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学生時代に卒業論文に取り組んだことがある人なら「参考文献が多すぎて収拾がつかなくなってしまった」という経験があるはず。学生や研究職ではない人でも、興味がある事柄についてインターネットで調べることがよくありますが、引用や参照を次々とたどっていくと、何がどの論文に書いてあったのか分からなくなってしまうことがよくあります。そんな時にWindows・Mac・Linux向けオープンソースソフトの「Zotero」を使うと、DOIやPMIDで簡単に論文を検索して管理可能で、論文同士の関連付けや引用リストの作成も簡単とのことなので、実際に使ってみました。 Zotero | Your personal research assistant https://www.zotero.org/ ◆Zotero本体と拡張機能の準備 ZoteroはZotero本体とブラウザ向け拡張機能を併用することで便利に使えます。ま
はじめに どうする人文・社会科学系の文献管理 「社会学評論スタイルガイド」の場合 その他の問題点 知られざる神ソフト「Juris-M」 Juris-Mとは メリット デメリット Juris-Mの導入によって可能になること Juris-Mの導入方法 １．インストール ２．同期設定 ３．ZotFileの導入・設定 ４．Juris-Mの言語設定 ５．Chrome拡張機能の導入 ６．（うまく動作しない場合）Wordコネクタの導入 動作テスト：Wordでの引用＆文献リスト作成 引用のやり方 文献リストの作成 おわりに はじめに どうする人文・社会科学系の文献管理 文献のPDFファイルや書誌情報の管理ほど面倒なことはない。 文献管理の手段としてまず挙げられるのが、MendeleyやEndNote、Zotero、Paperpileといった文献管理ソフトの存在である。これらの有名ソフトの導入方法や使い方に
こんにちは、Choimirai Schoolのサンミンです。 00 はじめに今回のnoteではZoteroのPDFリーダーから英語論文の日本語訳を自動化する手順について紹介します。 Zoteroはオープンソースの文献管理ツールで、専用の拡張機能を開発されている方も多い。中には、PDFの翻訳ツール（👉https://t.co/XyiciW0DxQ）も。利用できる翻訳サービスはGoogleやDeepLなど多数。ハイライトしたテキストが自動的に翻訳され、コメントとして保存されるのでとても便利です✨。 https://t.co/d9MRI4KTsY pic.twitter.com/JOvn82pbSK — sangmin.eth @ChoimiraiSchool (@gijigae) November 23, 2022 01 Pre-requisiteZoteroは既にインストールされている
はじめに それぞれのツールの特徴（感触） Zotero ObsidianとNotion ObsidianとZotero NotionとZotero おわりに はじめに 先日下記のような記事を書いた。 dlit.hatenadiary.com 思いつきなどをさっと書くのはTwitter (X)、まとまったものはブログというここ数年の使い分けを見直して、あまりまとまっていないものもブログに書くようにしようかなと思ったのでこんな記事も書いてみることにした。 というわけで、この記事では今試している最中の感触について書いている。このサービスはこう使うと良いとか、実際の設定方法についてこの記事だけを読めば分かるようには書いていないので注意してほしい。 それぞれのツールの特徴（感触） Zotero 使い始めたきっかけはLaTeXで共同執筆するということだったので、Mendeleyとかそのほかのいろいろあ
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はじめに 簡単な背景 はてなブログからWordpressへ Zoteroだと何が良いか 作業環境 作ったもの1: Zoteroから情報を取得してWordpressで表示させる 情報を取得するオリジナルプラグイン Wordpressに表示させる仕組み 文献ごとに表示内容を変える 作ったもの2: 文献の固有IDを取得するZoteroのプラグイン 細かい背景・事情に関する補足 おわりに はじめに 少しずつ作って少しずつ試してきたものがようやく実際に運用できるくらい形になったので、まとめておきます。 作ったものだけでなく背景・事情まで含めるとけっこういろいろな話がありますので、先に簡単にまとめておくと、この記事には次のようなことが書いてあります。 Zoteroから文献情報を自動的に取得するWordpressのオリジナルプラグインを作り、文献の種類ごとにアレンジして表示させる仕組みを整備した Zot
前回のZoteroのすすめで書いたように、研究者にとって膨大な量の文献の管理を助けてくれる文献管理ソフトは、まさに相棒のような存在です。 しかし！世の中にはいくつもの文献管理ソフトがあり、それぞれ一長一短の特徴があります。しかも、まだまだ発展途上のものも多いのです。 文献管理ソフトを使っていたりデフォルトのエクスプローラーでフォルダ管理している方は、論文にいろんなメモや下線、添付ファイル、フォルダ・タグ分け等をしているのではないかと思います。いくら最近の文献管理ソフトのインポート機能が便利になっているからといって、膨大な自分のコレクションを抱えてコロコロと各サービス間を引っ越しするのは避けたいところです。 なので自分がどのサービスを使っていくか？をじっくり検討して、これと決めたら長期間そのサービスに乗っかって文献管理したい！というのが理想ですよね。 かく言う私は学生のころに２～３年間Men
