「pI変異体」とも呼ばれる分離変異体(separation variant)の使用と関連した図であり、本明細書で「歪曲変異体」とも呼ばれる二量体会合変異体(heterodimer assembly variant)と組み合わせられている。こうした変異体は、変異体の効果が、異なるFv領域を有する異なる抗体へ容易に移行するという点で、「プラグアンドプレイ」形式において使用することができ、非常に安定である。 一般的な抗CD3scFv−Fcの最適化を示す。希少アミノ酸の置き換え、通常とは異なる接触残基でのアミノ酸の置き換え、リンカー操作(安定性及び精製の増進向けであり、例えば荷電scFvリンカーである)の実施、及びVL−VH配向への変換を含む様々な方法で安定性を増加させた。 野生型の安定性を保持するが、FcγR結合はすべて除去するFcノックアウト(または消去変異体)の使用を示す。 試験管内における、抗CD3X抗CD38ボトルオープナー形式の殺傷及び安定性のデータを示す。 ヒト骨髄腫細胞株の殺傷を示す。XmAb13551は、CD3に対して高親和性を有し、一方で、XmAb13243は、より低い親和性を有する。ダラツムマブは、抗CD38二価単一特異性抗体である。 マウスにおける、本発明のボトルオープナー二重特異性体の長期半減期活性、及び対応するヒトIgの抑制を示す。 XmAb13551及びXmAb13243の抗CD38X抗CD3機能を示し、血液及び骨髄におけるサルCD38+細胞の欠乏を含むものである。 CD38+細胞の欠乏が、T細胞の再分布及び活性化と相関することを示す。 XmAb13551(高CD3親和性)の産生に向けた安定細胞株の開発及びその対応する収率を示す。 収率改善に向けた細胞培養の最適化のいくつかを示し、≧3g/Lの力価が得られ、スケールアップでみられるヘテロ二量体/ホモ二量体比に顕著な差は無かった。 製造の3つの段階工程から得られた分析結果を示す。工程によって、非常に純粋なヘテロ二量体二重特異性分子が、55%を超える高収率で得られ、HCPに加えて、ホモ二量体、HMW、及びLMWの混入物が、効果的に除去された。 図45A〜図45Uは、様々な追加のヘテロ二量体化形式を示し、そのいずれの1つも本発明の抗CD3配列及び抗CD38配列を含むことができる。図45A〜図45Uは、本発明において使用できる、幅広い種類の多特異性(例えば、ヘテロ二量体化)形式、及びヘテロ二量体化変異体の異なる型の組み合わせを示す(これらは、本明細書で、「ヘテロ二量体骨格(heterodimeric scaffold)」と呼ばれることがある)。さらに、こうした形式のすべてが、以下により完全に論じられるように、Fc領域において追加の変異体を含むことができ、「消去」変異体または「ノックアウト」変異体(図7)、FcγR結合(FcγRIIb、FcγRIIIa等)を変えるためのFc変異体、FcRn受容体に対する結合を変えるためのFc変異体等が含まれることに留意されたい。図45Aは、本明細書に記載されるすべてのヘテロ二量体化形式に関する二重scFc−Fc形式を示し、pI変異体、ノブインホール(knob in hole)(KIH、本明細書で立体変異体または「歪曲」変異体とも呼ばれる)、電荷対(立体変異体のサブセット)、等比体積変異体、ならびにSEED体(「鎖交換反応が操作されたドメイン(strand−exchange engineered domain)」、Klein et al.,mAbs 4:6 653−663(2012)及びDavis et al,Protein Eng Des Sel 2010 23:195−202参照のこと)などのヘテロ二量体化変異体を含めることができる。SEED体は、ヒトIgG及びヒトIgAのCH3ドメインが、お互いに結合しないという事実に依存している。図45Bは、再度、様々なヘテロ二量体化変異体の選択肢と共に二重特異性IgGを示す。図45Cは、2つの異なる可変重ドメイン及び可変軽ドメインを利用するDVD−Igの「ワンアーム化(one armed)」型を示す。図45Dは、可変重鎖及び可変軽鎖が、反対側の重鎖上にあるということを除いては、「空アーム(empty arm)」というより、むしろ類似している。図45Eは、一般的に「mAb−Fv」と呼ばれる。図45Fは、多重scFv形式(multi−scFv format)を示し、当業者によって理解されるように、本明細書で論じられる「A、B、C、D」形式に類似しており、関連するscFv(またはそれに関連する何らかの他の結合リガンドまたは機能性)がいくらでもあり得ることを理解されよう。したがって、図45Fは、1、2、3、または4つのscFv(例えば、二重特異性体向けには、scFvは、「シス」若しくは「トランス」、または分子の1つの「末端」上に両方存在するであろう)を有するであろう。図45Gは、一方が重鎖Fab配列を含み、もう一方が軽鎖Fab配列を含む2つの異なる重鎖によって形成されているFabを有するヘテロ二量体FabFcを示す。図45Hは、「ワンアーム化Fab−Fc」を示し、1つの重鎖が、Fabを含む。図45Iは、「ワンアーム化scFv−Fc」を示し、一方の重鎖Fcが、scFvを含み、もう一方の重鎖は、「空(empty)」である。図45Jは、scFv−CH3を示し、重鎖CH3領域のみが使用され、それぞれが、それら独自のscFvを有する。図45Kは、mAb−scFvを示し、分子の1つの末端が、重鎖の内の1つのscFvを使用する一価の会合で、抗原を二価で捕捉する。図45Lは、両重鎖が、追加のscFvを含む以外は、同一の構造を示し、追加のscFvは、同一抗原、または異なる抗原のいずれにも結合できる。図45Mは、「CrossMab」構造を示し、2つの異なる軽鎖による多重形成の問題は、Fab部分において配列交換することにより対処されている。図45Nは、scFvを示し、図45Oは、本明細書に概要が記載されるリンカーによって連結された「BiTE」またはscFv−scFvであり、図45Pは、DARTを示し、図45Qは、TandAbを示し、そして図45Rは、ダイアボディを示す。図45S、図45T、及び図45Uは、本発明において有用である追加の代替骨格形式を示す。 図45A〜図45Uは、様々な追加のヘテロ二量体化形式を示し、そのいずれの1つも本発明の抗CD3配列及び抗CD38配列を含むことができる。図45A〜図45Uは、本発明において使用できる、幅広い種類の多特異性(例えば、ヘテロ二量体化)形式、及びヘテロ二量体化変異体の異なる型の組み合わせを示す(これらは、本明細書で、「ヘテロ二量体骨格(heterodimeric scaffold)」と呼ばれることがある)。さらに、こうした形式のすべてが、以下により完全に論じられるように、Fc領域において追加の変異体を含むことができ、「消去」変異体または「ノックアウト」変異体(図7)、FcγR結合(FcγRIIb、FcγRIIIa等)を変えるためのFc変異体、FcRn受容体に対する結合を変えるためのFc変異体等が含まれることに留意されたい。図45Aは、本明細書に記載されるすべてのヘテロ二量体化形式に関する二重scFc−Fc形式を示し、pI変異体、ノブインホール(knob in hole)(KIH、本明細書で立体変異体または「歪曲」変異体とも呼ばれる)、電荷対(立体変異体のサブセット)、等比体積変異体、ならびにSEED体(「鎖交換反応が操作されたドメイン(strand−exchange engineered domain)」、Klein et al.,mAbs 4:6 653−663(2012)及びDavis et al,Protein Eng Des Sel 2010 23:195−202参照のこと)などのヘテロ二量体化変異体を含めることができる。SEED体は、ヒトIgG及びヒトIgAのCH3ドメインが、お互いに結合しないという事実に依存している。図45Bは、再度、様々なヘテロ二量体化変異体の選択肢と共に二重特異性IgGを示す。図45Cは、2つの異なる可変重ドメイン及び可変軽ドメインを利用するDVD−Igの「ワンアーム化(one armed)」型を示す。図45Dは、可変重鎖及び可変軽鎖が、反対側の重鎖上にあるということを除いては、「空アーム(empty arm)」というより、むしろ類似している。図45Eは、一般的に「mAb−Fv」と呼ばれる。図45Fは、多重scFv形式(multi−scFv format)を示し、当業者によって理解されるように、本明細書で論じられる「A、B、C、D」形式に類似しており、関連するscFv(またはそれに関連する何らかの他の結合リガンドまたは機能性)がいくらでもあり得ることを理解されよう。したがって、図45Fは、1、2、3、または4つのscFv(例えば、二重特異性体向けには、scFvは、「シス」若しくは「トランス」、または分子の1つの「末端」上に両方存在するであろう)を有するであろう。図45Gは、一方が重鎖Fab配列を含み、もう一方が軽鎖Fab配列を含む2つの異なる重鎖によって形成されているFabを有するヘテロ二量体FabFcを示す。図45Hは、「ワンアーム化Fab−Fc」を示し、1つの重鎖が、Fabを含む。図45Iは、「ワンアーム化scFv−Fc」を示し、一方の重鎖Fcが、scFvを含み、もう一方の重鎖は、「空(empty)」である。図45Jは、scFv−CH3を示し、重鎖CH3領域のみが使用され、それぞれが、それら独自のscFvを有する。図45Kは、mAb−scFvを示し、分子の1つの末端が、重鎖の内の1つのscFvを使用する一価の会合で、抗原を二価で捕捉する。図45Lは、両重鎖が、追加のscFvを含む以外は、同一の構造を示し、追加のscFvは、同一抗原、または異なる抗原のいずれにも結合できる。図45Mは、「CrossMab」構造を示し、2つの異なる軽鎖による多重形成の問題は、Fab部分において配列交換することにより対処されている。図45Nは、scFvを示し、図45Oは、本明細書に概要が記載されるリンカーによって連結された「BiTE」またはscFv−scFvであり、図45Pは、DARTを示し、図45Qは、TandAbを示し、そして図45Rは、ダイアボディを示す。図45S、図45T、及び図45Uは、本発明において有用である追加の代替骨格形式を示す。 図45A〜図45Uは、様々な追加のヘテロ二量体化形式を示し、そのいずれの1つも本発明の抗CD3配列及び抗CD38配列を含むことができる。図45A〜図45Uは、本発明において使用できる、幅広い種類の多特異性(例えば、ヘテロ二量体化)形式、及びヘテロ二量体化変異体の異なる型の組み合わせを示す(これらは、本明細書で、「ヘテロ二量体骨格(heterodimeric scaffold)」と呼ばれることがある)。さらに、こうした形式のすべてが、以下により完全に論じられるように、Fc領域において追加の変異体を含むことができ、「消去」変異体または「ノックアウト」変異体(図7)、FcγR結合(FcγRIIb、FcγRIIIa等)を変えるためのFc変異体、FcRn受容体に対する結合を変えるためのFc変異体等が含まれることに留意されたい。図45Aは、本明細書に記載されるすべてのヘテロ二量体化形式に関する二重scFc−Fc形式を示し、pI変異体、ノブインホール(knob in hole)(KIH、本明細書で立体変異体または「歪曲」変異体とも呼ばれる)、電荷対(立体変異体のサブセット)、等比体積変異体、ならびにSEED体(「鎖交換反応が操作されたドメイン(strand−exchange engineered domain)」、Klein et al.,mAbs 4:6 653−663(2012)及びDavis et al,Protein Eng Des Sel 2010 23:195−202参照のこと)などのヘテロ二量体化変異体を含めることができる。SEED体は、ヒトIgG及びヒトIgAのCH3ドメインが、お互いに結合しないという事実に依存している。図45Bは、再度、様々なヘテロ二量体化変異体の選択肢と共に二重特異性IgGを示す。図45Cは、2つの異なる可変重ドメイン及び可変軽ドメインを利用するDVD−Igの「ワンアーム化(one armed)」型を示す。図45Dは、可変重鎖及び可変軽鎖が、反対側の重鎖上にあるということを除いては、「空アーム(empty arm)」というより、むしろ類似している。図45Eは、一般的に「mAb−Fv」と呼ばれる。図45Fは、多重scFv形式(multi−scFv format)を示し、当業者によって理解されるように、本明細書で論じられる「A、B、C、D」形式に類似しており、関連するscFv(またはそれに関連する何らかの他の結合リガンドまたは機能性)がいくらでもあり得ることを理解されよう。したがって、図45Fは、1、2、3、または4つのscFv(例えば、二重特異性体向けには、scFvは、「シス」若しくは「トランス」、または分子の1つの「末端」上に両方存在するであろう)を有するであろう。図45Gは、一方が重鎖Fab配列を含み、もう一方が軽鎖Fab配列を含む2つの異なる重鎖によって形成されているFabを有するヘテロ二量体FabFcを示す。図45Hは、「ワンアーム化Fab−Fc」を示し、1つの重鎖が、Fabを含む。図45Iは、「ワンアーム化scFv−Fc」を示し、一方の重鎖Fcが、scFvを含み、もう一方の重鎖は、「空(empty)」である。図45Jは、scFv−CH3を示し、重鎖CH3領域のみが使用され、それぞれが、それら独自のscFvを有する。図45Kは、mAb−scFvを示し、分子の1つの末端が、重鎖の内の1つのscFvを使用する一価の会合で、抗原を二価で捕捉する。図45Lは、両重鎖が、追加のscFvを含む以外は、同一の構造を示し、追加のscFvは、同一抗原、または異なる抗原のいずれにも結合できる。図45Mは、「CrossMab」構造を示し、2つの異なる軽鎖による多重形成の問題は、Fab部分において配列交換することにより対処されている。図45Nは、scFvを示し、図45Oは、本明細書に概要が記載されるリンカーによって連結された「BiTE」またはscFv−scFvであり、図45Pは、DARTを示し、図45Qは、TandAbを示し、そして図45Rは、ダイアボディを示す。図45S、図45T、及び図45Uは、本発明において有用である追加の代替骨格形式を示す。 図45A〜図45Uは、様々な追加のヘテロ二量体化形式を示し、そのいずれの1つも本発明の抗CD3配列及び抗CD38配列を含むことができる。図45A〜図45Uは、本発明において使用できる、幅広い種類の多特異性(例えば、ヘテロ二量体化)形式、及びヘテロ二量体化変異体の異なる型の組み合わせを示す(これらは、本明細書で、「ヘテロ二量体骨格(heterodimeric scaffold)」と呼ばれることがある)。さらに、こうした形式のすべてが、以下により完全に論じられるように、Fc領域において追加の変異体を含むことができ、「消去」変異体または「ノックアウト」変異体(図7)、FcγR結合(FcγRIIb、FcγRIIIa等)を変えるためのFc変異体、FcRn受容体に対する結合を変えるためのFc変異体等が含まれることに留意されたい。図45Aは、本明細書に記載されるすべてのヘテロ二量体化形式に関する二重scFc−Fc形式を示し、pI変異体、ノブインホール(knob in hole)(KIH、本明細書で立体変異体または「歪曲」変異体とも呼ばれる)、電荷対(立体変異体のサブセット)、等比体積変異体、ならびにSEED体(「鎖交換反応が操作されたドメイン(strand−exchange engineered domain)」、Klein et al.,mAbs 4:6 653−663(2012)及びDavis et al,Protein Eng Des Sel 2010 23:195−202参照のこと)などのヘテロ二量体化変異体を含めることができる。SEED体は、ヒトIgG及びヒトIgAのCH3ドメインが、お互いに結合しないという事実に依存している。図45Bは、再度、様々なヘテロ二量体化変異体の選択肢と共に二重特異性IgGを示す。図45Cは、2つの異なる可変重ドメイン及び可変軽ドメインを利用するDVD−Igの「ワンアーム化(one armed)」型を示す。図45Dは、可変重鎖及び可変軽鎖が、反対側の重鎖上にあるということを除いては、「空アーム(empty arm)」というより、むしろ類似している。図45Eは、一般的に「mAb−Fv」と呼ばれる。図45Fは、多重scFv形式(multi−scFv format)を示し、当業者によって理解されるように、本明細書で論じられる「A、B、C、D」形式に類似しており、関連するscFv(またはそれに関連する何らかの他の結合リガンドまたは機能性)がいくらでもあり得ることを理解されよう。したがって、図45Fは、1、2、3、または4つのscFv(例えば、二重特異性体向けには、scFvは、「シス」若しくは「トランス」、または分子の1つの「末端」上に両方存在するであろう)を有するであろう。図45Gは、一方が重鎖Fab配列を含み、もう一方が軽鎖Fab配列を含む2つの異なる重鎖によって形成されているFabを有するヘテロ二量体FabFcを示す。図45Hは、「ワンアーム化Fab−Fc」を示し、1つの重鎖が、Fabを含む。図45Iは、「ワンアーム化scFv−Fc」を示し、一方の重鎖Fcが、scFvを含み、もう一方の重鎖は、「空(empty)」である。図45Jは、scFv−CH3を示し、重鎖CH3領域のみが使用され、それぞれが、それら独自のscFvを有する。図45Kは、mAb−scFvを示し、分子の1つの末端が、重鎖の内の1つのscFvを使用する一価の会合で、抗原を二価で捕捉する。図45Lは、両重鎖が、追加のscFvを含む以外は、同一の構造を示し、追加のscFvは、同一抗原、または異なる抗原のいずれにも結合できる。図45Mは、「CrossMab」構造を示し、2つの異なる軽鎖による多重形成の問題は、Fab部分において配列交換することにより対処されている。図45Nは、scFvを示し、図45Oは、本明細書に概要が記載されるリンカーによって連結された「BiTE」またはscFv−scFvであり、図45Pは、DARTを示し、図45Qは、TandAbを示し、そして図45Rは、ダイアボディを示す。図45S、図45T、及び図45Uは、本発明において有用である追加の代替骨格形式を示す。 図45A〜図45Uは、様々な追加のヘテロ二量体化形式を示し、そのいずれの1つも本発明の抗CD3配列及び抗CD38配列を含むことができる。図45A〜図45Uは、本発明において使用できる、幅広い種類の多特異性(例えば、ヘテロ二量体化)形式、及びヘテロ二量体化変異体の異なる型の組み合わせを示す(これらは、本明細書で、「ヘテロ二量体骨格(heterodimeric scaffold)」と呼ばれることがある)。さらに、こうした形式のすべてが、以下により完全に論じられるように、Fc領域において追加の変異体を含むことができ、「消去」変異体または「ノックアウト」変異体(図7)、FcγR結合(FcγRIIb、FcγRIIIa等)を変えるためのFc変異体、FcRn受容体に対する結合を変えるためのFc変異体等が含まれることに留意されたい。図45Aは、本明細書に記載されるすべてのヘテロ二量体化形式に関する二重scFc−Fc形式を示し、pI変異体、ノブインホール(knob in hole)(KIH、本明細書で立体変異体または「歪曲」変異体とも呼ばれる)、電荷対(立体変異体のサブセット)、等比体積変異体、ならびにSEED体(「鎖交換反応が操作されたドメイン(strand−exchange engineered domain)」、Klein et al.,mAbs 4:6 653−663(2012)及びDavis et al,Protein Eng Des Sel 2010 23:195−202参照のこと)などのヘテロ二量体化変異体を含めることができる。SEED体は、ヒトIgG及びヒトIgAのCH3ドメインが、お互いに結合しないという事実に依存している。図45Bは、再度、様々なヘテロ二量体化変異体の選択肢と共に二重特異性IgGを示す。図45Cは、2つの異なる可変重ドメイン及び可変軽ドメインを利用するDVD−Igの「ワンアーム化(one armed)」型を示す。図45Dは、可変重鎖及び可変軽鎖が、反対側の重鎖上にあるということを除いては、「空アーム(empty arm)」というより、むしろ類似している。図45Eは、一般的に「mAb−Fv」と呼ばれる。図45Fは、多重scFv形式(multi−scFv format)を示し、当業者によって理解されるように、本明細書で論じられる「A、B、C、D」形式に類似しており、関連するscFv(またはそれに関連する何らかの他の結合リガンドまたは機能性)がいくらでもあり得ることを理解されよう。したがって、図45Fは、1、2、3、または4つのscFv(例えば、二重特異性体向けには、scFvは、「シス」若しくは「トランス」、または分子の1つの「末端」上に両方存在するであろう)を有するであろう。図45Gは、一方が重鎖Fab配列を含み、もう一方が軽鎖Fab配列を含む2つの異なる重鎖によって形成されているFabを有するヘテロ二量体FabFcを示す。図45Hは、「ワンアーム化Fab−Fc」を示し、1つの重鎖が、Fabを含む。図45Iは、「ワンアーム化scFv−Fc」を示し、一方の重鎖Fcが、scFvを含み、もう一方の重鎖は、「空(empty)」である。図45Jは、scFv−CH3を示し、重鎖CH3領域のみが使用され、それぞれが、それら独自のscFvを有する。図45Kは、mAb−scFvを示し、分子の1つの末端が、重鎖の内の1つのscFvを使用する一価の会合で、抗原を二価で捕捉する。図45Lは、両重鎖が、追加のscFvを含む以外は、同一の構造を示し、追加のscFvは、同一抗原、または異なる抗原のいずれにも結合できる。図45Mは、「CrossMab」構造を示し、2つの異なる軽鎖による多重形成の問題は、Fab部分において配列交換することにより対処されている。図45Nは、scFvを示し、図45Oは、本明細書に概要が記載されるリンカーによって連結された「BiTE」またはscFv−scFvであり、図45Pは、DARTを示し、図45Qは、TandAbを示し、そして図45Rは、ダイアボディを示す。図45S、図45T、及び図45Uは、本発明において有用である追加の代替骨格形式を示す。 図45A〜図45Uは、様々な追加のヘテロ二量体化形式を示し、そのいずれの1つも本発明の抗CD3配列及び抗CD38配列を含むことができる。図45A〜図45Uは、本発明において使用できる、幅広い種類の多特異性(例えば、ヘテロ二量体化)形式、及びヘテロ二量体化変異体の異なる型の組み合わせを示す(これらは、本明細書で、「ヘテロ二量体骨格(heterodimeric scaffold)」と呼ばれることがある)。さらに、こうした形式のすべてが、以下により完全に論じられるように、Fc領域において追加の変異体を含むことができ、「消去」変異体または「ノックアウト」変異体(図7)、FcγR結合(FcγRIIb、FcγRIIIa等)を変えるためのFc変異体、FcRn受容体に対する結合を変えるためのFc変異体等が含まれることに留意されたい。図45Aは、本明細書に記載されるすべてのヘテロ二量体化形式に関する二重scFc−Fc形式を示し、pI変異体、ノブインホール(knob in hole)(KIH、本明細書で立体変異体または「歪曲」変異体とも呼ばれる)、電荷対(立体変異体のサブセット)、等比体積変異体、ならびにSEED体(「鎖交換反応が操作されたドメイン(strand−exchange engineered domain)」、Klein et al.,mAbs 4:6 653−663(2012)及びDavis et al,Protein Eng Des Sel 2010 23:195−202参照のこと)などのヘテロ二量体化変異体を含めることができる。SEED体は、ヒトIgG及びヒトIgAのCH3ドメインが、お互いに結合しないという事実に依存している。図45Bは、再度、様々なヘテロ二量体化変異体の選択肢と共に二重特異性IgGを示す。図45Cは、2つの異なる可変重ドメイン及び可変軽ドメインを利用するDVD−Igの「ワンアーム化(one armed)」型を示す。図45Dは、可変重鎖及び可変軽鎖が、反対側の重鎖上にあるということを除いては、「空アーム(empty arm)」というより、むしろ類似している。図45Eは、一般的に「mAb−Fv」と呼ばれる。図45Fは、多重scFv形式(multi−scFv format)を示し、当業者によって理解されるように、本明細書で論じられる「A、B、C、D」形式に類似しており、関連するscFv(またはそれに関連する何らかの他の結合リガンドまたは機能性)がいくらでもあり得ることを理解されよう。したがって、図45Fは、1、2、3、または4つのscFv(例えば、二重特異性体向けには、scFvは、「シス」若しくは「トランス」、または分子の1つの「末端」上に両方存在するであろう)を有するであろう。図45Gは、一方が重鎖Fab配列を含み、もう一方が軽鎖Fab配列を含む2つの異なる重鎖によって形成されているFabを有するヘテロ二量体FabFcを示す。図45Hは、「ワンアーム化Fab−Fc」を示し、1つの重鎖が、Fabを含む。図45Iは、「ワンアーム化scFv−Fc」を示し、一方の重鎖Fcが、scFvを含み、もう一方の重鎖は、「空(empty)」である。図45Jは、scFv−CH3を示し、重鎖CH3領域のみが使用され、それぞれが、それら独自のscFvを有する。図45Kは、mAb−scFvを示し、分子の1つの末端が、重鎖の内の1つのscFvを使用する一価の会合で、抗原を二価で捕捉する。図45Lは、両重鎖が、追加のscFvを含む以外は、同一の構造を示し、追加のscFvは、同一抗原、または異なる抗原のいずれにも結合できる。図45Mは、「CrossMab」構造を示し、2つの異なる軽鎖による多重形成の問題は、Fab部分において配列交換することにより対処されている。図45Nは、scFvを示し、図45Oは、本明細書に概要が記載されるリンカーによって連結された「BiTE」またはscFv−scFvであり、図45Pは、DARTを示し、図45Qは、TandAbを示し、そして図45Rは、ダイアボディを示す。図45S、図45T、及び図45Uは、本発明において有用である追加の代替骨格形式を示す。 図45A〜図45Uは、様々な追加のヘテロ二量体化形式を示し、そのいずれの1つも本発明の抗CD3配列及び抗CD38配列を含むことができる。図45A〜図45Uは、本発明において使用できる、幅広い種類の多特異性(例えば、ヘテロ二量体化)形式、及びヘテロ二量体化変異体の異なる型の組み合わせを示す(これらは、本明細書で、「ヘテロ二量体骨格(heterodimeric scaffold)」と呼ばれることがある)。さらに、こうした形式のすべてが、以下により完全に論じられるように、Fc領域において追加の変異体を含むことができ、「消去」変異体または「ノックアウト」変異体(図7)、FcγR結合(FcγRIIb、FcγRIIIa等)を変えるためのFc変異体、FcRn受容体に対する結合を変えるためのFc変異体等が含まれることに留意されたい。図45Aは、本明細書に記載されるすべてのヘテロ二量体化形式に関する二重scFc−Fc形式を示し、pI変異体、ノブインホール(knob in hole)(KIH、本明細書で立体変異体または「歪曲」変異体とも呼ばれる)、電荷対(立体変異体のサブセット)、等比体積変異体、ならびにSEED体(「鎖交換反応が操作されたドメイン(strand−exchange engineered domain)」、Klein et al.,mAbs 4:6 653−663(2012)及びDavis et al,Protein Eng Des Sel 2010 23:195−202参照のこと)などのヘテロ二量体化変異体を含めることができる。SEED体は、ヒトIgG及びヒトIgAのCH3ドメインが、お互いに結合しないという事実に依存している。図45Bは、再度、様々なヘテロ二量体化変異体の選択肢と共に二重特異性IgGを示す。図45Cは、2つの異なる可変重ドメイン及び可変軽ドメインを利用するDVD−Igの「ワンアーム化(one armed)」型を示す。図45Dは、可変重鎖及び可変軽鎖が、反対側の重鎖上にあるということを除いては、「空アーム(empty arm)」というより、むしろ類似している。図45Eは、一般的に「mAb−Fv」と呼ばれる。図45Fは、多重scFv形式(multi−scFv format)を示し、当業者によって理解されるように、本明細書で論じられる「A、B、C、D」形式に類似しており、関連するscFv(またはそれに関連する何らかの他の結合リガンドまたは機能性)がいくらでもあり得ることを理解されよう。したがって、図45Fは、1、2、3、または4つのscFv(例えば、二重特異性体向けには、scFvは、「シス」若しくは「トランス」、または分子の1つの「末端」上に両方存在するであろう)を有するであろう。図45Gは、一方が重鎖Fab配列を含み、もう一方が軽鎖Fab配列を含む2つの異なる重鎖によって形成されているFabを有するヘテロ二量体FabFcを示す。図45Hは、「ワンアーム化Fab−Fc」を示し、1つの重鎖が、Fabを含む。図45Iは、「ワンアーム化scFv−Fc」を示し、一方の重鎖Fcが、scFvを含み、もう一方の重鎖は、「空(empty)」である。図45Jは、scFv−CH3を示し、重鎖CH3領域のみが使用され、それぞれが、それら独自のscFvを有する。図45Kは、mAb−scFvを示し、分子の1つの末端が、重鎖の内の1つのscFvを使用する一価の会合で、抗原を二価で捕捉する。図45Lは、両重鎖が、追加のscFvを含む以外は、同一の構造を示し、追加のscFvは、同一抗原、または異なる抗原のいずれにも結合できる。図45Mは、「CrossMab」構造を示し、2つの異なる軽鎖による多重形成の問題は、Fab部分において配列交換することにより対処されている。図45Nは、scFvを示し、図45Oは、本明細書に概要が記載されるリンカーによって連結された「BiTE」またはscFv−scFvであり、図45Pは、DARTを示し、図45Qは、TandAbを示し、そして図45Rは、ダイアボディを示す。図45S、図45T、及び図45Uは、本発明において有用である追加の代替骨格形式を示す。 図45A〜図45Uは、様々な追加のヘテロ二量体化形式を示し、そのいずれの1つも本発明の抗CD3配列及び抗CD38配列を含むことができる。図45A〜図45Uは、本発明において使用できる、幅広い種類の多特異性(例えば、ヘテロ二量体化)形式、及びヘテロ二量体化変異体の異なる型の組み合わせを示す(これらは、本明細書で、「ヘテロ二量体骨格(heterodimeric scaffold)」と呼ばれることがある)。さらに、こうした形式のすべてが、以下により完全に論じられるように、Fc領域において追加の変異体を含むことができ、「消去」変異体または「ノックアウト」変異体(図7)、FcγR結合(FcγRIIb、FcγRIIIa等)を変えるためのFc変異体、FcRn受容体に対する結合を変えるためのFc変異体等が含まれることに留意されたい。図45Aは、本明細書に記載されるすべてのヘテロ二量体化形式に関する二重scFc−Fc形式を示し、pI変異体、ノブインホール(knob in hole)(KIH、本明細書で立体変異体または「歪曲」変異体とも呼ばれる)、電荷対(立体変異体のサブセット)、等比体積変異体、ならびにSEED体(「鎖交換反応が操作されたドメイン(strand−exchange engineered domain)」、Klein et al.,mAbs 4:6 653−663(2012)及びDavis et al,Protein Eng Des Sel 2010 23:195−202参照のこと)などのヘテロ二量体化変異体を含めることができる。SEED体は、ヒトIgG及びヒトIgAのCH3ドメインが、お互いに結合しないという事実に依存している。図45Bは、再度、様々なヘテロ二量体化変異体の選択肢と共に二重特異性IgGを示す。図45Cは、2つの異なる可変重ドメイン及び可変軽ドメインを利用するDVD−Igの「ワンアーム化(one armed)」型を示す。図45Dは、可変重鎖及び可変軽鎖が、反対側の重鎖上にあるということを除いては、「空アーム(empty arm)」というより、むしろ類似している。図45Eは、一般的に「mAb−Fv」と呼ばれる。図45Fは、多重scFv形式(multi−scFv format)を示し、当業者によって理解されるように、本明細書で論じられる「A、B、C、D」形式に類似しており、関連するscFv(またはそれに関連する何らかの他の結合リガンドまたは機能性)がいくらでもあり得ることを理解されよう。したがって、図45Fは、1、2、3、または4つのscFv(例えば、二重特異性体向けには、scFvは、「シス」若しくは「トランス」、または分子の1つの「末端」上に両方存在するであろう)を有するであろう。図45Gは、一方が重鎖Fab配列を含み、もう一方が軽鎖Fab配列を含む2つの異なる重鎖によって形成されているFabを有するヘテロ二量体FabFcを示す。図45Hは、「ワンアーム化Fab−Fc」を示し、1つの重鎖が、Fabを含む。図45Iは、「ワンアーム化scFv−Fc」を示し、一方の重鎖Fcが、scFvを含み、もう一方の重鎖は、「空(empty)」である。図45Jは、scFv−CH3を示し、重鎖CH3領域のみが使用され、それぞれが、それら独自のscFvを有する。図45Kは、mAb−scFvを示し、分子の1つの末端が、重鎖の内の1つのscFvを使用する一価の会合で、抗原を二価で捕捉する。図45Lは、両重鎖が、追加のscFvを含む以外は、同一の構造を示し、追加のscFvは、同一抗原、または異なる抗原のいずれにも結合できる。図45Mは、「CrossMab」構造を示し、2つの異なる軽鎖による多重形成の問題は、Fab部分において配列交換することにより対処されている。図45Nは、scFvを示し、図45Oは、本明細書に概要が記載されるリンカーによって連結された「BiTE」またはscFv−scFvであり、図45Pは、DARTを示し、図45Qは、TandAbを示し、そして図45Rは、ダイアボディを示す。図45S、図45T、及び図45Uは、本発明において有用である追加の代替骨格形式を示す。 図46A、46B、及び46Cは、安定性が最適化された、ヒト化抗CD3変異体scFvを示す。置換は、H1.1_L1.4scFv配列に対して与えられている。アミノ酸の番号付けは、Kabatの番号付けである。 図46A、46B、及び46Cは、安定性が最適化された、ヒト化抗CD3変異体scFvを示す。置換は、H1.1_L1.4scFv配列に対して与えられている。アミノ酸の番号付けは、Kabatの番号付けである。 図46A、46B、及び46Cは、安定性が最適化された、ヒト化抗CD3変異体scFvを示す。置換は、H1.1_L1.4scFv配列に対して与えられている。アミノ酸の番号付けは、Kabatの番号付けである。 図47A及び47B。本発明において使用される抗CD3配列向けの可変重鎖及び可変軽鎖であり、「強」結合配列及び「より弱い」結合配列の両方を含む。当業者によって理解されるように、これらは、何らかの標的腫瘍抗原結合ドメインと組み合わせて、Fab構築物またはscFv構築物において使用できる。 図47A及び47B。本発明において使用される抗CD3配列向けの可変重鎖及び可変軽鎖であり、「強」結合配列及び「より弱い」結合配列の両方を含む。当業者によって理解されるように、これらは、何らかの標的腫瘍抗原結合ドメインと組み合わせて、Fab構築物またはscFv構築物において使用できる。 Biacoreアッセイにおける結合親和性を示す。 軽鎖、Fab−Fc、及びscFv−Fcの比を変更して使用し、安定プールを生成させた際のヘテロ二量体の純度を示す。 huPBMCマウスモデルにおける抗CD38x抗CD3二重特異性体によるヒトIgM及びヒトIgG2の欠乏である。 図51A及び図51Bは、XENP13243及びXENP13551の精製が、CD38に対してそれぞれ低親和性及び高親和性を有するように設計されていることを示す。 図51A及び図51Bは、XENP13243及びXENP13551の精製が、CD38に対してそれぞれ低親和性及び高親和性を有するように設計されていることを示す。 図52A、図52B、及び図52Cは、ヒト及びサルのCD38及びCD3に対する結合、ならびにKdを示す。 図52A、図52B、及び図52Cは、ヒト及びサルのCD38及びCD3に対する結合、ならびにKdを示す。 図52A、図52B、及び図52Cは、ヒト及びサルのCD38及びCD3に対する結合、ならびにKdを示す。 骨髄腫細胞の殺傷を示す。 標的細胞が数で上回るときでさえ、T細胞は、連続殺傷体であることを示す。 Fcドメインが、半減期を延長することを示す。 図14の実験に向けた投与を示す。 より強いhIg欠乏と、ダラツムマブとの比較を示す。 図16の実験に向けた投与を示す。 図59A及び図59B。二重特異性体は、サルの血液及びリンパ器官において、CD38+細胞を欠乏させる。 図59A及び図59B。二重特異性体は、サルの血液及びリンパ器官において、CD38+細胞を欠乏させる。 図60A、60B、及び60C。図60A(血液からの再分布)、図60B(CD69誘導)、及び図60C(サイトカイン放出)は、CD38+細胞の欠乏が、T細胞の再分布及び活性化と相関することを示す。 図60A、60B、及び60C。図60A(血液からの再分布)、図60B(CD69誘導)、及び図60C(サイトカイン放出)は、CD38+細胞の欠乏が、T細胞の再分布及び活性化と相関することを示す。 図60A、60B、及び60C。図60A(血液からの再分布)、図60B(CD69誘導)、及び図60C(サイトカイン放出)は、CD38+細胞の欠乏が、T細胞の再分布及び活性化と相関することを示す。 本発明の特定使用のいくつかの実施形態を示す。
発明の詳細な説明
I.外観
本発明は、CD3抗原及びCD38抗原の両方に結合する二重特異性抗体を提供する新規の構築物を対象とする。抗体技術における継続問題は、2つの(またはそれより多くの)異なる抗原に同時に結合し、一般に、そのようにして、異なる抗原を近接させることを可能にし、新しい機能性及び新しい治療をもたらす「二重特異性」(及び/または多特異性)抗体が、切望されていることである。一般に、こうした抗体は、重鎖及び軽鎖それぞれの遺伝子を宿主細胞へと含めることによって作られる。これにより、一般に、所望のヘテロ二量体(A−B)、ならびに2つのホモ二量体(A−A及びB−B)の形成がもたらされる。しかしながら、多特性抗体形成における主な障壁は、ヘテロ二量体抗体を精製してホモ二量体抗体を除去すること、及び/またはホモ二量体形成を上回るようにヘテロ二量体形成に偏らせることが困難であるということである。
本発明は、一般に、いくつかの方法で、抗原を共捕捉できる抗体などのヘテロ二量体タンパク質の創出を対象とし、それぞれの鎖で異なる、定常領域のアミノ酸変異体に依存することで、ヘテロ二量体形成の促進、及び/またはホモ二量体に関してテロ二量体精製の容易化を可能にする。
したがって、本発明は、少なくとも第一抗原及び第二抗原を共捕捉する新規のイムノグロブリン組成物を対象とする。本発明の第一抗原及び第二抗原は、本明細書で、それぞれ抗原1及び抗原2と呼ばれる。抗体の一方の重鎖は、単鎖Fv(以下に定義される「scFv」)を含み、もう一方の重鎖は、「定型的な(regular)」FAb形式であって、可変重鎖及び軽鎖を含む。この構造は、本明細書で「三重F」形式(scFv−FAb−Fc)、またはボトルオープナーにおおよそ視覚的に類似している(図参照)ことから「ボトルオープナー」形式と呼ばれることがある。2つの鎖は、ヘテロ二量体抗体の形成を促進する定常領域(例えば、Fcドメイン及び/またはヒンジ領域)において、アミノ酸変異体を使用することによって一緒にまとめられており、以下に、より完全に説明される。
本発明の「三重F」形式には、いくつかの明確に異なる利点が存在する。当該技術分野で知られるとおり、2つのscFv構築物に依存する抗体アナログは、安定性及び凝集の問題を有することが多いが、本発明においては、「定型的な」重鎖及び軽鎖の対を追加することによって、こうした問題を軽減できる。さらに、2つの重鎖及び2つの軽鎖に依存する形式とは対照的に、重鎖及び軽鎖が、不正確に対になる(例えば、重1が、軽2と対になる等)という問題は存在しない。
本発明のヘテロ二量体を生成させるために使用できる機構は、数多く存在する。さらに、当業者によって理解され、以下により完全に説明されるように、こうした機構は、高いヘテロ二量体化を維持するために組み合わせることができる。
1つの機構は、一般に、当該技術分野において、「ノブアンドホール(knob and hole)」(「KIH」)と呼ばれるか、または本明細書で「歪曲」変異体と呼ばれることがある。これは、ヘテロ二量体形成に有利に働くと共にホモ二量体形成を抑制する立体的な影響を創出するアミノ酸操作を指し、任意選択で使用することもできる。これは、「ノブアンドホール」と呼ばれることがあり、USSN61/596,846,Ridgway et al.,Protein Engineering 9(7):617(1996)、Atwell et al.,J.Mol.Biol.1997 270:26、米国特許第8,216,805号において説明されるとおりである。これらはすべて、全体が、参照によって、本明細書に組み込まれる。図によって多くの「ノブアンドホール」に依存する「単量体A−単量体B」の対が特定されている。さらに、Merchant et al.,Nature Biotech.16:677(1998)において説明されるとおり、こうした「ノブアンドホール」変異は、ジスルフィド結合と組み合わせて、形成をヘテロ二量体化へと歪曲することができる。
ヘテロ二量体の生成において有用な追加の機構は、「静電操縦(electrostatic steering)」と呼ばれることがあり、Gunasekaran et al.,J.Biol.Chem.285(25):19637(2010)において説明されるとおりである。当該文献は、参照によって、その全体が、本明細書に組み込まれる。これは、本明細書で「電荷対」と呼ばれることがある。この実施形態では、静電気が、形成をヘテロ二量体化へと歪曲するために使用される。当業者であれば、これらは、pIに対する効果も有し得、そうすることで、精製に対しても影響を有し得、したがって、場合によっては、pI変異体にもなり得ると考えられることを理解されるであろう。しかしながら、これらは、ヘテロ二量体化を押し進めるために生成され、精製手段としては使用されなかったため、それらは、「立体変異体」として分類される。これらには、限定はされないが、D221R/P228R/K409Rと対であるD221E/P228E/L368E(例えば、これらは、「単量体が対応するセットである)及びC220R/E224R/P228R/K409Rと対であるC220E/P228E/368Eが含まれる。(以下により完全に説明されるとおり、220の変異は、重鎖及び軽鎖のジスルフィド形成に、もはや必要ないシステインを除去するためのものであることに留意されたい)。
本発明には、ヘテロ二量体タンパク質の精製を容易化できるいくつかの基礎的な機構が存在する。すなわち、pI変異体の使用に依存し、その結果、単量体は、それぞれが異なるpIを有し、そうすることで、A−A二量体タンパク質、A−B二量体タンパク質、及びB−B二量体タンパク質の等電点精製を可能にするものである。あるいは、「三重F」形式は、サイズに基づく分離も可能にする。以下にさらに概要が記載されるとおり、ヘテロ二量体形成が、ホモ二量体を上回るようにする「歪曲」も可能であり、以下に、一般的に概要が記載されるとおりである。したがって、立体二量体化変異体、及びpI変異体または電荷対変異体の組み合わせは、本発明において、特定用途で有用である。さらに、以下に、より完全に概要が記載されるとおり、三重F形式のscFv単量体は、精製目的に向けて、さらなるpIの増大を与える荷電scFvリンカー(正か負のいずれか)を含むことができる。当業者によって、理解されるとおり、三重F形式によっては、荷電scFvリンカーのみを有し、追加のpI調整無しでも有用であるが、本発明は、荷電scFvリンカーを有する歪曲変異体(ならびにFc変異体、FcRn変異体、及びKO変異体)の使用も確実に提供する。
ヘテロ二量体三重F形式を創出するための分離機構としてpIを利用する本発明においては、アミノ酸変異体を、単量体ポリペプチドの1つまたは両方に導入することができる。すなわち、単量体(本明細書では、単純化のため「単量体A」と呼ぶ)の内の1つのpIが、単量体Bから遠ざかるように操作できるか、または単量体A及び単量体Bの両方が変更され、単量体AのpIは増加し、単量体BのpIは減少する。以下に、より完全に概略が記載されるように、単量体のいずれか、または両方のpIの変更は、荷電残基を除去若しくは追加(例えば、中性アミノ酸は、正若しくは負に荷電したアミノ酸残基によって置き換えられ、例えば、グリシンからグルタミン酸への置き換えである)するか、荷電残基を正若しくは負から反対の電荷へと変更(アスパラギン酸からリジンへ)するか、または荷電残基を中性残基へと変更(例えば、リジンからセリンへであり、これにより荷電が消失する)することによって実施できる。多くのこうした変異体が、図に示される。
したがって、この実施形態では、本発明は、少なくとも1つの単量体において、pIの十分な変更の創出を提供し、その結果、ヘテロ二量体は、ホモ二量体から分離できる。当業者によって、理解されるように、そして、以下にさらに論じられるように、これは、「野生型」重鎖定常領域と、そのpIが増加若しくは減少(wt A−+B若しくはwt A− −B)のいずれかとなるように操作された変異体領域と、を使用することによって実施できるか、または一方の領域を増加し、もう一方の領域を減少させること(A+ −B−若しくはA− B+)によって実施できる。この議論において、どの単量体が、scFvを含み、どれが、Fabを含むかは、問題ではないことに留意されたい。
したがって、一般に、本発明の構成要素は、抗体の定常領域におけるアミノ酸変異体であり、当該アミノ酸変異体は、アミノ酸置換(「pI変異体」または「pI置換」)を単量体の1つまたは両方へ組み込むことによって、「pIヘテロ二量体」(タンパク質が抗体であるとき、それは、「pI抗体」と呼ばれる)を形成するために、二量体タンパク質の単量体の両方か、もし両方でないなら少なくとも1つの等電点(pI)を変えることに向けられる。本明細書で示されるように、2つのホモ二量体からのヘテロ二量体の分離は、2つの単量体のpIが、わずか0.1pH単位でも異なれば達成でき、0.2、0.3、0.4、及び0.5、またはそれより大きな差異は、すべて本発明において有用である。
当業者によって理解されるとおり、よい分離を得るために単量体のそれぞれまたは両方に含まれるpI変異体の数は、対象のscFv及びFabの出発pIに依存する部分があるであろう。すなわち、どの単量体を操作するか、またはどの「方向」(例えば、より正、若しくはより負)にするかを決定するために、2つの標的抗原のFv配列が計算され、そこから決定がなされる。当該技術分野で知られるように、異なるFvであれば、本発明で活用される異なる出発pIを有する。一般に、本明細書に概要が記載されるように、pIが操作されることにより、それぞれの単量体で、少なくとも約0.1logの総pI差異がもたらされ、本明細書に概要が記載されるように当該総pI差異は、0.2〜0.5であることが好ましい。
さらに、当業者によって理解されると共に、本明細書に概要が記載されるように、ヘテロ二量体は、サイズに基づいてホモ二量体から分離できる。例えば、図8に示すように、2つのscFvを有するヘテロ二量体(図8A)は、「三重F」形式のもの(図8B)及び二重特異性mAbのもの(図8C)によって分離できる。これは、利用する追加の抗原結合部位を有する、より高い結合価においてさらに活用できる。例えば、さらに示されるとおり、一方の単量体が、2つのFab断片を有し、もう一方が、1つのscFvを有することになるのであれば、サイズの差異をもたらし、したがって、分子量の差異につながる。
さらに、当業者によって理解されると共に、本明細書に概要が記載されるように、本明細書に概要が記載される形式は、拡張して三重特異性抗体及び四重特異性抗体を供給することもできる。この実施形態では、そのいくつかのバリエーションが図に示されており、いくつかの抗原は、二価で結合されることが可能であることを認識されるであろう(例えば、単一抗原に対する2つの抗原結合部位であって、例えば、A及びBは、典型的な二価会合の一部であり得、C及びDは、任意選択で存在し、任意選択で同一であるか、または異なり得る)。Fab及びscFvの何らかの組み合わせを、所望の結果及び組み合わせを達成するために利用できることを理解されよう。
pI変異体が、重鎖の定常領域を使用することによって、二量体化を達成するために使用される場合は、抗体を含む多特異性タンパク質の設計及び精製に対する、よりモジュール型の手法が提供される。したがって、いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体化変異体(歪曲ヘテロ二量体化変異体及び精製ヘテロ二量体化変異体を含む)は、可変領域に含まれておらず、その結果、個々の抗体は、それぞれ操作されなければならない。さらに、いくつかの実施形態では、pI変異体からもたらされる免疫原性の可能性は、異なるIgGアイソタイプ由来のpI変異体を移入することによって、著しく低減され、その結果、pIは、著しい免疫原性を導入することなく変更される。したがって、解決すべき追加の問題は、ヒト配列含量が高い低pI定常ドメインの解明であり、例えば、何らかの特定位置における非ヒト残基の最小化または回避である。
1つの実施形態では、ヘテロ二量体抗体は、scFvを使用した一方の抗原の一価の会合と、FAbを使用したもう一方の抗原の一価の会合と、を提供する。以下に概要が記載されるとおり、この形式は、変えることもでき、いくつかの実施形態では、3つの抗原の一価の会合、1つの抗原の二価の会合、ならびに第二の抗原の一価の会合(例えば、A及びCは、同一抗原へ、Bは、異なる抗原へ)等が存在する。
このpI操作で起こり得る付帯利点は、血清半減期の延長及びFcRn結合の増加でもある。すなわち、USSN13/194,904において説明されるように(参照によって、その全体が組み込まれる)、抗体定常ドメイン(抗体及びFc融合体においてみられるものを含む)のpIを下げることは、生体内において、血清での保持が長期化することにつながり得る。血清半減期の増加に向けた、こうしたpI変異体によって、精製に向けたpIの変更も促進される。
さらに、本明細書に概要が記載されるとおり、追加の機能性を追加するために、追加のアミノ酸変異体を本発明の二重特異性抗体へ導入してよい。例えば、Fc領域内に、アミノ酸の変更を(一方の単量体または両方に)追加することで、ADCCまたはCDCの増加(例えば、Fcγ受容体に対する結合の変更)を促進でき、毒物及び薬物の追加を可能にするか、またはその収率を増加(例えば、ADC向け)させることができ、ならびにFcRnに対する結合を増加させ、及び/または得られる分子の血清半減期を増加させることができる。本明細書でさらに説明されると共に、当業者によって理解されるとおり、本明細書に概要が記載される変異体のいずれか、及びすべては、任意選択かつ独立して他の変異体と組み合わせることができる。
同様に、機能性変異体の別のカテゴリーは、「Fcγ消去変異体」または「Fcノックアウト(FcKO若しくはKO)変異体である。こうした実施形態では、いくつかの治療用途に向け、Fcγ受容体(例えば、FcγR1、FcγRIIa、FcγRIIb、FcγRIIIa等)の1つまたは複数またはすべてに対するFcドメインの通常の結合を低減または除去して、作用の付加的な機構を回避することが望ましい。すなわち、例えば、多くの実施形態では、FcγRIIIa結合を消去して、ADCC活性を排除、または著しく低下させることが一般に望ましい。
さらに、本発明は、CDR、完全可変軽鎖、及び完全可変重鎖のセット、ならびに関連scFvを含む新規のヒト化抗CD3配列を提供し、当該関連scFvは、荷電scFvリンカーを任意選択で含む。こうした最適化配列は、他の抗体形式において使用できる。
本発明は、CDR、完全可変軽鎖、及び完全可変重鎖のセット、ならびに関連scFvを含む新規の抗CD38配列をさらに提供し、当該関連scFvは、荷電scFvリンカーを任意選択で含む。こうした最適化配列は、他の抗体形式において使用できる。
したがって、本発明は、CD3及びCD38の両方に結合する、二重特異性である二価抗体を産生するための新規構築物を提供する。
さらに、本発明は、異なる親和性の抗原結合ドメインを提供する。すなわち、抗CD3配列及び抗CD38配列の両方に向けて、いくつかの適応では、より強い親和性が好ましくあり得、一方で、他では、より弱い親和性が有用であり得る。したがって、いくつかの実施形態では、本発明は、CD3に対する「強」または「高親和性」結合体(例えば、1つ例は、H1.30_L1.47として示される重可変ドメイン、及び軽可変ドメインである(必要に応じて任意選択で荷電リンカーを含む))である抗CD3抗原結合ドメインを含む抗体構築物を提供する。他の実施形態では、本発明は、図47に示されるとおり、CD3に対する「軽(lite)」または「低親和性」結合体である抗CD3抗原結合ドメインを含む抗体構築物を提供する。
II.定義
本出願をより完全に理解し得るために、いくつかの定義を以下に示す。そのような定義は、文法的に等価であるものを包含することを意図する。
本明細書では、「消去」は、活性の低減または除去を意味する。したがって、たとえば、「FcγR結合の消去」は、特定の変異体を含まないFc領域と比較して、Fc領域アミノ酸変異体が、出発結合の50%未満を有することを意味し、活性を70〜80〜90〜95〜98%喪失していることが好ましく、一般に、活性は、Biacoreアッセイにおいて、検出可能な結合水準を下回る。消去変異体(本明細書では、「FcγR消去変異体」、「Fc消去変異体」、「Fcノックアウト」、(「FcKO」)または「ノックアウト」(「KO」)変異体とも呼ばれることがある)が使用される、特定用途の変異体は、図35に示すものである。
本明細書では、「ADCC」または「抗体依存性細胞傷害」は、細胞が媒介する反応であり、FcγRを発現する非特異的細胞傷害性の細胞が、標的細胞上に結合した抗体を認識し、その後に標的細胞の溶解を引き起こすことを意味する。ADCCは、FcγRIIIaに対する結合と相関しており、FcγRIIIaに対する結合の増加は、ADCC活性の増加につながる。
本明細書では、「ADCP」または抗体依存性細胞貪食は、細胞が媒介する反応であり、FcγRを発現する非特異的細胞傷害性の細胞が、標的細胞上に結合した抗体を認識し、その後に標的細胞の貪食を引き起こすことを意味する。
本明細書では、「改変」は、ポリペプチド配列における、アミノ酸の置換、挿入、及び/若しくは欠失、またはタンパク質に化学的に連結された部分に対する変更を意味する。例えば、改変は、糖質の変更またはタンパク質に付加されたPEG構造であってよい。本明細書では、「アミノ酸改変」は、ポリペプチド配列における、アミノ酸の置換、挿入、及び/または欠失を意味する。明確化に向けた説明として、別段の記載が無い限り、アミノ酸改変は、常に、DNAよってコードされるアミノ酸への改変であり、例えば、DNA及びRNAにおいてコドンを有する20個のアミノ酸である。
本明細書では、「アミノ酸置換」または「置換」は、親ポリペプチド配列における特定位置で、アミノ酸を異なるアミノ酸と置き換えることを意味する。具体的には、いくつかの実施形態では、置換は、特定位置で自然発生しないアミノ酸に対するものであり、生物内において、または何らかの生物において、いずれでも自然発生しない。例えば、置換E272Yは、変異体ポリペプチドを指し、この場合、位置272で、グルタミン酸が、チロシンで置き換えられているFc変異体である。明確化に向けた説明として、核酸がコードする配列が変わるように操作されているが、出発アミノ酸から変えていないタンパク質(例えば、CGG(アルギニンをコードする)をCGA(依然としてアルギニンをコードする)へと交換すると、宿主組織の発現水準は増加する)は、「アミノ酸置換」ではない。すなわち、同一タンパク質をコードする新しい遺伝子が創出されているにもかかわらず、タンパク質が、出発時の特定位置に、同一のアミノ酸を有するのであれば、それは、アミノ酸置換ではない。
本明細書では、「アミノ酸挿入」または「挿入」は、親ポリペプチド配列における特定位置でのアミノ酸配列の追加を意味する。例えば、−233Eまたは233Eは、位置233の後かつ位置234の前でのグルタミン酸の挿入を指定する。さらに、−233ADEまたはA233ADEは、位置233の後かつ位置234の前でのAlaAspGluの挿入を指定する。