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もともと文献管理のために Mendeley や Notion を使っていたのですが、ところどころ使いにくいなと思っていました。そこで、新たな文献管理ソフトを検討していたところ、世界的にユーザー数の多い Zotero を導入してみました。 結論を言うと、これ以上ないんじゃないか、というぐらい素晴らしいソフトで導入してよかったと思っています。 ありがたいことに来年度から2名の修士学生が研究室に入ってくるので、知見を共有する目的でも Zotero の良いところ、微妙なところなどをまとめておきます。 Zotero の良いところなんといっても軽い本当に多くのメリットがあるのですが、なんといっても軽くてサクサク動くのが素晴らしいです。導入前まで pdf ファイルを読むときは Adobe Acrobat だったのですが、結構もっさり動くことに不満を持っていました。 Zotero は違います。 信じられな
はじめに \LaTeXは誰も教えてくれない みなさん、 いつから\LaTeXを使いはじめたでしょうか。 大学一年生でしょうか。 ゼミや研究室に入った時でしょうか。 はたまた卒論や修論を執筆しはじめた時でしょうか。 そのとき、 誰か今節丁寧に教えてくれましたか？ 少なくとも、私の周りではそんなことありませんでした。誰も教えてないのに、みんな元から知ってたかのような顔をして、当たり前のように使っている。でも使い方について話題に上がることもないから、みんながなんとなくで使っている。そんな感じじゃないでしょうか。 BibTeXや文献管理ソフトはもっと教えてくれない テンプレートを使いながら、コマンドをググればなんとか\LaTeXで文章を自力で作成することは可能です。しかし、文献引用についてはどうでしょう。世の中にはZoteroやMendeleyといった文献管理ソフトやBibTeXという文献引用のた
本記事は、Paperpileで文献管理をしている臨床医が Paperpileの便利なポイントや使い方について解説する記事です。 僕が文献管理にPaperpileを選んだ理由 文献管理ソフト探しは結局どれがよいのかわかりにくい… みなさんは文献管理ソフトは何を使っていますか？ Mendeley, EndNote, Zotero, Paperpile… はたまた、他の文献管理ソフトですか？ 文献管理ソフトって、たくさんあって、結局どれが良いのかわかりにくい… と感じていませんか？ 僕は臨床医をしている仕事柄、 文献をたくさん読みます。 僕がなぜ文献管理ソフトpaperpileを選んだのか… Paperpileの便利なポイントと使い方など おさらいしつつ紹介します。 僕の文献管理ソフトの遍歴 僕が初めて文献管理ソフトを知ったのは2014年。 Mendeleyを賢い先輩が使ってました。 初めて見た
論文などの PDF ファイルを管理するための文献管理ソフトウエアにはいくつかの候補があるが、その中でも Zotero は他のサービス (Mendelay, ReadCube Papers, Paperpile) と比べて、 無料 動作が軽い 依存関係が少ない (= PDF の閲覧・編集・同期のいずれも任意の外部サービスを使うことができる) という利点がある。一方で (各所で指摘されている) 欠点としては、Zotero のアプリは PC/Mac だけでしか提供されておらず、PDF ファイルをモバイル端末とスムーズに同期するのが難しい。ここでは私が Mac と iPad の間での PDF 同期をするために行き着いた方法を書く。 Zotfile + Google Drive + Acrobat Reader Zotero Storage という Zotero が提供するクラウド同期サービスは色々
大学院に入る前に、文献管理の方法を整えた記事を書いたのだが、大学院の修士課程を経て多少のアップデート... こんにちは、たわです。今回は論文を読むためのフローを整理した話です。 4 月から大学院生になるということで、受験段階で論文は読んでいたのですが、本腰入れるためにちゃんと流れを確立しておきたいと思い、試行錯誤しておりました。 調べてもデファクトスタンダード的なものはなく、結構人によって千差万別という感じで、色々試してみて落ち着いたやり方を紹介します。 論文管理・閲覧方法の概要 結論から書くと、Zotero + ZotFile + Dropbox（+ Adobe Acrobat Reader）という組み合わせでやることにしました。 論文を読むフローには大きく分けて以下 3 点あると思うので、 文献管理 ファイル管理（PDF など） ファイル閲覧（メモやマーカー引くのも含めて） それぞれに