本明細書では、「アミノ酸欠失」または「欠失」は、親ポリペプチド配列における特定位置でのアミノ酸配列の除去を意味する。例えば、G236−またはG236#またはG236delは、位置236でのグリシンの欠失を指定する。さらに、EDA233−またはEDA233#は、位置233から始まる配列GluAspAlaの欠失を指定する。同様に、ヘテロ二量体化変異体のいくつかは、「K447del」を含み、位置447で、リジンが欠失していることを意味する。
本明細書では、「変異体タンパク質」または「タンパク質変異体」または「変異体」は、少なくとも1つのアミノ酸改変の理由によって、親タンパク質のそれとは異なるタンパク質を意味する。タンパク質変異体は、タンパク質自体、タンパク質を含む組成物、またはそれをコードするアミノ配列を指してよい。好ましくは、タンパク質変異体は、親タンパク質と比較して少なくとも1つのアミノ酸改変を有し、例えば、親と比較して、約1〜約70個のアミノ酸改変、好ましくは、約1〜約5個のアミノ酸改変を有する。以下に説明されるとおり、いくつかの実施形態では、親ポリペプチド、例えば、Fc親ポリペプチドは、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4由来のFc領域などのヒト野生型配列であるが、変異体を有するヒト配列は、「親ポリペプチド」としても働くことができる。本明細書に記載されるタンパク質変異体配列は、好ましくは、親タンパク質配列との比較で、少なくとも約80%の同一性、最も好ましくは、少なくとも約90%の同一性、より好ましくは、少なくとも95〜98〜99%の同一性を有する。変異体タンパク質は、変異体タンパク質自体、タンパク質変異体を含む組成物、またはそれをコードするDNA配列を指し得る。したがって、本明細書では、「抗体変異体」または「変異体抗体」は、少なくとも1つのアミノ酸改変の理由によって、親抗体と異なる抗体を意味し、本明細書では、「IgG変異体」または「変異体IgG」は、少なくとも1つのアミノ酸改変の理由によって、親IgG(再度記載するが、多くの場合、ヒトIgG配列由来)と異なる抗体を意味し、本明細書では、「イムノグロブリン変異体」または「変異体イムノグロブリン」は、少なくとも1つのアミノ酸改変の理由によって親イムノグロブリン配列のそれと異なるイムノグロブリン配列を意味する。本明細書で使用される「Fc変異体」または「変異体Fc」は、Fcドメインにおいてアミノ酸改変を含むタンパク質を意味する。本発明のFc変異体は、それを構成するアミノ酸改変に従って定義される。したがって、例えば、N434Sまたは434Sは、親Fcポリペプチドに対して、位置434で置換セリンを有するFc変異体であり、番号付けは、EUインデックスに従うものである。同様に、M428L/N434Sは、親Fcポリペプチドに対して、置換M428L及び置換N434Sを有するFc変異体を定義する。WTアミノ酸の同一性が、特定されていなくてもよく、その場合、先に記載した変異体は、428L/434Sと呼ばれる。置換が提供される規則は任意であることに留意されたい。つまり、例えば、428L/434Sは、M428L/N434Sと同一のFc変異体である等である。本発明において論じられ、抗体に関連する位置のすべてで、別段の記載が無い限り、アミノ酸位置の番号付けは、EUインデックスに従うものである。EUインデックス、またはKabat若しくはEUの番号付けスキームにあるようなEUインデックスは、EU抗体の番号付けを指す(Edelman et al.,1969,Proc Natl Acad Sci USA 63:78−85の全体が、これにより、参照によって、本明細書に組み込まれる。)改変は、追加、欠失、または置換であり得る。置換は、自然発生するアミノ酸を含み得、場合によっては、合成アミノ酸を含み得る。例には、米国特許第6,586,207号、WO98/48032、WO03/073238、US2004−0214988A1、WO05/35727A2、WO05/74524A2、J.W.Chin et al.,(2002),Journal of the American Chemical Society 124:9026−9027、J.W.Chin,& P.G.Schultz,(2002),ChemBioChem 11:1135−1137、J.W.Chin,et al.,(2002),PICAS United States of America 99:11020−11024、及びL.Wang,& P.G.Schultz,(2002),Chem.1−10が含まれ、これらはすべて、全体が、参照によって、組み込まれる。
本明細書では、本明細書に記載される「タンパク質」は、少なくとも2つの共有結合したアミノ酸を意味し、タンパク質、ポリペプチド、オリゴペプチド、及びペプチドが含まれる。ペプチジル基は、自然発生するアミノ酸及びペプチド結合、または合成ペプチド模倣構造、すなわち、ペプトイドなどの「アナログ」を含んでよい(Simon et al.,PNAS USA 89(20):9367(1992)参照。参照にって、全体が組み込まれる)。アミノ酸は、自然発生または合成(例えば、DNAによってコードされるアミノ酸ではない)のいずれでもよく、当業者によって理解されるとおりである。例えば、ホモ−フェニルアラニン、シトルリン、オルニチン、及びノルロイシンは、本発明の目的に向けた合成アミノ酸であると考えられ、D及びL(RまたはS)で形成されたアミノ酸の両方を利用してよい。本発明の変異体は、例えば、Schultzらによって開発された技術を使用して組み込まれた合成アミノ酸の使用を含む改変を含んでよく、限定はされないが、Cropp & Shultz,2004,Trends Genet.20(12):625−30、Anderson et al.,2004,Proc Natl Acad Sci USA 101(2):7566−71、Zhang et al.,2003,303(5656):371−3、及びChin et al.,2003,Science 301(5635):964−7によって説明される方法が含まれ、これらはすべて、全体が、参照によって組み込まれる。さらに、ポリペプチドは、1つまたは複数の側鎖または末端の合成誘導体化、グリコシル化、PEG化、円順列、環化、他の分子へのリンカー、タンパク質またはタンパク質ドメインへの融合、及びペプチドタグまたはペプチド標識の追加を含んでよい。
本明細書では、「残基」は、タンパク質における位置を意味し、アミノ酸同一性と関連する。例えば、アスパラギン297(Asn297またはN297とも呼ばれる)は、ヒト抗体IgG1における位置297の残基である。
本明細書では、「Fab」または「Fab領域」は、VHイムノグロブリンドメイン、CH1イムノグロブリンドメイン、VLイムノグロブリンドメイン、及びCLイムノグロブリンドメインを含むポリペプチドを意味する。Fabは、単独でこの領域を指してよく、または全長抗体、抗体断片、またはFab融合タンパク質の構成においてこの領域を指してよい。本明細書では、「Fv」または「Fv断片」または「Fv領域」は、単一抗体のVLドメイン及びVHドメインを含むポリペプチドを意味する。
本明細書では、「IgGサブクラス改変」または「アイソタイプ改変」は、1つのIgGアイソタイプの1つのアミノ酸を、異なる、位置合わせされたIgGアイソタイプにおいて、対応するアミノ酸に変換するアミノ酸改変を意味する。例えば、EU位置296に、IgG1は、チロシンを含み、IgG2は、フェニルアラニンを含むため、IgG2におけるF296Y置換は、IgGサブクラス改変であると考えられる。
本明細書では、「非自然発生改変」は、アイソタイプではないアミノ酸改変を意味する。例えば、IgGのいずれも位置434にセリンを含まないため、IgG1、IgG2、IgG3、若しくはIgG4(またはそのハイブリッド)における置換434Sは、非自然発生改変であると考えられる。「アイソタイプ」改変は、1つの位置での、1つのアイソタイプアミノ酸の、異なるアイソタイプの主鎖への取り込み(importation)を指し、例えば、IgG1アミノ酸の、同一位置でのIgG2主鎖への取り込みである。
本明細書では、「アミノ酸」及び「アミノ酸同一性」は、DNA及びRNAによってコードされる自然に発生する20個のアミノ酸の1つを意味する。
本明細書では、「エフェクター機能」は、抗体Fc領域と、Fc受容体またはFcリガンドとの相互作用からもたらされる生化学的現象を意味する。エフェクター機能には、限定はされないが、ADCC、ADCP、及びCDCが含まれる。
本明細書では、「IgG Fcリガンド」は、IgG抗体のFc領域に結合し、Fc/Fcリガンド複合体を形成する、何らかの生物由来の分子、好ましくは、ポリペプチドを意味する。Fcリガンドには、限定はされないが、FcγRI、FcγRII、FcγRIII、FcRn、C1q、C3、マンナン結合レクチン、マンノース受容体、ブドウ球菌プロテインA、ブドウ球菌プロテインG、及びウイルスFcγRが含まれる。Fcリガンドは、FcγRに相同性のFc受容体のファミリーであるFc受容体相同体(FcRH)(Davis et al.,2002,Immunological Reviews 190:123−136の全体が、参照によって、組み込まれる)も含む。Fcリガンドには、Fcに結合する未発見分子を含まれてよい。特定のIgG Fcリガンドは、FcRn及びFcガンマ受容体である。本明細書では、「Fcリガンド」は、抗体のFc領域に結合し、Fc/Fcリガンド複合体を形成する、何らかの生物由来の分子、好ましくはポリペプチドを意味する。
本明細書では、「Fcガンマ受容体」、「FcγR」、または「FcガンマR」は、IgG抗体のFc領域に結合するタンパク質ファミリーの何らかのメンバーを意味し、FcγR遺伝子によってコードされる。ヒトにおいては、このファミリーには、限定はされないが、アイソフォームFcγRIa、アイソフォームFcγRIb、及びアイソフォームFcγRIcを含むFcγRI(CD64)、アイソフォームFcγRIIa(アロタイプH131及びアロタイプR131を含む)、アイソフォームFcγRIIb(FcγRIIb−1及びFcγRIIb−2を含む)、ならびにアイソフォームFcγRIIcを含むFcγRII(CD32)、ならびにアイソフォームFcγRIIIa(アロタイプV158及びアロタイプF158を含む)、及びアイソフォームFcγRIIIb(アロタイプFcγRIIb−NA1及びアロタイプFcγRIIb−NA2を含む)を含むFcγRIII(CD16)(Jefferis et al.,2002,Immunol Lett 82:57−65の全体が、参照によって組み込まれる)、ならびに何らかの未発見のヒトFcγRまたはFcγRアイソフォーム若しくはFcγRアロタイプが含まれる。FcγRは、何らかの生物由来であってよく、限定はされないが、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、及びサルが含まれる。マウスFcγRには、限定はされないが、FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)、FcγRIII(CD16)、及びFcγRIII−2(CD16−2)、ならびに何らかの未発見のマウスFcγRまたはFcγRアイソフォーム若しくはFcγRアロタイプが含まれる。
本明細書では、「FcRn」または「新生児型Fc受容体」は、IgG抗体のFc領域に結合するタンパク質を意味し、少なくとも一部がFcRn遺伝子によってコードされる。FcRnは、何らかの生物由来であってよく、限定はされないが、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、及びサルが含まれる。当該技術分野で知られるように、機能性FcRnタンパク質は、2つのポリペプチドを含み、重鎖及び軽鎖と呼ばれることが多い。軽鎖は、ベータ−2−ミクログロブリンであり、重鎖は、FcRn遺伝子によってコードされる。別段の記載が無い限り、FcRnまたはFcRnタンパク質は、FcRn重鎖のベータ−2−ミクログロブリンとの複合体を指す。様々なFcRn変異体が、FcRn受容体に対する結合の増加に使用され、場合によっては、血清半減期の増加に使用される。FcRn受容体に対する結合の増加、及び血清半減期の対応する増加を与えるFc変異体には、限定はされないが、434A、434S、428L、308F、259I、428L/434S、259I/308F、436I/428L、436IまたはV/434S、436V/428L、252Y、252Y/254T/256E、及び259I/308F/428Lが含まれる。すなわち、図8Bの三重F形式は、単量体配列のいずれか、または両方にこうしたFcRn変異体のいずれかを有し得る。明確化に向けた説明として、重鎖はそれぞれ異なり、FcRn変異体(及びFc変異体)は、単量体の一方または両方に存在し得る。
本明細書では、「親ポリペプチド」は、後に改変されて変異体が生成する出発ポリペプチドを意味する。親ポリペプチドは、自然発生するポリペプチド、または変異体、または自然発生するポリペプチドの操作された型であってよい。親ポリペプチドは、ポリペプチド自体、親ポリペプチドを含む組成物、またはそれをコードするアミノ酸配列を指し得る。したがって、本明細書では、「親イムノグロブリン」は、改変されて変異体が生成する未改変イムノグロブリンポリペプチドを意味し、本明細書では、「親抗体」は、改変されて変異体抗体を生成する未改変抗体を意味する。「親抗体」は、以下に概要が記載される、既知であって、市販の、組換えで産生される抗体を含む。
本明細書では、「Fc融合タンパク質」または「イムノアドヘシン」は、Fc領域を含むタンパク質を意味し、当該Fc領域は、一般に、本明細書で説明される、標的タンパク質に対する結合部分などの異なるタンパク質に、連結(任意選択で、本明細書で説明されるリンカー部分を介する)される。
本明細書では、「位置(postion)」は、タンパク質の配列における場所(location)を意味する。位置は、連続して番号付けしてよく、または確立された形式に従ってよく、例えば、抗体の番号付けのためのEUインデックスに従ってよい。
本明細書に記載される、本発明のヘテロ二量体タンパク質の単量体の構成における「鎖性(strandedness)」は、「適合」するDNAの2つの鎖(strand)と同様に、ヘテロ二量体化変異体が、「適合」してヘテロ二量体を形成する能力を保つように、それぞれの単量体へと取り込まれることを意味する。例えば、いくつかのpI変異体が、単量体Aへと操作導入されている(例えば、pIを高くする)のであれば、「電荷対」である立体変異体も利用することができ、pI変異体を妨害しない。例えば、pIを高くする電荷変異体を、同一「鎖」または同一「単量体」に加えることにより、両機能性が保持される。
本明細書では、「標的抗原」は、所与の抗体の可変領域によって特異的に結合される分子を意味する。標的抗原は、タンパク質、糖質、脂質、または他の化学化合物であってよい。本発明の好ましい標的抗原は、CD3及びCD38である。
本明細書では、「標的細胞」は、標的抗原を発現している細胞を意味する。
本明細書では、「可変領域」は、カッパイムノグロブリン、ラムダイムノグロブリン、及び重鎖イムノグロブリンの遺伝子座位をそれぞれ構成するV.カッパ遺伝子、V.ラムダ遺伝子、及び/またはVH遺伝子のいずれかによって実質的にコードされる1つまたは複数のIgドメインを含むイムノグロブリンの領域を意味する。
本明細書では、「野生型またはWT」は、天然においてみられるアミノ酸配列またはヌクレオチド配列を意味し、対立遺伝子変動を含む。WTタンパク質は、意図的に改変されていないアミノ酸配列またはヌクレオチド配列を有する。
「単鎖可変断片」、「scFv」、または「単鎖Fv」は、当該技術分野でよく理解されており、本明細書では、抗体の可変重鎖及び可変軽鎖の融合タンパク質を意味し、通常、リンカーペプチドで連結されている。当該技術分野でよく知られる典型的なscFvリンカーは、一般に、長さがアミノ酸で10〜25個であり、グリシン及びセリンを含む。
本明細書では、「荷電scFvリンカー」は、少なくとも1つのscFvを含むヘテロ二量体抗体の創出及び精製において使用に向けて、荷電アミノ酸を利用するscFvリンカーを意味する。適した荷電scFvリンカーは、図に示されるが、他のものを使用できる。一般的に、本発明において使用するための荷電scFvリンカーは、伝統的に使用される(GGGGS)3−5配列などの標準非荷電scFvリンカーと比較して、3〜8(3、4、5、6、7、または8のすべてが可能である)の電荷の変化を有する(負または正のいずれか)。当業者によって、2つのscFvを利用するヘテロ二量体抗体は、1つの電荷リンカー、及び1つの中性リンカー(例えば、正または負に荷電したscFvリンカー)、または2つの逆に荷電したscFvリンカー(1つが正、1つが負)を有し得ることを理解されよう。
ヘテロ二量体タンパク質
本発明は、多特異性、特に二重特異性結合タンパク質の生成を対象とし、具体的には、scFvを含む一方の単量体、及びFvを含むもう一方の単量体を有する多特異的抗体を対象とする。本明細書で論じられるとおり、開示される実施形態の多くが、CD3に結合するscFv及びCD38に結合するFv(またはFab)を使用する。あるいは、本明細書に記載されるvh及びvlの抗CD38配列をscFv構築物において使用することができ、ここで、抗CD3単量体は、Fabである。
抗体
本発明は、多特異性抗体、一般には、治療用抗体の生成に関する。以下に論じられるように、「抗体」という用語が、一般に使用される。本発明において有用である抗体は、本明細書で説明される多くの形式で使用でき、伝統的な抗体、ならびに以下に説明される抗体の誘導体、断片、及び模倣体が含まれる。一般に、「抗体」という用語は、少なくとも1つの定常ドメインを含む何らかのポリペプチドを含み、当該定常ドメインには、限定はされないが、CH1、CH2、CH3、及びCLが含まれる。本明細書に記載される特に好ましい抗体は「三重F」形式の抗体である。
伝統的な抗体構造単位は、典型的には、四量体を含む。それぞれの四量体は、典型的には、ポリペプチド鎖の2つの同一対からなり、それぞれの対が、1つの「軽」鎖(典型的には、約25kDaの分子量を有する)、及び1つの「重」鎖(典型的には、約50〜70kDaの分子量を有する)を有する。ヒト軽鎖は、カッパ軽鎖及びラムダ軽鎖として分類される。本発明は、IgGクラスを対象とし、IgGクラスは、いくつかのサブクラスを有し、限定はされないが、IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4が含まれる。したがって、本明細書では、「アイソタイプ」は、その定常領域の化学的特性及び抗原特性によって定義されるイムノグロブリンのサブクラスのいずれかを意味する。治療用抗体は、アイソタイプ及び/またはサブクラスのハイブリッドも含み得ることを理解されるべきである。例えば、参照によって組み込まれる米国公開第2009/0163699号に示されるように、本発明は、IgG1/G2ハイブリッドのpI操作を含む。
それぞれの鎖のアミノ末端部分は、抗原認識を第一に担う約100〜110個またはそれより多いアミノ酸の可変領域を含み、可変領域は、一般に、当該技術分野及び本明細書で「Fvドメイン」または「Fv領域」と呼ばれる。可変領域では、3つのループが、重鎖及び軽鎖のVドメインのそれぞれに向けて集まり、抗原結合部位を形成する。ループのそれぞれは、相補性決定領域と呼ばれ(以下で「CDR」と呼ばれる)、アミノ酸配列における変動が最も顕著である。「可変」は、可変領域のある一定のセグメントが、抗体間の配列において広く異なるという事実を指す。可変領域内の可変性は、均等に分布していない。その代わりに、V領域は、相対的に不変な区間からなり、当該区間は、それぞれの長さがアミノ酸で、9〜15個か、またはそれより長い「超可変領域」と呼ばれる極度に可変性の、より短い領域によって分離されており、15〜30個のアミノ酸のフレームワーク領域(FR)と呼ばれる。
VH及びVLは、それぞれが3つの超可変領域(「相補性決定領域」、「CDR」)及び4つのFRからなり、次の順序で、アミノ末端からカルボキシ末端へと配置される。すなわち、FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4である。
超可変領域は、軽鎖可変領域における、約アミノ酸残基24〜34(LCDR1;「L」は軽鎖を示す)、50〜56(LCDR2)、及び89〜97(LCDR3)、重鎖可変領域における、およそ約31〜35B(HCDR1;「H」は、重鎖を示す)、約50〜65(HCDR2)、及び約95〜102(HCDR3)のアミノ酸残基;Kabat et al.,SEQUENCES OF PROTEINS OF IMMUNOLOGICAL INTEREST,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991)、ならびに/または超可変ループを形成するそうした残基(例えば、軽鎖可変領域における残基26〜32(LCDR1)、50〜52(LCDR2)、及び91〜96(LCDR3)、ならびに重鎖可変領域における26〜32(HCDR1)、53〜55(HCDR2)、及び96〜101(HCDR3);Chothia and Lesk(1987)J.Mol.Biol.196:901−917、由来のアミノ酸残基を包含することが一般的である。本発明の特定のCDRは、以下に説明される。
本明細書を通して、可変ドメイン(およそ、軽鎖可変領域の残基1〜107、及び重鎖可変領域の残基1〜113)における残基を指すときは、Kabat番号付けシステムが一般に使用される(例えば、Kabat et al.,supra(1991))。
CDRは、抗体結合の形成に寄与し、またはより具体的には、抗体のエピトープ結合部位の形成に寄与する。「エピトープ」は、パラトープとして知られる、抗体分子の可変領域における特定抗原結合部位と相互作用する決定基を指す。エピトープは、アミノ酸または糖側鎖などの分子の分類であり、通常、特定の構造特性、及び特定の電荷特性を有する。単一抗原が複数のエピトープを有してよい。
エピトープは、結合に直接関与するアミノ酸残基(エピトープの免疫優性成分とも呼ばれる)、及び特異的な抗原結合ペプチドによって、効果的に遮断されるアミノ残基などの、結合に直接関与しない他のアミノ酸残基を含んでよい。換言すれば、当該アミノ酸残基は、特異的な抗原結合ペプチドのフットプリントの範疇である。
エピトープは、立体構造的、または直線的のいずれでもよい。立体構造的エピトープは、空間的に並置されたアミノ酸によって、直線的ポリペプチド鎖の異なるセグメントから産生される。直線的エピトープは、ポリペプチド鎖における隣接アミノ酸残基によって産生されるものである。立体的エピトープ及び非立体的エピトープは、前者に対する結合であって、後者に対するものではない結合が、変性溶媒の存在下で消失するという点で区別されてよい。
エピトープは、特有の空間的立体構造において、典型的には少なくとも3個のアミノ酸を含み、より典型的には、少なくとも5または8〜10個のアミノ酸を含む。同一エピトープを認識する抗体は、1つの抗体が、標的抗原に対する別の抗体の結合を遮断する能力を示す単純なイムノアッセイにおいて検証でき、例えば、「ビニング(binning)」である。
それぞれの鎖のカルボキシ末端部分は、エフェクター機能を第一に担う定常領域を定義する。Kabatらは、重鎖及び軽鎖の可変領域の多数の一次配列を収集した。配列保存の程度に基づき、彼らは、個々の一次配列をCDR及びフレームワークへと分類し、その一覧を作った(SEQUENCES OF IMMUNOLOGICAL INTEREST,5th edition,NIH publication,No.91−3242,E.A.Kabat et al.を参照のこと。参照によって、全体が組み込まれる)。
イムノグロブリンのIgGサブクラスでは、重鎖において、いくつかのイムノグロブリンドメインが存在する。本明細書では、「イムノグロブリン(Ig)ドメイン」は、明確に異なる三次構造を有するイムノグロブリンの領域を意味する。本発明における対象は、定常重(CH)ドメイン及びヒンジドメインを含む重鎖ドメインにある。IgG抗体の構成では、IgGアイソタイプは、それぞれが3つのCH領域を有する。したがって、IgGの構成における「CH」ドメインは、次の通りである。「CH1」は、Kabatにあるように、EUインデックスによる位置118〜220を指し、「CH2」は、Kabatにあるように、EUインデックスによる位置237〜340を指し、及び「CH3」は、Kabatにあるように、EUインデックスによる位置341〜447を指す。本明細書に示され、以下に説明されるように、pI変異体は、以下に論じられる1つまたは複数のCH領域、及びヒンジ領域であり得る。
本明細書に示される配列は、位置118であるCH1領域から始まり、別段の記載が無い限り、可変領域は含まれないことに留意されるべきである。例えば、配列識別番号2の第一アミノ酸は、配列一覧表で、位置「1」であると指定されるが、EU番号付けによるCH1領域の位置118に対応する。
重鎖のIgドメインの別の型は、ヒンジ領域である。本明細書では、「ヒンジ」または「ヒンジ領域」または「抗体ヒンジ領域」または「イムノグロブリンヒンジ領域」は、抗体の第一定常ドメイン及び第二定常ドメインの間にアミノ酸を含む可動性のポリペプチドを意味する。構造的に、IgG CH1ドメインは、EU位置220で終了し、IgG CH2ドメインは、残基EU位置237から始まる。したがって、本明細書では、IgGに向けて、抗体ヒンジは、位置221(IgG1におけるD221)〜位置236(IgG1におけるG236)を含むと定義され、番号付けは、Kabatにあるように、EUインデックスによるものである。いくつかの実施形態では、例えば、Fc領域の構成では、下位ヒンジ(lower hinge)が含まれ、「下位ヒンジ」は、一般的に位置226または位置230を指す。本明細書に示されるとおり、pI変異体は、ヒンジ領域においても作ることができる。
軽鎖は、一般に、2つのドメイン、可変軽ドメイン(Fv領域を形成する可変重ドメインと共に軽鎖CDRを含む)、及び定常軽鎖領域(CLまたはCκと呼ばれることが多い)を含む。
以下に概要が記載される、追加の置換向けの別の関心領域は、Fc領域である。本明細書では、「Fc」または「Fc領域」または「Fcドメイン」は、第一定常領域イムノグロブリンドメイン、及び場合によっては、ヒンジ部分を除く抗体の定常領域を含むポリペプチドを意味する。したがって、Fcは、IgA、IgD、及びIgGの最後の2つの定常領域イムノグロブリンドメイン、IgE及びIgMの最後の3つの定常領域イムノグロブリンドメイン、ならびにこうしたドメインに対する可動性のヒンジN末端を指す。IgA及びIgM向けに、Fcは、J鎖を含んでよい。IgG向けに、Fcドメインは、イムノグロブリンドメインCγ2及びイムノグロブリンドメインCγ3(Cγ2及びCγ3)、ならびにCγ1(Cγ1)及びCγ2(Cγ2)の間の下位ヒンジ領域を含む。Fc領域の境界は、変わってよいが、ヒトIgG重鎖Fc領域は、残基C226または残基P230をそのカルボキシ末端に含めると定義されることが通常であり、番号付けは、Kabatにあるように、EUインデックスによるものである。いくつかの実施形態では、以下に、より完全に説明されるように、アミノ酸改変が、Fc領域に対してなされることで、例えば、1つまたは複数のFcγR受容体に対する結合、またはFcRn受容体に対する結合が変わる。
いくつかの実施形態では、抗体は、全長である。本明細書では、「全長抗体」は、抗体の天然の生物学的形態を構成する構造を意味し、以下に概要が記載される1つまたは複数の改変を含む可変領域、及び定常領域を含む。
あるいは、抗体は、様々な構造を含むことができ、限定はされないが、抗体断片、モノクローナル抗体、二重特異性抗体、低分子化抗体(minibody)、ドメイン抗体、合成抗体(本明細書で「抗体模倣物」と呼ばれることがある)、キメラ抗体、ヒト化抗体、抗体融合体(「抗体結合体」と呼ばれることがある)、及びそれぞれの断片が、それぞれ含まれる。
1つの実施形態では、抗体は、抗体断片であり、それが、pI操作などで、ヘテロ二量体を産生するように操作できる少なくとも1つの定常ドメインを含む場合に限られる。使用できる他の抗体断片には、pIが操作される、本発明の1つまたは複数のCH1ドメイン、CH2ドメイン、CH3ドメイン、ヒンジドメイン、及びCLドメインを含む断片が含まれる。例えば、Fc融合体は、Fc領域(CH2及びCH3、任意選択でヒンジ領域を有する)が別のタンパク質に融合した融合体である。多くのFc融合体が、当該技術分野で知られており、本発明のヘテロ二量体化変異体の追加によって改良できる。この場合、抗体融合体を、CH1と、CH1、CH2、及びCH3と、CH2と、CH3と、CH2及びCH3と、CH1及びCH3と、を含めて作ることができ、それらのいずれか、またはすべてを、本明細書において説明されるヘテロ二量体化変異体のいずれかの組み合わせを利用して、任意選択でヒンジ領域を含めて作ることができる。
本発明のいくつかの実施形態では、一方の単量体は、Fcドメインに連結されたscFVを含む重鎖を含み、もう一方の単量体は、Fcドメインに連結されたFabを含む重鎖を含む。例えば、「典型的な」重鎖、及び軽鎖である。本明細書では、「Fab」または「Fab領域」は、VHイムノグロブリンドメイン、CH1イムノグロブリンドメイン、VLイムノグロブリンドメイン、及びCLイムノグロブリンドメインを含むポリペプチドを意味する。Fabは、この領域を単独で指してよく、または全長抗体、抗体断片、若しくはFab融合タンパク質の構成におけるこの領域を指してよい。本明細書では、「Fv」または「Fv断片」または「Fvドメイン領域」は、単一抗体のVLドメイン及びVHドメインを含むポリペプチドを意味する。
キメラ抗体及びヒト化抗体
いくつかの実施形態では、抗体は、異なる種由来の混合物であり得、例えば、キメラ抗体及び/またはヒト化抗体である。一般に、「キメラ抗体」及び「ヒト化抗体」の両方が、複数の種由来の領域を組み合わせる抗体を指す。例えば、「キメラ抗体」は、伝統的に、マウス(または場合によってはラット)由来の可変領域、及びヒト由来の定常領域を含む。「ヒト化抗体」は、一般に、ヒト抗体においてみられる配列と交換された可変ドメインフレームワーク領域を有する非ヒト抗体を指す。一般に、ヒト化抗体では、CDRを除き、抗体全体が、ヒト起源のポリヌクレオチドによってコードされるか、またはそのCDR内は除いて、そのような抗体と同一である。CDRのいくつか、またはすべては、非ヒト生物起源の核酸によってコードされており、抗体を創出するためにヒト抗体可変領域のβシートフレームワークへ移植され、その特異性は、移植されたCDRによって決定される。そのような抗体の創出は、例えば、WO92/11018、Jones,1986,Nature 321:522−525、Verhoeyen et al.,1988,Science 239:1534−1536において説明されており、これらはすべて、全体が、参照によって、組み込まれる。対応するドナー残基に対して選択されたアクセプターフレームワーク残基の「復帰突然変異(Backmutation)」が、初期移植構築物において消失した親和性を回復するために必要であることが多い(US5530101、US5585089、US5693761、US5693762、US6180370、US5859205、US5821337、US6054297、US6407213、これらはすべて、全体が、参照によって、組み込まれる)。ヒト化抗体は、イムノグロブリンの定常領域の少なくとも一部も最適に含むであろうし、これは、典型的には、ヒトイムノグロブリンのものであることから、したがって、典型的には、ヒトFc領域を含むことになる。ヒト化抗体は、遺伝学的に操作された免疫系を有するマウスを使用して生成させることもできる。Roque et al.,2004,Biotechnol.Prog.20:639−654の全体が、参照によって、組み込まれる。非ヒト抗体のヒト化及び再形成のための様々な技術及び方法が、当該技術分野でよく知られている(Tsurushita & Vasquez,2004,Humanization of Monoclonal Antibodies,Molecular Biology of B Cells,533−545,Elsevier Science(USA)、及びそこでの引用文献参照のこと。これらはすべて、全体が、参照によって、組み込まれる)ヒト化の方法には、限定はされないが、Jones et al.,1986,Nature 321:522−525、Riechmann et al.,1988、Nature 332:323−329、Verhoeyen et al.,1988,Science,239:1534−1536、Queen et al.,1989,Proc Natl Acad Sci,USA 86:10029−33、He et al.,1998,J.Immunol.160:1029−1035、Carter et al.,1992,Proc Natl Acad Sci USA 89:4285−9,Presta et al.,1997,Cancer Res.57(20):4593−9、Gorman et al.,1991,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:4181−4185、O’Connor et al.,1998,Protein Eng 11:321−8において説明される方法が含まれ、これらはすべて、全体が、参照によって、組み込まれる。非ヒト抗体可変領域の免疫原性を低下させるヒト化または他の方法には、例えば、Roguska et al.,1994,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:969−973において説明されるような表面再構成法(resurfacing method)が含まれ、参照によって、全体が、組み込まれる。1つの実施形態では、親抗体は、親和性が成熟しており、当該技術分野で知られるとおりである。構造に基づく方法が、ヒト化及び親和性の成熟に用いられてよく、例えば、USSN11/004,590において説明されるとおりである。ヒト化及び/または抗体可変領域の親和性成熟のために、選択に基づく方法が用いられてよく、限定はされないが、Wu et al.,1999,J.Mol.Biol.294:151−162、Baca et al.,1997,J.Biol.Chem.272(16):10678−10684、Rosok et al.,1996,J.Biol.Chem.271(37):22611−22618、Rader et al.,1998,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 95:8910−8915、Krauss et al.,2003,Protein Engineering 16(10):753−759において説明される方法が含まれ、これらはすべて、全体が、参照によって、組み込まれる。他のヒト化方法は、CDRの一部のみの移植を伴うものでよく、限定はされないが、USSN09/810,510、Tan et al.,2002,J.Immunol.169:1119−1125、De Pascalis et al.,2002,J.Immunol.169:3076−3084において説明される方法が含まれ、これらはすべて、全体が、参照によって、組み込まれる。
多特異性抗体構築物
当業者によって理解され、以下により完全に論じられるように、本発明のヘテロ二量体融合タンパク質は、多岐にわたる立体配置をとり、好ましい実施形態は、図Bに「三重F」構築物として示されるものである。
ヘテロ二量体重鎖定常領域
したがって、本発明は、第一ドメインとして変異体重鎖構築物領域を含む単量体の使用に基づく二量体タンパク質を提供する。本明細書では、「単量体」は、ヘテロ二量体タンパク質の半分を意味する。伝統的な抗体は、実際は、四量体(2つの重鎖、及び2つの軽鎖)であることに留意されるべきである。本発明の構成においては、重鎖−軽鎖の1つの対(適用可能な場合であり、例えば、単量体がFabを含む場合)は、「単量体」であると考えられる。同様に、scFvを含む重鎖領域は、単量体であると考えられる。本質的に、それぞれの単量体は、ヘテロ二量体化操作を可能にするために十分な重鎖定常領域を含み、それが、定常領域のすべてであるか、例えば、Ch1−ヒンジ−CH2−CH3、Fc領域(CH2−CH3)、またはCH3ドメインのみであるかは、問わない。
変異体重鎖定常領域は、重鎖定常領域のすべて、または一部を含むことができ、全長構築物、CH1−ヒンジ−CH2−CH3、またはその部分が含まれ、その部分には、例えば、CH2−CH3またはCH3単独が含まれる。さらに、それぞれの単量体の重鎖領域は、同一主鎖(CH1−ヒンジ−CH2−CH3若しくはCH2−CH3)であるか、または異なり得る。N末端及びC末端の短縮化及び追加も定義に含まれ、例えば、pI変異体によっては、重鎖ドメインのC末端への荷電アミノ酸の追加を含む。
したがって、一般に、本発明の「三重F」構築物の一方の単量体は、scFv領域−ヒンジ−Fcドメイン)であり、もう一方は、(VH−CH1−ヒンジ−CH2−CH3と、関連軽鎖)であって、ヘテロ二量体化変異体を有し、当該ヘテロ二量体化変異体には、立体変異体及びpI変異体、Fc変異体及びFcRn変異体、ならびにこうした領域に含まれる追加の抗原結合ドメイン(任意選択のリンカーを有する)が含まれる。
本明細書に概要が記載されるヘテロ二量体化変異体(例えば、立体変異体及びpI変異体)に加えて、重鎖領域は、追加のアミノ酸置換も含んでよく、以下に論じられるFcγR結合及びFcRn結合を変えるための変更が含まれる。
さらに、単量体によっては、「ボトルオープナー」のscFv部分のためのリンカーを利用できる。三重F形式では、1つの荷電scFvリンカーを使用する。本明細書に示されるとおり、標的抗原向けscFvの固有pI、及びもう一方の標的抗原のFabの固有pIによって、荷電scFvリンカーは、正または負のいずれかであり得る。二重scFv形式では、単一荷電scFvリンカーのいずれかが、1つの単量体(再度記載するが、正または負のいずれかである)または両方の単量体(1つが正であり、1つが負である)に使用される。この実施形態では、2つのリンカーのそれぞれの電荷は、同一である必要はない(例えば、一方は、+3であり、もう一方は、−4等である)。
1つの実施形態では、scFvが、抗CD3抗原結合部位であり、正に荷電したscFvリンカーを含む。あるいは、「ボトルオープナー」構築物のscFvが、抗CD38抗原結合部位であり得る。
ヘテロ二量体化変異体は、多くの異なる型の変異体を含み、限定はされないが、立体変異体(電荷変異体を含む)、及びpI変異体が含まれ、任意選択かつ独立して何らかの他の変異体と組み合わせることができる。こうした実施形態では、「単量体A」と、「単量体B」とを適合させることが重要であり、すなわち、ヘテロ二量体タンパク質が、立体変異体及びpI変異体の両方に依存するのであれば、これらは、それぞれの単量体に正しく適合する必要がある。例えば、それぞれの単量体に存在する変異体が設計され、所望の機能が達成されるように、機能する立体変異体のセット(1つのセットは、単量体Aに存在し、1つのセットは単量体Bに存在する)が、pI変異体のセット(1つのセットは、単量体Aに存在し、1つのセットは単量体Bに存在する)と組み合わせられる。立体変異体が、電荷も変え得る例では、正しいセットを、正しい単量体に適合させる必要がある。
本明細書に概要が記載されるヘテロ二量体化変異体(例えば、限定はされないが、図に示されるそうした変異体を含む)は、何らかの他の変異体と任意選択かつ独立に組み合わせることができ、及び何らかの他の単量体に任意選択かつ独立に存在し得ることに留意することが重要である。したがって、例えば、1つの図に由来の、単量体1向けのpI変異体を、異なる図にある、単量体1向けの他のヘテロ二量体化変異体に追加することができ、または単量体2から追加することができる。すなわち、ヘテロ二量体化に重要なことは、1つのセットは、一方の単量体向けであり、1つのセットは、もう一方の単量体向けである、変異体の「セット」が存在するということである。それらは、図1のものから図1のものへ組み合わされる(例えば、単量体1の一覧にあるものは、共に機能する)か、または交換される(単量体1のpI変異体が、単量体2の立体変異体と)かは、重要ではない。しかしながら、本明細書に示されるとおり、上に概要を記載したように組み合わせが作られるとき、「鎖性」は、維持されるべきであり、その結果、好ましいヘテロ二量体化が起こる。例えば、pIを上昇させる電荷変異体は、pIが上昇した変異体、及び/または上昇pIを有するscFvリンカー等と共に使用されるべきである。さらに、追加のFc変異体向けに(FcγR結合、FcRn結合、消去変異体等向けなど)、どちらかの単量体、または両単量体が、記載した変異体のいずれかを独立かつ任意選択で含むことができる。いくつかの場合では、両単量体が、追加の変異体を有し、いくつかの場合では、1つの単量体のみが、追加の変異体を有するか、またはそれらを組み合わせることができる。
ヘテロ二量体化変異体
本発明は、例えば、図8Bに示される「三重F」骨格または「ボトルオープナー」骨格の多特異性抗体形式を提供する。
立体変異体
いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体の形成は、立体変異体の追加によって促進され得る。すなわち、それぞれの重鎖におけるアミノ酸を変更することによって、同一Fcアミノ酸配列を有するホモ二量体の形成と比較して、異なる重鎖が、会合してヘテロ二量体構造を形成する可能性が高くなる。適した立体変異体は、図に示される。
1つの機構は、当該技術分野において、「ノブアンドホール」と一般に呼ばれるものであり、立体的な影響を創出し、ヘテロ二量体形成に有利に働き、ホモ二量体形成を抑制するアミノ酸操作を指し、任意選択で使用することもできる。これは、「ノブアンドホール」と呼ばれることがあり、USSN61/596,846,Ridgway et al.,Protein Engineering 9(7):617(1996)、Atwell et al.,J.Mol.Biol.1997 270:26、米国特許第8,216,805号において説明されるとおりであり、これらはすべて、全体が、参照によって、本明細書に組み込まれる。図4及び図5は、以下にさらに説明され、それによって、「ノブアンドホール」に依存する多くの「単量体A−単量体B」の対が明らかとなる。さらに、Merchant et al.,Nature Biotech.16:677(1998)において説明されるとおり、こうした「ノブアンドホール」変異は、ジスルフィド結合と組み合わせて、形成をヘテロ二量体化へと歪曲することができる。
ヘテロ二量体の生成において有用である追加の機構は、「静電操縦」と呼ばれることがあり、Gunasekaran et al.,J.Biol.Chem.285(25):19637(2010)において説明されるとおりである。当該文献は、参照によって、その全体が、本明細書に組み込まれる。これは、本明細書で「電荷対」と呼ばれることがある。この実施形態では、静電気が、形成をヘテロ二量体化へと歪曲するために使用される。当業者であれば、これらは、pIに対しても効果を有し得、そうすることで、精製に対しても影響を有し得、したがって、場合によっては、pI変異体であり得るとも考えられることを理解されるであろう。しかしながら、これらは、ヘテロ二量体化を押し進めるために生成され、精製手段としては使用されなかったため、それらは、「立体変異体」として分類される。これらには、限定はされないが、D221R/P228R/K409Rと対であるD221E/P228E/L368E(例えば、これらは、「単量体が対応するセットである)及びC220R/E224R/P228R/K409Rと対であるC220E/P228E/368Eなどの、図中の、75%を超えるヘテロ二量体化をもたらす変異体が含まれる。
追加の単量体A変異体、及び単量体B変異体を、本明細書に概要が記載されるpI変異体または、US2012/0149876の図37に示される他の立体変異体などの他の変異体と、任意選択かつ独立して、何らかの量で、組み合わせることができる。当該特許文献の図及び説明文が、参照によって、本明細書に明確に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本明細書に概要が記載される立体変異体を、pI変異体(またはFc変異体、FcRn変異体、消去変異体等の他の変異体)を含む何らかのヘテロ二量体化変異体と共に1つまたは両方の単量体へ、任意選択かつ独立して、組み込むことができる。
ヘテロ二量体向けのpI(等電点)変異体
一般に、当業者によって理解されるように、pI変異体には2つの一般的なカテゴリーが存在する。タンパク質のpIを増加させるもの(塩基性の変更)、及びタンパク質のpIを減少させるもの(酸性の変更)である。本明細書に説明されるとおり、こうした変異体の組み合わせは、すべて実施することが可能である。すなわち、一方の単量体が、野生型、または野生型と顕著に異なるpIを示さない変異体であり得、もう一方は、より塩基性、またはより酸性であり得る。あるいは、それぞれの単量体が、1つは、より塩基性へ、1つは、より酸性へと変更される。
pI変異体の好ましい組み合わせは図に示される。
重鎖酸性pIの変更
したがって、変異体重鎖定常ドメインを含む1つの単量体が、より正に(例えば、pIの低下)作られることになるとき、次の置換の1つまたは複数を作ることができる。すなわち、S119E、K133E、K133Q、T164E、K205E、K205Q、N208D、K210E、K210Q、K274E、K320E、K322E、K326E、K334E、R355E、K392E、K447の欠失、C末端におけるペプチドDEDEの追加、G137E、N203D、K274Q、R355Q、K392N、及びQ419Eである。本明細書に概要が記載され、図に示されるとおり、こうした変更は、IgG1に対して示されるが、すべてのアイソタイプ及びアイソタイプハイブリッドを、このように変えることができる。
重鎖定常ドメインが、IgG2〜4由来である場合は、R133E及びR133Qも使用できる。
塩基性pIの変更
したがって、変異体重鎖定常ドメインを含む1つの単量体が、より負に(例えば、pIの増加)作られることになるとき、次の置換の1つまたは複数を作ることができる。すなわち、Q196K、P217R、P228R、N276K、及びH435Rである。本明細書に概要が記載され、図に示されるとおり、こうした変更は、IgG1に対して示されるが、すべてのアイソタイプ及びアイソタイプハイブリッドを、このように変えることができる。
抗体ヘテロ二量体軽鎖変異体
抗体に基づくヘテロ二量体の場合で、例えば、単量体の少なくとも1つが、重鎖ドメインに加えて軽鎖を含む場合、pI変異体を軽鎖に作ることもできる。軽鎖のpIを低下させるためのアミノ酸置換には、限定はされないが、K126E、K126Q、K145E、K145Q、N152D、S156E、K169E、S202E、K207E、及び軽鎖のC末端におけるペプチドDEDEの追加が含まれる。定常ラムダ軽鎖に基づくこのカテゴリーにおける変更には、R108Q、Q124E、K126Q、N138D、K145T、及びQ199Eでの1つまたは複数の置換が含まれる。さらに、軽鎖のpIの増加も可能である。
アイソタイプ変異体
さらに、本発明の多くの実施形態が、1つのIgGアイソタイプから別のものへの、特定位置でのpIアミノ酸の「取り込み」に依存しており、したがって、変異体へ導入される不要な免疫原性の可能性を低下または除去している。すなわち、IgG1は、高いエフェクター機能を含めて、様々な理由で、治療用抗体のための共通のアイソタイプである。しかしながら、IgG1の重定常領域は、IgG2のそれと比較して、より高いpIを有している(8.10対7.31)。特定位置で、IgG2残基を、IgG1主鎖へ導入することによって、得られる単量体のpIは低下(または増加)し、付加的に血清半減期の長期化を示す。例えば、IgG1は、位置137にグリシン(pI5.97)を有し、IgG2は、グルタミン酸(pI3.22)を有している。つまり、グルタミン酸の取り込みは、得られるタンパク質のpIに影響を与えることになる。以下に説明されるとおり、多くのアミノ酸置換は、一般に、変異体抗体のpIに顕著な影響を与えることが必要とされている。しかしながら、以下に論じられるとおり、IgG2分子における変更でさえ、血清半減期の増加を可能にすることに留意されるべきである。
他の実施形態では、非アイソタイプアミノ酸の変更がなされ、得られるタンパク質の全体の電荷状態が低下(例えば、より高いpIアミノ酸を、より低いpIアミノ酸へと変更することによって)するか、または安定に向けた構造の適応が可能になる等、以下にさらに説明されるとおりである。
さらに、重定常ドメイン及び軽定常ドメインの両方のpI操作によって、ヘテロ二量体のそれぞれの単量体において、顕著な変化をみることができる。本明細書で論じられるように、2つの単量体のpIを少なくとも0.5異なるようにすることで、イオン交換クロマトグラフィー若しくは等電点電気泳動、または等電点感受性の他の方法によっての分離が可能になる。
等比体積変異体
さらに、図47に示すとおり、等比体積であるpI変異体、例えば、親アミノ酸とほぼ同一サイズである電荷変異体を作ることができる。
pIの計算
それぞれの単量体のpIは、変異体重鎖定常ドメイン及び融合相手を含めて、可変重鎖定常領域及び総単量体のpIに依存し得る。したがって、いくつかの実施形態では、図中のチャートを使用して、変異体重鎖定常ドメインに基づいて、pIの変化が計算される。あるいは、それぞれの単量体のpIを、比較することができる。同様に、「出発」可変領域(例えば、scFvまたはFabのいずれか)のpIを計算することで、どの単量体が、どの方向に操作されることになるかの情報が得られる。
より良いFcRnの生体内結合も与えるpI変異体
pI変異体が、単量体のpIを低減する場合、生体内での血清における保持の改善という利点が追加され得る。
未だ試験中であるが、Fc領域は、生体内においてより長い半減期を有すると考えられ、これは、エンドソームにおける、pH6でのFcRnに対する結合が、Fcを隔離するためである(Ghetie and Ward,1997 Immunol Today.18(12):592−598の全体が、参照によって組み込まれる)。その後、エンドソームの区画は、細胞表面へとFcを再循環させる。区画が、より高いpHである約7.4の細胞外空間へと一旦開くと、Fcの放出が誘導され、血液へ戻る。マウスにおいて、Dall’Acquaらは、pH6及びpH7.4でのFcRn結合が増加したFc変異型(Fc mutant)が、実際は、血清濃度が低下しており、野生型Fcと同一の半減期を有することを示した(Dall’Acqua et al.2002,J.Immunol.169:5171−5180の全体が、参照によって、組み込まれる)。pH7.4でのFcRnに向けたFcの親和性の上昇は、Fcが放出されて血流へ戻ることを妨げると考えられる。それ故に、生体内におけるFcの半減期を増加させるであろうFc変異は、より高いpHでのFcの放出を、可能なままにしつつ、より低いpHでFcRn結合を理想的に増加させることになる。アミノ酸であるヒスチジンは、6.0〜7.4のpH範囲において、その電荷状態が変化する。したがって、ヒスチジン残基が、Fc/FcRn複合体において、重要な位置を占めるという発見は、驚くべきことではない。
最近、より低い等電点を有する可変領域を有する抗体が、より長い血清半減期も有し得ることが示唆された(Igawa et al.,2010 PEDS.23(5):385−392の全体が、参照によって、組み込まれる)。しかしながら、この機構の理解は、依然として不十分である。その上、可変領域は、抗体毎に異なる。pIが低下、及び半減期が延長している定常領域変異体であれば、抗体の薬物動態特性の改善に対する、よりモジュール型の手法を提供するであろうことは、本明細書で説明されるとおりである。
この実施形態において有用なpI変異体、及び精製の最適化にむけたその使用は、図に開示される。
変異体の組み合わせ
当業者によって理解されるように、その「鎖性」または「単量体区分(monomer partition)」が保持される限り、繰り返し記載されているヘテロ二量体化変異体はすべて、任意選択かつ独立に、何らかの方法で組み合わせることができる。さらに、こうした変異体はすべて、ヘテロ二量体化形式のいずれかに組み入れることができる。
pI変異体の場合、特定用途に有用な実施形態は、図に示されているが、精製の容易化のために2つの単量体間のpI差異を変える基礎的な規則に従って、他の組み合わせを生成できる。
本発明の抗体は、一般に、単離されているか、または組換え体である。「単離された」
が、本明細書に開示される様々なポリペプチドについての説明に使用されるとき、それが発現される細胞または細胞培養から、同定され、分離され、及び/または回収されたポリペプチドを意味する。通常、単離されたポリペプチドは、少なくとも1つの精製段階によって調製されることになる。「単離された抗体」は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指す。
「特異的結合(Specific binding)」、または特定の抗原若しくはエピトープ「に特異的に結合する(specifically bind to)」、または特定の抗原若しくはエピトープ「に向けて特異的(specific for)」は、非特異的相互作用とは、測定可能な程に異なる結合を意味する。特異的結合は、例えば、一般に、結合活性を有さない類似構造の分子である対照分子の結合と比較した分子の結合を決定することによって、測定できる。例えば、特異的結合は、標的に類似した対照分子との競合によって決定できる。
特定の抗原またはエピトープに向けた特異的結合は、例えば、抗原またはエピトープに向けて、抗体が、少なくとも約10〜4MのKD、少なくとも約10〜5MのKD、少なくとも約10〜6MのKD、少なくとも約10〜7MのKD、少なくとも約10〜8MのKD、少なくとも約10〜9MのKD、あるいは、少なくとも約10〜10MのKD、少なくとも約10〜11MのKD、少なくとも約10〜12MのKD、またはそれより高いKDを有することによって示すことができ、KDは、特定の抗体−抗原相互作用の解離速度を指す。典型的には、抗原に特異的に結合する抗体であれば、抗原またはエピトープに対して、対照分子が、20倍〜、50倍〜、100倍〜、500倍〜、1000倍〜、5,000倍〜、10,000倍〜、またはこれらを上回る倍数のKDを有することになる。
また、特定の抗原またはエピトープに向けた特異的結合は、例えば、対照に対して、抗体が、そのエピトープに向けて、少なくとも20倍〜、50倍〜、100倍〜、500倍〜、1000倍〜、5,000倍〜、10,000倍〜、またはこれらを上回る倍数の、抗原またはエピトープに向けたKAまたはKaを有することによって示すことができ、KAまたはKaは、特定の抗体−抗原相互作用の会合速度を指す。
改変抗体
上に概要を記載した改変に加えて、他の改変を作ることが可能である。例えば、VHドメイン及びVLドメインを連結するジスルフィド架橋の組み込みによって分子を安定;化してよい(Reiter et al.,1996,Nature Biotech.14:1239−1245の全体が、参照によって、組み込まれる)。さらに、抗体の様々な共有結合性改変が存在し、以下に概要が記載されるように作ることができる。
抗体の共有結合性改変は、本発明の範囲内に含まれ、常にではないが、一般に、翻訳後修飾によってなされる。例えば、抗体の共有結合性改変のいくつかの型は、選択される側鎖またはN末端残基若しくはC末端残基と反応が可能な有機誘導体化物質で、抗体の特定アミノ酸残基を反応させることによって、分子へ導入される。
システイニル残基は、クロロ酢酸またはクロロアセトアミドなどのα−ハロアセテート(及び対応するアミン)と反応させることが最も一般的であり、カルボキシメチル誘導体またはカルボキシアミドメチル誘導体が得られる。システイニル残基は、ブロモトリフルオロアセトン、α−ブロモ−β−(5−イミドゾイル)プロピオン酸、クロロアセチルリン酸、N−アルキルマレイミド、3−ニトロ−2−ピリジルジスルフィド、メチル2−ピリジルジスルフィド、p−クロロ安息香酸水銀、2−クロロ水銀−4−ニトロフェノール、またはクロロ−7−ニトロベンゾ−2−オキサ−1,3−ジアゾール、及び同様のものとの反応によって誘導体化してもよい。