はじめに論文を読んでも、内容をすぐに忘れてしまいませんか？タイトルとアブストラクトを読み返しても記憶が蘇らない。Figureを見てようやく「あー、あれね！」と思い出す…。 こんな経験、誰しもあるはずです。 そもそも、タイトルや抄録など文字情報だけで内容を覚えておくのは、無理があります。 生成AIがこれだけ進化した今、モダンな文献管理の正解は、「ビジュアルアブストラクトを自動生成し、文献と一緒に保管すること」です。 具体的には、以下のステップです。 NotebookLMでビジュアルアブストラクトを作る Zoteroの文献データにその画像を添付する こうしておくと、後でライブラリを見返したときに、一瞬で内容がフラッシュバックするようになります。 論文読んでも内容すぐ忘れちゃう方 タイトルと抄録で内容覚えておくのは無理がありますよね。 そんなときは、 NotebookLMでインフォグラフィックを
今回は、「話題の文献管理ソフトZoteroってなんですか？使い方を教えてください。」という質問に対して答えていきたいと思います。 文献管理ソフトZotero（ゾテロ）とは 文献管理ソフトZotero（ゾテロ）とは学術論文の管理を目的としたオープンソースのソフトウェアであり、ジョージ・メイソン大学が開発しました。 初版は2007年となりますので、今から約13年前になります。 対応OSは、Windows・Mac・Linuxであり、日本語に対応しています。 検索エンジンは、Chrome・Safari・Firefox・Edgeに対応しています。 基本的には無料で使用することができ、データ同期用のオンラインストレージの容量を増加する時のための有料プランが用意されています。 文献管理ソフトとは 文献管理ソフトとは、学術論文のPDFファイルをパソコン等で管理するためのソフトであり、英語論文を執筆する際に
Deleted articles cannot be recovered. Draft of this article would be also deleted. Are you sure you want to delete this article? 1 はじめに 論文のメモを Zotero + Obsidian でうまく残す方法をまとめました。日本語ではあまり情報がありません。 手順が多いので、地道に頑張りましょう。 1.1 本稿で達成できること Web 上の論文データを適切にテンプレートに取り込んだノートを簡単に作成できる。論文ごとにメモを取りたい人の情報整理が簡単に！ Obsidian や Zotero といった便利な道具を使い始められる。 1.2 本稿の問題点 情報がだいたい英語：広く使われている手法ではないみたいなので、日本語の情報があまりないです。英語でドキュメントを探す
このnoteは、「いくつかのデバイスを使って、でも論文の情報は競合しないようにうまく管理したい。」「 iPadでカッコよく論文読んだり、マーカー引いたりして研究してる感がほしい、でもちゃんとデスクトップにも簡単に同期したい」と考えている方におすすめです。 デバイスMacデスクトップ2台 iPad1台（Apple Pencil） Zotero（unlimited） Dropbox pro 当時の状況Zoteroを先輩に教えてもらい、PDFの保存はZoteroで一括管理していた Zoteroは引用文献リストを自動作成してくれるので気に入っていた デスクトップで論文を読んでいた 当時不満だったこともっと気軽に寝っ転がったりしてiPadでも論文を読みたかった PDFをDropboxにも保存すれば同期が楽にできiPadでも作業できるはずだが、ZoteroのPDF自動取得機能を気に入っていたので、Dr
Notionで論文管理はズボラな自分には無理だった。PDFはPDFのままぶっこんで、変に階層化や他の形式でラップしずに、好きなように情報の断片をネットワークでつなげて、必要なときにLLMなど検証可能な形で取り出したい。 — Gyroid (@shutoito) May 14, 2025 Zoteroに入っている文献データが7GBほどあり、一時期storageを課金していたが、バカらしくなったのでPDFデータのみiCloudに移動して、論文のimportとメタデータ生成だけZotero、他の作業は全てObsidianで行う。 行った作業Zotero6から最新のZotero7にupgrade ZotMoovというpluginをつかってlocalのZoteroのPDFをicloudへ移動(fileはstoredからlinkedへ変換) 変換時にpdfの名前がformatされるのでobsidian
文献管理だけじゃない！ 趣味に、仕事に。日常生活なんでもお気に入り登録！ 色々便利なZoteroの使い方。 更新履歴： 2023/07/17 公開 2025/02/05 WebDAV容量変更（Koofr 10GB→ InfiniCLOUD 20GB） はじめに仕事や勉強で論文を読んだり書いたりしていると、かなりたくさんの論文PDFがたまってくる。そのままタイトルだけ変えて、PC上のフォルダに分類して入れているだけだと、読み途中の論文やら、重要論文やらが散在して、何年も経つとカオス状態に…。 そこで必要になるのが、”文献管理ソフト”！！ ”文献管理”というのは、ただ分類して論文置き場にするだけではなく、”論文のメタ情報（出版年、著者、DOIなど本文以外の添付情報）を含めて管理する”という機能があるということで、論文執筆時に参考文献目録作成などにも役立つ。 文献管理ソフトといえば、End