さらに、システインにおける改変は、抗体−薬物結合体(ADC)の適用において特に有用であり、以下にさらに説明される。いくつかの実施形態では、抗体の定常領域を操作して、薬物部分の、より特異的かつ制御された設置が可能になるように、具体的には、「チオール反応性」である1つまたは複数のシステインを含めることができる。例えば、米国特許第7,521,541号を参照のこと。当該特許文献は、その全体が、参照によって本明細書に組み込まれる。
ヒスチジル残基は、pH5.5〜7.0でのジエチルピロカルボネートとの反応によって誘導体化される。これは、この物質が、ヒスチジル側鎖に相対的に特異的であるためである。パラ−ブロモフェナシルブロミドも有用であり、反応は、pH6.0で、0.1Mのカコジル酸ナトリウム中で実施することが好ましい。
リジニル残基、及びアミノ末端残基は、コハク酸または他のカルボン酸の無水物と反応する。こうした物質での誘導体化は、リジニル残基の電荷を逆転する効果を有する。アルファアミノ含有残基の誘導体化に適した他の試薬には、ピコリンイミド酸メチルなどのイミドエステル、ピリドキサールリン酸、ピリドキサール、クロロボロヒドリド、トリニトロベンゼンスルホン酸、O−メチルイソ尿素、2,4−ペンタンジオン、及びトランスアミナーゼが触媒するグリオキシル酸との反応が含まれる。
アルギニル残基は、1つまたはいくつかの通常の試薬との反応によって改変され、それらの中には、フェニルグリオキサール、2,3−ブタンジオン、1,2−シクロヘキサンジオン、及びニンヒドリンがある。グアニジン官能基のpKaが高いため、アルギニン残基の誘導体化は、アルカリ条件においてその反応を実施する必要がある。さらに、こうした試薬は、リジンの基、及びアルギニンのイプシロンアミノ基と反応させてもよい。
芳香族ジアゾニウム化合物またはテトラニトロメタンとの反応による、チロシル残基へのスペクトル標識導入に特定の関心を有して、チロシル残基の特異的改変をしてよい。最も一般には、N−アセチルイミジゾール(N−acetylimidizole)及びテトラニトロメタンが使用され、O−アセチルチロシル種及び3−ニトロ誘導体がそれぞれ形成される。チロシル残基を、125Iまたは131Iを使用してヨウ素化することで、ラジオイムノアッセイでの使用に向けた標識タンパク質が調製され、これには、上に説明したクロラミンT法が適している。
カルボキシ側基(アスパルチルまたはグルタミル)は、カルボジイミド(R’−N=C=N−−R’)との反応によって、選択的に改変され、R及びR’は、1−シクロヘキシル−3−(2−モルホリニル−4−エチル)カルボジイミドまたは1−エチル−3−(4−アゾニア−4,4−ジメチルフェニル)カルボジイミドなどの任意選択で異なるアルキル基である。さらに、アスパルチル残基及びグルタミル残基は、アンモニウムイオンとの反応によって、アスパラギニル残基及びグルタミニル残基に変換される。
二機能性物質での誘導体化は、以下に説明される方法に加えて様々な方法における使用に向けて、水不溶性の支持マトリックスまたは支持表面に、抗体を架橋するために有用である。一般に使用される架橋物質には、例えば、1,1−ビス(ジアゾアセチル)−2−フェニルエタン、グルタルアルデヒド、N−ヒドロキシスクシンイミドエステル、例えば、4−アジドサリチル酸とのエステル、3,3’−ジチオビス(スクシンイミジルプロピオン酸)などのジスクシンイミジルエステルを含むホモ二機能性イミドエステル、及びビス−N−マレイミド−1,8−オクタンなどの二機能性マレイミドが含まれる。メチル−3−[(p−アジドフェニル)ジチオ]プロピオイミデートなどの誘導体化物質は、光の存在下で架橋形成が可能である光励起性中間体をもたらす。あるいは、サイノモルガソジェン(cynomolgusogen)ブロミドで活性化された糖質、ならびにすべて全体が、参照によって組み込まれる米国特許第3,969,287号、第3,691,016号、第4,195,128号、第4,247,642号、第4,229,537号、及び第4,330,440号において説明される反応性基質などの反応性の水不溶マトリックスが、タンパク質の固定化に用いられる。当該特許文献はすべて、全体が、参照によって組み込まれる。
グルタミニル残基及びアスパラギニル残基は、対応するグルタミル残基及びアスパルチル残基へとそれぞれ脱アミノ化されることが多い。あるいは、こうした残基は、穏やかな酸性条件下で脱アミノ化される。こうした残基のいずれの形態も、本発明の範囲内に入る。
他の改変には、プロリン及びリジンのヒドロキシル化、セリル残基またはスレオニル残基のヒドロキシル基のリン酸化、リジン、アルギニン、及びヒスチジン側鎖のα−アミノ基のメチル化(T.E.Creighton,Proteins:Structure and Molecular Properties,W.H.Freeman & Co.,San Francisco,pp.79−86[1983]の全体が、参照によって組み込まれる)、N末端アミンのアセチル化、及び何らかのC末端カルボキシル基のアミド化が含まれる。
さらに、当業者によって理解されるように、標識(蛍光、酵素、磁気、放射性等を含む、はすべて、抗体(及び本発明のその他の組成物)に追加することができる。
グリコシル化
共有結合性改変の別の型は、グリコシル化の変更である。別の実施形態では、本明細書に開示される抗体は、1つまたは複数の操作されたグリコフォームを含むように改変できる。本明細書では、「操作されたグリコフォーム」は、抗体に共有結合された糖質組成物を意味し、当該糖質組成物は、親抗体のそれとは、化学的に異なる。操作されたグリコフォームは、様々な目的に向けて有用であり得、限定はされないが、当該目的には、エフェクター機能の増進または低下が含まれる。操作されたグリコフォームの好ましい形態は、無フコシル化(afucosylation)であり、無フコシル化は、ADCC機能の増加と相関していることが示されており、FcγRIIIa受容体に対する、より堅固な結合を介していると推定される。この構成では、「無フコシル化」は、宿主細胞において産生される抗体の大部分が、フコースを実質的に欠いていることを意味し、例えば、生成する抗体の90〜95〜98%が、抗体の糖質部分の成分(一般に、Fc領域におけるN297に付加される)として検知可能なフコースを有さない。無フコシル化抗体は、FcγRIIIa受容体に対して、一般に、少なくとも50%、またはそれより高い親和性を示すと、機能的に定義される。
操作されたグリコフォームは、当該技術分野において知られる様々な方法によって生成されてよい(Umana et al.,1999,Nat Biotechnol 17:176−180、Davies et al.,2001,Biotechnol Bioeng 74:288−294、Shields et al.,2002,J Biol Chem 277:26733−26740、Shinkawa et al.,2003,J Biol Chem 278:3466−3473、US6,602,684、USSN10/277,370、USSN10/113,929、PCT WO00/61739A1、PCT WO01/29246A1、PCT WO02/31140A1、PCT WO02/30954A1。これらはすべて、全体が、参照によって、組み込まれる。(Potelligent(登録商標)技術[Biowa,Inc.,Princeton,NJ]、GlycoMAb(登録商標)グリコシル化操作技術[Glycart Biotechnology AG,Zuerich,Switzerland])。こうした技術の多くが、Fc領域に共有結合したフコシル化オリゴ糖及び/または二分岐(bisecting)オリゴ糖の水準を制御することに基づいており、これは、例えば、IgGを、操作された様々な生物、若しくは操作された細胞株において発現することによってなされ、またはそうでなければ、(例えばLec−13 CHO細胞、若しくはラットハイブリドーマYB2/0細胞において、グリコシル化経路に関与する酵素(例えば、FUT8[α1,6−フコシルトランスフェラーゼ]及び/若しくはβ1,4−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII[GnTIII])を制御することによってなされ、またはIgGが発現された後に糖質を改変することによってなされる。例えば、生成の間、フコシル化を阻害する改変された糖類を添加することによるSeattle Genetics機能の「糖操作された抗体」または「SEA技術」である。例えば、20090317869を参照のこと。これにより、その全体が、参照によって、組み込まれる。操作されたグリコフォームは、典型的には、異なる糖質またはオリゴ糖を指し、したがって、抗体は、操作されたグリコフォームを含むことができる。
あるいは、操作されたグリコフォームは、異なる糖質またはオリゴ糖を含むIgG変異体を指してよい。当該技術分野で知られるように、グリコシル化パターンは、タンパク質の配列(例えば、特定のグリコシル化アミノ酸残基の存在の有無であり、以下に論じられる)、またはタンパク質が産生される宿主細胞若しくは生物の両方に依存し得る。特定の発現系が、以下に論じられる。
ポリペプチドのグリコシル化は、典型的には、N−結合型またはO−結合型のいずれかである。N−結合型は、アスパラギン残基の側鎖に対する糖質部分の付加を指す。トリペプチド配列である、アスパラギン−X−セリン、及びアスパラギン−X−スレオニンは、アスパラギン側鎖に対する糖質部分の酵素による付加のための認識配列であり、Xは、プロリンを除く、何らかのアミノ酸である。したがって、ポリペプチドにおけるこうしたトリペプチド配列のいずれかが存在すれば、潜在的なグリコシル化部位が創出される。O結合型グリコシル化は、糖であるN−アセチルグルコサミン、ガラクトース、またはキシロースの内の1つの、ヒドロキシアミノ酸に対する付加を指し、ヒドロキシアミノ酸は、最も一般には、セリンまたはスレオニンであるが、5−ヒドロキシプロリンまたは5−ヒドロキシセリンが使用されてもよい。
抗体に対するグリコシル化部位の追加は、アミノ酸配列を変えることによって簡便に達成され、その結果、抗体は、1つまたは複数の上に説明したトリペプチド配列を含む(N結合型グリコシル化部位向け)。変更は、出発配列に対して1つまたは複数のセリン残基またはスレオニン残基の追加、またはそれらによる置換によってなされてもよい(O結合型グリコシル化部位向け)。簡便には、抗体のアミノ酸配列は、DNAレベルでの変更を介して変えることが望ましく、具体的には、事前選択された塩基で、標的ポリペプチドをコードするDNAを変異させることよってなされ、その結果、所望のアミノ酸へと翻訳されることになるコドンが生成される。
抗体上の糖質部分の数を増加させる別の手段は、グリコシドをタンパク質へ、化学的または酵素的にカップリングすることによるものである。NまたはO結合型グリコシル化のグリコシル化能力を有する宿主細胞においてタンパク質を生成させる必要が無い点で、こうした手順は、有利である。使用するカップリングの様式によって、(a)アルギニン及びヒスチジン、(b)遊離カルボキシル基、(c)システインのものなどの遊離スルフヒドリル基、(d)セリン、スレオニン、若しくはヒドロキシプロリンのものなどの遊離ヒドロキシル基、(e)フェニルアラニン、チロシン、若しくはトリプトファンのものなどの芳香族残基、または(f)グルタミンのアミド基に糖を付加してよい。こうした方法は、WO87/05330、及びAplin and Wriston,1981,CRC Crit.Rev.Biochem.,pp.259−306において説明されており、両方の全体が、参照によって組み込まれる。
出発抗体上に存在する糖質部分(例えば、翻訳後修飾によって)の除去は、化学的または酵素的に達成されてよい。化学的脱グリコシル化には、化合物であるトリフルオロメタンスルホン酸または相当する化合物に対して、タンパク質を暴露する必要がある。この処理は、連結糖(linking sugar)(N−アセチルグルコサミンまたはN−アセチルガラクトサミン)を除く大部分またはすべての糖の開裂をもたらす一方で、ポリペプチドはそのままで残る。化学的脱グリコシル化は、Hakimuddin et al.,1987,Arch.Biochem.Biophys.259:52、及びEdge et al.,1981,Anal.Biochem.118:131によって説明されており、両方の全体が、参照によって、組み込まれる。ポリペプチド上の糖質部分の酵素的開裂は、様々なエンド−グリコシダーゼ及びエキソ−グリコシダーゼを使用することによって達成でき、全体が、参照によって、組み込まれるThotakura et al.,1987,Meth.Enzymol.138:350によって説明されるとおりである。潜在的グリコシル化部位でのグリコシル化は、化合物であるツニカマイシンの使用によって阻止されてよく、全体が、参照によって組み込まれるDuskin et al.,1982,J.Biol.Chem.257:3105によって説明されるとおりである。ツニカマイシンは、タンパク質−N−グリコシド結合の形成を遮断する。
抗体の共有結合性改変の別の型は、様々な非タンパク質性の重合体に対する抗体の連結を含み、非タンパク質性の重合体には、限定はされないが、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、またはポリオキアルキレンなどの様々なポリオールが含まれ、例えば、Nektar Therapeuticsの2005−2006PEGカタログ(Nektarのウェブサイトで入手可能)、全体が、参照によって組み込まれる米国特許第4,640,835号、第4,496,689号、第4,301,144号、第4,670,417号、第4,791,192号、または第4,179,337号に示される様式においてなされる。さらに、当該技術分野で知られるように、PEGなどの重合体の追加を容易にするために、アミノ酸置換を、抗体内の様々な位置において作ってよい。例えば、参照によって、全体が本明細書に組み込まれる米国公開第2005/0114037A1号参照のこと。
追加の機能性に向けた追加のFc変異体
pIアミノ酸変異体に加えて、様々な理由から実施することのできる、有用なFcアミノ酸改変が多く存在し、限定はされないが、1つまたは複数のFcγR受容体に対する結合の変更、FcRn受容体に対する結合の変更等が含まれる。
したがって、本発明のタンパク質は、アミノ酸改変を含むことができ、アミノ酸改変には、pI変異体を含めて、本明細書に概要が記載されるヘテロ二量体化変異体が含まれる。
FcγR変異体
したがって、1つまたは複数のFcγR受容体に対する結合を変えるために作ることのできる有用なFc置換が多く存在する。結合の増加、及び結合の減少をもたらす置換が有用であり得る。例えば、Fc RIIIaに対する結合の増加は、一般に、ADCC(抗体依存性細胞傷害。これは、細胞が媒介する反応であって、FcγRを発現している、非特異性である細胞傷害性の細胞が、標的細胞上に結合した抗体を認識し、その後に標的細胞の溶解を引き起こす反応である)の増加をもたらすことが知られている。同様に、FcγRIIb(抑制性受容体)に対する結合の減少も、状況によっては、有益であり得る。本発明において有用であるアミノ酸置換には、USSN11/124,620(特に図41)、USSN11/174,287、USSN11/396,495、USSN11/538,406において記載されるものが含まれ、これらはすべて、全体が、参照によって、明確に本明細書に組み込まれ、特に、そこで開示される変異体に向けて組み込まれる。有用な特定の変異体には、限定はされないが、236A、239D、239E、332E、332D、239D/332E、267D、267E、328F、267E/328F、236A/332E、239D/332E/330Y、239D、332E/330L、及び299Tが含まれる。
さらに、FcRn受容体に対する結合増加、及び血清半減期の増加において有用な追加のFc置換が存在し、全体が、参照によって組み込まれるUSSN12/341,769において具体的に開示されるとおりであって、限定はされないが、434S、428L、308F、259I、428L/434S、259I/308F、436I/428L、436IまたはV/434S、436V/428L、及び259I/308F/428Lが含まれる。
Fc消去変異体
本発明において有用な追加の変異体は、Fcγ受容体に対する結合を消去(例えば、低下または排除)するものである。これは、本発明のヘテロ二量体抗体作用の潜在的機構を低下させる(例えば、ADCC活性の低下)ために望ましくあり得る。多くの適したFc消去変異体が、図35に示されており、それらを、pI変異体及び立体変異体を含む何らかの他のヘテロ二量体化変異体と、任意選択かつ独立して組み合わせて含める、または除外することができる。
特定用途のいくつかの実施形態は、pI変異体N208D/Q295E/N384D/Q418E/N421D、歪曲変異体368D/370S、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S267Kを含む第一単量体(「負側」)であって、pI変異体を含まず、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S267Kを含む正側と対をなし(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、正側は、scFv単量体であり、荷電scFvリンカーを含む(特にscFvが抗CD3であるとき)。第二の実施形態は、I199T/N203D/K274Q/R355Q/Q419E/K447del、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S267Kを含む第一の負側単量体を利用し(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、第一の負側単量体は、pI変異体Q196K/I199T/P271R/P228R/N276K、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S267Kを含む正側と対をなし(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、正側は、scFv単量体であり、荷電scFvリンカーを含む(特にscFvが、抗CD3であるとき)。第三の実施形態は、I199T/N203D/K274Q/R355Q/N384S/K392N/V397M/Q419E/K447del、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S267Kを含む第一の負側単量体を利用し(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、第一の負側単量体は、pI変異体を含まず、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S267Kを含む正側単量体と対をなし(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、正側は、scFv単量体であり、荷電scFvリンカーを含む(特にscFvが、抗CD3であるとき)。第四の実施形態は、pI変異体N208D/Q295E/N384D/Q418E/N421D、歪曲変異体368D/370S、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S239Kを含む第一の単量体(「負側」)を利用し、第一の単量体は、pI変異体を含まず、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S239Kを含む正側と対をなす(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)。第五の実施形態は、I199T/N203D/K274Q/R355Q/Q419E/K447del、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S239Kを含む第一の負側単量体を利用し(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、第一の負側単量体は、pI変異体Q196K/I199T/P271R/P228R/N276K、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S239Kを含む正側と対をなす(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)。第六の実施形態は、I199T/N203D/K274Q/R355Q/N384S/K392N/V397M/Q419E/K447del、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S267Kを含む第一の負側単量体を利用し(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、第一の負側単量体は、歪曲変異体S364K/E357Q及び消去変異体E233P/L234V/L235A/G236del/S239Kを含む正側と対をなし(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、正側は、scFv単量体であり、荷電scFvリンカーを含む(特にscFvが、抗CD3であるとき)。第七の実施形態は、pI変異体N208D/Q295E/N384D/Q418E/N421D、歪曲変異体368D/370S、及び消去変異体S239K/S267Kを含む第一の単量体(「負側」)を利用し、第一の単量体は、pI変異体を含まず、歪曲変異体S364K/E357Q及び消去変異体S239K/S267Kを含む正側と対をなし(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、正側は、scFv単量体であり、荷電scFvリンカーを含む(特にscFvが、抗CD3であるとき)。第八の実施形態は、I199T/N203D/K274Q/R355Q/Q419E/K447del、歪曲変異体S364K/E357Q及び消去変異体S239K/S267Kを含む第一の負側単量体を利用し(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、第一の負側単量体は、pI変異体Q196K/I199T/P271R/P228R/N276K、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体S239K/S267Kを含む正側と対をなし(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、正側は、scFv単量体であり、荷電scFvリンカーを含む(特にscFvが、抗CD3であるとき)。第九の実施形態は、I199T/N203D/K274Q/R355Q/N384S/K392N/V397M/Q419E/K447del、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体S239K/S267Kを含む第一の負側単量体を利用し(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、第一の負側単量体は、pI変異体を含まず、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体S239K/S267Kを含む正側単量体と対をなし(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、正側は、scFv単量体であり、荷電scFvリンカーを含む(特にscFvが、抗CD3であるとき)。第十の実施形態は、pI変異体N208D/Q295E/N384D/Q418E/N421D、歪曲変異体368D/370S、及び消去変異体S267K/P329Kを含む第一の単量体(「負側」)を利用し、第一の単量体は、pI変異体を含まず、歪曲変異体S364K/E357Q及び消去変異体S267K/P329Kを含む正側と対をなし(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、正側は、scFv単量体であり、荷電scFvリンカーを含む(特にscFvが、抗CD3であるとき)。第十一の実施形態は、I199T/N203D/K274Q/R355Q/Q419E/K447del、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体S267K/P329Kを含む第一の負側単量体を利用し(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、第一の負側単量体は、pI変異体Q196K/I199T/P271R/P228R/N276K、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体S267K/P329Kを含む正側と対をなし(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、正側は、scFv単量体であり、荷電scFvリンカーを含む(特にscFvが、抗CD3であるとき)。第十二の実施形態は、I199T/N203D/K274Q/R355Q/N384S/K392N/V397M/Q419E/K447del、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体S267K/P329Kを含む第一の負側単量体を利用し(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、第一の負側単量体は、pI変異体を含まず、歪曲変異体S364K/E357Q、及び消去変異体S267K/P329Kを含む正側単量体と対をなし(両単量体は、FcRn変異体428L/434Sを任意選択で含む)、正側は、scFv単量体であり、荷電scFvリンカーを含む(特にscFvが、抗CD3であるとき)。
リンカー
本発明は、例えば、追加の抗原結合部位に加えて、必要に応じて、リンカーを任意選択で提供し、例えば、図11、12、及び13に示されるとおりであり、ここで、分子の「もう一方の末端」が、追加の抗原結合成分を含む。さらに、以下に概要が記載されるように、リンカーも、抗体薬物結合体(ADC)系において任意選択で使用される。中心であるmAb−Fv構築物の成分を連結するために使用されるとき、リンカーは、一般に、ペプチド結合によって連結された2つ以上のアミノ酸残基を含むポリペプチドであり、本発明の1つまたは複数の成分を連結するために使用される。そのようなリンカーポリペプチドは、当該技術分野においてよく知られている(例えば、Holliger,P.,et al.(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444−6448、Poljak,R.J.,et al.(1994)Structure 2:1121−1123参照)。本明細書で説明される実施形態のいくつかで、様々なリンカーが有用であり得る。当業者によって理解されるように、本発明において使用されるものには、少なくとも3つの異なるリンカーの型が存在する。