PubMedなどのウェブサイトからワンクリックでデータベースに文献情報を取り込むことができます。PDFも同時にダウンロードして自動的にリンクしてくれます。PubMedの文献ページ、出版社の文献ページ、PDFをダウンロードした後のページのいずれからアドレスバーの右横にあるノートのアイコン（図、赤矢印、WindowsではZのアイコン）をクリックするとダウンロードが始まります。 出版社のページからダウンロードするのが一番確実のようです。PubMedの文献ページからだとPubMed Entryという付属物がついてきてPDFがダウンロードされないこともあります。PDFをダウンロードした後のページからだと文献情報の読み込みがやや不安定です。 この機能にはブラウザに対応したコネクターというプラグ・インが必要です。FireFox, Chrome, Safari, Edgeに対応しているようです。 手持ちの
Deleted articles cannot be recovered. Draft of this article would be also deleted. Are you sure you want to delete this article? はじめに 研究室に配属から数か月たつと、その分野の代表的な概念や自分の研究の先行事例などを調べ、論文をチェックするかと思います。最初の方は2、3本と論文の本数が少なく、特に何も意識しませんが、本数が5本、10本、20本となっていくと、管理が大変になっていきます。特にいくつかの研究プロジェクトを持つと、どの論文がどのプロジェクトに対応しているのかわからなくなります。 以前私は、Notionでデータベースを作成し、論文のPDFとURL、タグの情報を書き込んでページに論文の内容をまとめていました。ただ、20本手前になると、だんだんと管理がつら
私以外にも同様の記事をアップする人もちらほらおり、現在引用されがちなのは An Updated Academic Workflow: Zotero & Obsidian | by Alexandra Phelan | Medium この記事である 私もこのワークフローに近い使い方をしているが、1 年も経過すると大分プラスαでできることが増えてきた 現在はプラグインの自作も一部行っている そろそろ情報をアップデートする時期だろうと思い、今回まとめることにした Basic Usage これは、前回と大きく変わらない 文献を Obsidian にインポートして管理するための設定である Zotero に Better BibTex をインストール Better BibTeX for Zotero をまずはインストール インストールしたらマイ・ライブラリを右クリック→エクスポート Better CS
本や論文を書くときに、参考文献を専用のシステム（文献管理ソフト）で管理すると便利です。 これから前編・後編にわたって、文献管理ソフトの1つであるZoteroの参考文献リストを、文書変換ツールPandocから利用する方法について紹介します。 参考文献リストをZoteroからPandocへ渡すために、次のファイル形式が利用できます。 BibTeX形式 LaTeXにおいてよく用いられる参考文献リストの形式 BibLaTeX形式 BibTeXにおける機能の大半（ソート機能以外）LaTeXで実現した参考文献リストの形式 CSL JSON形式 CSL（Citation Style Language）プロジェクトで用いられるJSON形式の参考文献リスト 今回はBibTeX形式のファイル (.bib) を主に使います。ここでは単に、BibTeX形式のことを「参考文献リストのファイル形式」だと思っていただけ
!a.isFolder&&!b.isFolder||a.isFolder&&b.isFolder?a.displayName.localeCompare(b.displayName,void 0,{numeric:!0,sensitivity:\"base\"}):!a.isFolder&&b.isFolder?1:-1","filterFn":"node=>node.slugSegment!==\"tags\"","mapFn":"node=>node"}">エクスプローラー はじめに 最近になり急激にObsidianが注目を浴び始めた。特にAIエディタのCursorとの連携が強力であると各所で紹介されている。しかし、流行り物の宿命か、多くは表面的な紹介にとどまり具体的な使用例はなかなか見えてこない。本当は、長期スパンでどう使われているのかという点が重要だろう。私は2年ほど前からObsi
この記事は前編・後編で構成されています（注：余談編が追加されました）。 前編：Zoteroから参考文献リストを自動エクスポートする Zotero → BibTeX形式 後編：Pandocで参考文献リストを処理する扱う方法 Pandoc's Markdown + BibTeX形式 → HTMLやLaTeXなど出力ファイル いまここ 余談編：Pandocで参考文献が辛い話 結論：既存のBibTeX用参考文献スタイル（bstファイル）を使いたいなら、Pandocの参考文献機能を諦めよう （余談編にさらっと絶望的な結論が書いていますね……） 後編で説明するのは、Pandocで参考文献を処理する方法です。特に次の前提で説明します。 BibTeX形式の参考文献リストを用いる（前編参照） Pandoc's Markdownで原稿を書き、文献を引用する 参考文献スタイルはCSLファイルを用いる Citat
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