本明細書に記載される「リンカー」は、「リンカー配列」、「スペーサー」、「繋留配列(tethering sequence)」、またはその文法的相当物も指す。ホモまたはヘテロ二機能性リンカーが、よく知られている(全体が、参照によって組み込まれている1994 Pierce Chemical Companyカタログのクロス−リンカーに関する技術セクション、155〜200ページ参照。)。(一般的な「リンカー」及び「scFvリンカー及び「荷電scFvリンカー」の区別に留意されたい)。多くの方針を使用して、分子を一緒に共有結合で連結してよい。こうしたものには、限定はされないが、タンパク質またはタンパク質ドメインのN末端及びC末端間のポリペプチド連鎖、ジスルフィド結合を介する連鎖、及び化学架橋結合試薬を介した連鎖が含まれる。この実施形態の1つの態様では、リンカーは、組換え技術またはペプチド合成によって生成したペプチド結合である。リンカーペプチドは、次のアミノ酸残基を主に含んでよい。すなわち、Gly、Ser、Ala、またはThrである。リンカーペプチドは、2つの分子を連結するために適切な長さを有するべきであり、そのようにして、それらは、お互いに対して正しい立体構造をとり、その結果、それらは、所望の活性を保持する。1つの実施形態では、リンカーは、長さが、アミノ酸で約1〜50個、好ましくは、長さが、アミノ酸で約1〜30個である。1つの実施形態では、長さが、アミノ酸で1〜20個であるリンカーを使用してよい。有用なリンカーには、グリシン−セリン重合体が含まれ、当該グリシン−セリン重合体には、例えば、(GS)n、(GSGGS)n、(GGGGS)n、及び(GGGS)n、ここで、nは、少なくとも1である整数であり、グリシン−アラニン重合体、アラニン−セリン重合体、ならびに他の可動性リンカーが含まれる。あるいは、限定はされないが、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリプロピレングリコール、ポリオキシアルキレン、またはポリエチレングリコール及びポリプロピレングリコールの共重合体を含む様々な非タンパク質性の重合体が、リンカーとして有用であり得、すなわち、リンカーとして有用であり得る。
他のリンカー配列は、CL/CH1ドメインのすべての残基ではないが、CL/CH1ドメインの何らかの長さの何らかの配列を含んでよく、例えば、CL/CH1ドメインの最初の5〜12個のアミノ酸残基を含んでよい。リンカーは、イムノグロブリン軽鎖由来であり得、例えば、CκまたはCλである。リンカーは、何らかのアイソタイプのイムノグロブリン重鎖由来であり得、例えば、Cγ1、Cγ2、Cγ3、Cγ4、Cα1、Cα2、Cδ、Cε、及びCμが含まれる。リンカー配列は、Ig様タンパク質(例えば、TCR、FcR、KIR)、ヒンジ領域由来の配列、及び他のタンパク質由来の他の天然の配列などの他のタンパク質由来であってもよい。
抗体−薬物結合体
いくつかの実施形態では、本発明の多特異性抗体は、薬物と結合して、抗体−薬物結合体(ADC)を形成する。一般に、ADCは、腫瘍学用途において使用され、細胞傷害性物質または細胞増殖抑制性物質の局所送達に向けて、抗体−薬物結合体を使用することで、薬物部分の腫瘍への標的化送達が可能になり、これにより、有効性の向上、毒性の低下等が可能になり得る。この技術の外観は、Ducry et al.,Bioconjugate Chem.,21:5−13(2010)、Carter et al.,Cancer J.14(3):154(2008)、及びSenter,Current Opin.Chem.Biol.13:235−244(2009)において提供されており、これによって、それらはすべて、全体が、参照によって、組み込まれる。
したがって、本発明は、薬物に結合した多特異性抗体を提供する。一般に、結合は、抗体に対する共有結合によってなされ、以下にさらに説明されるとおり、一般に、リンカーに依存し、リンカーは、ペプチド連鎖であることが多い(以下に説明されるとおり、連鎖は、標的部位または他の部位において、プロテアーゼによる開裂に対して感受性であるように設計してよい)。さらに、上に説明されるとおり、リンカー−薬物単位(LU−D)の連鎖は、抗体内のシステインに対する付加によって作ることができる。当業者によって理解されるように、抗体当たりの薬物部分の数は、反応条件によって変更することができ、薬物:抗体の比で、1:1〜10:1で変わり得る。当業者によって理解されるように、実際の数は、平均値である。
したがって、本発明は、薬物に結合した多特異性抗体を提供する。以下に説明されるとおり、ADCの薬物は、何らかの数の物質であり得、限定はされないが、化学療法物質などの細胞傷害性物質、成長阻害物質、毒物(例えば、細菌、真菌、植物、若しくは動物起源の酵素的に活性を有する毒物、またはそれらの断片)、あるいは放射性同位体(すなわち、放射性結合体)が含まれ、提供される。他の実施形態では、本発明は、ADCを使用する方法をさらに提供する。
本発明における使用に向けた薬物には、細胞傷害性毒物、具体的には、癌治療向けに使用されるものが含まれる。そのような薬物には、一般に、DNA損傷物質、代謝拮抗物質、天然物、及びそれらのアナログが含まれる。細胞傷害性物質の例示のクラスには、ジヒドロ葉酸還元酵素阻害物質、及びチミジル酸合成酵素阻害物質などの酵素阻害物質、DNAインターカレーター、DNA開裂物質(DNA cleaver)、トポイソメラーゼ阻害物質、薬物のアントラサイクリンファミリー、ビンカ薬物、マイトマイシン、ブレオマイシン、細胞傷害性ヌクレオシド、薬物のプテリジンファミリー、ジイネン、ポドフィロトキシン、ドラスタチン、メイタンシノイド、分化誘導物質、ならびにタキソールが含まれる。
こうしたクラスのメンバーには、例えば、メトトレキサート、メトプテリン、ジクロロメトトレキサート、5−フルオロウラシル、6−メルカプトプリン、シトシンアラビノシド、メルファラン、ロイロシン、ロイロシデイン(leurosideine)、アクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、マイトマイシンC、マイトマイシンA、カミノマイシン(caminomycin)、アミノプテリン、タリソマイシン、ポドフィロトキシン、及びエトポシドまたはリン酸エトポシドなどのポドフィロトキシン誘導体、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、タキソールを含むタキサン、タキソテールレチノイン酸、ブタン酸、N8−アセチルスペルミジン、カンプトテシン、カリチアマイシン、エスペラミシン、エンジイン(ene−diyne)、デュオカルマイシンA、デュオカルマイシンSA、カリチアマイシン、カンプトテシン、メイタンシノイド(DM1を含む)、モノメチルオーリスタチンE(MMAE)、モノメチルオーリスタチンF(MMAF)、ならびにメイタンシノイド(DM4)ならびにそれらのアナログが含まれる。
毒物が、抗体−毒物結合体として使用されてよく、毒物には、ジフテリア毒物などの細菌毒物、リシンなどの植物毒物、ゲルダナマイシンなどの小分子毒物(Mandler et al(2000)J.Nat.Cancer Inst.92(19):1573−1581、Mandler et al(2000)Bioorganic & Med.Chem.Letters 10:1025−1028、Mandler et al(2002)Bioconjugate Chem.13:786−791)、メイタンシノイド(EP1391213、Liu et al.,(1996)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93:8618−8623)、及びカリチアマイシン(Lode et al (1998)Cancer Res.58:2928、Hinman et al(1993)Cancer Res.53:3336−3342)が含まれる。毒物は、チューブリン結合、DNA結合、またはトポイソメラーゼ阻害を含む機構によって、その細胞傷害性及び細胞増殖抑制性の効果を発揮してよい。
多特異性抗体と、メイタンシノイド、ドラスタチン、オーリスタチン、トリコテシン、カリチアマイシン、及びCC1065、ならびに毒物活性を有するこうした毒物の誘導体などの、1つまたは複数の小分子毒物と、の結合体を企図する。
メイタンシノイド
メイタンシノイド薬物部分としての使用に適したメイタンシン化合物は、当該技術分野においてよく知られており、既知の方法に従って天然源から単離できると共に、遺伝学的操作技術(Yu et al(2002)PNAS 99:7968−7973参照)を使用して、またはメイタンシノール及び既知の方法に従って合成的に調製されたメイタンシノールアナログを使用して、産生できる。以下に説明されるとおり、薬物は、抗体に対する結合に向けて、チオール基またはアミノ基などの機能的活性基の組み込みによって改変されてよい。
例示のメイタンシノイド薬物部分には、C−19−脱クロロ(米国特許第4,256,746号)(アンサマイトシンP2の水素化アルミニウムリチウム還元によって調製される)、C−20−ヒドロキシ(またはC−20−脱メチル)+/−C−19−脱クロロ(米国特許第4,361,650号及び第4,307,016号)(ストレプトマイセス若しくはアクチノマイセスを使用した脱メチル化、またはLAHを使用した脱塩素化によって調製される)、ならびにC−20−脱メトキシ、C−20−アシルオキシ(――OCOR)、+/−脱クロロ(米国特許第4,294,757号)(塩化アシルを使用したアシル化によって調製される)ならびに他の位置での改変を有するものなどの改変された芳香族環を有するものが含まれる。
例示のメイタンシノイド薬物部分には、C−9−SH(米国特許第4,424,219号)(メイタンシノールと、H2SまたはP2S5との反応によって調製される)、C−14−アルコキシメチル(脱メトキシ/CH2OR)(米国特許第4,331,598号)、C−14−ヒドロキシメチルまたはアシルオキシメチル(CH2OHまたはCH2OAc)(米国特許第4,450,254号)(ノカルジアから調製された)、C−15−ヒドロキシ/アシルオキシ(米国特許第4,364,866号)(ストレプトマイセスによるメイタンシノールの変換によって調製された)、C−15−メトキシ(米国特許第4,313,946号、及び第4,315,929号)(Trewia nudlfloraから単離された)、C−18−N−ジメチル(米国特許第4,362,663号、及び第4,322,348号)(ストレプトマイセスによるメイタンシノールの脱メチル化によって調製された)、ならびに4,5−デオキシ(米国特許第4,371,533号)(三塩化チタン/メイタンシノールのLAH還元によって調製された)などの改変を有するものも含まれる。
特定用途のものとしては、DM1(米国特許第5,208,020号において開示され、参照によって組み込まれる)及びDM4(米国特許第7,276,497号において開示され、参照によって組み込まれる)である。多くの追加のメイタンシノイド誘導体及び方法についても、5,416,064、WO/01/24763、7,303,749、7,601,354、USSN12/631,508、WO02/098883、6,441,163、7,368,565、WO02/16368、及びWO04/1033272において参照のこと。これらはすべて、全体が、参照によって、明確に組み込まれる。
メイタンシノイドを含むADC、その調製方法、及びその治療用途は、例えば、米国特許第5,208,020号、第5,416,064号、第6,441,163号、及び欧州特許EP0425235B1において開示されており、これにより、これらの開示は、参照によって、明確に組み込まれる。DM1と命名され、ヒト結腸直腸癌を標的とするモノクローナル抗体C242に連結されたメイタンシノイドを含むADCが、Liu et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA93:8618−8623(1996)において説明された。当該結合体は、培養された結腸癌細胞に対して高度に細胞傷害性であることが明らかとなり、生体内における腫瘍成長アッセイにおいて、抗腫瘍活性を示した。
ADCは、Chari et al.,Cancer Research 52:127−131(1992)において説明されており、その中で、メイタンシノイドは、ジスルフィドリンカーを介して、ヒト結腸癌細胞株上の抗原に結合しているマウス抗体A7に、またはHER−2/neu癌遺伝子に結合する別のマウスモノクローナル抗体TA.1に、結合された。TA.1−メイタンシノイド結合体の、ヒト乳癌細胞株SK−BR−3に対する細胞傷害性が、試験管内で、試験された。当該ヒト乳癌細胞株SK−BR−3は、細胞当たり、3x105個のHER−2表面抗原を発現している。当該薬物結合体は、遊離のメイタンシノイド薬物と類似した細胞傷害性度を達成し、当該細胞傷害性度は、抗体分子当たりのメイタンシノイド分子数の増加によって、増加させることが可能であった。A7−メイタンシノイド結合体は、マウスにおいて、低い全身性の細胞傷害性を示した。
オーリスタチン及びドラスタチン
いくつかの実施形態では、ADCは、ドラスタチンまたはドラスタチンペプチドアナログ及びドラスタチンペプチド誘導体、オーリスタチンに結合した多特異的抗体を含む(米国特許5,635,483号、第5,780,588号)。ドラスタチン及びオーリスタチンは、微小管の動力学、GTPの加水分解、ならびに核及び細胞の分裂に干渉することが示されており(Woyke et al(2001)Antimicrob.Agents and Chemother.45(12):3580−3584)、抗癌活性(米国特許第5,663,149号)及び抗真菌活性(Pettit et al(1998)Antimicrob.Agents Chemother.42:2961−2965)を有する。ドラスタチン薬物部分またはオーリスタチン薬物部分は、ペプチド薬物部分のN(アミノ)末端、またはC(カルボキシル)末端を介して抗体に付加してよい(WO02/088172)。
例示のオーリスタチンの実施形態は、N末端に連結されたモノメチルオーリスタチン薬物部分DE及びDFを含み、これは、2004年3月28日に公開された「Senter et al,Proceedings of the American Association for Cancer Research、Volume 45,Abstract Number 623において開示され、米国特許公開第2005/0238648号において説明されており、この開示は、その全体が、参照によって、明確に組み込まれる。
例示のオーリスタチンの実施形態は、MMAEである(全体が、明確に組み込まれる米国特許第6,884,869号参照。)。
別の例示のオーリスタチンの実施形態は、MMAFである(全体が、明確に組み込まれるUS2005/0238649、5,767,237、及び6,124,431参照。)。
MMAEまたはMMAF及び様々なリンカー成分(本明細書でさらに説明される)を含む追加の例示の実施形態は、下記の構造及び略語を有する(ここで、Abは、抗体を意味し、pは1〜約8である)。
典型的には、ペプチドに基づく薬物部分は、2つ以上のアミノ酸、及び/またはペプチド断片の間にペプチド結合を形成することによって調製できる。そのようなペプチド結合は、例えば、液相合成法(E.Schroder and K.Lubke,“The Peptides”,volume 1,pp76−136,1965,Academic Press参照)に従って調製でき、液相合成法は、ペプチド化学の分野においてよく知られている。オーリスタチン/ドラスタチン薬物部分は、米国特許第5,635,483号、米国特許第5,780,588号、Pettit et al(1989)J.Am.Chem.Soc.111:5463−5465、Pettit et al(1998)Anti−Cancer Drug Design 13:243−277、Pettit,G.R.,et al.Synthesis,1996,719−725、Pettit et al(1996)J.Chem.Soc.Perkin Trans.1 5:859−863、及びDoronina(2003)Nat Biotechnol 21(7):778−784の方法に従って調製してよい。
カリチアマイシン
他の実施形態では、ADCは、1つまたは複数のカリチアマイシン分子に結合した本発明の抗体を含む。例えば、Mylotargは、最初に市販されたADC薬物であり、ペイロード(payload)としてカリチアマイシンγ1を利用している(全体が、参照によって組み込まれる米国特許第4,970,198号参照。)。追加のカリチアマイシン誘導体は、米国特許第5,264,586号、第5,384,412号、第5,550,246号、第5,739,116号、第5,773,001号、第5,767,285号、及び第5,877,296号において説明され、すべてが、参照によって明確に組み込まれる。抗体のカリチアマイシンファミリーは、ピコモル以下の濃度で、二本鎖DNAに切れ目を入れることが可能である。カリチアマイシンファミリー結合体の調製については、米国特許第5,712,374号、第5,714,586号、第5,739,116号、第5,767,285号、第5,770,701号、第5,770,710号、第5,773,001号、第5,877,296号参照(すべてAmerican Cyanamid Companyに属す)。使用してよいカリチアマイシンの構造アナログには、限定はされないが、γ1I、α2I、α2I、N−アセチル−γ1I、PSAG、及びθI1が含まれる(Hinman et al.,Cancer Research 53:3336−3342(1993)、Lode et al.,Cancer Research 58:2925−2928(1998)、及びAmerican Cyanamidに属する上記の米国特許)。抗体に結合できる別の抗腫瘍薬物は、葉酸代謝拮抗薬であるQFAである。カリチアマイシン及びQFAの両方が、細胞内部位で作用を有し、細胞膜を容易には通過しない。したがって、抗体が媒介する内部移行を介した、こうした物質の細胞への取り込みは、それらの細胞傷害性効果を大幅に増進する。
デュオカルマイシン
CC−1065(参照によって組み込まれる4,169,888参照。)及びデュオカルマイシンは、ADCにおいて利用される抗腫瘍抗生物質ファミリーのメンバーである。こうした抗生物質は、副溝において、DNAをアデニンのN3位で、配列選択的にアルキル化することを介して働くようであり、これにより、アポトーシスをもたらすたくさんの現象のを引き起こす。
デュオカルマイシンの重要なメンバーには、デュオカルマイシンA(米国特許第4,923,990号が、参照によって組み込まれる)、及びデュオカルマイシンSA(米国特許第5,101,038号が、参照によって組み込まれる)、ならびに多数のアナログが含まれ、当該アナログは、米国特許第7,517,903号、第7,691,962号、第5,101,038号、第5,641,780号、第5,187,186号、第5,070,092号、第5,070,092号、第5,641,780号、第5,101,038号、第5,084,468号、第5,475,092号、第5,585,499号、第5,846,545号、WO2007/089149、WO2009/017394A1、第5,703,080号、第6,989,452号、第7,087,600号、第7,129,261号、第7,498,302号、及び第7,507,420号において説明されており、これらはすべて、参照によって、明確に組み込まれる。
他の細胞傷害性物質
本発明の抗体に結合できる他の抗腫瘍物質には、BCNU、ストレプトゾシン、ビンクリスチン及び5−フルオロウラシル、米国特許第5,053,394号、第5,770,710号において説明される、LL−E33288複合体としてまとめて知られる物質のファミリー、ならびにエスペラミシン(米国特許第5,877,296号)が含まれる。
使用できる酵素的に活性な毒物及びその断片には、ジフテリアA鎖、ジフテリア毒物の非結合性活性断片、菌体外毒物A鎖(Pseudomonas aeruginosa由来)、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデシンA鎖、アルファ−サルシン、Aleurites fordiiタンパク質、ジアンシン(dianthin)タンパク質、Phytolaca americanaタンパク質(PAPI、PAPII、及びPAP−S)、momordica charantia阻害物質、クルシン、クロチン、sapaonaria officinalis阻害物質、ゲロニン、ミトゲリン(mitogellin)、レストリクトシン、フェノマイシン(phenomycin)、エノマイシン(enomycin)、ならびにトリコテセンが含まれる。例えば、1993年10月28日に公開されたWO93/21232参照。
本発明は、抗体と、核酸分解活性を有する化合物と、で形成されるADCをさらに企図する(例えば、リボヌクレアーゼ、またはデオキシリボヌクレアーゼ、すなわち、DNaseなどのDNAエンドヌクレアーゼ)。
腫瘍の選択的破壊に向けて、抗体は、高放射性原子を含んでよい。様々な放射性同位体が、放射性物質結合抗体(radioconjugated antibody)の産生に利用可能である。例には、At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212、及びLuの放射性同位体が含まれる。
放射性標識または他の標識を、既知に方法で、結合体に組み込んでよい。例えば、ペプチドは、例えば、水素の代わりにフッ素19を含有する適したアミノ酸前駆体を使用して、生合成されてよく、または、化学的アミノ酸合成によって合成されてよい。Tc99mまたはI123、Re186、Re188、及びIn111などの標識は、ペプチド中のシステイン残基を介して付加できる。イットリウム−90は、リジン残基を介して付加できる。IODOGEN法(Fraker et al(1978)Biochem.Biophys.Res.Commun.80:49−57を、ヨウ素123を組み込むために使用できる。他の方法は、「免疫シンチグラフィーにおけるモノクローナル抗体(Monoclonal Antibodies in Immunoscintigraphy)」(Chatal,CRC Press 1989)において詳細に説明される。
複数の抗体を含む組成物では、薬物負荷は、抗体当たりの薬物分子の平均数であるpによって表される。薬物負荷は、抗体当たり、1〜20薬物(D)の範囲であってよい。結合反応の調製における、抗体当たりの薬物の平均数を、質量分析、ELISAアッセイ、及びHPLCなどの通常の手段によって特徴づけてよい。pに関する抗体−薬物結合体の定量的な分布を決定してもよい。
いくつかの事例では、pが、他の薬物の負荷を有する抗体−薬物結合体由来のある一定の値である場合、分離、精製、及び均一な抗体−薬物結合体の特徴づけは、逆相HPLCまたは電気泳動などの手段によって、達成されてよい。例示の実施形態では、pは、2、3、4、5、6、7、若しくは8、またはそれらの分数である。
抗体−薬物結合体化合物の生成は、当業者によって知られる何らかの技術によって達成できる。簡潔には、抗体−薬物結合体化合物は、抗体単位としての多特異性抗体、薬物、及び任意選択で、薬物と、結合性物質とを連結するリンカーを含むことができる。
多くの異なる反応が、結合性物質に対する薬物及び/またはリンカーの共有結合に向けて、利用可能である。これは、例えば、抗体分子といった結合性物質のアミノ酸残基の反応によって達成でき、当該アミノ酸残基には、リジンのアミノ基、グルタミン酸及びアスパラギン酸の遊離カルボン酸基、システインのスルフヒドリル基、芳香族アミノ酸の様々な部分が含まれる。共有結合の非特異的方法であって、一般に使用される方法は、カルボジイミド反応であり、化合物のカルボキシ基(またはアミノ基)を、抗体のアミノ基(またはカルボキシ基)へ、連結する反応である。さらに、ジアルデヒドまたはイミドエステルなどの二機能性物質が、化合物のアミノ基を、抗体分子のアミノ基へ連結するために使用されてきた。
シッフ塩基反応も、結合性物質への薬物の付加に、利用可能である。この方法には、グリコール基またはヒドロキシ基を含む薬物の過ヨウ素酸酸化が関与し、したがって、その後に結合性物質と反応するアルデヒドを形成する。付加は、結合性物質のアミノ基とのシッフ塩基の形成を介して起こる。イソチオシアン酸を、結合性物質に薬物を共有結合で付加するためのカップリング物質として使用することもできる。他の技術は、当業者によって知られており、本発明の範囲内である。
いくつかの実施形態では、リンカーの前駆体である中間体が、適切な条件下で、薬物と反応する。他の実施形態では、反応性基が、薬物及び/または中間体に使用される。薬物と、中間体との反応産物、または誘導体化された薬物は、続いて、適切な条件下で本発明の多特異性抗体と反応する。
本発明の結合体を調製する目的に向けて、所望の化合物に対して、その化合物の反応を、より簡便なものとするために、化学的改変をしてもよいと理解されることになる。例えば、アミン、ヒドロキシル、またはスルフヒドリルなどといった官能基を、薬物の活性または他の性質に与える効果が、最小または許容可能である位置で、薬物に対して付加してよい。
リンカー単位
典型的には、抗体−薬物結合体化合物は、薬物単位と、抗体単位との間にリンカー単位を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、細胞内または細胞外の条件下で開裂可能であり、その結果、リンカーの開裂によって、適切な環境において、抗体から薬物単位が遊離する。例えば、ある一定のプロテアーゼを分泌する固形腫瘍が、開裂可能であるリンカーの標的として働いてよい。他の実施形態では、細胞内プロテアーゼが利用される。さらに他の実施形態では、リンカー単位は、開裂不可能であり、例えば、リソソームにおいて抗体が分解されることによって、薬物が遊離する。
いくつかの実施形態では、リンカーは、細胞内環境(例えば、リソソーム内またはエンドソーム内またはカベオラ内)に存在する開裂物質によって、開裂可能である。リンカーは、例えば、細胞内のペプチダーゼ酵素またはプロテアーゼ酵素によって開裂されるペプチジルリンカーであり得、当該酵素には、限定はされないが、リソソームプロテアーゼまたはエンドソームプロテアーゼが含まれる。いくつかの実施形態では、ペプチジルリンカーの長さは、少なくともアミノ酸が2個であるか、または少なくともアミノ酸が3個であるか、またはそれより長い。
開裂物質には、限定無しに、カテプシンB及びカテプシンDならびにプラスミン含まれ得、それらのすべてが、ジペプチド薬物誘導体を加水分解し、標的細胞内で活性薬物の遊離をもたらすことが知られている(例えば、Dubowchik and Walker,1999,Pharm.Therapeutics 83:67−123参照)。ペプチジルリンカーは、CD38を発現している細胞に存在する酵素によって開裂可能である。例えば、チオール依存性プロテアーゼであるカテプシンBによって開裂可能なペプチジルリンカーを使用できる(例えば、Phe−LeuリンカーまたはGly−Phe−Leu−Glyリンカー(配列識別番号X))。カテプシンBは、癌性組織において高度に発現している。そのようなリンカーの他の例は、例えば、米国特許第6,214,345号において説明されており、参照によってその全体が、あらゆる目的に向けて、本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、細胞内プロテアーゼによって開裂可能なペプチジルリンカーは、Val−CitリンカーまたはPhe−Lysリンカーである(例えば、val−citリンカーを有するドキソルビシンの合成が説明されている米国特許第6,214,345号参照。)。
他の実施形態では、開裂可能なリンカーは、pH感受性であり、すなわち、ある一定のpH値での加水分解に対して感受性である。典型的には、pH感受性リンカーは、酸性条件下で加水分解可能である。例えば、リソソームにおいて加水分解可能である、酸性で不安定なリンカー(例えば、ヒドラゾン、セミカルバゾン、チオセミカルバゾン、シス−アコニットアミド、オルトエステル、アセタール、ケタール、及び同様のもの)を使用してよい。(例えば、米国特許第5,122,368号、第5,824,805号、第5,622,929号、Dubowchik and Walker,1999,Pharm.Therapeutics 83:67−123、Neville et al.,1989,Biol.Chem.264:14653−14661参照。)そのようなリンカーは、血液中の条件などの中性pH条件下で相対的に安定であるが、リソソームのおよそのpHであるpH5.5または5.0より低いpHでは不安定である。ある一定の実施形態では、加水分解可能なリンカーは、チオエーテルリンカーである(例えば、アシルヒドラゾン結合を介して、治療用物質に付加したチオエーテルなど(例えば、米国特許第5,622,929号参照)。
さらに他の実施形態では、リンカーは、還元条件下で開裂可能である(例えば、ジスルフィドリンカー)。様々なジスルフィドリンカーが、当該技術分野において知られており、例えば、SATA(N−スクシンイミジル−5−アセチルチオ酢酸)、SPDP(N−スクシンイミジル−3−(2−ピリジルジチオ)プロピオン酸)、SPDB(N−スクシンイミジル−3−(2−ピリジルジチオ)ブタン酸)及びSMPT(N−スクシンイミジル−オキシカルボニル−アルファ−メチル−アルファ−(2−ピリジル−ジチオ)トルエン)−、SPDB及びSMPTを使用して形成できるものが含まれる。(例えば、Thorpe et al.,1987,Cancer Res.47:5924−5931、Wawrzynczak et al.,In Immunoconjugates:Antibody Conjugates in Radioimagery and Therapy of Cancer(C.W Vogel ed.,Oxford U.Press,1987参照。米国特許第4,880,935号も併せて参照。)
他の実施形態では、リンカーは、マロン酸リンカー(Johnson et al.,1995,Anticancer Res.15:1387−93)、マレイミドベンゾイルリンカー(Lau et al.,1995,Bioorg−Med−Chem.3(10):1299−1304)、または3’−N−アミドアナログ(Lau et al.,1995,Bioorg−Med−Chem.3(10):1305−12)である。
さらに他の実施形態では、リンカー単位は、開裂不可能であり、薬物は、抗体の分解によって放出される(米国公開第2005/0238649号参照。その全体が、参照によって、あらゆる目的に向けて、本明細書に組み込まれる)。
多くの実施形態では、リンカーは、自己崩壊性(self−immolative)である。本明細書では、「自己崩壊性スペーサー」という用語は、2つの間隔のある化学部分をまとめて共有結合的に連結して、安定な三部構成分子にすることが可能な二機能性の化学的な部分を指す。当該スペーサーは、第一部分に対するその結合が開裂した場合、第二化学部分から自発的に分離することになる。例えば、WO2007059404A2、WO06110476A2、WO05112919A2、WO2010/062171、WO09/017394、WO07/089149、WO07/018431、WO04/043493、及びWO02/083180参照。これらは、薬物−開裂可能基質結合体に向けられており、薬物及び開裂可能基質は、任意選択で、自己崩壊性リンカーを介して連結されており、これらはすべて、参照によって明確に組み込まれる。
リンカーは、細胞外環境に対して実質的に感受性でないことが多い。本明細書では、リンカーの構成における「細胞外環境に対して実質的に感受性でない」は、抗体−薬物結合体化合物が、細胞外環境(例えば、血漿)に存在するとき、抗体−薬物結合体化合物の試料において、リンカーの約20%以下、15%以下、10%以下、5%以下、3%以下、または約1%以下しか開裂しないことを意味する。
リンカーが、細胞外環境に対して実質的に感受性でないかどうかは、例えば、血漿で、抗体−薬物結合体化合物を予め決めた時間(例えば、2、4、8、16、または24時間)インキュベートし、その後、血漿中に存在する遊離薬物の量を定量化することによって決定できる。
相互に排他的ではない他の実施形態では、リンカーは、細胞への内部移行を促進する。ある一定の実施形態では、リンカーは、治療用物質と結合されるとき(すなわち、本明細書に記載される抗体−薬物結合体化合物のリンカー−治療用物質部分の環境において)、細胞への内部移行を促進する。さらに他の実施形態では、リンカーは、オーリスタチン化合物と、本発明の多特異性抗体との両方に結合されるとき、細胞への内部移行を促進する。
本発明の組成物及び方法と共に使用できる様々な例示のリンカーは、WO2004−010957、米国公開第2006/0074008号、米国公開第20050238649号、及び米国公開第2006/0024317号において説明される(これらはそれぞれ、その全体が、あらゆる目的に向けて本明細書に組み込まれる)。
薬物負荷
薬物負荷は、pによって表現され、分子における抗体当たりの薬物部分の平均数である。薬物負荷(「p」)は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、または抗体当たりの部分(D)が、これらより多くてよいが、平均数は、分数または少数であることが多い。一般に、1〜4の薬物負荷が、有用であることが多く、1〜2も有用である。本発明のADCは、1〜20の範囲の薬物部分と結合した抗体の集合を含む。結合反応によるADCの調製物において、抗体当たりの薬物部分の平均数は、質量分析、及びELISAアッセイなどの通常の手段によって特徴づけられてよい。
pに関するADCの定量的な分布を決定してもよい。いくつかの実例では、pが、他の薬物の負荷を有するADC由来のある一定の値の場合、均一なADCの分離、精製、及び特徴づけは、電気泳動などの手段によって達成されてよい。
いくつかの抗体−薬物結合体では、pは、抗体上の付加部位の数によって限定されてよい。例えば、上の例示の実施形態のように、付加が、システインチオールである場合、抗体は、1つのみ、若しくはいくつかのシステインチオール基を有してよく、または1つのみ、若しくはいくつかの十分に反応性であるチオール基を有してよく、当該チオール基を介してリンカーを付加してよい。ある一定の実施形態では、例えば、p>5といった、より多くの薬物負荷は、凝集、不溶性、毒性、またはある一定の抗体−薬物結合体の細胞透過性の消失を引き起こし得る。ある一定の実施形態では、本発明のADC向けの薬物負荷は、1〜約8、約2〜約6、約3〜約5、約3〜約4、約3.1〜約3.9、約3.2〜約3.8、約3.2〜約3.7、約3.2〜約3.6、約3.3〜約3.8、または約3.3〜約3.7の範囲である。実際、ある一定のADC向けには、抗体当たりの薬物部分の最適な比は、8未満であってよく、約2〜約5であってよい。US2005−0238649A1参照(参照によって、その全体が、本明細書に組み込まれる)。
ある一定の実施形態では、結合反応の間に、抗体に結合される薬物部分は、理論的な最大数より少ない。抗体は、例えば、以下に論じられる薬物−リンカー中間体またはリンカー試薬と反応しないリジン残基を含んでよい。一般に、抗体は、薬物部分に連結し得る、遊離であって反応性のシステインチオール基を多くは含まず、実際は、抗体におけるシステインチオール残基のほとんどが、ジスルフィド架橋として存在する。ある一定の実施形態では、抗体を、部分的または完全な還元条件下で、ジチオスレイトール(DTT)またはトリカルボニルエチルホスフィン(TCEP)などの還元物質で還元し、反応性のシステインチオール基を生成させてもよい。ある一定の実施形態では、抗体は、リジンまたはシステインなどの反応性の求核基を露出させるために変性条件に供される。
ADCの負荷(薬物/抗体比)は、異なる方法で制御されてよく、例えば、(i)薬物−リンカー中間体または抗体に対する、リンカー試薬のモル過剰量の限定によって、(ii)結合反応の時間または温度の限定によって、(iii)システインチオール改変に向けた部分的還元条件または還元条件の限定によって、(iv)システイン残基の数及び位置が、リンカー−薬物付加の数、及び/または位置の制御に向けて改変されるようにする、組換え技術による、抗体のアミノ酸配列の操作(本明細書及びWO2006/034488(その全体が、参照によって、本明細書に組み込まれる)で開示されるように調製されるthioMabまたはthioFabなど)によって制御されてよい。
複数の求核基が、薬物−リンカー中間体と反応するか、またはリンカー試薬に続いて薬物部分の試薬と反応する場合、その後に得られる産物は、抗体に対して1つまたは複数の薬物部分が付加した分布を有するADC化合物の混合物であると理解されることになる。抗体当たりの薬物の平均数は、二重ELISA抗体アッセイによって、混合物から計算されてよく、二重ELISA抗体アッセイは、抗体に特異的であると共に薬物に特異的である。混合物中の個々のADC分子は、質量分析によって同定されてよく、例えば、疎水性相互作用クロマトグラフィーといったHPLCによって分離されてよい。
いくつかの実施形態では、単一の負荷値を有する均一なADCが、電気泳動またはクロマトグラフィーによって、結合体混合物から単離されてよい。
ADCの細胞傷害効果の決定方法
薬物または抗体−薬物結合体が、細胞に対する細胞増殖抑制効果、及び/または細胞傷害効果を発揮するかどうかを決定する方法は既知である。一般に、抗体薬物結合体の細胞傷害活性または細胞増殖抑制活性は、細胞培養媒体中で、抗体薬物結合体の標的タンパク質を発現している哺乳類細胞を暴露し、約6時間〜約5日の期間細胞を培養し、そして細胞の生存率を測定することによって、測定できる。細胞に基づく試験内アッセイを、抗体薬物結合体の、生存率(増殖)、細胞傷害性、及びアポトーシスの誘導(カスパーゼの活性化)を測定ために使用できる。
抗体薬物結合体が、細胞増殖抑制効果を発揮するかどうかを決定するために、チミジン取り込みアッセイを使用してよい。例えば、96穴プレートに5,000個細胞/穴の密度で播種された、標的抗原を発現している癌細胞を72時間培養し、72時間の最後の8時間、0.5μCiの3H−チミジンに暴露することができる。抗体薬物結合体の存在下、及び非存在下における3H−チミジンの培養細胞への取り込みを測定する。
細胞傷害性の決定のために、ネクローシス、またはアポトーシス(プログラムされた細胞死)を測定できる。ネクローシスは、典型的には、細胞膜の透過性が増加し、細胞が膨化し、そして細胞膜が破裂することによって達成される。アポトーシスは、典型的には、膜小疱形成、細胞質凝縮、及び内在性エンドヌクレアーゼの活性化によって特徴づけられる。癌細胞に対するこうした効果のいずれかが決定されれば、抗体薬物結合体が、癌の処置において有用であると示される。
細胞生存率は、ニュートラルレッド、トリパンブルー、またはALAMAR(商標)ブルーなどの色素の細胞内への取り込みを決定することによって測定できる(Page et al.,1993,Intl.J.Oncology 3:473−476参照)。そのようなアッセイでは、細胞を、色素を含む媒体においてインキュベートし、細胞を、洗浄し、そして、残存色素を分光光度的に測定する。残存色素は、色素の細胞への取り込みを反映するものである。タンパク質結合性色素であるスルホローダミンB(SRB)も細胞傷害性を測定するために使用できる(Skehan et al.,1990,J.Natl.Cancer Inst.82:1107−12)。
あるいは、MTTなどのテトラゾリウム塩が、生存しており、死んでいない細胞の検出による、哺乳細胞の生存及び増殖に向けた定量的比色分析アッセイにおいて、使用される(例えば、Mosmann,1983,J.Immunol.Methods 65:55−63参照)。
アポトーシスは、例えば、DNA断片化の測定によって定量化できる。定量的に試験管内でDNA断片化を決定するために、市販の測光方法が、利用可能である。そのようなアッセイの例には、TUNEL(断片化したDNAへの標識化ヌクレオチドの取り込みを検出する)、及びELISAに基づくアッセイが含まれ、Biochemica,1999,no.2,pp.34−37(Roche Molecular Biochemicals)において説明される。
アポトーシスは、細胞における形態学的変化を測定することによっても決定できる。例えば、ネクローシスを伴う、細胞膜の統合性の消失は、ある一定の色素(例えば、アクリジンオレンジまたはエチジウムブロミドなどの蛍光色素)の取り込みを測定することによって決定できる。アポトーシス細胞数の測定方法は、Duke and Cohen,Current Protocols in Immunology(Coligan et al.eds.,1992,pp.3.17.1−3.17.16)によって説明される。細胞は、DNA色素(例えば、アクリジンオレンジ、エチジウムブロミド、またはヨウ化プロピジウム)で標識することもでき、細胞では、クロマチン凝縮及び核膜の内側に沿う辺縁趨向が観察される。アポトーシスを決定するために測定でき
る他の形態学的変化には、例えば、細胞質凝縮、膜小疱形成の増加、及び細胞収縮が含まれる。
アポトーシス細胞の存在は、培養の付着区画及び「浮遊」区画の両方において測定できる。例えば、両区画は、上清の除去、付着細胞のトリプシン処理、遠心洗浄段階(例えば、2000rpmで10分)後の調製物の統合、及びアポトーシスを検出(例えば、DNA断片化の測定)によって回収できる。(Piazza et al.,1995,Cancer Research 55:3110−16参照)。
生体内では、本発明の多特異性抗体の治療用組成物の効果は、適した動物モデルにおいて評価できる。例えば、異種間癌モデルを使用でき、癌の外植片または継代した異種移植片を、ヌードマウスまたはSCIDマウスなどの免疫が損なわれた動物へ導入する(Klein et al.,1997,Nature Medicine 3:402−408)。有効性は、腫瘍形成、腫瘍退縮、または腫瘍転移、及び同様のものの阻害を測定するアッセイを使用して測定できる。
先に記載した方法の実践において使用する治療用組成物は、所望の送達方法に適した担体を含む医薬組成物へと製剤化できる。適した担体には、治療用組成物と組み合わせたとき、治療用組成物の抗腫瘍機能を保持し、一般に、患者の免疫系と非反応性である何らかの材料が含まれる。例には、限定はされないが、無菌リン酸緩衝生理食塩水、静菌水、及び同様のものなどの多くの標準医薬担体のいずれかが含まれる(一般例として、Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th Edition,A.Osal.,Ed.,1980参照)。
生体内投与向けの抗体組成物
本発明に従って使用する抗体の製剤は、所望の純度を有し、任意選択で、医薬的に許容可能な担体、添加剤、または安定剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.[1980])と共に抗体を混合することによって、凍結乾燥製剤または水溶液の形態において、貯蔵向けに調製される。許容可能な担体、添加剤、または安定剤は、用いられる投与量及び濃度で、レシピエントに対して非毒性であり、リン酸、クエン酸、及び他の有機酸などの緩衝剤、アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化剤、保存剤(オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド、ヘキサメトニウムクロリド、ベンザルコニウムクロリド、ベンゼトニウムクロリド、フェノール、ブチルアルコール若しくはベンジルアルコール、メチルパラベン若しくはプロピルパラベンなどのアルキルパラベン、カテコール、レゾルシノール、シクロヘキサノール、3−ペンタノール、及びm−クレゾールなど)、低分子量(約10残基未満)ポリペプチド、血清アルブミン、ゼラチン、若しくはイムノグロブリンなどのタンパク質、ポリビニルピロリドンなどの親水性重合体、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、若しくはリジンなどのアミノ酸、単糖、二糖、及びグルコース、マンノース、若しくはデキストリンを含む他の糖質、EDTAなどのキレート物質、スクロース、マンニトール、トレハロース、若しくはソルビトールなどの糖、ナトリウムなどの塩形成対イオン、金属複合体(例えば、亜鉛−タンパク質複合体)、ならびに/またはTWEEN(商標)、PLURONICS(商標)、若しくはポリエチレングリコール(PEG)などの非イオン性界面活性剤が含まれる。
本明細書に記載される製剤は、処置されている特定の徴候に向けて、必要に応じて複数の活性化合物を含んでもよく、好ましくは、お互いに有害な影響を及ぼすことのない相補的な活性を有するものである。例えば、他の特異性を有する抗体を提供することが望ましくあり得る。あるいは、またはさらに、組成物は、細胞傷害性物質、サイトカイン、成長阻害物質、及び/または小分子アンタゴニストを含んでよい。そのような分子は、意図する目的に向けて、有効な量の組み合わせで、適切に存在する。
活性成分は、調製するカプセルに封入されてもよく、例えば、コアセルベーション技術によって、または界面重合によって封入されてよく、これらは、例えば、それぞれヒドロキシメチルセルロースマイクロカプセルまたはゼラチンマイクロカプセル、及びポリ−(メチルメタクリル酸)マイクロカプセルであり、コロイド薬物送達系(例えば、リポソーム、アルブミンマイクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子、及びナノカプセル)、またはマイクロエマルジョンにおいて、封入されてよい。そのような技術は、Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.(1980)において開示される。
生体内投与に向けて使用される製剤は、無菌、またはそれに近くあるべきである。これは、無菌ろ過膜を通過させるろ過によって容易に達成される。
持続放出調製物を調製してよい。持続放出調製物の適した例には、抗体を含む固体疎水性重合体の半透性マトリックスが含まれ、当該マトリックスは、成形物品の形態であり、例えば、フィルムまたはマイクロカプセルである。持続放出マトリックスの例には、ポリエステル、ヒドロゲル(例えば、ポリ(2−ヒドロキシエチル−メタクリル酸)、またはポリ(ビニルアルコール))、ポリラクチド(米国特許第3,773,919号)、L−グルタミン酸及び.ガンマ.エチル−L−グルタミン酸の共重合体、非分解性エチレン−酢酸ビニル、LUPRON DEPOT(商標)(乳酸−グリコール酸共重合体及び酢酸リュープロリドからなる注射可能なマイクロスフェア)などの分解性乳酸−グリコール酸共重合体ならびにポリ−D−(−)−3−ヒドロキシブタン酸が含まれる。エチレン−酢酸ビニル及び乳酸−グリコール酸などの重合体は、100日を超える期間の分子放出を可能にする一方で、ある一定のヒドロゲルでは、タンパク質の放出期間は、より短い。
カプセル化された抗体が、体内に長期間残存するとき、抗体は、37℃での水分へ暴露の結果として変性または凝集し得、生物学的活性の消失と共に免疫原性が変化する可能性をもたらす。関与する機構に応じて、安定化に向けた合理的な方針を立てることができる。例えば、凝集機構が、チオジスルフィド相互交換を介した分子間S――S結合形成であると見出されたのであれば、スルフヒドリル残基の改変、酸性溶液からの凍結乾燥、水分含量の制御、適した添加物の使用、及び特定の重合体マトリックス組成物の開発によって、安定化を達成してよい。
投与様式
本発明の抗体物質及び化学療法物質は、ボーラスとしての静脈投与、または期間にわたる継続注入による静脈投与などの既知の方法に従って、筋肉内経路、腹腔内経路、脳脊髄内(intracerobrospinal)経路、皮下経路、関節内経路、関節滑液嚢内経路、くも膜下腔内経路、口腔経路、局所的経路、または吸入経路によって、対象に投与される。抗体の静脈内投与または皮下投与が好ましい。
処置様式
本発明の方法において、治療は、病気または状態に関する有益な治療応答を提供するために使用される。「有益な治療応答」は、病気若しくは状態における改善、及び/または病気若しくは状態と関連する症状における改善を意図する。例えば、有益な治療応答は、病気における下記の改善の1つまたは複数を指すことになる。(1)新生細胞数の低下、(2)新生細胞死の増加、(3)新生細胞の生存阻害、(5)腫瘍成長の阻害(例えば、ある程度の鈍化、好ましくは停止)、(6)患者生存率の増加、及び(7)病気または状態と関連する1つまたは複数の症状のいくらかの緩和。
何らかの所与の病気または状態における有益な治療応答は、病気または状態に特有の標準化された応答の診断基準によって決定できる。腫瘍応答は、磁気共鳴画像法(MRI)スキャン、x−線画像法、コンピュータ断層撮影(CT)スキャン、骨スキャン画像法、内視鏡検査、ならびに骨髄穿刺(BMA)及び循環における腫瘍細胞の計数を含む腫瘍生検試料採取などの選別技術を使用して、腫瘍形態学(すなわち、全体的な腫瘍量、腫瘍サイズ、及び同様のもの)における変化で評価できる。
こうした有益な治療応答に加えて、治療が進行中の対象は、病気に関連する症状において、改善の有利な効果を経験してよい。
したがって、B細胞腫瘍に対しては、対象は、いわゆるB症状、すなわち、夜間の発汗、熱、体重減少、及び/または蕁麻疹の減少を経験してよい。前悪性状態に対しては、多特異性治療用物質での治療によって、関連悪性状態の発生を遮断、及び/または発生までの時間を延長してよく、当該関連悪性状態の発生は、例えば、意義不明の単クローン性ガンマグロブリン血症(MGUS)に罹患している対象における多発性骨髄腫の発生である。
病気の改善は、完全応答として特徴付けられてよい。「完全応答」は、何らかの、以前には異常であったX線試験、骨髄、及び脳脊髄液(CSF)の正常化、または骨髄腫の場合は、異常なモノクローナルタンパク質の正常化を伴って、臨床的に検出可能な病気が存在しないことを意図する。
そのような応答は、本発明の方法による処置の後、少なくとも4〜8週間持続してよく、または時には6〜8週間持続してよい。あるいは、病気の改善は、部分応答であるとして分類されてよい。「部分応答」は、新しい病変が存在せず、すべての測定可能な腫瘍量(すなわち、対象に存在する悪性細胞の数、または腫瘍質量の測定容積、または異常なモノクローナルタンパク質の量)が、少なくとも約50%の減少することを意図し、4〜8週間、または6〜8週間持続してよい。
本発明による処置は、使用する薬剤の「治療上有効量」を含む。「治療上有効量」は、必要な投与量及び期間で、所望の治療結果を達成するために有効である量を指す。
治療上有効量は、個々の病気の状況、年齢、性別及び体重などの要因、ならびに個々における、薬剤の所望応答を引き出す能力に応じて変化してよい。治療上有効量は、抗体または抗体部分の治療上有利な効果が、何らかの毒性効果または有害性効果を凌ぐ量でもある。
腫瘍治療に向けた「治療上有効量」は、病気の進行の安定化能力によって測定されてもよい。癌を抑制する化合物の能力を、ヒト腫瘍における有効性を予測する動物モデル系において評価してよい。
あるいは、組成物のこの性質は、当業者に知られる試験管内アッセイによって、化合物が、細胞の成長を抑制する能力、またはアポトーシスを誘導する能力を試験することによって評価してよい。治療用化合物の治療上有効量によって、対象の腫瘍サイズを減少させてよく、またはそうでなければ、対象の症状を回復させてよい。当業者であれば、対象のサイズ、対象の症状の重症度、及び特定組成物、または選択する投与経路などの要因に基づいてそのような量を決定できるであろう。
投与量レジメンは、最適な所望の応答を提供するように調整される(例えば、治療応答)。例えば、単回ボーラス投与をしてよく、いくつかに分割された用量を、期間にわたって投与してよく、または治療状況の要件が示すように、比例的に用量を減少または増加してよい。非経口組成物を、投与の容易化、及び投与量の均一性担保に向けて、投与量単位形態において製剤化してよい。本明細書では、投与量単位形態は、処置される対象向けの単位投与量として適した、物理的に別々の単位を指す。それぞれの単位は、必要な医薬担体と関連して、所望の治療効果を提供するように計算され、予め決定された量の活性化合物を含む。
本発明の投与量単位形態のための規格は、(a)活性化合物特有の特性、及び達成される特定の治療効果、ならびに(b)そのような活性化合物を、個々の感受性処置向けに配合する技術分野での固有の制限、によって決定されると共に、直接的にそれらに応じて、決定される。
本発明において使用される多特異性抗体に向けた、効率的な投与量及び投与量レジメンは、処置される病気または状態に依存し、当業者によって決定されてよい。
本発明において使用される多特異性抗体の治療上有効量のための、例示かつ非限定範囲は、約0.1〜50mg/kgなどの約0.1〜100mg/kg、例えば、約0.1〜10mg/kgなどの約0.1〜20mg/kg、例えば、約0.3mg/kgなどの約0.5mg/kg、約1mg/kg、または約3mg/kgである。別の実施形態では、抗体は、1〜20mg/kgの用量などの1mg/kg以上の用量で投与され、例えば、5〜20mg/kgの用量、例えば、8mg/kgの用量で投与される。
当該技術分野の医療従事者であれば、必要な医薬組成物の有効量を容易に決定し、処方し得る。例えば、医者または獣医師であれば、医薬組成物において用いられる薬剤を、所望の治療効果を達成するために必要となるよりも低い水準の用量で開始し、所望の効果が達成されるまで投与量を徐々に増加させることができるであろう。
1つの実施形態では、多特異性抗体は、注入によって、200〜400mg/kgの投与量などの10〜500mg/kgの投与量で毎週投与される。そのような投与は、例えば、3〜5回などの1〜8回繰り返されてよい。投与は、2〜12時間の期間などの2〜24時間の期間にわたる継続注入によって実施されてよい。
1つの実施形態では、毒性を含む副作用を減らす必要があれば、多特異性抗体は、24時間を超える期間などの長期にわたる、緩徐な継続注入によって投与される。
1つの実施形態では、多特異性抗体は、4〜6回などの最大8回の投与に向け、250mg〜2000mgの投与量が毎週投与され、例えば、300mg、500mg、700mg、1000mg、1500mg、または2000mgなどの投与量が毎週投与される。投与は、2〜12時間などの2〜24時間の期間にわたって継続注入によって実施されてよい。そのようなレジメンは、必要に応じて1回または複数回繰り返されてよく、例えば、6ヶ月後または12カ月後に繰り替えされてよい。投与量は、例えば、生物学的試料を取得し、多特異性抗体の抗原結合領域を標的とする抗イディオタイプ抗体を使用することにより、投与の際に血液中に存在する本発明の化合物量を測定することによって、決定または調整してよい。
さらなる実施形態では、多特異性抗体は、毎週1回、2〜12週間投与され、3〜10週間など、4〜8週間などの期間投与される。
1つの実施形態では、多特異性抗体は、維持療法によって投与され、例えば、6ヶ月またはそれより長い期間、1週間に1回などといった投与がなされる。
1つの実施形態では、多特異性抗体は、多特異性抗体の1回の注入後に、放射性同位体に結合した多特異性抗体の注入を含むレジメンによって投与される。レジメンは、繰り返されてよく、例えば、7〜9日後に繰り返されてよい。
非限定例として、本発明による処置は、1日の抗体投与量として提供されてよく、その量は、1日当たり、約0.1〜100mg/kgであって、1日当たり、0.5、0.9、1.0、1.1、1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、40、45、50、60、70、80、90、または100mg/kgなどであり、処置の開始後、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、若しくは40日目の内の少なくとも1日に提供されてよく、あるいは処置の開始後、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、若しくは20週間目の内の少なくとも1週に提供されてよく、またはそれらのいずれかの組み合わせで提供されてよく、単一または分割された用量を使用して、24、12、8、6、4、若しくは2時間毎に、またはそれらのいずれかの組み合わせで提供されてよい。
いくつかの実施形態では、その実施形態の多特異性抗体分子は、例えば、化学療法物質といった、1つまたは複数の追加の治療用物質と組み合わせて使用される。DNA損傷化学療法物質の非限定例には、トポイソメラーゼI阻害物質(例えば、イリノテカン、トポテカン、カンプトテシン、及びそれらのアナログまたは代謝物、ならびにドキソルビシン)、トポイソメラーゼII阻害物質(例えば、エトポシド、テニポシド、及びダウノルビシン)、アルキル化物質(例えば、メルファラン、クロラムブシル、ブスルファン、チオテパ、イホスファミド、カルムスチン、ロムスチン、セムスチン、ストレプトゾシン、デカルバジン(decarbazine)、メトトレキサート、マイトマイシンC、及びシクロホスファミド)、DNAインターカレーター(例えば、シスプラチン、オキサリプラチン、及びカルボプラチン)、ブレオマイシンなどのDNAインターカレーター兼遊離ラジカル発生物質、ならびにヌクレオシド模倣物質(例えば、5−フルオロウラシル、カペシタビン(capecitibine)、ゲムシタビン、フルダラビン、シタラビン、メルカプトプリン、チオグアニン、ペントスタチン、及びヒドロキシ尿素)が含まれる。
細胞複製を攪乱する化学療法物質には、パクリタキセル、ドセタキセル、及び関連アナログと、ビンクリスチン、ビンブラスチン及び関連アナログと、サリドマイド、レナリドミド及び関連アナログ(例えば、CC−5013及びCC−4047)と、タンパク質チロシンキナーゼ阻害物質(例えば、メシル酸イマチニブ及びゲフィチニブ)と、プロテアソーム阻害物質(例えば、ボルテゾミブ)と、IκBキナーゼの阻害物質を含むNF−κB阻害物質と、癌において過剰発現しているタンパク質に結合し、それによって細胞複製を下方制御する抗体(例えば、トラスツズマブ、リツキシマブ、セツキシマブ、及びベバシズマブ)と、癌において上方制御、過剰発現、または活性化していることが知られており、それを阻害することにより、細胞複製が下方制御されるタンパク質または酵素の他の阻害物質と、が含まれる。
いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、Velcade(登録商標)(ボルテゾミブ)での処置に先行して、処置と同時に、または処置の後に使用できる。
すべての引用文献は、それらの全体が、参照によって、明確に本明細書に組み込まれる。
例示目的に向けて、本発明の特定の実施形態を上に説明したが、添付の特許請求の範囲において説明される本発明から逸脱することなく、当業者によって、詳細の変更を数多く実施し得ることを理解されるであろう。
本発明を示すために、実施例を以下に提供する。こうした実施例は、本発明を何らかの特定の応用、または実施理論に限定しようと意図するものではない。本発明において論じられる定常領域の位置のすべてで、番号付けは、Kabat(Kabat et al.,1991,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.,United States Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda。参照によって、全体が組み込まれる)にあるように、EUインデックスに従う。抗体技術分野の当業者であれば、この慣習が、イムノグロブリン配列の特定領域における、非連続的な番号付けからなっており、イムノグロブリンファミリーにおける保存位置への標準化された参照が可能になっていることを理解されるであろう。したがって、EUインデックスによって定義される、何らかの所与のイムノグロブリンの位置は、その連続配列に対応する必要はないことになる。
実施例1.プロトタイプ「三重F」二重特異性抗体
本発明は、第一抗原及び第二抗原を共捕捉する新規のイムノグロブリン組成物について説明する。抗体の一方の重鎖は、単鎖Fv(本明細書では、「scFv」)を含み、もう一方の重鎖は、「定型的な」Fab形式であり、可変重鎖及び軽鎖を含む(図1参照)。この構造は、本明細書で「三重F」形式(scFv−Fab−Fc)と呼ばれることがある。2つの鎖は、二量体Fc領域によって一緒にまとめられる(図2参照)。Fc領域は、アミノ酸置換によって改変でき、「三重F」ヘテロ二量体の効率的な精製を可能にする。さらに、Fc領域は、アミノ酸置換によって改変され、「三重F」ヘテロ二量体の形成を促進できる。Fc置換の例は、以下により完全に説明される。
Fc置換を、「三重F」形式に含めることができ、不要な二重scFv−Fcホモ二量体及びmAbホモ二量体に関して、所望の「三重F」ヘテロ二量体の効率的な精製を可能にする。それぞれの単量体の等電点(pI)を変えるFc置換を含め、その結果、それぞれの単量体が異なるpIを有することは、この例である。この場合、所望の「三重F」ヘテロ二量体は、不要な二重scFv−Fcホモ二量体及びmAbホモ二量体のそれと比較して、異なるpIを有することになり、したがって、「三重F」ヘテロ二量体の等電点精製を容易にする(例えば、陰イオン交換カラム、陽イオン交換カラム)。こうした置換は、何らかの混入している二重scFv−Fcホモ二量体及びmAbホモ二量体の、精製後の判定及び監視においても役に立つ(例えば、IEFゲル、cIEF、及び分析IEXカラム)。Fc単量体1及びFc単量体2において作ることでき、所望の「三重F」ヘテロ二量体の効率的な精製を可能にする置換の一覧については、図3参照のこと。
Fc置換は、「三重F」形式に含めることができ、所望の「三重F」ヘテロ二量体への形成を、不要な二重scFv−Fcホモ二量体及びmAbホモ二量体を上回るように歪曲する。例えば、Fc単量体1及びFc単量体2において作ることができ、産生を「三重F」ヘテロ二量体へと「歪曲」する置換の一覧については、図4を参照のこと。図3及び図4に記載されるアミノ酸置換は、組み合わせることができ、これにより、何らかの混入している二重scFv−Fcホモ二量体及びmAbホモ二量体を除去して容易に精製できる「三重F」ヘテロ二量体の収率の増加につながる。
「三重F」形式に含めるためのscFvドメインの最適化後に、最適化scFvドメインを様々な標準抗体重鎖と簡便な様式でカップリングできる。例えば、T細胞の細胞傷害性を補充するための抗CD3scFvを、様々な抗腫瘍抗原抗体重鎖(例えば、CD5、CD20、CD30、CD40、CD33、CD38、EGFR、EpCAM、Her2、HM1.24、及び他の腫瘍抗原に結合するもの)とカップリングできる。標準抗体重鎖と簡便にカップリングできる最適化scFvドメインのさらなる例には、ナチュラルキラー細胞の細胞傷害性に向けた抗CD16scFv、阻害活性に向けた抗CD32bscFv(ここでは、カップリングされた抗体重鎖は、例えば、CD19、CD40、CD79a、CD79b、または他の免疫受容体に結合することになる)、及び血液脳関門を横切る輸送に向けた抗トランスフェリン受容体scFv、抗インスリン受容体、または抗LRP1が含まれる。
実施例2.「三重F」形式から得られる多特異性抗体
多特異性抗体は、第三の抗原に結合する追加のscFvドメインまたはFabドメインを、「三重F」重鎖の1つのC末端に付加することによって構築できる。例として図5参照のこと。あるいは、C末端scFvまたはC末端Fabは、第一抗原または第二抗原に結合してよく、そのようにして、二価性を与え、その抗原に向けた全体的な結合親和性を増加させる。
多特異性抗体は、「三重F」形式のscFv−Fc重鎖を、図6に示される再編成された抗体重鎖とカップリングすることによっても構築できる。そのような再編成重鎖は、第三の抗原に結合する追加のFv領域、または第一抗原若しくは第二抗原に結合する追加のFv領域を含んでよく、そのようにして、二価性を与え、その抗原に向けた全体的な結合親和性を増加させる。
実施例3.抗CD19Fabx抗CD3scFv「三重F」二重特異性体
抗CD19Fabx抗CD3scFv「三重F」二重特異性体のためのアミノ酸配列を図に記載した。不要な二重scFv−Fcホモ二量体及びmAbホモ二量体を上回る所望の「三重F」ヘテロ二量体の効率的な精製を可能にするために作られたアミノ酸置換には、下線が引かれている。好ましいヒト化抗CD3可変領域向けのアミノ酸配列は、図2及び図6(CDRには下線が引かれている)に記載される。所望の「三重F」種の発現及び精製のいくつかの例、ならびにその生物学的活性が、以下に挙げられる。
抗CD19Fab及び抗CD3scFvを有する「三重F」二重特異性体であるXENP11874の産生の概要を、図9に記載する。図9Aでは、不要な二重scFv−Fcホモ二量体及びmAbホモ二量体からの、所望の「三重F」ヘテロ二量体のイオン交換精製が示される。「三重F」画分の純度は、IEFゲルによって調べた(データは、USSN61/818,410の図9Bに示されており、その図及び説明文が、参照によって、明確に組み込まれる)。最終的に、SECを使用して「三重F」産物の均一なサイズを確認した(データは、USSN61/818,410の図9Cに示されており、参照によって、明確に組み込まれる)。
CD19Fabx抗CD3scFv「三重F」二重特異性体であるXENP11874は、強力な生物学的活性を有することが示された。B細胞欠乏に向けてT細胞を強力に補充するXENP11874の能力が、USSN61/818,410の図10に示され、参照によって、明確に組み込まれる)。
抗CD19Fab及び抗CD3scFvを有する「三重F」特異性体であるXENP11924の産生は、USSN61/818,410の図11に概要が記載されており、参照によって明確に組み込まれる。USSN61/818,410の図11Aでは、不要な二重scFv−Fcホモ二量体及びmAbホモ二量体からの、所望の「三重F」ヘテロ二量体のイオン交換精製が示される。「三重F」画分の純度は、IEFゲルによって調べ、(USSN61/818,410の)図11Bに示される。最終的に、SECを使用して「三重F」産物の均一なサイズを確認した(USSN61/818,410の図11C参照)。
CD19Fabx抗CD3scFv「三重F」二重特異性体であるXENP11924は、強力な生物学的活性を有することが示された。XENP11924が、Raji腫瘍細胞株の殺傷に向けてT細胞を強力に補充する能力が、USSN61/818,410の図12に示される。
実施例4.抗CD38Fabx抗CD3scFv「三重F」二重特異性体
抗CD38Fabx抗CD3scFv「三重F」二重特異性体向けのアミノ酸配列は、USSN61/818,410の図13に記載される。不要な二重scFv−Fcホモ二量体及びmAbホモ二量体に関して、所望の「三重F」ヘテロ二量体の効率的な精製を可能にするために作られたアミノ酸置換には、下線が引かれている。所望の「三重F」種の発現及び精製のいくつかの例、ならびにその生物学的活性が、以下に挙げられる。
抗CD38Fab及び抗CD3scFvを有する「三重F」二重特異性体であるXENP11925の産生は、USSN61/818,410の図14に概要が記載される。USSN61/818,410の図14Aでは、不要な二重scFv−Fcホモ二量体及びmAbホモ二量体からの、所望の「三重F」ヘテロ二量体のイオン交換精製が示される。「三重F」画分の純度は、IEFゲルによって調べ、USSN61/818,410の図14Bに示される。最終的に、SECを使用して「三重F」産物の均一なサイズを確認した(USSN61/818,410の図14C参照)。
抗CD38Fabx抗CD3scFv「三重F」二重特異性体であるXENP11925は、強力な生物学的活性を有することが示された。XENP11925が、RPMI8226腫瘍細胞株の殺傷に向けてT細胞を強力に補充する能力が、USSN61/818,410の図15に示される。
実施例5.pI変更アイソタイプ定常領域変異体の不安定化の同定及び修復
上に説明したとおり、IgGサブクラス(IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4)間のアイソタイプの差異を利用することによって、pIを増加または減少させる置換が免疫原性を誘発する危険の最小化を試みることができる。新規アイソタイプの新しいセットを、この原理に基づいて設計した。こうした新しい変異体は、ISO(−)、ISO(+)、及びISO(+RR)と呼ばれる。こうした新規アイソタイプの熱安定性を、ヒンジ−CH2−CH3(H−CH2−CH3)系(Fc領域のみ)において決定した。上で説明したとおり、タンパク質を発現及び精製した。この概念証明系向けの配列を図16に記載した。
示差走査熱量測定(DSC)によって決定された熱安定性の測定(図17)により、ISO(−)/ISO(+RR)ヘテロ二量体(XENP12488、配列は、図16参照)は、野生型IgG1(XENP8156、配列は、図16参照)と比較して安定性が低いことが明らかとなった。引き続き、操作を試みたところ、ISO(−)重鎖における置換N384S/K392N/M397Vが、不安定化の原因であると同定した。結果的に、ISO(−NKV)と命名された変異体を設計し、試験した(図16参照)。この変異体では、位置384、392、及び397が、野生型IgG1(S384N/N392K/M397V)に復帰している。ISO(−NKV)/ISO(+RR)ヘテロ二量体(XENP12757、配列は、図16参照)の熱安定性をDSCによって測定し、野生型IgG1のそれに相当することを明らかにした(図17)。この結果は、特定のpI変更アイソタイプ置換を選択して、または選択しないことによって、不安定化するものを回避することの重要性を強調するものである。
実施例6.追加のヘテロ二量体歪曲Fc変異体
上に説明したとおり、ヘテロ二量体歪曲Fc変異体を、不要なホモ二量体に対して、所望のヘテロ二量体の形成へと偏らせるために作ることができる。追加のヘテロ二量体歪曲Fc変異体L368D/K370S−S364K/E357Q(XENP12760、配列は、図18参照)を設計し、ヒンジ−CH2−CH3系(Fc領域のみ)において試験した。上で説明したとおり、タンパク質を発現及び精製した。
1回のみの標準プロテインA精製段階後に、存在するタンパク質を、陽イオン交換(CIEX)カラムを使用した高速液体クロマトグラフィー(HPLC)によって調べた(図19参照)。これにより、不要なホモ二量体に対する所望のヘテロ二量体の収率の決定が可能になった。L368D/K370S−S364K/E357Q変異体(XENP12760、図19の下パネル)の存在によって、この変異体が存在しない場合(XENP12757、図19の上パネル)と比較して、所望のヘテロ二量体形成への極度な偏りが導入された。ヘテロ二量体の収率は、L368D/K370S−S364K/E357Q変異体を有さないものでは、僅か52.7%であるのに対し、有するものでは95.8%であることに留意されたい。
追加のヘテロ二量体歪曲Fc変異体も設計及び試験した。図36は、ヘテロ二量体の収率(HPLC−CIEXにより決定)及び熱安定性(DSCにより決定)と共に、操作されたヘテロ二量体歪曲Fc変異体の一覧を提供するものである。L368D/K370S−S364K/E357Q変異体が高いヘテロ二量体収率、及び高い熱安定性を有しており、特に好ましい。
実施例7.Fab−scFv−Fc構成における追加のヘテロ二量体歪曲Fc変異体
ヘテロ二量体歪曲Fc変異体L368D/K370S−S364K/E357Qを、抗CD19x抗CD3Fab−scFv−Fcへと操作した(アミノ酸配列は、図15参照)。対照であるFab−scFv−FcXENP13228は、こうしたヘテロ二量体歪曲Fc変異体を欠いているものであった。1回のみの標準プロテインA精製段階後に、存在するタンパク質を、等電点電気泳動(IEF)ゲルによって調べた。これにより、不要なホモ二量体に対する所望のヘテロ二量体の収率の決定が可能であった。L368D/K370S−S364K/E357Q変異体(XENP13122、図22の右レーン)の存在によって、この変異体が存在しない場合(XENP13228、図22、左レーン)と比較して、所望のヘテロ二量体(中央のバンド)形成への極度な偏りが導入された。
実施例7.抗CD38x抗CD3二重特異性抗体の構築
抗CD38抗体であるOKT10を、ヒトストリング含量(human string content)(Lazar et al.,Mol.Immunol.,(2007),44:1986−1998)の最適化によってヒト化し、ヒト化抗CD38Fv及び抗CD3ドメインを含む二重特異性分子を創出した(図37)。所望の遺伝子セグメントは、合成オリゴヌクレオチド、及び自動化された遺伝子合成によるPCR産物からBlue Heron Biotechnologies(Bothell、WA)によって合成された。pTT5ベクターにおける抗体構築物を293E細胞において発現させ、所望のヘテロ二量体二重特異性体を単離するために、標準プロテインA、及びその後のGE HiTrap SP陽イオン交換カラムを使用したIEXクロマトグラフィーによって精製した。抗体Fcドメインは、操作されたヘテロ二量体Fc領域を含み、二重特異性分子の効率的な精製が容易であった。CD38に向けた二重特異性体の親和性は、Biacore 3000を使用したSPRでのFv領域変異体のライブラリーの選別によって改善した(図38)。
実施例8.抗CD38x抗CD3二重特異性抗体の、試験管内における性質
最適化された二重特異性分子を、LDH再配向化T細胞細胞傷害性(RTCC)アッセイ(図39)及びT細胞対RPMI8226の異なる比を利用したアネキシンV+RTCCアッセイ(図40)における、RPMI8226多発性骨髄腫(MM)細胞の殺傷能力で選別した。最適化された分子を、直接結合アッセイを使用してカニクイザル抗CD38に対する交差反応性を評価した(図41)。最適化された抗CD38x抗CD3二重特異性分子の様々な性質をまとめた表を、図42に示す。
実施例8.huPBMCが移植されたSCIDマウスにおける抗CD38x抗CD3二重特異性体によるヒト血漿細胞の殺傷
最適化された二重特異性分子を、huPBMCが移植されたSCIDマウスモデルにおけるヒト血漿細胞の殺傷能力で選別した。それぞれ10匹のマウスの群を0日目にα−ASGM1で処理し、SCIDのNK細胞を欠乏させ、その後、1日目に3x107個のヒトPBMCを移植した。4日目に、群を総IgG水準に基づいて無作為化した。PBMC移植後の7日目及び15日目に、抗CD38x抗CD3二重特異性分子、または対照を投与した。IgG2、IgE、及びIgMの力価を14日目及び21日目に決定した。5mg/kgの用量で、ダラツムマブ(抗CD38IgG1抗体)を対照として含めた。ダラツムマブと比較して、抗CD38x抗CD3二重特異性分子では、ヒトIgアイソタイプの顕著な減少がみられた(図43及び図44)。
実施例4.抗CD38x抗CD3二重特異性抗体による、多発性骨髄腫患者のPBMCにおけるCD38+CD138+細胞の欠乏
二人のMMドナー由来のPBMCを1μg/mLの抗CD38x抗CD3二重特異性分子と共に、24時間インキュベートし、細胞を数えた。事前にゲートした生細胞(FSC対SSCによってソートした)由来のCD38+CD138+細胞を数え、イベントをPBS処理した対照に対して標準化した。結果を、図45に示す。二重特異性体は、この濃度で、MM細胞を強力に欠乏させることができた。
実施例5.抗CD38x抗CD3二重特異性体向けのアミノ酸配列及びDNA配列
抗CD38x抗CD3二重特異性体であるXENP13243及びXENP13551のアミノ酸配列及びDNA配列をそれぞれ図50及び図51に記載した。
実施例6.チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞における、抗CD38x抗CD3二重特異性体向けの安定プールの生成
チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞に、XENP13243及びXENP13551をコードするDNAをトランスフェクトし、Selexisが所有権を有するSURE Technology Platform(商標)を使用し、図3に記載したに比に従って、平行安定プールを生成させた。トランスフェクトされたDNAは、図52に記載されるDNAを含む単シストロン性ベクターからなるものであった。安定プール細胞を10mLの回転チューブ内で、7日間培養し、7日目に5mLの培養上清を抜き取り、プロテインA親和性クロマトグラフィーによって精製してから、陽イオン交換クロマトグラフィーによって分析した。生成されるであろう可能性のあるタンパク質が、異なる等電点を有するように設計したため、陽イオン交換クロマトグラフィーによって、異なるDNA比に応じて、どのタンパク質種が、CHO細胞によって分泌されたかを分析することが可能であった。図4は、XENP13243及びXENP13551の両方に向けた、図3に記載の特定DNA比のそれぞれで、陽イオン交換クロマトグラムを分類したものである。陽イオン交換クロマトグラフィー分析に使用した条件下で、HC−Fabホモ二量体は、約15分に溶出し、所望のヘテロ二量体特異性体は、約22分に溶出し、HC−scFv単量体は、約26分に溶出し、そしてHC−scFvホモ二量体は、約29分に溶出している。異なるタンパク質種の量の概要は、図54に記載される。
驚くべきことに、ヘテロ二量体形成は、宿主細胞におけるこうした核酸(HC−scFv、HC及びLC)のトランスフェクション比によって誘起できる。いくつかのDNAのトランスフェクション比によって、プロテインAで精製された総材料の80%を超える量で、好ましい二重特異性ヘテロ二量体が形成された。80%を超えるヘテロ二量体形成に好ましい比は、1:1.5:1.5、1:2:1.5、1:0.667:2、1:1:2、1:1.5:2、及び1:2:2である(すべてHC−Fab:HC−scFv:LCとして記載)。いくつかのDNA比によって、好ましい二重特異性ヘテロ二量体が、90%を超える量で形成された。90%を超えるヘテロ二量体形成に好ましい比は、1:1.5:1.5、1:2:1.5、1:1:2、及び1:2:2である(すべてHC−Fab:HC−scFv:LCとして記載)。DNA比の1つによって、好ましい二重特異性ヘテロ二量体が、95%を超える量で形成された。95%を超えるヘテロ二量体形成に特に好ましい比は、1:2:2である(HC−Fab:HC−scFv:LCとして記載)。
実施例7.C57BL/6マウスにおける抗CD38x抗CD3二重特異性体の薬物動態
C57BL/6マウス(群当たりn=5)に、抗CD38x抗CD3二重特異性体であるXENP13243及びXENP13551を、2mg/kgの静脈内用量を単回で与えた。試験物投与後1時間の時点、及び投与後1、3、6、10、14、17、及び21日の時点で、マウスを眼窩静脈叢穿刺(OSP)で出血させ、血液を処理して、試験物水準の決定のための血清とした。血清濃度をイムノアッセイによって決定し、図6にプロットした。試験物の半減期をPhoenix WinNonlin6.3の非区画分析モジュールを使用して決定した。半減期を図55に記載した。二重特異性体の設計においてFc領域を含めることによって、典型的なモノクローナル抗体と同等の半減期がもたらされたことに留意されたい。BiTE形式またはDART形式などの典型的な非Fc含有二重特異性体は、はるかに短い半減期を有し、半減期は、時間のオーダーである。
実施例8.抗CD38x抗CD3二重特異性体によって媒介されるCD38+RPMI8226細胞の再配向化T細胞細胞傷害性
抗CD38x抗CD3二重特異性体であるXENP13243及びXENP13551をCD38+RPMI8226細胞の再配向化T細胞細胞傷害性を媒介するために使用した。アッセイは、10,000個のRPMI8226細胞を、400,000個の精製されたヒトT細胞と37℃で24時間インキュベートすることからなる構成であった。細胞傷害性の計測は、乳酸脱水素酵素(LDH)によるものである。結果を図に示す。
実施例9.抗CD38x抗CD3二重特異性体の結合親和性
ヒト及びカニクイザルのCD38及びCD3に向けたXENP13243及びXENP13551の親和性をBiacore 3000を使用した表面プラズモン共鳴で測定した。標準法を使用し、BIAevaluationソフトウェアを使用して、動力学的パラメーターを決定した。結果を図に記載する。
実施例10.カニクイザルにおける、抗CD38x抗CD3二重特異性体によるCD38+細胞の欠乏
カニクイザルの6つの群(群当たりn=2)に、XENP13243またはXENP13551のいずれかを静脈内注入を介して投与した。3週間あけて、サル当たり2つの用量を投与した。初期用量は、5、50、及び500ng/kgであり、第二用量は、2、5、及び20μg/kgであった。CD20−CD38+細胞の欠乏が、用量依存的な様式で観察された(図参照)。T細胞補充の証拠が、CD8+T細胞上のCD69の上方制御においてみられた(図参照)。

Claims (13)

  1. a)i)第一Fcドメイン変異体と、
    ii)CD3に結合する単鎖Fv領域(scFv)と、
    を含む第一重鎖と、
    b)i)第二Fcドメイン変異体と、
    ii)第一可変重ドメインと、
    を含む第二重鎖と、
    c)第一可変軽ドメイン及び第一定常軽ドメインを含む第一軽鎖と、
    を含むヘテロ二量体抗体であって、
    前記第一可変重ドメイン及び前記第一可変軽ドメインが、CD38に結合し、
    前記第二重鎖が、アミノ酸配列RSWMNからなるCDR1配列、アミノ酸配列EINPDSSTINYATSVKGからなるCDR2配列およびアミノ酸配列YGNWFPYからなるCDR3配列を含み、前記第一軽鎖が、アミノ酸配列RASQNVDTWVAからなるCDR1配列、アミノ酸配列SASYRYSからなるCDR2配列およびアミノ酸配列QQYDSYPLTからなるCDR3配列を含む、前記ヘテロ二量体抗体。
  2. 前記第二重鎖及び前記第一軽鎖が、H1(配列識別番号473)およびL1.24(配列識別番号475)である、請求項1に記載のヘテロ二量体抗体。
  3. 前記scFvが、荷電scFvリンカーを有する、請求項1または請求項2に記載のヘテロ二量体抗体。
  4. 荷電scFvリンカーが、3〜8の正電荷を有し、配列識別番号443〜451からなる群から選択される、請求項3に記載のヘテロ二量体抗体。
  5. 前記第一重鎖が、配列識別番号520のFcドメインを含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載のヘテロ二量体抗体。
  6. 前記第一重鎖が、配列識別番号520のアミノ酸255〜485を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載のヘテロ二量体抗体。
  7. a)請求項1に記載の第一重鎖をコードする第一核酸と、
    b)請求項1に記載の第二重鎖をコードする第二核酸と、
    c)請求項1に記載の第一軽鎖をコードする第三核酸と、
    を含む、核酸組成物。
  8. a)請求項1に記載の第一重鎖をコードする第一核酸を含む第一発現ベクターと、
    b)請求項1に記載の第二重鎖をコードする第二核酸を含む第二発現ベクターと、
    c)請求項1に記載の第一軽鎖をコードする第三核酸を含む第三発現ベクターと、
    を含む、核酸組成物。
  9. 請求項7または請求項8に記載の核酸組成物を含む、宿主細胞。
  10. a)i)前記第二Fcドメイン変異体と、
    ii)前記第一可変重ドメインと、
    を含む前記第二重鎖をコードする第一核酸を含む第一発現ベクターの供給と、
    b)i)前記第一Fcドメイン変異体と、
    ii)CD3に結合する前記単鎖Fv領域(scFv)と、
    を含む前記第一重鎖をコードする第二核酸を含む第二発現ベクターの供給と、
    c)前記第一軽鎖をコードする第三核酸を含む第三発現ベクターの供給と、
    を含む、請求項1〜6のいずれかに記載のヘテロ二量体抗体の産生方法であって、
    前記第一可変重ドメイン及び前記第一軽鎖の可変軽ドメインが、CD38に結合し、
    d)前記第一、第二、及び第三発現ベクターが、1:1.5:1.5、1:2:1.5、1:0.667:2、1:1:2、1:1.5:2、及び1:2:2からなる群から選択される比で、宿主細胞にトランスフェクトされ、
    e)前記宿主細胞において、前記第一、第二、及び第三核酸を発現し、それぞれが第一、第二、及び第三アミノ酸配列を産生し、その結果、前記第一、第二、及び第三アミノ酸配列が、前記ヘテロ二量体抗体を形成する、
    前記産生方法。
  11. (f)前記ヘテロ二量体抗体の医薬組成物への製剤化をさらに含む、請求項10に記載の方法。
  12. 請求項1〜6のいずれか一項に記載のヘテロ二量体抗体を含む、必要とする患者を処置するための組成物。
  13. 請求項1〜6のいずれか一項に記載のヘテロ二量体抗体を含む医薬組成物。
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